"Эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Омской области"

Горбунова, Марина Георгиевна

Диссертации по медицине → Эпидемиология

Автореферат и диссертация по медицине (14.02.02) на тему:"Эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Омской области"

ДИССЕРТАЦИЯ

АВТОРЕФЕРАТ

Горбунова, Марина Георгиевна Омск 2010 г.

Ученая степень: кандидата медицинских наук

ВАК РФ: 14.02.02

Автореферат диссертации по медицине на тему "Эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Омской области"

ГОРБУНОВА Марина Георгиевна

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РОТАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ В ОМСКОЙ ОБЛАСТИ

14.02.02. - эпидемиология

Автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата медицинских наук

2 3 ЛЕК 20ю

Омск-2010

004618622

Работа выполнена в Государственном образовательном учреждении высшего профессионального образования «Омская государственная медицинская академия Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию».

Научный руководитель:

доктор медицинских наук, профессор Стасенко Владимир Леонидович

Официальные оппоненты: доктор медицинских наук, профессор

Ведущая организация: Федеральное государственное учреждение науки Нижегородский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии имени академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора.

заседании диссертационного совета Д 208.065.03 при ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава» по адресу: 644043, Омск, ул. Ленина, 12; тел.(3812) 23-13-32.

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Омской государственной медицинской академии.

Сергевнин Виктор Иванович (г. Пермь) доктор медицинских наук, доцент Устюжанин Юрий Викторович (г. Тюмень)

Защита диссертации состоится _ декабря 2010 г. в

часов на

Автореферат разослан «_» ноября 2010 г.

И.о. ученого секретаря диссертационного сове™ доктор медицинских наук, профессор

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы

Крупные международные исследования свидетельствуют, что от 50 до 80% случаев ежегодно регистрируемых в мире диарейных заболеваний могут быть обусловлены вирусами, ведущее место среди которых принадлежит ротавирусам, вызывающим от 25 до 60% случаев острых кишечных инфекций (Roman Е., 2003; Parashar U. et al., 2003; Feeney S.A. et al., 2006). От тяжелой ротавирусной диареи в мире ежегодно умирают до 2 млн. человек, большинство из которых составляют дети первых лет жизни (Bryce J. et al., 2005; Podewils L. et al., 2005; Parashar U. et al., 2006; Santosham M. et al., 2007). Ротавирусная инфекция распространена повсеместно и наносит существенный вред здоровью населения как развитых, так и развивающихся стран, обусловливая прямые и непрямые экономические затраты, оценивающиеся сотнями миллиардов долларов в год (Parashar U. et al., 2003; Fischer Т. et al., 2007).

Установлено значительное генетическое разнообразие и изменчивость ротавирусов, географические и сезонные различия циркулирующих генотипов со сменой доминирующих и эпидемически значимых генотипов. В настоящее время идентифицировано 27 Р- и 15 G-генотипов ротавирусов группы А, из них 14 Р- и 10 G-генотипов вызывают острый гастроэнтерит у человека (Gentsch J., 2005; Banyai К. et al., 2007; Macedo С. et al., 2007; Le V. et al., 2008). Проведение мониторинга за циркуляцией ротавирусов разных [PJG-генотипов и знание антигенного спектра ротавирусов, распространенных на той или иной территории, необходимо для создания поливалентной вакцины и оценки уже

разработанных вакцин (Santos N., 2005; Vesikari T. étal, 2006; GlassR., 2006; Parashar U., 2006; Dennehy P., 2008).

Проведенные к настоящему времени в нескольких регионах Российской Федерации исследования циркуляции генетических вариантов ротавирусов охватывали только госпитализированных городских жителей (Новикова H.A., 2007; Жираковская Е.В., 2007; Подколзин А.Т., 2008) и не распространялись на амбулаторных пациентов и жителей сельских территорий. В Омском регионе на момент планирования настоящей работы эпидемиологические и молекулярно-генетические особенности ротавирусной инфекции углубленно изучались рядом авторов лишь применительно к перинатальным центрам в аспекте внутрибольничной инфекции.

Цель исследования: Совершенствование системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в Омской области с учетом региональных особенностей.

Задачи исследования:

1. Изучить этиологическую структуру и проявления эпидемического процесса острых кишечных инфекций в Омской области за период с 1993 по 2007 гг.

2. Изучить проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции в Омской области за период с 1993 по 2007 гг. и определить территории риска, группы риска, время риска и факторы риска.

3. Изучить генетическое разнообразие ротавирусов, циркулирующих на территории Омской области.

4. Разработать предложения по оптимизации системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции с учетом региональных особенностей.

Научная новизна

В работе продемонстрирована ведущая роль ротавирусов группы А в этиологической структуре острых кишечных инфекций на территории Омской области, представлены новые данные о возрастных и социальных характеристиках поражаемых контингентов, выявлены различия внутригодовой динамики заболеваемости детского и взрослого населения. Проведено ранжирование административных территорий по уровню заболеваемости ротавирусной инфекцией, выявлены сельские районы со стабильно высоким уровнем заболеваемости и установлены причины, его определяющие. Впервые дана оценка роли ротавирусов в формировании вспышечной заболеваемости населения Омской области острыми кишечными инфекциями.

Установлены территориальные, сезонные и возрастные особенности циркуляции различных генотипов ротавирусов группы А в населении г. Омска и сельских районов Омской области. Выявлены штаммы ротавирусов группы А с уникальными геномными характеристиками.

Практическая значимость

На основании проведенных исследований были разработаны предложения по совершенствованию системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции для регионального уровня реализации, позволившие улучшить этиологическую расшифровку острых кишечных инфекций и совершенствовать профилактику ротавирусной инфекции.

По результатам исследований подготовлены:

- Эпидемиологический надзор и контроль ротавирусной инфекции в Омской области : методические рекомендации МР 3.1.1.003-10, утвержденные главным государственным санитарным врачом по Омской области 27.09.2010 г.;

- Эпидемиологический надзор за ротавирусной инфекцией в лечебно-профялактических учреждениях для новорожденных и детей первого года жизни : методические указания МУ 3.1.6.007-04, утвержденные главным государственным санитарным врачом по Омской области 05.05.2004 г.;

-«Комплексный план мероприятий по профилактике острых кишечных заболеваний, иерсиниозов и вирусного гепатита А на территории Омской области на 2006-2010 гг.», утвержденный Постановлением санитарно-противоэпидемической комиссии Правительства Омской области № 4 от

05.12.2006 г.;

- Постановление Главного государственного санитарного врача по Омской области № 7 от 25.05.2010 г. «О профилактике острых кишечных инфекций»;

- «О дополнительных профилактических и противоэпидемических мероприятиях по ротавирусной инфекции», «О лабораторной диагностике ротавирусной инфекции», «О состоянии заболеваемости ротавирусной инфекции в Омской области в 2007 г. и мерах ее профилактики» -информационно-методические письма № 10564 от 15.12.2006 г., № 775 от

01.02.2007 г., № 3069 от 15.04.2008 г.

В ОепВапк зарегистрированы 82 нуклеотидные последовательности изолятов ротавирусов группы А, циркулировавших на территории Омской области в 2007-2008 гг.

Материалы исследования и разработанные на их основе региональные методические рекомендации используются в деятельности Управления

Роспотребнадзора по Омской области, ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Омской области», в работе лечебно-профилактических учреждений, в учебно-педагогическом процессе кафедры эпидемиологии, микробиологии, вирусологии и иммунологии, Центра повышения квалификации и профессиональной переподготовки специалистов ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава».

Положения, выносимые на защиту:

1. Ротавирусы группы А являются ведущими возбудителями острых кишечных инфекций установленной этиологии на территории Омской области. Проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции в Омской области имеют региональные особенности.

2. Циркулировавшие в регионе ротавирусы группы А характеризовались выраженной вариабельностью генотипов в многолетней динамике и в распределении по административным территориям и поражаемым контингентам населения.

3. Приоритетным направлением повышения эффективности эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в современных условиях следует рассматривать совершенствование подходов к организации и проведению микробиологического мониторинга популяции возбудителя инфекции.

Апробация работы

Диссертационная работа апробирована на совместном заседании проблемной комиссии «Гигиена, экология, эпидемиология, общественное здоровье и здравоохранение» и кафедр эпидемиологии, микробиологии, вирусологии и иммунологии, гигиены с курсом гигиены детей и подростков, медицинской экологии с курсами гигиены питания и радиационной гигиены, общественного здоровья и здравоохранения с курсами истории медицины и биомедицинской этики, медицины труда и профзаболеваний ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава» (2010).

Основные положения диссертации доложены и обсуждены на:

-VII межрегиональной научно-практической конференции с

международным участием, посвященной 85-летию образования

Государственной санитарно-эпидемиологической службы Российской

Федерации «Актуальные проблемы обеспечения санитарно-

эпидемиологического благополучия населения», Омск, 2007; th

- 26 Annual Meeting of the European Society for Paediatric Infectious Diseases (ESPID), Graz, Austria, 2008;

-совместном заседании Омских отделений Национального научного медицинского общества гигиенистов и санитарных врачей и Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов, Омск, 2008;

-VIII межрегиональной научно-практической конференции с международным участием, посвященной 70-летию медико-профилактического факультета Омской государственной медицинской академии «Актуальные проблемы сохранения здоровья населения Сибири», Омск, 2008;

- конференциях и совещаниях специалистов здравоохранения регионального и муниципального уровней.

По теме диссертации опубликовано 12 научных работ, из них 2 - в изданиях, рекомендованных Высшей аттестационной комиссией Министерства образования и науки Российской Федерации для публикаций основных положений диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук.

Структура и объем работы

Диссертация изложена на 176 страницах текста компьютерного набора, содержит введение, обзор литературы, материалы и методы исследования, главу собственных исследований, заключение, выводы и практические рекомендации, иллюстрирована 12 таблицами и 42 диаграммами. Список литературы включает 69 источников на русском языке и 126 иностранных источников. Диссертация выполнена в соответствии с планом научно-исследовательской работы Омской государственной медицинской академии, номер государственной регистрации 01.200402778.

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

Материалы и методы исследования

В работе использованы данные статистических отчетных форм №№ 2, 2-06 (6-96; 6-03; 6-05), 23 (23-06) Управления Роспотребнадзора по Омской области за 1993-2007 гг., регистрационные карты экстренных извещений (ф. 058/у) и карты эпидемиологического обследования очагов ротавирусной инфекции (ф. 257/у), а также данные Территориального органа Федеральной службы государственной статистики о численности различных возрастных групп населения области за 1993-2007 гг.

В исследование были включены 38395 больных острыми кишечными инфекциями, находившихся на амбулаторном или стационарном лечении в

лечебно-профилактических учреждениях г. Омска и сельских районов области. Ретроспективный анализ заболеваемости населения ротавирусной инфекцией основан на изучении 10733 случаев манифестной формы инфекции, зарегистрированных с 1993 по 2007 гг., в том числе 6737 случаев в областном центре и 3996 в сельских районах Омской области, а также результатов обследования 11717 контактных лиц из очагов ротавирусной инфекции и 7693 человек, обследованных на антиген ротавирусов с профилактической целью (медицинские работники детских больниц и отделений, родильных домов, работники молокоперерабатывающих предприятий г. Омска и сельских районов Омской области, беременные во второй половине беременности).

С целью выделения антигена ротавирусов из объектов окружающей среды исследованы 542 пробы воды источников централизованного водоснабжения, 31 проба воды источников децентрализованного водоснабжения, 110 проб воды открытых водоемов, 482 пробы сточных вод, 718 проб продовольственного сырья и продуктов питания, 589 смывов с объектов внешней среды.

Для проведения лабораторных исследований материал транспортировался в лаборатории в условиях «холодовой цепи» с последующим хранением при температуре минус 70°С. Детекция антигенов ротавирусов проводилась в вирусологической лаборатории ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Омской области» (совместно с к.м.н. Логиновских Н.В.) методом иммуноферментного анализа с использованием тест-систем для выявления антигена ротавируса группы А «Рота - Антиген» НПО «Аквапаст» (г. Санкт-Петербург) и «Ротавирус-антиген-ИФА-БЕСТ» ЗАО «ВЕКТОР-БЕСТ» (г. Новосибирск).

С целью генетической идентификации выделенных ротавирусов образцы фекалий от 250 больных из 27 сельских районов Омской области и г. Омска, содержащие антиген ротавируса группы А, отобранные методом случайной выборки за период с января 2007 г. по май 2008 г., были исследованы методом мультиплексной ОТ-ПЦР в лаборатории разработки средств экстренной профилактики Федерального государственного учреждения науки государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора Новосибирской области (совместно с д.б.н. Н.В.Тикуновой, к.б.н. Е.В. Жираковской). Работа была выполнена в рамках проекта МНТЦ ВТЕР 58 / ISTC 2935 р - «Эпидемиология вирусных кишечных инфекций в России: разработка новых подходов для выявления и характеристики возбудителей» (руководитель академик РАМН, д.м.н. В.В. Малеев). Секвенирование трех фрагментов генома, кодирующих структурные белки VP4,

VP6 и VP7 ротавирусов, выполнено на автоматическом анализаторе CEQ™2000XL DNA Analysis System (Beckman, США) в ЦКП «Секвенирование ДНК» Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН (г. Новосибирск, совместно с д.б.н. Н.В.Тикуновой, к.б.н. Е.В. Жираковской). Определены нуклеотидные последовательности исследуемых фрагментов генома для 37 изолятов ротавирусов различных генотипов, выявленных в Омской области. Полученные 82 нуклеотидные последовательности зарегистрированы в GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html).

Изучение проявлений эпидемического процесса ротавирусной инфекции на территории Омской области проводилось по следующим параметрам: удельный вес в структуре заболеваемости, уровень, многолетняя и внутригодовая динамика заболеваемости, интенсивность эпидемического процесса в различных территориях и социально-возрастных группах населения.

Количественные данные представлены в виде средних величин (средняя арифметическая, медиана). Для проверки статистических гипотез использовались t-критерий, критерии %2, <р Фишера при 5% критическом уровне значимости нулевой гипотезы. Направление и сила связи между явлениями определялись с помощью коэффициента корреляции Пирсона и Спирмена. Для оценки распределения показателей в интервальном ряду применялась метод персентилей. Обработка данных проводилась с использованием Microsoft Excel

2000 и Statistica 6.0.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

За период 1993-2007 гг. заболеваемость острыми кишечными инфекциями (ОКИ) на территории Омской области составила 469,3+4,68°/оооо и имела умеренно выраженную тенденцию к снижению (Тсн. = - 2,35%; р<0,001), как и заболеваемость ОКИ неустановленной этиологии (231,8+3,30°/оооо'> Тсн. = — 2,26%; р<0,001). Заболеваемость ОКИ установленной этиологии (114,5+2,32°/оооо) за аналогичный период, напротив, возросла (Тпр. = + 6,87%, р<0,001).

2001 гг. доля ОКИ неустановленной этиологии увеличилась на 13,4%

(Тпр. = + 1,57%; р<0,001), а в период 2002-2007 гг. снизилась на 20,8% (Тсн. = - 2,3%; р<0,001).

Многолетняя динамика показателей заболеваемости ОКИ неустановленной этиологии соответствовала таковой при шигеллезах (г5 = + 0,78; р<0,001) и сальмонеллезах (г5 = + 0,80; р<0,001), что объясняется общностью происхождения заболеваемости указанными инфекциями и/или отнесением неверифицированной части случаев шигеллезов и сальмонеллезов к ОКИ неустановленной этиологии. В период с 2001 года, одновременно с улучшением лабораторной диагностики ротавирусной инфекции, прослежена обратная статистическая связь между уровнем заболеваемости населения ротавирусной инфекцией и ОКИ неустановленной этиологии (г3 = - 0,63; р<0,05).

В структуре ОКИ на территории области доля ротавирусной инфекции возросла с 0,03+0,02% в 1993 г. до 26,4+0,45% в 2007 г., а среди ОКИ установленной этиологии с 0,2+0,11% до 57,4+0,74% соответственно.

В динамике заболеваемость населения Омской области ротавирусной инфекцией увеличилась (Тпр. = + 22,95%; р<0,001) и имела более выраженный темп прироста, чем в целом по РФ (Тпр. по РФ = + 17,41%; рис. 1).

О,' ■0000

1993 1994 1995 1996 199" 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 20052006 200' ■■ РФ «к» Омская область — Полиномиальная (РФ) -Полиномиальная (Омская область)

Рис. 1. Динамика заболеваемости ротавирусной инфекцией населения Омской области и Российской Федерации в 1993 - 2007 гг. (на 100 тыс. населения)

Причинами роста заболеваемости населения Омской области ротавирусной инфекцией стало не только истинное увеличение ежегодного числа

заболевших, но и регистрационный рост за счет увеличения охвата лабораторным обследованием лиц с подозрением на ОКИ, главным образом, детей в возрасте до 3-х лет: между уровнем заболеваемости ротавирусной инфекцией и количеством обследованных на антиген ротавируса прослежена сильная прямая корреляционная связь (rs = + 0,96, р < 0,001).

Тенденция к росту заболеваемости ротавирусными гастроэнтеритами была выражена как в областном центре, так и в сельских районах Омской области (Тпр. = + 21,26% ; р<0,001, и Тпр. = + 25,69%; р<0,001, соответственно). При этом, в г. Омске уровень заболеваемости был в 1,3 раза выше, чем в сельских районах (39,1+1,83°/оооо и 28,8+1,73°/00оо соответственно; р<0,05). В структуре заболевших ротавирусным гастроэнтеритом на долю городского населения пришлось 62,8%.

С момента охвата диагностическим обследованием на ротавирусную инфекцию заболевших ОКИ во всех административных территориях Омской области (2005 г.), в шести сельских районах (Знаменский, Калачинский, Кормиловский, Омский, Тарский, Усть-Ишимский) и г. Омске среднемноголетние показатели заболеваемости ротавирусной инфекцией существенно превысили среднеобластной показатель.

Одной из причин высокого уровня заболеваемости населения ротавирусной инфекцией в сельских районах послужило неудовлетворительное качество воды, подаваемой населению для питьевых и хозяйственных целей (rs = 0,457; р=0,009). За период наблюдения в районах области отмечался высокий удельный вес нестандартных проб воды на водопроводах по микробиологическим (22-47%) и санитарно-химическим показателям (22-89%).

Уровень заболеваемости ротавирусной инфекцией населения Омской области определялся в основном заболеваемостью детей. Данные официальной регистрации наиболее адекватно отражают интенсивность эпидемического процесса именно в этой возрастной группе населения. Среднемноголетний показатель заболеваемости в группе детей до 14 лет составил 204,7±7,04°/оооо и превысил аналогичный показатель у взрослых в 146 раз (1,4+0,29°/оооо; р<0,001). В то же время, частота обнаружения антигена ротавируса у детей с подозрением на ОКИ оказалась всего в 3,0 раза выше, чем среди обследованных с диагностической целью взрослых (39,0% против 13,0%), а среди контактных - только в 2,0 раза (17,1% детей и 8,6% взрослых соответственно).

Наибольшими показатели заболеваемости гастроэнтеритами ротавирусной этиологии были у детей первого (1250,1±79,670/оооо) и второго (739,7±42,07°/оооо) года жизни, что позволило отнести их группами риска.

Среднемноголетние показатели заболеваемости ротавирусной инфекцией различных возрастных групп детей в г. Омске превышали аналогичные показатели заболеваемости детей сельских районов в 1,5-2,5 раза (р<0,05). В то же время аналогичный показатель у взрослых в сельских районах превысил таковой взрослого населения г. Омска в 5,4 раза (2,7+0,59 и 0,5+0,22°/оооо, соответственно, р<0,05).

Выявлены различия в показателях заболеваемости ротавирусной инфекцией детей в возрастной группе 1-2 лет, посещавших и не посещавших дошкольные образовательные учреждения (соответственно 530,6+79,63 и 799,6±48,90°/оооо; р<0,05), и отсутствие таковых различий у детей 3-6 лет (соответственно 141,7±16,27и 156,4+19,710/00оо; р>0,05).

Среди взрослого населения наиболее высокие показатели заболеваемости отмечались в возрастных группах с 15 до 35 лет (7,8±1,190/00оо) и лиц 60 лет и старше (3,0±0,87°/оооо). что согласуется с данными других авторов (Б.Я. Васильев, 2000; Сагалова, 2009). Полученные результаты подтвердили данные ряда авторов (Б.Я. Васильев, 2000; И.П. Повиличенко, 2006) о том, что группами повышенного риска заболевания ротавирусной инфекцией являются работники детских дошкольных и лечебно-профилактических учреждений. В нашем исследовании заболеваемость этих профессиональных групп была в 2,0-4,5 раза выше заболеваемости прочего взрослого населения (р<0,05).

Во внутригодовой динамике заболеваемости населения ротавирусной инфекцией была выявлена отчетливая зимне-весенняя сезонность (с января по июнь). Активизация эпидемического процесса в холодные месяцы календарного года была характерной для всех возрастных групп населения, однако доля сезонной заболеваемости среди детей в возрасте 1-2 лет (61,1+0,77%) оказалась более значительной, нежели среди детей прочих возрастных групп и взрослых (р<0,05). Сезонный подъем заболеваемости ротавирусной инфекцией детей в возрасте до 6 лет отмечался с января по июнь, тогда как у детей 7-14 лет и взрослых имели место два эпидемических подъема: первый, менее интенсивный, в сентябре-октябре, и второй - с конца января по май (рис. 2).

В зимне-весенний период первыми в эпидемический процесс ротавирусной инфекции вовлекались дети до 1 года, затем взрослые, далее, практически одновременно, дети 1-2 и 3-6 лет, не посещающие дошкольные

образовательные учреждения, несколько позднее - дети 3-6 лет, посещающие дошкольные образовательные учреждения, и в последнюю очередь - дети 7-14 лет. Более интенсивный и продолжительный сезонный подъем заболеваемости ротавирусной инфекцией отмечался у детей с 1 года до 2-х лет и детей 3-6 лет, посещающих дошкольные образовательные учреждения.

250.0

100.0

VIH IX X XI XII I II III IV V VI VII —л— 7-14 лег —ища 15 лег и старше ——

Рис. 2. Внутригодовая динамика заболеваемости ротавирусной инфекцией в различных возрастных группах населения (по индексам сезонных колебаний, %)

Интенсивность эпидемического процесса ротавирусной инфекции на территории Омской области определялась спорадической заболеваемостью. Доля вспышечной заболеваемости в целом за период наблюдения составила лишь 3,3+0,17%. Тем не менее, за период с 2005 по 2007 гг. (с начала официальной регистрации вспышек ротавирусной этиологии в форме статистической отчетности № 23 «Сведения о вспышках инфекционных заболеваний») 27 из 57 вспышек ОКИ были ротавирусной этиологии, а удельный вес заболевших при этих вспышках составил 5,4+0,28% от общего числа зарегистрированных за эти годы случаев ротавирусной инфекции.

Большая часть случаев групповой заболеваемости ротавирусной инфекцией (21 из 27 эпидемических вспышек) была зарегистрирована в детских дошкольных и лечебно-профилактических учреждениях. Среди населения возникло шесть вспышек ОКИ ротавирусной этиологии, причем все были зарегистрированы в сельских районах и обусловлены повышением активности водного пути передачи возбудителя.

В лечебно-профилактических, дошкольных образовательных учреждениях г. Омска и сельских районов реализовывался преимущественно контактно-бытовой путь вследствие несвоевременного выявления и изоляции первых заболевших и других нарушений санитарно-противоэпидемического режима. Контактно-бытовой характер вспышек был реализован в 21 из 27 случаев групповой заболеваемости, водный - в пяти, пищевой - в одной вспышке.

При обследовании объектов внешней среды антиген ротавируса выявлялся в 7,2+1,95% случаев, в т.ч. в пробах из водных объектов в 10,0+1,15% случаев: в воде открытых водоемов - в 15,5+3,45%; в воде централизованного и децентрализованного водоснабжения - в 9,0+1,23% и 6,5+4,41% случаев соответственно, в пищевых продуктах - в 7,4+0,98% случаев, в смывах с объектов в дошкольных образовательных и лечебно-профилактических учреждениях в 5,3+0,92% случаев, что указывает на разнообразие путей передачи ротавирусов и их роль в распространении ротавирусной инфекции.

В образцах фекалий от заболевших ОКИ антигены ротавирусов обнаруживались у 37,3+0,96% обследованных, среди контактных лиц в очагах ротавирусной инфекции - в 9,3±1,04% случаев. Положительные находки у обследованных с профилактической целью здоровых лиц имели место в 4,2+0,89% случаев. Множественность источников инфекции, в том числе бессимптомное вирусоносительство, в совокупности с высокой контагиозностью и малой инфицирующей дозой, являются основной причиной

высокого уровня спорадической заболеваемости и в значительной степени определяет очаговость и групповую заболеваемость ротавирусной инфекцией.

Одним из основных направлений эпидемиологического надзора за ротавирусной инфекцией является изучение циркуляции доминирующих' штаммов ротавирусов. Среди циркулировавших в 2007 и 2008 гг. на территории Омской области ротавирусов группы А (табл.) преобладали вирусы генотипа (36,0±3,04%).

Таблица

[Рекомбинации генотипов изолятов ротавирусов группы А, выделенных от

больных ОКИ в Омской области в 2007-2008 гг. (абс.; %)

Генотипы 02 вз й9 С1-Ю2 С1-К33 01+64 и/т* Всего %

Р[4] 37 2 1 40 16,0

Р[6] 1 1 0,4

Р[8] 76 5 74 1 1 1 2 3 163 65,2

Р[9] 3 3 1,2

н/т* 14 6 23 43 17,2

Всего 90 37 8 81 1 3 1 2 27 250 100,0

% 36,0 14,8 3,2 32,4 0,4 1,2 0,4 0,8 10,8 100,0

* - нетипируемые изоляты

Вторым по частоте обнаружения был генотип 04 (32,4±2,96%), далее следовали генотипы 02 (14,8±2,25%) и вЗ (3,2±1,11%). Среди Р-генотипов доминировал Р[8] (65,2±3,01%). Генотип Р[4] был выявлен в 16,0±2,32% случаев, генотипы Р[6] и Р[9] определялись в единичных изолятах. Часть изолятов не была идентифицирована по в (10,8±1,96%) и Р (17,2±2,39%) генотипам.

Спектр ротавирусов был представлен одиннадцатью [Рекомбинациями (рис. 3). Преобладали широко распространенные во всем мире генотипы Р[8]С1 (30,4±2,91%) и Р[8]04 (29,6±2,89%). Далее следовали генотипы Р[4]в2 (14,8±2,25%), Р[8]СЗ (2,0±0,89%) и Р[9]СЗ (1,2±0,69%). Генотипы Р[4]02Л31, Р[6]С4, Р[8]01/02, Р[8]СЛ/СЗ, Р[8]С4Л31, Р[8]С9 бьши выявлены в единичных случаях. В то же время, 9,2±1,83% изолятов не были идентифицированы по [Р]в типам, что позволило отнести их к редко встречающимся штаммам ротавирусов.

прочг-14.04

неггтп-

руемые 9.2%

Р[8]03 2,0%

Р[8]01 30.4%

Р[4]й2 14.8» о

1_Р[8]04

29.6%

Рис. 3. Распределение ротавирусов группы А, изолированных от заболевших на территории Омской области в 2007-2008 гг., по [Р]в типам (в %)

Результаты генотипирования позволяют говорить об особенностях в распределении генотипов ротавирусов на территории области. Так, генотип Р[8]01 преобладал в сельских районах (44,1±4,03%), тогда как в г. Омске на его долю пришлось 9,2±2,92% выделенных изолятов (р<0,05). В областном центре доминировал генотип Р[8]в4 (51,0±5,05%), в сельских районах частота его выявления составила 15,8±2,96% (р<0,05). Имелись территориальные отличия и в распределении других генотипов ротавирусов. Генотип Р[8]в1 в 2007-2008 гг. доминировал в 14 из 32 сельских районов области; в двух сельских районах (Москаленском и Русско-Полянском) превалировал !'[4]02, в Горьковском и Оконешниковском районах - Р[8]04. В девяти сельских районах циркулировали ротавирусы разных генотипов примерно в одинаковом соотношении. В трех сельских районах (Исилькульском, Муромцевском и Называевском) была высока доля нетипируемых изолятов (от 30 до 60%).

В динамике доля генотипа Р[8]в1 уменьшилась с 55,6±5,24% в эпидемический сезон 2007 г. до 16,9±2,96% в эпидемический сезон 2008 г. (р<0,05) и, напротив, возросла значимость генотипа Р[8]С4 с 10,0±3,16% до 40,0±3,87% (р<0,05). Динамические изменения отмечались и в отношении частоты выявления генотипа Р[4]в2 (10,0±3,16 и 17,5±3,00% соответственно).

Выявлены особенности в частоте обнаружения [Р]С-генотипов ротавирусов группы А в различных возрастных группах заболевших: генотип Р[8]в1 доминировал у детей первого и третьего года жизни, а также среди взрослых; генотип Р[8]в4 - в возрастных группах 1-2 г. и 3-6 лет.

Лабораторное обследование на ротавирусы больных ОКИ до недавнего времени проводилось по клиническим и эпидемиологическим показаниям, перечень которых не был четко регламентирован, в связи с чем регистрируемая заболеваемость и учтенное носительство ротавирусов не в полной мере отражали интенсивность эпидемического процесса. Изменение подходов к организации микробиологического мониторинга значительно улучшило расшифровку ротавирусной инфекции в Омской области и позволило выделить территории, группы риска и отследить происходящие изменения в популяции возбудителя и хозяина.

Полученные результаты исследования позволили внести ряд предложений по совершенствованию информационно-аналитической подсистемы эпидемиологического надзора за ротавирусной инфекцией и конкретизировать его схему. Разработанные предложения были оформлены в виде региональных методических рекомендаций (Омск, 2010). Мониторинг циркулирующих генотипов ротавирусов стал важным элементом системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции, необходимым для расшифровки групповой заболеваемости ротавирусной инфекцией и решения вопросов планирования специфической профилактики.

Результаты эпидемиологического анализа позволили определить направления совершенствования и критерии эффективности системы управления эпидемическим процессом ротавирусной инфекции:

■ разработка единых критериев диагностики ротавирусной инфекции;

■ упорядочение регистрации и учета, их унификация на различных административных территориях Омской области;

■ улучшение этиологической расшифровки ОКИ за счет расширения круга лиц, подлежащих обследованию на ротавирусы, а также внедрения новых современных методов идентификации ротавирусов;

■ предупреждение групповой заболеваемости ротавирусной инфекции в организованных коллективах и среди населения;

■ снижение индекса очаговости;

■ снижение удельного веса заболеваемости, обусловленной влиянием сезонного фактора;

■ отсутствие случаев летального исхода при ротавирусной инфекции.

выводы

1. Структура заболеваемости населения острыми кишечными инфекциями на территории Омской области за период 1993-2007 гг. характеризовалась снижением удельного веса бактериальной дизентерии и сальмонеллезов одновременно с уменьшением доли острых кишечных инфекций неустановленной этиологии. На фоне увеличения охвата населения лабораторным обследованием доля ротавирусной инфекции в структуре острых кишечных инфекций на территории Омской области увеличилась к концу периода наблюдения до 26,3%, определив ее ведущее значение.

2. Заболеваемость населения ротавирусной инфекцией в динамике характеризовалась выраженной тенденцией к росту (Тпр.= + 22,95%, р<0,001) с большей интенсивностью эпидемического процесса в городе Омске по сравнению с таковой в сельской местности (р<0,05). Территориями риска стали г. Омск и шесть сельских районов Омской области (Знаменский, Калачинский, Кормиловский, Омский, Тарский, Усть-Ишимский).

3.Во внутригодовой динамике заболеваемости населения области ротавирусной инфекцией была выявлена зимне~весенняя сезонность, при этом выраженный ежегодный сезонный подъем заболеваемости у детей в возрасте до 6 лет отмечался с января по июнь, тогда как у детей 7-14 лет и взрослых имели место два эпидемических подъема: в сентябре-октябре и январе - мае.

4. Группами риска заболеваемости ротавирусной инфекцией являлись дети первого года жизни (1250,1±79,67°/оооо), не посещавшие дошкольные образовательные учреждения дети второго года жизни (799,6±48,90°/ооооХ а также работники детских дошкольных образовательных и лечебно-профилактических учреждений, заболеваемость которых была в 2,5-4,5 раза выше (р<0,05) по сравнению с прочими категориями взрослого населения.

5. Заболеваемость ротавирусной инфекцией населения Омской области носила преимущественно спорадический характер. В то же время, в период с 2005 по 2007 гг. 27 из 57 всех вспышек острых кишечных инфекций были ротавирусной этиологии. При групповой заболеваемости в лечебно-профилактических и дошкольных образовательных учреждениях области реализовывался преимущественно контактно-бытовой путь распространения возбудителя, тогда как среди сельского населения преобладал водный путь.

6. На территории Омской области циркулировали ротавирусы группы А одиннадцати [P]G типов с преобладанием в сельских районах генотипа P[8]G1 (44,1% изолятов), в г. Омске - P[8]G4 (51,0% изолятов). За период наблюдения

произошла смена доминирующих геновариантов: снизилась доля P[8]G1 с 55,6% в эпидемический сезон 2007 г. до 16,9% в эпидемический сезон 2008 г. (р<0,05) и, напротив, рост P[8]G4 с 10,0% до 40,0% (р<0,05).

7. Совершенствование подходов к организации микробиологического мониторинга позволило повысить качество эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в регионе.

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

1. Шахова, Т.А. Анализ заболеваемости населения ротавирусной инфекцией в Кировском административном округе г. Омска / Т.А. Шахова, М.Г. Горбунова, В.М. Миленина II Актуальные проблемы обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения : материалы IV межрегион, науч.-практ. конф. с междунар. участием. - Омск, 2003. - Т. 2. - С. 316-318.

2. Богомолов, О.В. О результатах расследования вспышки острых кишечных инфекций среди населения Калачинского района Омской области / О.В. Богомолов, М.А. Вайтович, М.Г. Горбунова // Актуальные вопросы здоровья населения Сибири: гигиенические и эпидемиологические аспекты : материалы VI межрегион, науч.-практ. конф. - Омск, 2006. - С. 101-106.

3. Горбунова, М.Г. Актуальные проблемы заболеваемости ротавирусной инфекцией в Омской области / М.Г. Горбунова, О.В. Богомолов, М.А. Вайтович // Актуальные вопросы здоровья населения Сибири: гигиенические и эпидемиологические аспекты : материалы VI межрегион, науч.-практ. конф. -Омск, 2006.-С. 110-112.

4. Анализ заболеваемости ротавирусной инфекцией и циркуляции ротавирусов разных типов на территории Омской области / М.Г. Горбунова, Н.В. Тикунова, Е.В. Жираковская и др. // Актуальные проблемы обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения : материалы VII межрегион, науч.-практ. конф. с междунар. участием. - г. Омск, 2007 г. - С. 115 -118.

5. Эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Омской области I М.Г. Горбунова, М.А. Вайтович, В.М. Миленина и др. // Материалы IX съезда всероссийского науч.-практ. общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов. - Москва, 2007. - С. 141.

6. Epidemiological profile of rotavirus infection in Western Siberia, Russia, July 2003 - December 2007: diversity of group A rotavirus genotypes / E.

Zhirakovskaya, S. Bodnev, A. Tikimov, M. Gorbunova et al. // 26th Annual Meeting of the European Society for Paediatric Infectious Diseases (ESPID). - 13-17 May 2008. - Graz, Austria. - P. 402.

7. Полянская, H.A. Клинико-эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции у детей раннего возраста / H.A. Полянская, М.Г. Горбунова // Актуальные вопросы инфекционной патологии : материалы ЕвроАзиатского конгресса по инфекц. болезням. - Витебск, 2008. - С. 163.

8. Роль ротавирусов в этиологической структуре острых кишечных инфекций и клиническая картина гастроэнтеритов, обусловленных ротавирусами генотипа P8G4, у пациентов детского инфекционного стационара / М.Г. Горбунова, H.A. Полянская, B.JI. Стасенко и др. // Актуальные проблемы сохранения здоровья населения Сибири : материалы VIII межрегион, науч,-практ. конф. с междунар. участием. - Омск, 2008. - С. 203 -205.

9. Характеристика эпидемического процесса ротавирусной инфекции на территории Омской области в 1993-2007 годах / М.Г. Горбунова, Е.В. Жираковская, Н.В. Тикунова и др. // Сибирский медицинский журнал. - 2008. -Т. 82,-№7.-С. 113-116.

10. Эпидемиологическая характеристика и особенности этиологии ротавирусной инфекции в Омской области / М.Г. Горбунова, Н.В. Тикунова, Е.В. Жираковская и др. // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2008. -№6.-С. 36-39.

11. Особенности этиологии ротавирусной инфекции в Омской области / М.Г. Горбунова, B.JI. Стасенко, М.А. Вайтович и др. // Актуальные проблемы природной очаговости болезней : материалы всероссийской конф. с междунар. участием. - Омск, 2009. - С. 225 -226.

12. Ротавирусная инфекция в Омской области / М.Г. Горбунова, В.Л. Стасенко, М.А. Вайтович и др. // Проблемы инфекционной патологии в Уральском регионе : сборник работ III окружной науч.-практ. конф. -Екатеринбург, 2010. - С. 113-118.

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И ОБОЗНАЧЕНИЙ

ОКИ - острые кишечные инфекции

ФГУЗ - федеральное государственное учреждение здравоохранения Т пр.(сн.) - темп прироста (снижения) за период

На правах рукописи

ГОРБУНОВА Марина Георгиевна

ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РОТАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ В ОМСКОЙ ОБЛАСТИ

14.02.02. - эпидемиология

Автореферат диссертации на соискание учёной степени кандидата медицинских наук

Омск-2010

Подписано в печать 23.11.2010 г. Формат 60x84/16 Бумага офсетная Пл.-1,0 Способ печати - оперативный Тираж 100

Издательско-полиграфический центр ОмГМА 644050, г. Омск, пр. Мира, 30, т. 69-32-72

Оглавление диссертации Горбунова, Марина Георгиевна :: 2010 :: Омск

Список сокращений

Введение.

ГЛАВА 1. Ротавирусная инфекция: этиология, эпидемиология, профилактика (обзор литературы).

ГЛАВА 2. Материалы и методы.

ГЛАВА 3. Эпидемиологическая характеристика, эпидемиологический надзор и контроль ротавирусной инфекции в Омской области.

3.1. Острые кишечные инфекции в структуре инфекционной заболеваемости населения Омской области.

3.1.1. Этиология острых кишечных инфекций в Омской области

3.1.2. Проявления эпидемического процесса острых кишечных инфекций в Омской области.

3.1.2.1. Проявления эпидемического процесса шигеллезов.

3.1.2.2. Проявления эпидемического процесса сальмонеллезов.

3.1.2.3. Проявления эпидемического процесса острых кишечных инфекций неустановленной этиологии.

3.2. Эпидемиологические особенности ротавирусной инфекции в Омской области.

3.2.1. Проявления эпидемического процесса ротавирусной инфекции в Омской области.

3.2.1.1. Многолетняя динамика заболеваемости ротавирусной инфекцией. 58 *

3.2.1.2. Внутригодовая динамика заболеваемости ротавирусной инфекцией.

3.2.1.3. Интенсивность эпидемического процесса ротавирусной инфекции в различных возрастных и социально-профессиональных группах.

3.2.1.4. Групповая заболеваемость ротавирусной инфекцией населения Омской области и в организованных коллективах г. Омска и сельских районов.

3.2.1.5. Изучение распространенности ротавирусов среди населения и во внешней среде на территории Омской области.

3.2.2. Генетическое разнообразие ротавирусов группы А ([Р]6 генотипы), циркулировавших на территории Омской области в 2007-2008 гг.

3.3. Эпидемиологический надзор и контроль ротавирусной инфекции в Омской области.

Введение диссертации по теме "Эпидемиология", Горбунова, Марина Георгиевна, автореферат

Актуальность проблемы

Острые кишечные инфекции представляют одну из серьезных проблем здравоохранения. По данным Всемирной организации здравоохранения, ежегодно регистрируется около миллиарда диарейных заболеваний, от которых умирает до 4 миллионов человек, причем 60-70% заболевших составляют дети до 14 лет [24, 91]. В последние годы отмечается отчетливая тенденция к изменению этиологической значимости патогенов, вызывающих острые кишечные инфекции [8, 94, 95, 112]. Международные исследования показывают, что 50-80% диарей может быть обусловлено различными вирусами (ротавирусами, норовирусами, астровирусами и др.), которые поражают преимущественно тонкую кишку и вызывают водянистую диарею [98, 153]. Ведущая роль среди них принадлежит ротавирусам, которые обусловливают от 25 до 60% всех случаев острых кишечных инфекций, а от тяжелой ротавирусной диареи в мире ежегодно умирают до 2 млн. человек [91, 153, 154, 175]. Особенно высоки показатели смертности в развивающихся странах. Ротавирусная инфекция наносит не только существенный вред здоровью населения всех стран, но и влечет за собой прямые и непрямые экономические затраты, оценивающиеся сотнями миллиардов долларов в год [95, 114, 153].

В РФ ежегодно регистрируется от 35 до 40 млн. случаев инфекционных и паразитарных заболеваний, экономические потери от которых составляют примерно 140 млрд. рублей, при этом число острых кишечных заболеваний достигает 700 тыс. случаев в год [29, 30, 49]. Рост в последние годы показателей заболеваемости острыми кишечными инфекциями, вызванных установленными бактериальными и вирусными возбудителями, в РФ обусловлен, в основном, ротавирусной инфекцией, уровень заболеваемости которой за период 1999-2009 гг. вырос практически в 7 раз, а удельный вес указанной нозологии^ в структуре острых кишечных инфекций увеличился с

1,4% до 7,0% [50]. Однако официальные данные до сих пор не отражают истинного уровня заболеваемости ротавирусными гастроэнтеритами из-за недостаточного обследования больных острыми кишечными инфекциями на ротавирусы, при этом даже у детей отмечается существенная гиподиагностика ротавирусной инфекции [15, 29, 45]. У взрослых, согласно российским данным официальной статистики, доля ротавирусной инфекции в структуре острых кишечных инфекций в 2008 г. составила 1,8%, в то время как применение иммуноферментной диагностики позволило подтвердить диагноз ротавирусной инфекции у 9,8%) больных острыми кишечными инфекциями из числа взрослых [30, 51, 54].

По данным ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, в РФ показатели заболеваемости ротавирусной инфекцией в 20072008 гг. составляли 36,6 - 49,2 на 100 тысяч населения, а среди детей в возрасте до 14 лет - более 200 на 100 тысяч детей данной возрастной группы (http://www.fcgsen.ru).

Улучшение лабораторной диагностики ротавирусной инфекции позволяет выявить повсеместное ее распространение и дает возможность изучения клинических и эпидемиологических особенностей данной инфекции в различных регионах РФ [26, 27, 36, 39, 42, 43, 44, 45, 46, 47].

Результаты крупных зарубежных обсервационных исследований и данные систематических обзоров свидетельствуют о существовании значительных географических различий в распространенности серотипов и генотипов ротавирусов, фактах их временного перераспределения, выявлении определенного количества нетипируемых штаммов. Сообщается о находках новых, эпидемически значимых вариантов ротавируса [82, 83, 118, 140, 141, 142, 165, 187]. В настоящее время идентифицировано 27 Р- и 15 G-генотипов ротавирусов группы А, из них 14 Р- и 10 G-генотипов были определены у человека [118, 174]. Проведение мониторинга за циркуляцией ротавирусов разных [PJG-генотипов и знание антигенного спектра ротавирусов, распространенных на той или иной территории, необходимо для создания поливалентной вакцины и оценки уже разработанных вакцин. Такие исследования в мире носят широкомасштабный характер [105, 114, 121, 154, 190].

Всемирная организация здравоохранения рекомендует включение оральной ротавирусной вакцины во все национальные программы иммунизации. В рамках Ротавирусной программы вакцинации (http://www.rotavirusvaccine.org) Всемирным альянсом вакцинации и иммунизации (САУ1) при сотрудничестве Всемирной организации здравоохранения с 2003 г. созданы пять региональных сетей мониторинга ротавирусного гастроэнтерита, которые охватывают более 40 стран мира. С 2005 г. Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии (Москва) принимал участие в реализации международного проекта, посвященного изучению эпидемиологии вирусных гастроэнтеритов на территории РФ [46]. Однако в ходе исследования проводилось обследование только пациентов с острыми кишечными инфекциями, госпитализированных в инфекционные стационары различных городов РФ. Ранее проведенные исследования по изучению генетических вариантов ротавирусов на европейской территории России, в Западной Сибири (Новосибирск) также охватывали только госпитализированных пациентов - городских жителей [26, 39]. В то же время изучение особенностей проявлений эпидемического процесса ротавирусной инфекции и отличие молекулярно-генетического спектра ротавирусов, циркулирующих у жителей сельских административных территорий, в литературных источниках не представлено.

В Омской области по данным государственной статистической отчетности (форма № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях») за последние 5 лет ежегодно регистрировалось от 8 до 12 тысяч случаев острых кишечных инфекций, четверть из которых -ротавирусной этиологии. Однако особенности проявлений эпидемического процесса ротавирусной инфекции, особенно в сельской местности, в регионе изучены недостаточно, тогда как ее значимость велика ввиду широкого распространения и возникновения вспышечной заболеваемости. В Омском регионе на момент планирования настоящей работы эпидемиологические и молекулярно-генетические особенности ротавирусной инфекции углубленно изучались рядом авторов лишь применительно к перинатальным центрам в аспекте внутрибольничной инфекции [37].

Цель исследования

Совершенствование системы эпидемиологического надзора и контроля ротавирусной инфекции в Омской области с учетом региональных особенностей.

Задачи исследования

1. Изучить этиологическую структуру и проявления эпидемического процесса острых кишечных инфекций в Омской области за период с 1993 по 2007 гг. I

3. Изучить генетическое разнообразие ротавирусов, циркулирующих на территории Омской области.

Научная новизна

Практическая значимость

По результатам исследований подготовлены:

- «Эпидемиологический надзор и контроль ротавирусной инфекции в Омской области» - методические рекомендации МР 3.1.1.003-10, утвержденные главным государственным санитарным врачом по Омской области 27.09.2010 г.;

- «Эпидемиологический надзор за ротавирусной инфекцией в лечебно-профилактических учреждениях для новорожденных и детей первого года жизни» - методические указания МУ 3.1.6.007-04, утвержденные главным государственным санитарным врачом по Омской области 05.05.2004 г.;

-«Комплексный план мероприятий по профилактике острых кишечных инфекций, иерсиниозов и вирусного гепатита А на территории Омской области на 2006-2010- гг.», утвержденный Постановлением санитарнопротивоэпидемической комиссии Правительства Омской области № 4 от

05.12.2006 г.;

- «О дополнительных профилактических и противоэпидемических мероприятиях по ротавирусной инфекции», «О лабораторной диагностике ротавирусной инфекции», «О состоянии заболеваемости ротавирусной инфекцией в Омской области в 2007 г. и мерах ее профилактики» -информационно-методические письма № 10564 от 15.12.2006 г., № 775 от

01.02.2007 г., № 3069 от 15.04.2008 г.

Материалы исследования и разработанные на их основе региональные методические рекомендации используются в деятельности Управления Роспотребнадзора по Омской области, Федерального государственного учреждения здравоохранения «Центр гигиены и эпидемиологии в Омской области», в работе лечебно-профилактических учреждений, в учебно-педагогическом процессе кафедры эпидемиологии и кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии, Центра повышения квалификации и профессиональной переподготовки специалистов ГОУ ВПО «Омская государственная медицинская академия Росздрава».

Положения, выносимые на защиту

Апробация работы

Основные положения диссертации доложены и обсуждены на:

-VII межрегиональной научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы обеспечения санитарноэпидемиологического благополучия населения», посвященной 85-летию образования Государственной санитарно-эпидемиологической службы

Российской Федерации, Омск, 2007; th

-26 Annual Meeting of the European Society for Paediatric Infectious Diseases (ESPID), Graz, Austria, 2008;

- VIII межрегиональной научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы сохранения здоровья населения Сибири», посвященной 70-летию медико-профилактического факультета Омской государственной медицинской академии, Омск, 2008;

- конференциях и совещаниях специалистов здравоохранения регионального и муниципального уровней.

Публикации

Структура и объем работы

Заключение диссертационного исследования на тему ""Эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Омской области""

ВЫВОДЫ

3. Во внутригодовой динамике заболеваемости населения Омской области ротавирусной инфекцией была выявлена зимне-весенняя сезонность, при этом выраженный ежегодный сезонный подъем заболеваемости у детей в возрасте до 6 лет отмечался с января по июнь, тогда как у детей 7-14 лет и взрослых имели место два эпидемических подъема: в сентябре-октябре и январе - мае.

4. Группами риска заболеваемости ротавирусной инфекцией являлись дети первого года жизни (1250,1±79,67°/оооо), не посещавшие дошкольные образовательные учреждения дети второго года жизни (799,6±48,900/оооо)> а также работники детских дошкольных образовательных и лечебно-профилактических учреждений, заболеваемость которых была в 2,5-4,5 раза выше (р<0,05) по сравнению с прочими категориями взрослого населения.

5. Заболеваемость ротавирусной инфекцией населения Омской области носила преимущественно спорадический характер. В то лее время, в период с

2005 по 2007 гг. 27 из 57 вспышек острых кишечных инфекций были ротавирусной этиологии. При групповой заболеваемости в лечебно-профилактических и дошкольных образовательных учреждениях области реализовывался преимущественно контактно-бытовой путь распространения возбудителя, тогда как среди сельского населения преобладал водный путь.

6. На территории Омской области циркулировали ротавирусы группы А одиннадцати [Р]0 типов с преобладанием в сельских районах генотипа Р[8]в1 (44,1% изолятов), в г. Омске - Р[8]С4 (51,0% изолятов). За период наблюдения произошла смена доминирующих геновариантов: снизилась доля Р[8]С1 с 55,6% в эпидемический сезон 2007 г. до 16,9% в эпидемический сезон 2008 г. (р<0,05) и, напротив, рост Р[8]в4 с 10,0% до 40,0% (р<0,05).

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Международные исследования свидетельствуют, что от 50 до 80% случаев ежегодно регистрируемых в мире диарейных заболеваний могут быть обусловлены вирусами, ведущее место среди которых принадлежит ротавирусам, вызывающим, по разным оценкам, от 25 до 60% случаев острых кишечных инфекций [112, 154, 171]. От тяжелой ротавирусной диареи в мире ежегодно умирают до 2 млн. человек, большинство из которых составляют дети первых лет жизни [91, 154, 159, 175]. Ротавирусная инфекция распространена повсеместно и наносит существенный вред здоровью населения как развитых, так и развивающихся стран, обусловливая прямые и непрямые экономические затраты, оценивающиеся сотнями миллиардов долларов в год [114. 154].

Регистрируемый в Российской Федерации рост показателей заболеваемости острыми кишечными инфекциями установленной этиологии был обусловлен в последние годы ротавирусной' инфекцией, уровень заболеваемости которой за период 1999-2009 гг. увеличился в 7 раз, а удельный вес в структуре острых кишечных инфекций - с 1,4%) до 7,0% [50]. Истинный уровень заболеваемости ротавирусными гастроэнтеритами, несомненно, выше официально регистрируемого, что объясняется недостаточным на сегодняшний день лабораторным обследованием больных острыми кишечными инфекциями, в том числе детей, на ротавирусы в различных регионах Российской Федерации [26, 36, 39, 42, 46]. Установлено значительное генетическое разнообразие и изменчивость ротавирусов, географические и сезонные различия циркулирующих генотипов со сменой доминирующих и эпидемически значимых генотипов. В настоящее время идентифицировано 27 Р- и 15 G-генотипов ротавирусов группы А, из них 14 Р- и 10 G-генотипов вызывают острый гастроэнтерит у человека [81, 118, 140, 142]. Проведение мониторинга за циркуляцией ротавирусов разных [Р]0-генотипов и знание антигенного спектра ротавирусов, распространенных на той или иной территории, необходимо для создания поливалентной вакцины и оценки уже разработанных вакцин [105, 121, 174, 190].

Проведенные к настоящему времени в нескольких регионах Российской Федерации исследования циркуляции генетических вариантов ротавирусов охватывали только госпитализированных городских жителей [25, 26, 39, 46, 52] и не распространялись на амбулаторных пациентов и жителей сельских территорий. В Омском регионе на момент планирования настоящей работы эпидемиологические и молекулярно-генетические особенности ротавирусной инфекции углубленно изучались рядом авторов лишь применительно к перинатальным центрам в аспекте внутрибольничной инфекции.

Согласно данным годовых статистических отчетных форм № 2 «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях» в Омской области с 1993 по 2007 гг. ежегодно регистрировалось в среднем около 10 тысяч случаев ОКИ, удельный вес которых в этиологической структуре инфекционной заболеваемости составлял от 13% до 20%.

За период 1993-2007 гг. заболеваемость острыми кишечными инфекциями (ОКИ) на территории Омской области составила 469,3±4,68°/оооо и имела умеренно выраженную тенденцию к снижению (Тсн. = - 2,35%; р<0,001), как и заболеваемость ОКИ неустановленной этиологии (231,8+3,30°/оооо; Тсн. = - 2,26%; р<0,001). Заболеваемость ОКИ установленной этиологии (114,5+2,32°/оооо) за аналогичный период, напротив, возросла (Тпр. = + 6,87%, р<0,001).

В структуре заболеваемости ОКИ удельный вес верифицированных инфекций составил 50,6+0,50%, в том числе дизентерии - 17,6+0,38%, сальмонеллезов - 8,9+0,28%, ротавирусной инфекции - 7,1+0,26%. С 1993 по 2001 гг. доля ОКИ неустановленной этиологии увеличилась на 13,4% (Тпр. = + 1,57%; р<0,001), а в период 2002-2007 гг. снизилась на 20,8% (Тсн. =-2,3%; р<0,001).

При ретроспективном анализе многолетней динамики заболеваемости населения Омской области острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии нами было установлено, что до 2000 г. характер многолетней динамики заболеваемости данной нозологической формой и дизентерией практически совпадал: годы подъема и годы снижения синхронно чередовались при обеих нозоформах. С 2001 г. такой зависимости в динамике заболеваемости острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии и дизентерии не отмечалось: на фоне выраженного снижения заболеваемости дизентерией (Тсн. = - 11,31%; р<0,001) заболеваемость острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии снизилась незначительно (Тсн. = - 2,26%; р<0,001).

За период с 1993 по 2007 гг. выявлена сильная прямая статистическая связь как между показателями заболеваемости шигеллезами и острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии (гу = +0,78; р<0,001), так и между заболеваемостью сальмонеллезами и острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии (г^ = +0,80; р<0,001). Можно предположить влияние на данные группы инфекций единых факторов (социальных и природных), обусловивших параллельный рост или снижение заболеваемости, при этом значительная часть случаев острых кишечных инфекций неустановленной этиологии могли быть недиагностированными случаями шигеллезов и сальмонеллезов.

В то же время, прослеживалась средней силы обратная статистическая связь между уровнем регистрационной заболеваемости ротавирусным гастроэнтеритом и количеством острых кишечных инфекций неустановленной этиологии (г5 = -0,63; р<0,05): начиная с 2001 года, одновременно с улучшением лабораторной диагностики ротавирусной инфекции, в Омской области было отмечено снижение заболеваемости острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии.

При изучении внутригодовой динамики заболеваемости острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии выявлена зимневесенняя сезонность, характерная для ротавирусной инфекции, и летне-осенняя сезонность, характерная для многих бактериальных кишечных инфекций, при этом зимне-весенняя сезонность наиболее отчетливо прослеживалась в группе детей до 14 лет, с максимальной выраженностью у детей в возрасте от 1 года до 6 лет.

Максимальный уровень заболеваемости острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии за период наблюдения с 1993 по 2007 гг. отмечался у детей первого года жизни (2858,1±121,230/оооо)> интенсивность эпидемического процесса в других возрастных группах детского населения была значительно ниже (р<0,001). Между уровнем заболеваемости острыми кишечными инфекциями неустановленной этиологии и заболеваемостью ротавирусной инфекцией у детей первого года жизни, была установлена средней силы обратная корреляционная связь (г$ = -0,63; р<0,05).

За анализируемый период (1993-2007 гг.) в области были достигнуты определенные положительные результаты в расшифровке вирусных кишечных инфекций за счет увеличения количества обследованных больных острыми кишечными инфекциями на ротавирусы: в структуре острых кишечных инфекций, зарегистрированных на территории Омской области, доля ротавирусной инфекции возросла с 0,03+0,02% в 1993 г. до 26,4+0,45% в 2007 г., а среди острых кишечных инфекций установленной этиологии - с 0,2+0,11% до 57,4+0,74%, соответственно.

Однако улучшение этиологической расшифровки острых кишечных инфекций отмечалось в основном по лечебно-профилактическим учреждениям, обслуживающим детское население: удельный вес острых кишечных инфекций неустановленной этиологии в структуре острых кишечных инфекций у детей за последние 5 лет периода наблюдения составил 41,3% и оказался в 1,5 раза ниже, чем у взрослых (62,5%; р<0,05), в то время как в 1993-2002 гг. удельный вес острых кишечных инфекций неустановленной этиологии у детей и взрослых не различался и составлял в среднем 50,9% и 51,2%) соответственно.

За период 1993-2007 гг. в динамике заболеваемости ротавирусной инфекцией населения Омской области прослежена выраженная тенденция к ее увеличению (Тпр. = + 22,95%), р<0,001), также как и в целом по РФ (Тпр. = 17,04%; р<0,001), однако с большей выраженностью интенсивности эпидемического процесса в Омской области (р<0,05). Причиной зарегистрированного роста заболеваемости ротавирусной инфекцией в Омской области стало не только увеличение ежегодного числа заболевших этой инфекцией, но и постепенное расширение возможностей лабораторной диагностики и увеличение количества лабораторно обследованных лиц, главным образом, детей в возрасте до 3-х лет.

Тенденция к росту заболеваемости ротавирусными гастроэнтеритами была выражена как в г. Омске, так и в районах Омской области (Тпр. = +21,26%; р<0,001 и Тпр. = +25,69%о; р<0,001 соответственно). Однако заболеваемость населения ротавирусными гастроэнтеритами по среднемноголетним показателям в областном центре в 1,3 раза выше, чем в сельских районах (39,1+1,83°/00оо и 28,8+1,73°/00оо соответственно), а в структуре заболевших ротавирусным гастроэнтеритом на долю городского населения пришлось 62,8%.

Цикличности эпидемического процесса ротавирусной инфекции как в целом среди населения Омской области, так и в отдельных возрастных группах за анализируемый период выявить не удалось. Подъем уровня заболеваемости ротавирусной инфекцией в 1995-1996 гг. и с 2002 г. по 2007 г. можно в значительной мере связать с увеличением количества лабораторно обследованных лиц, а не с проявлением цикличности эпидемического процесса.

В то же время, H.A. Новиковой и соавторами [39, 63] на основании многолетнего изучения эпидемического процесса ротавирусной инфекции (с 1984 по 2003 гг.) и высокого уровня диагностики ротавирусной инфекции, удалось установить, что цикличность является характерным признаком ротавирусной инфекции, причем длительность циклов составляет 7-8 лет. По материалам авторов, с 1984 по 2003 гг. в Нижнем Новгороде было зарегистрировано 3 цикла эпидемического процесса ротавирусной инфекции: 1984-1989 гг., 1989-1996 гг., 1996-2003 гг. при этом цикличность ротавирусной инфекции определялась сменой доминирующего варианта возбудителя. По данным И.П. Повиличенко в г. Владивостоке за период 1993-2004 гг. отмечалась 2-3-летняя цикличность с 1-2 годами подъема заболеваемости и одним годом ее снижения [42, 43] . Однако с учетом того, что в г. Владивостоке, также как и в Омской области до 2002 г., обследование больных с острыми кишечными инфекциями на ротавирусы носило весьма ограниченный характер (обследовались в основном больные при наличии клиники ротавирусной инфекции, дети в возрасте до 2-х лет и больные с острыми кишечными инфекциями при наличии в эпиданамнезе фактов употребления сырой воды и бахчевых культур), мы считаем, что эти данные не вполне достоверны.

Заболеваемость ротавирусной инфекцией населения Омской области в течение 1993-2007 гг., в основном, определялась круглогодичной и сезонной формами эпидемического процесса, на долю которых в среднем пришлось 36,0+8,17% и 54,1+8,48%), соответственно. Удельный вес вспышечной заболеваемости составил 9,9+5,09%. Результаты нашего исследования совпадают с данными других авторов [17, 42, 43, 44].

Во внутригодовой динамике заболеваемости ротавирусной инфекцией за период с 1993 по 2007 гг. была выявлена зимне-весенняя сезонность, начало сезонного подъема заболеваемости ротавирусной инфекцией по среднемноголетним интенсивным показателям было отмечено в ноябре, окончание - в начале июля. Всего вследствие действия сезонных факторов за период с 1993 по 2007 гг. возникла четверть всех случаев заболеваний, показатель сезонного подъема за этот период составил 25,5%.

Активизация эпидемического процесса при ротавирусной инфекции в холодные месяцы года была характерной для всех возрастных групп населения, однако доля сезонной заболеваемости среди детей в возрасте 1-2 лет (61,1+0,77%) оказалась более значительной, нежели среди детей до 1 года, 3-6 лет, 7-14 лет и взрослых (р<0,05). Кроме того, имелись существенные различия в помесячной динамике заболеваемости детей в возрастных группах до 6 лет, по сравнению с детьми более старшего возраста и взрослыми: у детей до 1 года, 1-2 и 3-6 лет, выраженный сезонный подъем заболеваемости отмечался только в холодное время года (с января по июнь), тогда как у детей 7-14 лет и взрослых отмечалось два подъема заболеваемости: первый, менее интенсивный, в сентябре-октябре, и второй -с конца января, по май. Не исключено, что первый подъем заболеваемости у детей 7-14 лет и взрослых был связан с действием водного (более частое, по сравнению с маленькими детьми, пользование водой открытых водоемов) и пищевого (употребление немытых овощей и фруктов, контаминированных ротавирусами) путей передачи возбудителей инфекции. На Дальнем Востоке в г. Владивостоке также было выявлено два сезонных подъема заболеваемости ротавирусной инфекцией: более выраженный в августе-январе с пиком в ноябре и менее выраженный в марте-мае с пиком в апреле [42, 43, 44], однако, в отличие от эпидемического процесса в Омской области, оба сезонных подъема заболеваемости отмечались во всех возрастных группах населения.

В сезонный подъем заболеваемости ротавирусной инфекцией в холодный период года первыми в эпидемический процесс вовлекались дети до 1 года, затем взрослые, далее, практически одновременно, дети 1-2 лет и дети 3-6 лет, не посещающие дошкольные образовательные учреждения, несколько позднее - дети 3-6 лет, посещающие дошкольные образовательные учреждения, и в самую последнюю очередь - дети '7-14 лет. Более интенсивный и продолжительный сезонный подъем заболеваемости ротавирусной инфекцией отмечался у детей 3-6 лет, посещающих дошкольные образовательные учреждения, и детей 1-2 лет. Наши данные не совпадают с данными других авторов по активизации эпидемического процесса ротавирусной инфекции в различных контингентах, так, в Екатеринбурге первыми в эпидпроцесс вовлекались дети в возрасте от 6 до 12 месяцев, через 1-2 месяца «подключались» дети от 1 до 6 месяцев и от 12 месяцев до 2-х лет, а заболеваемость взрослых ротавирусной инфекцией начинала возрастать на 2-3 недели позже, чем у детей, что объясняли внутрисемейными или другими контактами с больными детьми [68]. В г. Перми сезонные подъемы «организованных» детей наступали и заканчивались раньше, чем «неорганизованных» [17].

Уровень заболеваемости ротавирусной инфекцией населения Омской области определялся в основном заболеваемостью детей. Среднемноголетний показатель заболеваемости в возрастной группе от 0 до 14 лет в 1993-2007 гг. составил 204,7±7,04°/оооо, аналогичный показатель у взрослых был в 146 раз ниже (1,4±0,29°/00оо).

В то же время, удельный вес обнаружения антигена ротавируса у больных с подозрением на острую кишечную инфекцию из числа детей до 14 лет (39,0%) оказался выше, чем среди обследованных с диагностической целью взрослых (13,0%) всего лишь в 3,0 раза, а по данным обследования лиц, контактных с больными ротавирусной инфекцией, удельный вес выделения антигена ротавируса у детей до 14 лет (17,1%) был выше, чем у взрослых (8,6%) только в 2,0 раза. В связи с приоритетным лабораторным обследованием на ротавирусы детей младшего возраста, данные официальной регистрации заболеваемости наиболее адекватно отражают интенсивность эпидемического процесса именно среди этой возрастной группы населения. Однако ротавирусная инфекция широко распространена не только среди детей, но и среди взрослых.

Наибольшими показатели заболеваемости гастроэнтеритами ротавирусной этиологии были у детей первого года жизни (1250,1 ±79,67°/оооо) и в возрастной группе от 1 года до 2 лет (739,7±42,07°/0ооо)> что согласуется с данными других авторов [11, 15, 24, 26, 43, 44, 65, 91, 94]. Именно эти возрастные группы стали группами риска по заболеваемости данной инфекцией. В других возрастных группах интенсивность эпидемического процесса была существенно ниже: с 3 до 6 лет - 146,8±12,51°/оооо и с 7 до 14 лет - 16,4±2,53°/оооо- Подобное распределение заболеваемости в выделенных возрастных группах было характерно для всего периода наблюдения как в целом по области, так и в г. Омске и сельских районах. Исключением стали Горьковский и Полтавский районы, где наиболее высокие показатели заболеваемости РВИ за период 1993-2007 гг. были зарегистрированы в возрастной группе 1-2 лет и превышали аналогичные показатели заболеваемости детей до 1 года соответственно в 1,1 и 1,3 раза (р<0,05), а в г. Омске в 2001 г. показатели заболеваемости ротавирусной инфекцией детей в возрастных группах 1-2, 3-6 и 7-14 лет превысили аналогичный показатель у детей до 1 года.

Среднемноголетние интенсивные показатели заболеваемости ротавирусной инфекцией различных возрастных групп детей в г. Омске в 1993-2007 гг. превышали аналогичные показатели заболеваемости детей сельских районов, в то же время среднемноголетний показатель среди лиц 15 лет и старше в сельских районах превысил заболеваемость ротавирусной инфекцией взрослого населения г. Омска в 5,4 раза и составил в сельских районах 2,7+0,59 против 0,5+0,22 на 100 тысяч (р<0,05) в г. Омске. Такие различия в интенсивности эпидемического процесса у взрослых можно объяснить различным подходом врачей в сельских районах и г. Омске к диагностике ротавирусной инфекции у лиц с подозрением на острые кишечные инфекции из числа взрослых.

В целом в период наблюдения с 1993 по 2007 гг. нами были выявлены различия в показателях заболеваемости детей, посещавших и не посещавших дошкольные образовательные учреждения, в возрастной группе 1-2 лет (соответственно 530,6+79,63 и 799,6+48,90 на 100 тыс. детей данного возраста, р<0,05) и отсутствие таковых у детей 3-6 лет (соответственно -141,7+16,27 и 156,4+19,71; р>0,05).

Однако в возрастной группе 3-6 лет, несмотря на отсутствие в целом статистически значимых различий среднемноголетних показателей заболеваемости детей, посещавших и не посещавших дошкольные образовательные учреждения, в 1994, 1996 и 2007 гг. отмечено статистически значимое превышение заболеваемости ротавирусной инфекцией детей, не посещавших дошкольные образовательные учреждения, над заболеваемостью детей, посещавших дошкольные учреждения (р<0,05), а в 2002 г. превалировала инцидентность детей, посещавших организованные коллективы (р<0,05), за счет расшифровки случаев групповой заболеваемости в дошкольных образовательных учреждениях г. Омска.

При анализе среднемноголетних интенсивных показателей заболеваемости ротавирусной инфекцией в различных возрастных группах взрослого населения, нами было установлено, что наиболее высокие показатели отмечались в возрастных группах с 15 до 35 лет (7,8+1,19 на 100000) и среди лиц 60 лет и старше (3,0+0,87), что согласуется с данными других авторов [11, 15, 51, 54], которые приводят убедительные свидетельства активного участия взрослых в инфекционном и эпидемическом процессах, особенно применительно к группе лиц молодого возраста, имеющих контакт с детьми раннего возраста, а также лиц пожилого возраста.

Наши исследования также подтвердили мнение ряда авторов [11, 15, 42, 44] о том, что среди профессиональных контингентов группами повышенного риска заболевания ротавирусной инфекцией являлись работники детских дошкольных и лечебно-профилактических учреждений: заболеваемость этих профессиональных групп в Омской области в 2,5-4,5 раза выше заболеваемости прочего взрослого населения, р<0,05. С другой стороны, это можно объяснить лучшей лабораторной диагностикой ротавирусной инфекции у больных острыми гастроэнтеритами, относящихся к данным профессиональным контингентам.

Интенсивность эпидемического процесса ротавирусной инфекции на территории Омской области определялась спорадической заболеваемостью. Доля вспышечной заболеваемости в целом за период наблюдения составила лишь 3,3+0,17%. Тем не менее, за период с 2005 по 2007 гг. (с начала официальной регистрации вспышек ротавирусной этиологии в форме статистической отчетности № 23 «Сведения о вспышках инфекционных заболеваний») 27 из 57 вспышек ОКИ были ротавирусной этиологии, а удельный вес заболевших при этих вспышках составил 5,4+0,28%) от общего числа зарегистрированных за эти годы случаев ротавирусной инфекции.

В ходе исследования изучалась циркуляция ротавирусов среди населения Омской области. У больных острыми кишечными инфекциями антигены ротавирусов обнаруживались в 37,3±0,96%>, а среди контактных лиц в очагах ротавирусной инфекции - в 9,3±1,04%> случаев. Положительные находки у обследованных здоровых лиц имели место в 4,2±0,89% случаев. После проведенного курса лечения вирусоносительство выявлялось в общей сложности у 20,4+1,7% детей, что может свидетельствовать о неэффективности применяемой в настоящее время схемы санации.

При исследовании объектов внешней среды с целью изучения циркуляции ротавирусов за период наблюдения антиген ротавируса был выявлен в 7,2+1,95% случаев, в т.ч. из водных объектов - в 10,0+1,15% случаев (в воде открытых водоемов в 15,5+3,45%; в воде централизованного и децентрализованного водоснабжения - в ^,0+1,23% и 6,5+4,41% случаев^ соответственно), из пищевых продуктов - в 7,4+0,98% случаев, в смывах с объектов, в дошкольных образовательных, и лечебно-профилактических учреждениях - в 5,3±0,92% случаев, что указывает на разнообразие путей передачи возбудителя (пищевого^ водного и контактно-бытового) и их роль в распространении ротавирусной; инфекции: ' .

В результате генотипированйя 250 изолятов ротавирусов группы А от больных острыми, кишечными инфекциями, находившихся на стационарном или амбулаторном лечении в; лечебно-профилактических учреждениях г. Омска и сельских районов Омской области с января 2007 г. по май 2008 г., Р- и О-генотипы. ротавирусов. были определены в 207 (82,8+2,39%) и 223 (89,2+1,96%) случаях, соответственно: В то же время,, часть, проб не типировалась по Р: (17,2+2,39%) и в (10,8+1,96%) генотипам.- О учетом того, что генотипы не определялись тем набором; генотипспецифических праймеров, которые позволяют выявлять' широко распространенные в мире генотипы ротавирусов, можно предположить, что они являлись какими-либо редкими генотипами ротавирусов.

В 2007-2008 гг. в Омской области антигенный спектр ротавирусов был представлен как минимум 11-ю [Р]С-комбинациями. В 2007-2008 гг. в Омской области доминировали широко распространенные во всем мире генотипы Р[8]в1 и Р[8]С4, на долю которых пришлось соответственно 30,4+2,91% и 29,6+2,89% всех изученных изолятов.

Анализ результатов типирования позволяет говорить о существенных территориальных различиях в распределении генотипов ротавирусов на территории области в 2007-2008 гг. Так, доминирующий в большинстве регионов мира генотип P[8]G1 в области преобладал в сельских районах (44,1±4,03%), в г. Омске превалировал генотип ротавируса P[8]G4 (51,0±5,05%) (р<0,05). Имелись территориальные отличия и в распределении других генотипов ротавирусов.

Анализ циркулирующих Р-,0-генотипов ротавирусов показал уменьшение доли генотипа P[8]G1 с 55,6±5,24% в эпидемический сезон 2007 г. до 16,9±2,96% в следующий эпидемический сезон 2008 г. и, напротив, частота обнаружения генотипа P[8]G4 в то же самое время возросла с 10,0±3,16% до 40,0±3,87% (р<0,05).

В ходе исследования выявлены особенности в частоте обнаружения [PJG-генотипов ротавирусов группы А в различных возрастных группах заболевших. В целом по области максимальный удельный вес выявления ротавирусов генотипа P[8]G1 отмечался в возрастных группах 0-1 г., 2-3 г. и среди взрослых, причем в возрастной группе детей с 2 до 3 лет (51,7±9;28%), он статистически значимо отличался от частоты встречаемости в данной возрастной группе других генотипов ротавирусов (р<0,05). Генотип ротавируса P[8]G4 преобладал в возрастных группах 1-2 г. и 3-6 лет, однако статистические различия частоты встречаемости данного генотипа имелись только с более редкими генотипами (P[4]G2, P[8]G3 и др.).

Имелись различия в частоте выявления различных генотипов ротавирусов из материала от больных в сельских районах и г. Омске. Так в сельских районах по сравнению с г. Омском генотип P[8]G1 выявлялся значительно чаще в материале от больных детей в возрасте до 6 лет и взрослых, тогда как в г. Омске, статистически чаще, чем в сельских районах, обнаруживался генотип P[8]G4, но только у детей в возрасте до 3-х лет.

В настоящее время лабораторные обследования больных ОКИ на ротавирусы носят выборочный характер и проводятся, как правило, по клиническим и эпидемиологическим показаниям, единый перечень которых до настоящего дня не разработан и не регламентирован. Плановое обследование декретированных контингентов не предусматривает обследование на ротавирусную инфекцию. Соответственно регистрируемая заболеваемость и учтенное носительство ротавирусов не в полной мере отражают интенсивность эпидемического процесса. Поэтому нами были предложены коррективы в перечень подлежащих лабораторному обследованию на ротавирусы лиц: из числа больных, обратившихся за медицинской помощью с подозрением на острые кишечные инфекции; с профилактической целью для активного выявления носителей ротавирусов среди контингентов «группы риска» и с целью дифференциальной диагностики у детей в возрасте до 3-х лет, госпитализируемых в стационары с острыми воспалительными респираторными заболеваниями в эпидемический сезон ротавирусной инфекции.

Для эпидемиологической диагностики ротавирусной инфекции мониторинг циркуляции ротавирусов среди населения и во внешней среде (вода, пищевые продукты, смывы), включая молекулярно-генетические исследования, следует осуществлять с учетом территорий и времени риска. Объем и кратность лабораторных исследований материала из объектов окружающей среды на ротавирусы в плановом порядке (мониторинг), внепланово (по эпидемическим показаниям) и в ходе производственного контроля отражены в методических рекомендациях «Эпидемиологический надзор и контроль ротавирусной инфекции в Омской области» (Омск, 2010).

Список использованной литературы по медицине, диссертация 2010 года, Горбунова, Марина Георгиевна

1. Беляев, А.Л. Ротавирусный гастроэнтерит как внутрибольничная вирусная инфекция / А.Л. Беляев // РЭТ-Инфо 2006. - Т. 59. - № 3. - URL: http://lib2005.rat-info.ru/ret info 3 2006.shtml

2. Беляев, А.Л. Вирусные гастроэнтериты как внутрибольничные вирусные инфекции / А.Л. Беляев // Здравоохранение. 2006. - № 8. - С.149-155.

3. Беляев, Е. Н. Концепция санитарно-эпидемиологического надзора и медико-экологическое районирование / Е. Н. Беляев, В. Д. Беляков // Региональные проблемы и управление здоровьем населения в России. М., 1996.-С. 16-26.

4. Беляков, В. Д. Эпидемиологический надзор основа современной противоэпидемической работы / В. Д. Беляков // Журн. Микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. - 1985. - № 5. - С. 53-58.

5. Беляков, В. Д. Эпидемиология / В. Д. Беляков, Р.Х. Яфаев // М., 1989. 416 с.

6. Беляков, В. Д. Введение в эпидемиологию инфекционных и неинфекционных заболеваний человека / В. Д. Беляков, Т. А. Семененко, М. X. Шрага // Медицина, Москва. 2001. - 264 с.

7. Богомолов, Б.П. Острые кишечные инфекции / Б.П. Богомолов // Инфекционные болезни: неотложная диагностика, лечение, профилактика. -Ньюдиамед, Москва. 2007. - С. 129-615.

8. Боковой, А.Г. Респираторный синдром у детей, больных ротавирусным гастроэнтеритом / А.Г. Боковой, Л.Г. Карпович, Е.Э. Евреинова и др. // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2000. - № 4. -С. 23-26.

9. Букринская, А.Г. Ротавирусная инфекция (этиология, клиника, диагностика, эпидемиология) / А.Г. Букринская, Н.М. Грачева, В.И. Васильева // Медицина, Москва. 1989. - 224 с.

10. Буланова, И.А. Рота- и норовирусные инфекции у детей раннего возраста в Архангельской области / И.А. Буланова, Л.В. Титова, Самодова О.В. и др. // ЭпиНорт. 2009. - Т. 10. - № 1. - С. 18-24.

11. Буланова, И.А. Ротавирусная инфекция в условиях Крайнего Севера / И.А. Буланова, Л.В. Титова, Л.В. Феклисова и др. // Экология человека. 2007. - № 3. - С. 24-27.

12. Буркин, A.B. Клинико-эпидемиологическая характеристика острых кишечных инфекций у детей Нижнего Поволжья / A.B. Буркин, Г.А. Харченко // ЖМЭИ. 2006. - № 1. - С. 69-72.

13. Васильев, Б.Я. Острые кишечные заболевания. Ротавирусы и ротавирусная инфекция // Лань, Санкт-Петербург. 2000. - 272 с.

14. Васильев, К.Г. Эпидемиологический надзор как система / К.Г. Васильев // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунологии. — 1988. -№ Ю.-С. 90-94.

15. Вольдшмидт, Н.Б. Роль различных путей передачи ротавирусной инфекции и совершенствование эпидемиологического надзора / Автореферат дисс. . кандидата медицинских наук. Пермь. - 2007. - 24 с.

16. Григорович, М.С. Клииико-иммунологические особенности формирования рековалесцентного вирусоносительства при ротавирусной инфекции у детей / М.С. Григорович, Г.А. Зайцева, А.Л. Бондаренко // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2002. - № 6. - С. 43-46.

17. Далматов, В. В. Эпидемиологический надзор за инфекциями с широким диапазоном клинического проявления : дис. . д-ра. мед. наук / В.В. Далматов. Омск, 1987. - 326 с.

18. Далматов, В.В. Принципы построения программ и организация эпидемиологического надзора за инфекционными болезнями / В.В. Далматов, Р.Н. Готвальд, Т. М. Обухова и др. // Омск, 1989. 153 с.

19. Далматов, В.В. Эпидемиологический надзор и социально-гигиенический мониторинг в системе управления здоровьем населения /В.В. Далматов, В. Л. Стасенко, Т. М. Обухова // Эпидемиологический надзор и социально-гигиенический мониторинг. М., 2002. - С. 26.

20. Дорошина, Е.А. Вирусные диареи в этиологической структуре острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в стационары г. Москвы / Е.А. Дорошина, Г.А. Козина, А.Т. Подколзин и др. // Инфекционные болезни. 2009. -.Т. 7. - № 3. - С. 84-86.

21. Еженедельный эпидемиологический бюллетень ВОЗ // 2007. № 32. - С. 285-296. http://www.who.int/wer.

22. Епифанова, Н.В. Характеристика генетических вариантов ротавирусов, циркулирующих среди населения г. Дзержинска / Н.В. Епифанова, Е.В. Филатова, Н.В. Куприянова и др. // Вестник Нижегородской академии. 2001. - Т. 1 (3). - № 6. - С. 26-29.

23. Жираковская, Е.В. Ротавирусная инфекция у детей раннего возраста в Новосибирске. Генотипирование циркулирующих изолятов / Е.В. Жираковская, Н.А. Никифорова, Т.Г. Корсакова // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2007. - № 3. - С. 32-36.

24. Жираковская, Е.В. Молекулярно-генетическая характеристика ротавирусов, циркулирующих в Новосибирске у детей раннего возраста / Автореф. дисс. . кандидата медицинских наук. Кольцово. - 2009. - 26 с.

25. Зуева, Л. П. Эпидемиология / Л. П.Зуева, Р. Х.Яфаев // М., 2005.746 с.

26. Инфекционная заболеваемость в субъектах Российской Федерации в 2005-2006 гг. : Информационный сборник статистических и аналитических материалов. Часть 1. М., 2007. - С. 12-75.

27. Инфекционная заболеваемость в субъектах Российской Федерации в 2007-2008 гг. : Информационный сборник статистических и аналитических материалов. Часть 1. М., 2009. - С. 8-60.

28. Кожухова, Е.А. Актуальные бактериальные и вирусные кишечные инфекции / Е.А. Кожухова, А.И. Большакова, Т.В. Беляева // Санитарный врач. 2009. - №4. - С. 11-13.

29. Коза, Н.М. Концептуальная модель системы эпидемиологического надзора / Н.М. Коза // Вопросы эпидемиологии инфекционных болезней : Сб. науч. тр. М., 1996. С. 30-32.

30. Куличенко, Т.В. Лечение и вакцинопрофилактика ротавирусной инфекции у детей / Т.В. Куличенко // Педиатрическая фармакология. 2007.- Т. 4. № 1. - С. 42-47.

31. Львов, Д.К. Ротавирусные инфекции / Д.К.Львов, Л.В. Колобухина // Медицинская вирусология. 2008. - С. 372-375.

32. Мальков, Н.В. Ротавирусная инфекция / Н.В. Мальков, В.Р. Саухат, Е.В. Краснова // Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии.- Магадан. 2002. - 49 с.

33. Мефодьев, B.B. Эпидемиология и профилактика ассоциированных с водой антропонозов / В.В. Мефодьев, Ю.В. Устюжанин, Л.Б. Козлов и др. // Издательский центр «Академия». Тюмень. - 2006. - 284 с.

34. Миленина, В.М. Эпидемиологический надзор за внутрибольничной инфекцией ротавирусной этиологии в стационарах для новорожденных детей / Автореф. дисс. . кандидата медицинских наук. -Омск. -2004.-21 с.

35. Мухина, A.A. Диагностика ротавирусной инфекции методом полимеразной цепной реакции / A.A. Мухина, Г.А. Шипулин, А.Г. Боковой и др. // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2002. - № 2. - С. 43-47.

36. Новикова, H.A. СР.-типы ротавируса группы А человека и их распространение в Нижнем Новгороде и Дзержинске в 1997-2005 гг. / H.A. Новикова, О.Ф. Федорова, Н.В. Епифанова и др. // Вопросы вирусологии. -2007.-Т. 52.-№3.-С. 19-23.

37. О санитарно-эпидемиологическом благополучии населения : закон Российской Федерации № 52-ФЗ. М., 1999.- 46 с.

38. Общие требования по профилактике инфекционных и паразитарных болезней : сан.-эпид. правила СП 3.1./3.2.1379-03. М. : Федеральный центр Госсанэпиднадзора МЗ России, 2004. - 15 с.

39. Повиличенко, И.П. К вопросу изучения ротавирусной инфекции во Владивостоке / И.П. Повиличенко, В.Б. Туркутюков, Т.Т. Тарасенко и др. // Тихоокеанский медицинский журнал. 2005. - № 2. - С. 66-68.

40. Повиличенко, И.П. Эпидемиологические закономерности эпидемического процесса ротавирусной инфекции на территории г. Владивостока / Автореферат дисс. . кандидата медицинских наук. -Владивосток. 2006. - 24 с.

41. Повиличенко, И.П. Эпидемиология ротавирусной инфекции и особенности профилактики при формировании групповой и вспышечной заболеваемости в дошкольных образовательных учреждениях / И.П.

42. Повиличенко, В.Б. Туркутюков, В.М. Воронок и др. // Тихоокеанский медицинский журнал. 2005. - № 3. - С. 39-41.

43. Подколзин, А.Т. Изучение этиологии острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в инфекционные отделения стационаров Москвы / А.Т. Подколзин, A.A. Мухина, Г.А. Шипулин и др. // Инфекционные болезни. 2004. - Т. 2. - № 2. - С. 85-91.

44. Подколзин, А.Т. Надзор за ротавирусной инфекцией по данным госпитализаций в отдельных городах РФ за 2005-2007 гг. / А.Т. Подколзин, Е.Б. Фенске, Н.Ю. Абрамычева и др. // Инфекционные болезни. 2008. - Т. 6(№4). - С. 29-31.

45. Подколзин, А.Т. Сезонность и возрастная структура заболеваемости острыми кишечными инфекциями на территории РФ / А.Т. Подколзин, Е.Б. Фенске, Н.Ю. Абрамычева и др. // Терапевтический архив. -2007.-Т. 79(11)-С. 10-16.

46. Покровский, В.И. Кишечные инфекции и инвазии: Ротавирусные инфекции / В.И. Покровский, С.Г. Пак, Н.И. Брико и др. // Инфекционные болезни и эпидемиология / ГЭОТАР-МЕД, Москва. 2002. - С. 168-190.

47. Постановление главного государственного врача РФ Г.Г. Онищенко «О профилактике острых кишечных инфекций» от 19.03.2010 г. № 21. Зарегистрировано в Министерстве Юстиции Российской Федерации № 16959 от 22.04.2010 г.

48. Сагалова, О.И. Острые кишечные инфекции вирусной этиологии у взрослых / О.И.Сагалова, А.Т. Подколзин, Н.Ю. Абрамычев и др. // Тер. Архив. 2006. - № 11. - С. 17-23.

49. Саломай, Т.В. Вопросы профилактики ротавирусной инфекции в детских дошкольных учреждениях / Т.В. Саломай, А.Н. Каира, О.Б. Захарова // Санитарный врач. 2008. - № 5. - С. 7-9.

50. Сергевнин, В.И. Водный путь передачи возбудителя ротавирусной инфекции / В.И. Сергевнин, Н.Б. Вольдшмидт, Е.В. Сармометов и др. // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2004. - № 6. -С. 17-20.

51. Сергевнин, В.И. Влияние ротавирусной контаминации молочных продуктов на заболеваемость населения / В.И. Сергевнин, Н.Б. Вольдшмидт, Е.В. Сармометов и др. // Гигиена и санитария. — 2007. № 1. - С. 56-58.

52. Сергевнин, В.И. О причинах сезонных подъемов заболеваемости ротавирусной инфекцией в холодный период года / В.И. Сергевнин, Н.Б. Вольдшмидт, Е.В. Кудреватых // Вестник Российской военно-медицинской академии СПб. 2006. - С. 165-166.

53. Сергевнин, В.И. Сезонность эпидемического процесса ротавирусной инфекции / В.И. Сергевнин, Н.Б. Вольдшмидт, Е.В.

54. Сармометов // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2007. - Т. 34. - № 3. - С. 35-40.

55. Сергевнин, В.И. Эпидемиологический надзор за ротавирусной инфекцией / В.И. Сергевнин, Е.В. Сармометов, Н.Б. Вольдшмидт // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2008. - Т. 38. - № 1. - С. 28-31.

56. Фатеева Е.М. Естественное вскармливание и кишечные инфекции: концепция протекторных эффектов женского молока / Е.М. Фатеева, М.В. Гмошинская // Вопросы детской диетологии. 2003. - Т. 1. -№2. - С. 60-63.

57. Федорова, О.Ф. Идентификация, молекулярно-биологическая характеристика и анализ циркуляции ротавирусов разных GP. типов / Автореферат дисс. . кандидата медицинских наук. Москва. - 2006. - 28 с.

58. Федорова О.Ф. Оптимизация метода ОТ-ПЦР для идентификации гена VP4 ротавирусов группы А и оценка его диагностической эффективности / О.Ф. Федорова, H.A. Новикова, Н.В. Епифанова и др. // Вопросы вирусологии. 2005. - № 1. - С. 39-41.

59. Шамхалов, М.М. Особенности эпидемиологии острых кишечных инфекций бактериальной и вирусной этиологии и совершенствование санитарно-эпидемиологического надзора / Автореферат дисс. . кандидата медицинских наук. Москва. - 2006. - 20 с.

60. Шаханина И.Л., Игонина Е.П. Динамика смертности от инфекционных болезней в России в XX веке / И.Л. Шаханина, Е.П. Игонина // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2006. - № 3. - С. 47-50.

61. Шаханина, И.Л. Стандартные величины экономического ущерба, наносимого инфекционными болезнями / И.Л. Шаханина, Л.А. Осипова // Эпидемиология и инфекционные болезни. 1999. - № 5. - С. 14.

62. Эпидемиологический надзор за ротавирусными заболеваниями: метод, рекомендации. — Екатеринбург. 1995. — 23 с.

63. Ющук Н.Д. Острые кишечные инфекции: актуальные проблемы клиники и диагностики / Н.Д. Ющук, Я.М. Еремушкина // Инфекционные болезни. 2006. - Т. 4. - № 1. - С.76-78.

64. Abid, I. Detection and characterization of human group С rotavirus in the pediatric population of Barcelona, Spain / I. Abid, S. Guix, M. Aouni et al. // J. Clin. Virol. 2007. - V. 38(1). - P. 78-82.

65. Araujo, I.T. Brazilian P8.G1, P[8]G5, P[8]G9, and P[4]G2 rotavirus strains: Nucleotide sequence and phylogenetic analysis / I.T. Araujo, R.M Assis., A.M. Fialho et al. //J. Med. Virol.-2007. V. 79(7). - P. 995-1001.

66. Arias, C:F. Molecular biology of rotavirus cell entry / C.F. Arias, P. Isa, C.A. Guerrero et al. // Arch. Med. Res. 2002. - V. 33(4). - P. 356-361.

67. Arista, S. G2 rotavirus infections in an infantile population of the South of Italy: variability of viral strains over time / S. Arista, G.M. Giammanco, S. De Grazia et al. // J. Med. Virol. 2005. - V. 77(4). - P. 587-594.

68. Arista, S. Genetic variability among serotype G4 Italian human rotaviruses / S. Arista, G.M. Giammanco, S. De Grazia et al. // J. Clin. Microbiol. -2005. V. 43(3). - P. 1420-1425.

69. Arista, S. Heterogeneity and temporal dynamics of evolution of G1 human rotaviruses in a settled population / S. Arista, G.M. Giammanco, S. De Grazia et al. // J. Virol. 2006. - V. 80(21). - P. 10724-10733.

70. Armah, G.E. Changing patterns of rotavirus genotypes in Ghana: emergence of human rotavirus G9 as a major cause of diarrhea in children / G.E. Armah, A.D. Steele, F.N. Binka et al. // J. Clin. Microbiol. 2003. - V. 41(6). -P.2317-2322.

71. Asensi, M.T. Anti-rotavirus Antibodies in Human Milk: Quantification and Neutralizing Activity / M.T. Asensi, C. Martinez-Costa, J. Buesa // J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 2006. - V. 42(5). - P. 560-567.

72. Bahl, R. Incidence of severe rotavirus diarrhea in New Delhi, India, and G and P types of the infecting rotavirus strains / R. Bahl, P. Ray, S. Subodh et al. // J. Infect. Dis. 2005. - V. 192(S 1).-S 114-S119.

73. Banerjee, I.Comparative study of the epidemiology of rotavirus in children from a community-based birth cohort and a hospital in South India / I. Banerjee, S. Ramani, B. Primrose et al. // J. Clin. Microbiol. 2006. - V. 44(7). -P. 2468-2474.

74. Banyai, K. Eight-year survey of human rotavirus strains demonstrates circulation of unusual G and P types in Hungary / K. Banyai, J.R. Gentsch, R.I. Glass et al. // J. Clin. Microbiol. 2004. - V. 42(1). - P. 393-397.

75. Banyai, K. Prevalence and molecular characterization of human group C rotaviruses in Hungary / K. Banyai, B. Jiang, A. Bogdan et al. // J. Clin. Virol. -2006. V. 37(4). - P. 317-322.

76. Banyai, K. Emergence of serotype G12 rotaviruses, Hungary / K. Banyai, A. Bogdan, P. Kisfali et al. // Emerg. Infect. Dis. 2007. - V. 13(6). -P. 916-919.

77. Barnes, G.L. Excretion of serotype G1 rotavirus strains by asymptomatic staff: a possible source of nosocomial infection / G.L. Barnes, S.L. Callaghan, C.D. Kirkwood et al. // J. Pediatr. 2003. - V. 142(6). - P. 722-725.

78. Beaglehole, R. Basic epidemiology // R. Beaglehole, R. Bonita, N. Kjellstrom // World Health Organizazion. Geneva, 1993. 175 p.

79. Bernstein D.I. RIX4414 (Rotarix): a live attenuated human rotavirus vaccine //J. Pediatr. (Rio J.) 2007. -V. 83(3). - P. 193-195.

80. Bishop, R.F. Detection of a new virus by electron microscopy of faecal extracts from children with acute gastroenteritis / R.F. Bishop, G.P Davidson., I.H. Holmes et al. //Lancet. 1974. - V. 1(7849). - P. 149-151.

81. Bishop, R.F. Serum, fecal, and breast milk rotavirus antibodies as indices of infection in mother-infant pairs / R.F. Bishop, H.C. Bugg, P.J. Masendycz et al. //J. Infect. Dis. 1996. - V. 174(S 1). - P. S22-S29.

82. Borchardt, M. A. Vulnerability of drinking-water wells in La Crosse, Wisconsin, to enteric-virus contamination from surface water contributions / M.A. Borchardt, N.L. Haas, R.J. Hunt // Appl. Environ. Microbiol. 2004. - V. 70(10). -P. 5937-5946.

83. Bozdayi, G. Diversity of human rotavirus G9 among children in Turkey / G. Bozdayi, B. Dogan, B. Dalgic et al. // J. Med. Virol. 2008. - V. 80(4). - P. 733-740.

84. Bryce, J. WHO estimates of the causes of death in children / J. Bryce, C. Boschi-Pinto, K. Shibuya et al. // Lancet. 2005. - V. 365(9465). - P. 11471152.

85. Carmona, R.C. Human rotavirus serotype G9, Sao Paulo, Brazil, 1996-2003 / R.C. Carmona, M.C. Timenetsky, S.G. Morillo et al. // Emerg. Infect. Dis. 2006. - V. 12(6). - P. 963-968.

86. Castello, A. Rotavirus strain surveillance in Latin America: a review of the last nine years / A.Castello, M. Arvay, R. Glass et al. // Pediatr. Infect. Dis. J. 2004. - V. 23(S 10). - S168-S172.

87. Charles, M.D. Hospitalizations associated with rotavirus gastroenteritis in the United States, 1993-2002 / M.D. Charles, R.C. Holman, A.T. Curns et al. // Pediatr. Infect. Dis. J. 2006. - V. 25(6). - P. 489-493.

88. Cheng, A.C.Infectious diarrhea in developed and developing countries / A.C. Cheng, J.R. McDonald, N.M. Thielman // J. Clin. Gastroenterol. 2005. -V. 39(9).-P. 757-773.

89. Ciarlet, M. Interactions between rotavirus and gastrointestinal cells / M. Ciarlet, M.K. Estes // Curr. Opin. Microbiol. 2001. - V. 4(4). - P. 435-441.

90. Cook, N. The zoonotic potential of rotavirus / N. Cook, J. Bridger, K. Kendall et al. // J. Infect. 2004. - V. 48(4). - P. 289-302.

91. Cunliffe, N.A. The expanding diversity of rotaviruses / N.A. Cunliffe, J.S. Bresee, J.R. Gentsch et al. // Lancet. 2002. - V. 359(9307). - P. 640-642.

92. D'Agostino J. Considerations in assessing the clinical course and severity of rotavirus gastroenteritis / J. D'Agostino // Clin. Pediatr. 2006. -V. 45(3).-P. 203-212.

93. D'Souza, R.M. Climatic factors associated with hospitalizations for rotavirus diarrhoea in children under 5 years of age / R.M. D'Souza, G. Hall, N.G. Becker//Epidemiol. Infect. 2008. - V. 136(1). - P. 56-64.

94. Das B.K., Gentsch J.R., Cicirello H.G. et al. Characterization of rotavirus strains from newborns in New Delhi, India // J. Clin. Microbiol. 1994. -V. 32 (7). - P. 1820-1822.

95. Das, S. Genetic variability of human rotavirus strains isolated from Eastern and Northern India / S. Das, V. Varghese, S. Chaudhuri et al. // J. Med. Virol. 2004. - V. 72(1). - P. 156-161.

96. De Grazia, S. Canine-origin G3P3. rotavirus strain in child with acute gastroenteritis / S. De Grazia, V. Martella, G.M. Giammanco et al. // Emerg. Infect. Dis. 2007. - V. 13(7).-P. 1091-1093.

97. De Grazia, S. Rare AU-l-like G3P9. human rotaviruses with a Kun-like NSP4 gene detected in children with diarrhea in Italy / S. De Grazia, V. Martella, G.M. Giammanco // J. Clin. Microbiol. 2008. - V. 46(1). - P. 357-360.

98. Dennehy P. H. Rotavirus vaccines: an overview // Clin. Microbiol. Rev. 2008. - V. 21(1). - P. 198-208.

99. Diwakarla, S. Expanding distribution of human serotype G6 rotaviruses in Australia / S. Diwakarla, R. Clark, E.A. Palombo // Microbiol. Immunol. 2002. - V. 46(7). - P. 499-502.

100. Esona, M.D. Prevalence of group C rotavirus among children in Rhode Island, United States / M.D. Esona, C.D. Humphrey, P. H. Dennehy et al. // J. Clin. Virol. 2008. - V. 42(2). - P. 221-224.

101. Espinola, E. Genetic diversity of the VP4 and VP7 genes affects the genotyping of rotaviruses: Analysis of Paraguayan strains / E Espinola, G. Parra, G. Russomando et al. // Infect. Genet. Evol. 2008. - V. 8(1). - P. 94-99.

102. Estes, M. Pathogenesis of rotavirus gastroenteritis / M. Estes., G. Kang, C. Zeng et al. // Novartis. Found. Symp. 2001. - V. 238 - P. 82-96.

103. Fang, Z.Y. Sentinel hospital surveillance for rotavirus diarrhea in the People's Republic of China, August 2001-July 2003 / Z.Y Fang., B. Wang, P.E. Kilgore et al. // J. Infect. Dis. 2005. - V. 192(S1). - P. S94-S99.

104. Farahtaj, F. Rotavirus VP7, VP4 and VP6 genotypes co-circulating in Tehran, Iran, between 2003 and 2004 / F. Farahtaj, C. Gallimore, M. Iturriza-Gomara et al. // Epidemiol. Infect. 2007. - V. 135(5). - P. 834-838.

105. Feeney, S.A. Association of the G4 rotavirus genotype with gastroenteritis in adults / S.A. Feeney, S.J. Mitchell, F. Mitchell et al. // J Med Virol.-2006,- V. 78(2).-P. 1119-1123.

106. Fischer, T.K. Hospitalizations and Deaths from Diarrhea and Rotavirus among Children <5 Years of Age in the United States, 1993-2003 / T.K. Fischer, C. Viboud, U. Parashar et al. // J. Infect. Dis. 2007. - V. 195(8). -P. 1117-1125.

107. Forster, J. Burden of acute rotavirus gastroenteritis (RV-AGE) in Germany: a comparison of federal statistics and epidemiological data / J. Forster, T. Hammerschmidt // Gesundheitswesen 2007. - V. 69(4). - P. 227-232.

108. Gallimore C. I. Contamination of the hospital environment with gastroenteric viruses: comparison of two pediatric wards over a winter season / C. I. Gallimore, C. Taylor, A. Gennery et al. // J. Clin. Microbiol. 2008. - V. 46(9). -P. 3112-3115.

109. Gentsch J.R., Glass R.I., Woods P. et al. Identification of group A rotavirus gene 4 types by polymerase chain reaction // J. Clin. Microbiol. 1992. -V. 30(6).-P. 1365-1373.

110. Gentsch, J.R. Serotype diversity and reassortment between human and animal rotavirus strains: implications for rotavirus vaccine programs / J.R. Gentsch, A.R. Laird, B. Bielfelt et al. // J. Infect. Dis. 2005. - V. 192(S1). - S146-S159.

111. Ghosh, S. Evidence for bovine origin of VP4 and VP7 genes of human group A rotavirus G6P14. and G10P[14] strains / S. Ghosh, V. Varghese , S. Samajdar et al. // J. Clin. Microbiol. 2007. - V. 45(8). - P. 2751-2753.

112. Giaquinto, C. Costs of community-acquired pediatric rotavirus gastroenteritis in 7 European countries: the REVEAL Study / C. Giaquinto, P. Van Damme, F. Huet et al. // J. Infect. Dis. 2007. - V. 195(S 1). - S36-S44.

113. Glass, R.I. The promise of new rotavirus vaccines / R.I. Glass, U.D. Parashar // N. Engl. J. Med. 2006. - V. 354 (1). - P. 75-77.

114. Gouvea V., Glass R.I., Woods P. et al. Polymerase chain reaction amplification and typing of rotavirus nucleic acid from stool specimens // J. Clin. Microbiol. 1990. - V. 28 (2). - P. 276-282.

115. Graham, D.Y. Minimal infective dose of rotavirus/ D.Y. Graham, G.R. Dufour, M.K. Estes // Arch. Virol. 1987. - V. 92(3-4): - P. 261-271.

116. Gray, J. Rotavirus / J. Gray, T. Vesikari, P. Van Damme et al. // J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 2008. - V. 46(S 2). - P. S24-S31.

117. Grimwood, K. Rotavirus hospitalisation in New Zealand children under 3 years of age / K. Grimwood, Q.S. Huang, C. Cohet et al. // J. Paediatr. Child Health. 2006. - V. 42(4). - P. 196-203.

118. Hong, S.K. Characterization of a Gil, P4. Strain of Human Rotavirus in South Korea / S.K. Hong, S.G. Lee, S.A. Lee et al. // J. Clin. Microbiol. 2007. - V. 45(11). - P. 3759-3761.

119. Hung, L.C. Epidemiology and strain characterization of rotavirus diarrhea in Malaysia / L.C. Hung, S.L. Wong, L.G. Chan et al. // Int. J. Infect. Dis.- 2006. V. 10(6). - P. 470-474.

120. Inoue, Y. Rare group a rotavirus P9.G3 isolated in Nara Prefecture, Japan / Y. Inoue, Y. Kitahori // Jpn. J. Infect. Dis. 2006. - V. 59(2). - P. 139-140.

121. Iturriza-Gomara, M. Rotavirus genotyping: keeping up with an evolving population of human rotaviruses / M. Iturriza-Gomara, G. Kang, J. Gray //J. Clin. Virol. -2004. V. 31(4). - P. 259-265.

122. Jiang, B. The role of serum antibodies in the protection against rotavirus disease: an overview / B. Jiang, J.R. Gentsch, R.I. Glass // Clin. Infect. Dis. 2002. - V. 34(10). - P. 1351-1361.

123. Jiang, B. Inactivated rotavirus vaccines: A priority for accelerated vaccine development / B. Jiang, J.R. Gentsch, R. I. Glass // Vaccine 2008. -V. 26(52).-P. 6754-6758.

124. Kang, G. Epidemiological profile of rotaviral infection in India: challenges for the 21st century / G. Kang, S.D. Kelkar, S.D. Chitambar et al. // J. Infect. Dis. 2005. - V. 192(S 1).-P. S120-S126.

125. Kang, J.O. G and P genotyping of human rotavirus isolated in a university hospital in Korea: implications for nosocomial infections / J.O. Kang,

126. C.R. Kim, P. E. Kilgore et al. // J. Korean Med. Sci. 2006. - V. 21(6). - P. 983988.

127. Kerin, T.K. Characterization of VP6 genes from rotavirus strains collected in the United States from 1996-2002 / T.K Kerin., E.M. Kane, R.I. Glass et al. // Virus Genes. 2007. - V. 35(3). - P. 489-495.

128. Khamrin, P. Emergence of human G9 rotavirus with an exceptionally high frequency in children admitted to hospital with diarrhea in Chiang Mai, Thailand / P. Khamrin, S. Peerakome, L. Wongsawasdi et al. // J. Med. Virol. -2006. V. 78(2). - P. 273-280.

129. Kou, X. Simultaneous detection of norovirus and rotavirus in oysters by multiplex RT-PCR / X. Kou, W. Qingping, D. Wang et al. // Food Control -2008.-No. 19.-P. 722-726.

130. Le, V.P. Detection of unusual rotavirus genotypes G8P8. and G12P[6] in South Korea / V.P. Le, J.Y. Kim, S.L. Cho et al. // J. Med. Virol. -2008. -V. 80(1). P. 175-182.

131. Le, V.P. Changing profile of rotavirus in Ireland: Predominance of P8. and emergence of P[6] and P[9] in mixed infections / V.P. Le, J.Y. Kim, S.L. Cho et al. // J. Med. Virol. 2008. - V. 80(3). - P. 524-530.

132. Macedo, C.I. G and P rotavirus genotypes in stool samples from children in Teresina / C.I. Macedo, A. Christofoletti, V. Munford et al. // Rev. Soc. Bras. Med. Trop. 2007. - V. 40(4). - P. 381-384.

133. Martella, V. Detection of a porcine-like rotavirus in a child with enteritis in Italy / V. Martella," D. Colombrita, E. Lorusso et al. // J. Clin. Microbiol. 2008. - V. 46(10). - P. 3501-3507.

134. Maunula, L. Frequent reassortments may explain the genetic heterogeneity of rotaviruses: analysis of Finnish rotavirus strains / L. Maunula, C.H. Von Bonsdorff // J. Virol. 2002. - V. 76(23). - P. 11793-11800.

135. Medici, M.C.Characterization of inter-genogroup reassortant rotavirus strains detected in hospitalized children in Italy / M.C. Medici, L.A. Abelli, V. Martella et al. // J. Med. Virol. 2007. - V. 79(9). - P. 1406-1412.

136. Muller, H. Rotaviruses: diversity and zoonotic potential-a brief review / H. Muller, R. Johne // Berl Munch. Tierarztl. Wochenschr. 2007. - V. 120(3-4). -P. 108-112.

137. Newall, A.T. Burden of severe rotavirus disease in Australia / A.T. Newall, R. Macintyre, H. Wang et al. // J. Paediatr. Child Health. 2006. -V. 42(9).-P. 521-527.

138. Newburg, D.S. Role of human-milk lactadherin in protection against symptomatic rotavirus infection / D.S. Newburg, J.A. Peterson, G.M. Ruiz-Palacios et al. //Lancet. 1998. -V. 351(9110). - P. 1160-1164.

139. Nguyen, T.A. Sequence analysis of Vietnamese P6. rotavirus strains suggests evidence of interspecies transmission / T.A. Nguyen, P. Khamrin, Q.D. Trinh et al. // J. Med. Virol. -2007. V. 79(12). - P. 1959-1965.

140. Nguyen, T.A. Diversity of viruses associated with acute gastroenteritis in children hospitalized with diarrhea in Ho Chi Minh City, Vietnam / T.A. Nguyen, F Yagyu., M. Okame et al. // J. Med. Virol. 2007. - V. 79(5). - P. 582590.

141. O'Ryan, M. A millennium update on pediatric diarrhoeal illness in the developing world / M. O'Ryan, V. Prado, L.K. Pickering // Semin. Pediatr. Infect. Dis. 2005. - V. 16(2). - P. 125-136.

142. Parashar, U.D. Global illness and deaths caused by rotavirus disease in children / U.D.Parashar, E.G.Hummelman, J.S.Bresee, et al. // Emerg. Infect. Dis. -2003; -V. 9. P. 562-72.

143. Parashar, U.D. Rotavirus and severe childhood diarrhea / U.D. Parashar, C.J. Gibson, J.S. Bresse et al. // Emerg. Infect. Dis. 2006. - V. 12(2). -P. 304-306.

144. Parra, G.I. Diversity of group A rotavirus strains circulating in Paraguay from 2002 to 2005: Detection of an atypical Gl in South America / G.I. Parra, E.E. Espinola, A.A. Amarilla et al. // J. Clin. Virol. 2007. - V. 40(2). -P. 135-141.

145. Perez-Schael, I. Rotavirus mortality confirmed by etiologic identification in Venezuelan children with diarrhea / I. Perez-Schael, B. Salinas, R. Gonzalez et al. // Pediatr. Infect. Dis. J. 2007. - V. 26(5). - P. 393-397.

146. Perez-Vargas, J. Rotavirus vaccine: early introduction in Latin America-risks and benefits / J. Perez-Vargas, P. Isa, S. Lopez et al. // Arch. Med. Res. 2006. - V. 37(1). - P. 1-10.

147. Phan, T.G. Detection and Genetic Characterization of Group A Rotavirus Strains Circulating among Children with Acute Gastroenteritis in Japan / T.G. Phan, P. Khamrin, T.D. Quang et al. // J. Virol. 2007. - V. 81(9). - P. 46454653.

148. Podewils, L.J. Projected cost-effectiveness of rotavirus vaccination for children in Asia / L.J. Podewils, L. Antil, E. Hummelman et al. // J. Infect. Dis. -2005.-V. 192(S1).-P. S133-S145.

149. Rahman, M. Detection and characterization of human group C rotaviruses in Bangladesh / M. Rahman, S. Banik, A. Faruque et al. // J. Clin. Microbiol. 2005. - V. 43(9). - P. 4460-4465.

150. Rahman, M. Characterization of a novel P25.,G11 human group a rotavirus / M. Rahman, J. Matthijnssens, S. Nahar et al. // J. Clin. Microbiol. -2005. V. 43(7). - P. 3208-3212.

151. Rahman, M. Prevalence of P4.G2and P[6]G12 rotavirus, Bangladesh / M. Rahman, R. Sultana, G. Ahmed et al. // Emerg. Infect. Dis. 2007. - V. 13(1). -P. 18-24.

152. Rahman, M. Emerging G9 rotavirus strains in the northwest of China / M. Rahman, X.L. Yang, H. Sun // Virus Res. 2008. - V. 137(1). - P. 157-162.

153. Ramani, S. Burden of disease and molecular epidemiology of group A rotavirus infections in India / S. Ramani, G. Kang // Indian J. Med. Res. 2007. -V. 125(5).-P. 619- 632.

154. Ramig, R.F. Systemic rotavirus infection / R.F. Ramig // Expert. Rev. Antiinfect. Ther. 2007. - V. 5(4). - P. 591-612.

155. Ray, P. G. Prevalence of neutralizing antibodies against different rotavirus serotypes in children with severe rotavirus-induced diarrhea and their mothers / P. G. Ray, S.D. Kelkar // Clin. Diagn. Lab Immunol. 2004. - V. 11(1). -P. 186-194.

156. Reidy, N. Emergence of G3 and G9 rotavirus and increased incidence of mixed infections in the southern region of Ireland 2001-2004 / N. Reidy, F. O'Halloran, S. Fanning et al. // J. Med. Virol. 2005. - V. 77(4). - P. 571-578.

157. Rendi-Wagner, P. Active hospital-based surveillance of rotavirus diarrhea in Austrian children, period 1997 to 2003 / P. Rendi-Wagner, M. Kundi, A. Mikolasek et al. // Wien. Klin. Wochenschr. 2006. - V. 118(9-10). - P. 280285.

158. Roman, E. Viruses causing gastroenteritis / E. Roman, I. Wilhelmi, A. Sanchez-Fauquier // Clin. Microbiol. Infect. 2003. - V. 9 (4). - P. 247-262.

159. Ruiz-Palacios, G.M. Safety and efficacy of an attenuated vaccine against severe rotavirus gastroenteritis / G.M. Ruiz-Palacios, I. Perez-Schael, F.R. Velazquez et al. // N. Engl. J. Med. 2006. - V. 354(1). - P. 11-22.

160. Rzezutka, A. Survival of human enteric viruses in the environment and food / A. Rzezutka, N. Cook // FEMS Microbiol. Rev. 2004. - V. 28(4). -P. 441-453.

161. Santos, N. Global distribution of rotavirus serotypes/genotypes and its implication for the development and implementation of an effective rotavirus vaccine /N. Santos, Y. Hoshino // Rev. Med. Virol. 2005. - V. 15(1). - P. 29-56.

162. Santosham, M. Implementing rotavirus vaccination in Asia / M. Santosham, E.A. Nelson, J.S. Bresee // Vaccine. 2007. - V. 25(44). - P. 77117716.

163. Schultz R. Rotavirus gastroenteritis in the Northern Territory, 19952004 / R. Schultz // Med. J. Aust. 2006. - V. 185(7). - P. 354-356.

164. Sharma, S. Emergence of G12 Rotavirus strains in Delhi, 2000-2007 / S. Sharma, P. Ray, J.R. Gentsch et al. // J. Clin. Microbiol. 2008. - V. 46(4). -P. 1343-1348.

165. Snelling, T. Nosocomial rotavirus infection in an Australian children's hospital / T. Snelling, T. Cripps, K. Macartney et al. // J. Paediatr. Child Health. -2007.-V. 43(4). P. 318.

166. Soriano-Gabarro, M. Burden of rotavirus disease in European Union countries / M. Soriano-Gabarro, J. Mrukowicz, T. Vesikari et al. // Pediatr. Infect. Dis. J.-2006. -V. 25(S1)-P. S7-S11.

167. Steele, A.D. Anticipating rotavirus vaccines: epidemiology and surveillance of rotavirus in South Africa / A.D. Steele, I. Peenze, M.C. de Beer et al. //Vaccine. 2003. - V. 21(5-6). - P. 354-360.

168. Steyer, A. Rotavirus genotypes in Slovenia: Unexpected detection of G8P8. and G12P[8] genotypes / A. Steyer, M. Poljsak-Prijatelj, T.L. Bufon et al. // J. Med. Virol. 2007. - V. 79(5). - P. 626-632.

169. Stockman, L.J. Optimum diagnostic assay and clinical specimen for routine rotavirus surveillance / L.J. Stockman, M.A. Staat, M. Holloway et al. // J. Clin. Microbiol. 2008. -V. 46(5). - P. 1842-1843.

170. Suzuki, H. Peak rotavirus activity shifted from winter to early spring in Japan / H. Suzuki., T. Sakai, N. Tanabe et al. // Pediatr. Infect. Dis. J. 2005. -V. 24-P. 257-260.

171. Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEG A4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0 // Mol. Biol. Evol. -2007. V. 24 (3). - P. 1596-1599.

172. Tcheremenskaia, O. Molecular epidemiology of rotavirus in Central and Southeastern Europe / O. Tcheremenskaia, G. Marucci, S. De Pétris et al // J. Clin. Microbiol. 2007. - V. 45(7). - P. 2197-2204.

173. Turcios, R.M. Temporal and geographic trends of rotavirus activity in the United States, 1997-2004 / R.M. Turcios, A.T. Curns, R.C. Holman et al. // Pediatr. Infect. Dis. J. 2006. - V. 25(5). - P. 451-454.

174. Van Damme, P. Distribution of Rotavirus Genotypes in Europe, 20042005: The REVEAL Study / P. Van Damme, C. Giaquinto, M. Maxwell et al. // J. Infect. Dis. 2007. - V. 195(S1). - S17-S25.

175. Van de Perre, P. Transfer of antibody via mother's milk / P. Van de Perre // Vaccine. 2003. - V. 21(24). - P. 3374-3376.

176. Wang, Y. Rotavirus infection alters peripheral T-cell homeostasis in children with acute diarrhea / Y. Wang, P.H. Dennehy, H.L. Keyserling et al. // J. Virol. 2007. - V. 81(8). - P. 3904-3912.

177. Xu, J. Serum antibody responses in children with rotavirus diarrhea can serve as proxy for protection / J. Xu, P. Dennehy, H. Keyserling et al. // Clin. Diagn. Lab Immunol. 2005. - V. 12(2). - P. 273-279.

178. Yang, X.L. Temporal changes of rotavirus strain distribution in a city in the northwest of China, 1996-2005 / X.L. Yang, J. Matthijnssens, H. Sun et al. // Int. J. Infect. Dis. 2008. - V. 12(6). - P. el 1 -el7.

179. Yoshinaga, M. Changing distribution of group A rotavirus G-types and genetic analysis of G9 circulating in Japan / M. Yoshinaga, T.G. Phan, T.A. Nguyen et al.//Arch. Virol. 2006. - V. 151(1).-P. 183-192.