Автореферат и диссертация по медицине (14.03.03) на тему:Тканеспецифичные особенности экспрессии генов, ассоциированных со стрессом эндоплазматического ретикулума под действием гомоцистеина

ДИССЕРТАЦИЯ
Тканеспецифичные особенности экспрессии генов, ассоциированных со стрессом эндоплазматического ретикулума под действием гомоцистеина - диссертация, тема по медицине
АВТОРЕФЕРАТ
Тканеспецифичные особенности экспрессии генов, ассоциированных со стрессом эндоплазматического ретикулума под действием гомоцистеина - тема автореферата по медицине
Меситов, Михаил Валентинович Москва 2012 г.
Ученая степень
кандидата биологических наук
ВАК РФ
14.03.03
 
 

Автореферат диссертации по медицине на тему Тканеспецифичные особенности экспрессии генов, ассоциированных со стрессом эндоплазматического ретикулума под действием гомоцистеина

На правах рукописи

МЕСИТОВ Михаил Валентинович

ТКАНЕСПЕЦИФИЧНЫЕ ОСОБЕННОСТИ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ СО СТРЕССОМ ЭНДОПЛАЗМАТИЧЕСКОГО РЕТИКУЛУМА ПОД ДЕЙСТВИЕМ ГОМОЦИСТЕИНА

14.03.03 - Патологическая физиология

АВТОРЕФЕРАТ

диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Москва-2012

005054774

005054774

Работа выполнена в Лаборатории молекулярных механизмов тромбогенеза и тромболизиса Федерального государственного бюджетного учреждения «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии» Российской академии медицинских наук

Научные руководители: доктор медицинских наук, профессор, академик РАМН

Аслан Амирханович Кубатиев

Кандидат медицинских наук, Алексей Александрович Московцев

Официальные онпоненты:

Михаил Юрьевич Карганов

Доктор биологических наук, профессор

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии» РАМН Заведующий Лабораторией полисистемных исследований

Всеволод Иванович Киселев

Доктор биологических наук, профессор, член-корреспондент РАМН

ГНЦ РФ Институт медико-биологических проблем РАН

Главный научный сотрудник Отдела молекулярно-клеточной медицины

бюджетное высшего Российский

Ведущая организация: Федеральное государственное

образовательное учреждение

профессионального образования

университет дружбы народов

Защита состоится « //» рклии^ 2012 года в часов на заседании

Диссертационного совета Д 001.0d3.01 при Федеральном государственном бюджетном учреждении «Научно-исследовательском институте общей патологии и патофизиологии» РАМН, по адресу: 125315, г. Москва, ул. Балтийская, дом 8.

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке ФГБУ «НИИОПП» РАМН

Автореферат разослан « $ » 2012 года

Ученый секретарь

Диссертационного совета, кандидат медицинских наук

Л.Н. Скуратовская

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы. Клеточный стрессовый ответ относится к числу механизмов, лежащих в основе патогенеза широкого спектра заболеваний. Изменения внутренней среды организма при патологических состояниях могут индуцировать стрессовые ответы определенных типов клеток в зависимости от их чувствительности к меняющимся факторам среды.

Клеточный стресс представляет собой универсальную неспецифическую форму системной реакции клетки на любую форму макромолекулярных повреждений, превышающих пороговую величину (Kültz D., 2003; Кубатиев A.A. и др., 2012). Стрессовая реакция необходима для временного увеличения толерантности к повреждениям макромолекул посредством использования филогенетически консервативных наборов генов и биохимических путей, которые опосредуют макромолекулярную стабилизацию и репарацию в клетке для обеспечения клеточной и организменной целостности в субоптимальных условиях (Kültz D, 2003). Структурированность эукариотической клетки, наличие отличающихся по составу внутренней среды компартментов с мембранами, выполняющими барьерные функции, и защитными системами, индуцируемыми независимо от цитоплазматических, обусловливают неодинаковую чувствительность к воздействиям и разную степень вовлеченности структурно-функциональных модулей клетки в стрессовый ответ. Факт наличия активных, стабилизирующих структуру и функцию биологического модуля, неспецифических «буферных» механизмов позволил масштабировать и использовать понятие «стресс» на субклеточном уровне, то есть рассматривать компартментализованный вариант клеточного стресса.

К числу компартментов эукариотической клетки, способных к инициации специальной формы стрессового ответа, относится эндоплазматический ретикулум (ЭПР) - многофункциональная органелла, одной из важнейших функций которой является конформационное созревание белков - в ЭПР осуществляется фолдинг около 30% белков эукариот (Hetz С., 2012). Нарушения процессов конформационного созревания белков могут стать причиной развития протеотоксического стресса, динамика которого определяется интенсивностью de novo синтеза и обновления клеточных и экстраклеточных белков. Продукты незаконченной трансляции, интермедиаты фолдинга с некорректной конформацией, а также субъединицы, не включенные в олигомерные белковые комплексы, могут экспонировать гидрофобные области (Hart F.U., Hayer-Hartl М., 2009), которые становятся дополнительными, «незаконными» интерфейсами для межмолекулярного взаимодействия и могут приводить к агрегации белков, формированию токсичных и иммуногенных продуктов. Накопление конформационно-дефектных белков в люмене ЭПР в связи со множественностью функций и единым объемом этого компартмента может инициировать нарушения работы других систем ЭПР, и тем самым индуцировать состояние, характеризуемое как стресс эндоплазматического ретикулума (Ron D Walter P., 2007).

Для защиты от протеотоксического стресса и ошибок работы системы конформационного созревания белков в ЭПР эукариот возникли следующие приспособления: 1) рецепция белков с ненативными конформациями в ЭПР; 2) обработка и передача информации в ядро о детектированных белках с дефектными

з

или незрелыми конформациями; 3) адаптационные изменения ЭПР и ассоциированных структур, общим результатом действия которых должно стать снижение концентрации дефектных белков в люмене ЭПР.

Перечисленные функции реализуются посредством нескольких механизмов, действующих зачастую совместно: 1) система сигнальных каскадов ответа на белки с ненативными конформациями (Unfolded Protein Response, UPR); 2) контроль трансляции - аттенюация кеп-зависимой трансляции, опосредуемая киназой PERK; 3) активация транскрипционного фактора ATF6; 4) ответ на избыток белка в люмене ЭПР, или «перегрузку» ЭПР (endoplasmic reticulum overload response, EROR), опосредуемый активированным транскрипционным фактором NF-kappaB.

Таким образом, в компартменте ЭПР при различных нарушениях может иметь место локализованный протеотоксический стресс. При дефектах или функциональной недостаточности системы контроля качества стресс может быть «генерализован» во внутри- и внеклеточном пространстве. Невозможности компенсации стресса индуцирует программированную клеточную гибель (Szegezdi Е. et al, 2006).

Несмотря на значительный интерес исследователей, динамические аспекты регуляции стресса ЭПР в клетках человека различных типов изучены недостаточно. Способность клеток различных типов к эффективной реализации во времени адаптивной фазы стресса ЭПР определяет устойчивость клеток к стрессу и их дальнейшую выживаемость. В этой связи, анализ тканеспецифичных особенностей временных профилей экспрессии генов системы UPR, в частности, BiP, ХВР1, кинетики сплайсинга ХВР1 и соотнесение динамики этих процессов с индукцией проапоптотического гена CHOP, а также анализом клеточной гибели представляются актуальными задачами исследования.

При гипергомоцистеинемии - распространенном патологическом состоянии (Hashimoto Т. et al, 2007), ассоциированном с сердечно-сосудистыми, нейродегенеративными заболеваниями, инсулиннезависимым диабетом и рядом других патологий, возросший уровень аминокислоты гомоцистеина в плазме крови может оказывать стресс-индуцирующее действие на клетки. Предполагается, что гомоцистеин может активировать стрессовый ответ эндотелиоцитов и быть причиной развития эндотелиальной дисфункции, при этом формой стрессовой реакции может быть стресс ЭПР и IRE 1-зависимый апоптоз (Zhang С. et al, 2001).

ЭПР-стресс как результат нарушений конформационного созревания белков может играть ключевую роль в патогенезе ассоциированных с гипергомоцистеинемией заболеваний и способен рассматриваться как типовой молекулярно-патофизиологический процесс. В связи с этим, исследование ЭПР-стрессовых ответов клеток разных типов и различной тканевой принадлежности имеет важнейшее фундаментальное и прикладное значение для патофизиологии и биомедицинской науки в целом. С учетом вовлеченности сосудистой стенки в развитие патологического состояния гипергомоцистеинемии (Kubatiev A. et al, 2005), изучение стресса эндоплазматического ретикулума в эндотелиоцитах и взаимодействующих с ними клетках иммунной системы является актуальной задачей.

Цель исследования. Целью настоящего исследования является сравнительный анализ экспрессионных профилей генов, вовлеченных в стресс эндоплазматического ретикулума, а также выявление неизвестных ранее тканеспецифических особенностей их регуляции под действием гомоцистеина in vitro и в условиях экспериментальной гипергомоцистеинемии in vivo. Задачи исследования:

1. Провести исследование уровней мРНК генов ХВР1, BiP и CHOP, ассоциированных со стрессом ЭПР, в клетках Т-лимфоцитарной линии Jurkat и эндотелиоцитарной линии EA.hy926 под действием гомоцистеина in vitro.

2. Изучить динамику внутриклеточных концентраций белков стрессового ответа BiP и CHOP в клетках линий Jurkat и EA.hy926 под действием гомоцистеина.

3. Установить взаимосвязь временных профилей экспрессии генов стрессового ответа и концентраций их белковых продуктов с процессами клеточной гибели и распределением клеток по фазам клеточного цикла.

4. Выявить особенности экспрессии генов стрессового ответа на модели гипергомоцистеинемии in vivo.

Научная новизна исследования. Впервые проанализирована экспрессия генов BiP, CHOP и ХВР1, участвующих в формировании стрессового ответа, в клетках линии Т-лимфобластной лейкемии человека Jurkat. Получены временные профили экспрессии генов в линиях клеток Jurkat и EA.hy926, свидетельствующие о клеточно-специфичной динамике стрессового ответа, определяемой морфофункциональными особенностями эндоплазматического ретикулума этих клеток. Впервые показано отсутствие корреляции между изменением уровня мРНК гена CHOP и его белкового продукта в клетках Jurkat и EA.hy926, что может указывать на важность посттранскрипционных механизмов в регуляции экспрессии генов системы сигнальных каскадов UPR, участвующих в принятии решения клеткой о запуске про-или антиапоптотических механизмов.

Теоретическая и практическая значимость работы. Полученные в работе данные углубляют существующие представления о динамике развития стрессового ответа в линиях клеток, различающихся по морфофункциональным свойствам эндоплазматического ретикулума, но имеющих идентичную организацию системы сигнальных каскадов UPR. Обнаруженные в работе особенности экспрессии проапоптотического гена CHOP могут указывать на существование нового регуляторного механизма при стрессе эндоплазматического ретикулума. Практическая значимость полученных данных состоит в возможности использования белков BiP и CHOP в качестве маркеров для диагностики стресса ЭПР in vivo.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Гомоцистеин способен вызывать стресс ЭПР в клетках различного тканевого происхождения (клетки Т-лимфоцитарной линии Jurkat и эндотелиоцитарной линии EA.hy926).

2. Степень чувствительности и устойчивости к стрессу ЭПР под действием гомоцистеина зависит от типа клеток и их тканевого происхождения.

3. Специфичность функционирования системы UPR в клетках Т-лимфоцитарной линии Jurkat и эндотелиоцитарной линии EA.hy926 выражается в различной динамике и уровнях экспрессии генов стрессового ответа.

4. Неполная корреляция между уровнями мРНК и концентрациями белковых продуктов генов стрессового ответа, прежде всего CHOP, указывает на возможность вовлечения дополнительных посттранскрипционных механизмов регуляции в систему сигнальных каскадов UPR.

5. Ключевую роль при стрессе ЭПР играет времязависимая регуляция системы UPR.

Апробация работы. Материалы диссертации были доложены на межлабораторной конференции Отдела молекулярной и клеточной патофизиологии ФГБУ «НИИОПП» РАМН (Россия, Москва, 26 июня 2012), на Циклах усовершенствования врачей и научно-педагогических кадров по молекулярной и клеточной патологии в РМАПО МЗ РФ (Россия, Москва, 2011 - 2012), на VII съезде аллергологов и иммунологов стран СНГ (Россия, Санкт-Петербург, 2009), IV международном конгрессе «Stress Responses in Biology and Medicine» (Япония, Саппоро, 2009).

Публикации по теме диссертации. По материалам диссертационной работы опубликовано 2 статьи в рецензируемых журналах, рекомендованных ВАК РФ.

Структура и объем диссертации. Диссертация состоит из следующих разделов: введения, обзора литературы, описания материалов, объектов и экспериментальных методов исследования, результатов и их обсуждения, выводов и списка цитируемой литературы. Работа изложена на 147 страницах машинописного текста, содержит 23 рисунка и 5 таблиц. Список литературы включает 166 источников.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

Клеточные линии. Исследования выполнены на линиях клеток Jurkat (Т-клеточный лимфобластоидный лейкоз человека), полученной из Российской коллекции культур клеток позвоночных, и EA.hy926 (гибрид первичной культуры эндотелиальных клеток пупочной вены человека HUVEC и тиогуанин-резистивного клона линии клеток аденокарциномы легкого А549). Клетки EA.hy926 были любезно предоставлены доктором Edgel С. J. (Университет Северной Каролины, США).

Инкубация клеток с D,L-roMOHiiCTCniioM и дитиотрейтолом. Клетки Jurkat инкубировали в полной питательной среде RPMI-1640 с добавлением 10% ТЭС в присутствии различных концентраций исследуемых препаратов в течение 0-24 ч., в атмосфере с 5% содержанием С02, при 37°С. Клетки EA.hy926 инкубировали в полной питательной среде DMEM (4,5г/л глюкозы) с добавлением 10% ТЭС, 50мкг/мл гентамицина, 2ммоль/л глютамина, 1% NEAA и суплемента HAT в присутствии различных концентраций исследуемых препаратов в течение 0-24 ч., в атмосфере с

б

5% содержанием С02, при 37°С. Контролем служили интактные клетки, которые инкубировали в тех же условиях, но в отсутствии препаратов.

Лазерная конфокальная сканирующая микроскопия (JIKCM). Сравнительный анализ морфологии эндоплазматического ретикулума в клетках Jurkat и EA.hy926 проводили методом прижизненно окрашивания карбоцианиновым красителем 3,3'-дигексилоксакарбоцианин перхлоратом (DiOC6). Визуализацию препаратов осуществляли с помощью конфокального лазерного сканирующего микроскопа Nikon CI («Nikon Corporation», Япония).

Иммуноцитохимия. Оценку содержания и распределения исследуемых белков в клетках проводили методом иммуноцитохимии, с использованием лазерного конфокального сканирующего микроскопа Nikon С1.

Проточно-цитофлуориметрический анализ. Изменения уровней белков BiP и CHOP в клетках Jurkat (плотность 5x105 клеток/мл.) и EA.hy926 (плотность 4x105 клеток/мл.), а также в выделенных клетках печени крыс анализировали методом иммунофлуоресценции с использованием проточного цитофлуориметра FACSCalibur («Becton-Dickinson Biosciences», США). Регистрацию интенсивности флуоресценции клеток проводили по каналу FL1 (FITC). Сбор и анализ данных осуществляли с использованием программного обеспечения CellQuest, версия 6.0 («Becton-Dickinson Biosciences», США).

Определение апонтотических клеток по окрашиванию ДНК пропидий йодидом. Для определения апоптотических клеток, ядерную ДНК окрашивали фенантридиновым флуорофором пропидий йодидом, используя для этой цели коммерческий набор BD Pharmingen™ PI/RNase Staining Buffer и предложенный производителем протокол. Суспензию клеток, окрашенных PI, анализировали методом проточной цитофлуориметрии с использованием цитометра FACSCalibur. Сбор и анализ данных проводили с использованием программного обеспечения CellQuest, версия 6.0.

Анализ клеточного цикла. Для исследования изменений клеточного цикла ядерную ДНК окрашивали пропидий йодидом, используя для этой цели коммерческий набор BD Pharmingen™ PI/RNase Staining Buffer и предложенный производителем протокол. Суспензию клеток, окрашенных PI, анализировали методом проточной цитофлуориметрии с использованием цитометра FACSCalibur. Анализ файловых данных проводили в программном обеспечении ModFit LT, версия 3.2 («Software House», США).

Выделение суммарной клеточной РНК. Суммарную РНК выделяли из 2x106 клеток Jurkat и 1х106 клеток EA.hy926 с использованием набора реагентов RNeasy® Mini Kit («Qiagen GmbH», Германия). Концентрацию РНК определяли на спектрофотометре NanoDrop® ND-1000 («NanoDrop Technologies Inc.», США). Для оценки качества (целостности) выделенной суммарной РНК проводили электрофорез в 1,2% агарозном геле. С целью предотвращения контаминации геномной ДНК, выделенную суммарную РНК из всех использованных в исследовании образцов клеток обрабатывали ДНКазой I («Fermentas», Литва).

Реакция обратной транскрипции. Перед реакцией количество суммарной РНК выравнивали с использованием флуориметра Qubit («Invitrogen», США). Реакцию обратной транскрипции проводили с использованием олиготимидиновых праймеров oligo-dT(ig) и обратной транскриптазы M-MuLV (без активности РНКазы Н) в составе

7

набора RevertAid™ Н Minus First Strand cDNA Synthesis Kit («Fermentas», Литва) в соответствии с протоколом производителя.

Полимеразная цепная реакция «в реальном времени» (ПЦР-РВ). Реакцию проводили с использованием набора реактивов Maxima™ SYBR Green/ROX qPCR MasterMix (2X) («Fermentas», Литва), включающим интеркалирующий краситель Sybr Green, на амплификаторе CFX96™ Real-Time PCR Detection Systems («Bio-Rad Laboratories, Inc.», США) при следующих условиях: начальная денатурация - 95°С, Юмин.; циклирование (40 циклов) - денатурация - 95°С, 15сек., отжиг - 55°С, ЗОсек., элонгация - 72°С, ЗОсек. Регистрация интенсивности флуоресценции SybrGreen, связанного с двухцепочечной ДНК, и пассивного референсного красителя ROX проходила автоматически в конце стадии элонгации каждого цикла при 72°С по каналам FAM/SybrGreen и ROX. Для подтверждения специфичности реакции, после последнего цикла снимали кривую плавления при следующих условиях: предварительное удерживание - 60°С, ЗОсек; диапазон плавления - от 55°С до 95°С с шагом 0,5°С, беек.

В каждую экспериментальную постановку включали контрольные реакции: отрицательный контроль без матрицы (кДНК); отрицательный контроль с неспецифической матрицей - суммарной РНК; положительный контроль, содержащий кДНК гена GAPDH (glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase), синтезированную в реакции обратной транскрипции совместно с экспериментальными образцами, но на основе синтетической мРНК гена GAPDH, приложенной производителем к набору (Ребриков Д.В. и др., 2009).

В нашей работе расчет уровня матричной РНК (мРНК) генов ХВР1, BiP и CHOP проводили с использованием алгоритма 2"MCt, в основу которого положены относительные изменения пороговых циклов (Ct) исследуемого гена и гена «домашнего хозяйства», в опытных и контрольных образцах (Livak K.J., Schmittgen T.D., 2001; Wong M.L., Medrano J.F., 2005). Для увеличения точности получаемых результатов, при их нормировании с использованием «гена домашнего хозяйства», предварительно было оценено изменение экспрессии сразу нескольких таких генов (Vandesompele J. et al, 2002), наиболее известных по литературным данным. Более стабильный уровень мРНК продемонстрировали гены GAPDH и HPRT1 (hypoxanthine phosphoribosyl transferase 1). В дальнейших расчетах мы использовали значения уровня мРНК только гена GAPDH. Обработанные данные представляли в виде среднего значения, выраженного в относительных единицах, +/- стандартное отклонение по выборке.

Животные. Работа проводилась на 25 самцах беспородных белых крыс массой 100 - 145 г. Животных содержали в стандартных условиях вивария при свободном доступе к пище и воде. Массу тела крыс определяли перед началом эксперимента и далее перед каждой новой серией инъекций.

Моделирование токсического действия гомоцистеина in vivo. Раствор гомоцистеина для инъекций готовили на стерильном физиологическом растворе. Все крысы были распределены на пять экспериментальных групп по пять животных в каждой. Первой группе крыс гомоцистеин вводили внутрибрюшинно, второй -подкожно, из расчета 0,6 мкмоль гомоцистеина на 1 г. массы тела, один раз в день (Streck E.L. et al, 2002; Streck E.L. et al, 2003). Животным контрольных групп вводили соответствующий объем физиологического раствора. Пятая группа животных была

8

интактной. Длительность введения гомоцистеина определялась кинетикой развития ответа на стресс, ранее уточненной в ходе предварительно проведенных экспериментов, в которых было установлено, что пик острого ответа приходился на 4 - 5 день. Через 1 час после последней инъекции крысы были декапитированы гильотиной согласно требованиям международных правил работы с животными, взята кровь и органы. Сыворотку анализировали на количественное содержание гомоцистеина методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (Иванов А.В. и др., 2011). Печень взвешивали и часть использовали для получения взвеси клеток.

Получение клеточной взвеси из ткани печени. Навески печени помещали в ростовую среду RPMI-1640 с 5% ТЭС и гомогенизировали в стеклянном гомогенизаторе. Профильтрованную суспензию клеток подвергали гипотоническому шоку для удаления мертвых клеток и эритроцитов. Далее клетки окрашивали моноклональными антителами для последующего проточно-цитофлуориметрического анализа.

Статистическая обработка данных. Статистическую обработку результатов производили с помощью программного обеспечения Statistica, версия 6.0 (StatSoft Inc, США), а также Microsoft Excel. Использовались однофакторный дисперсионный анализ и критерий Крускала-Уоллиса. Различия считались достоверными при р<0,05.

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

1. Морфофункциональные особенности эндоплазматического ретикулума в клеточных линиях EA.hy926 и Jurkat

Клетки линий EA.hy926 и Jurkat представляют собой функционально и морфологически разные клеточные типы: первые имеют эндотелиальное происхождение и являются адгезивной культурой, вторые - Т-лимфоцитарное с суспензионным типом роста. Нами был проведен сравнительный анализ степени >азвития ЭПР в этих двух клеточных типах. На рисунке 1 представлены полученные нами методом ЛКСМ микрофотографии прижизненно меченых клеток флуоресцентным зондом DIOC6. Данный зонд связывается с мембранами ¡нутриклеточных ретикулярных сетей и, в использованной концентрации, позволяет ;изуализироватъ ЭПР. С учетом неспецифичности мечения зондом, [редпочтительным местом визуализации ЭПР является периферия клеток.

На микрофотографиях видно, что клетки EA.hy926 и Jurkat обладают различным дерно-цитоплазматическим отношением и разной степенью развития ндоплазматического ретикулума: площадь, занимаемая ЭПР в клетках EA.hy926 в [есколько раз превышает таковую в клетках Jurkat. Известно, что эндотелиоциты интезируют и секретируют большое количество белковых продуктов, в том числе )актор Виллебранда, запасаемый в тельцах Вейбеля-Палада, причем синтез и нутриклеточное депонирование фактора меняются при стрессе ЭПР (Игнашкова Т.И. [ др., 2012). Различия в площади и объеме ЭПР этих двух клеточных типов ссоциированы с разной степенью интенсивности синтеза белка. Эти различия пределяются функциональными особенностями данных клеток и, по-видимому, югут обусловливать неодинаковую чувствительность к действию факторов, ¡ндуцирующих стресс ЭПР. Большее количество молекулярных сенсоров системы JPR и высокая концентрация белка в люмене ЭПР активно секретирующих клеток,

9

достигающая 100мг/мл (Stevens F.J., Argon Y., 1999; Wu J., Kaufman R.J., 2006), могут, по нашему предположению, привести к отличиям в динамике стрессового ответа: в частности, к различной длительности фаз интеграции сигналов, разным амплитуде и положению на временной шкале максимумов экспрессии генов стрессового ответа.

Рис. 1. Различная степень развития ЭПР в клетках двух линий, меченных зондом DIOC6: А - клетки линии EA.hy926; Б и В - клетки линии Jurkat; Г - фрагмент ЭПР клеток линии EA.hy926.

2. Изменения экспрессии генов системы UPR в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием 0,Ь-гомоцис геина и дитиотрейтола

Одним из предполагаемых механизмов патологического действия гомоцистеина на клетку является стресс эндоплазматического ретикулума (Austin R.C. et al, 2004; Roybal C.N. et al, 2004), в ответ на который в клетке активируется система сигнальных путей UPR (Ron D., Walter P., 2007; Merksamer P.I., Papa F.R., 2010). В ряде раб о показано, что действие гомоцистеина может приводить к аресту клеточного цикла, стрессу ЭПР и апоптозу эндотелиальных клеток, следствием чего может быть целыГ: ряд патологий, связанных с повреждением стенки сосуда (Outinen Р.A. et al, 1999; Zhang С. et al, 2001).

Известны иммунорегуляторные эффекты гомоцистеина при сердечнососудистых заболеваниях: индукция секреции хемокинов и цитокинов моноцитами и Т-лимфоцитами, а также непосредственное стимулирование пролиферации В-лимфоцитов и секреции IgG. Под воздействием гомоцистеина эндотелиоциты продуцируют молекулы адгезии и хемокины, что приводит к увеличению адгезии

ю

лейкоцитов на эндотелии (Dai J., Wang X., 2007; Todd et al, 2008). Таким образом, гомоцистеин может влиять как на функционирование отдельных типов клеток, так и на их взаимодействие.

Для сравнительного исследования процесса развития стресса ЭПР в эндотелиоцитарной (EA.hy926) и Т-лимфоцитарной (Jurkat) клеточных линиях человека при воздействии Б,Ь-гомоцистеина и положительного индуктора стресса -дитиотрейтола (Outinen P.A. et al, 1999), была проанализирована экспрессия генов-участников системы UPR - BiP (immunoglobulin heavy chain-binding protein), XBP1 (X-box binding protein 1) и CHOP (C/EBP-homologous protein), на уровне мРНК. Клетки EA.hy926 и Jurkat инкубировали в течение различных временных интервалов с D,L-гомоцистеином и дитиотрейтолом (ДТТ), с концентрацией в ростовой среде 2,5мМ. Содержание мРНК анализировали методом ПЦР-РВ в присутствии интеркалирующего красителя SybrGreen.

2.1. Изменение уровня сплайсинговой формы гена ХВР1 в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием 0,Ь-гомоцистеина и дитиотрейтола. Транскрипционный фактор ХВР1 (ХВР2, или TREB5) является одним из ключевых регуляторов экспрессии генов шаперонов ЭПР, компонентов ЭПР-ассоциированной системы деградации белков, а также генов участников системы UPR (Lee A.-H. et al, 2003; Merksamer P.I., Papa F.R., 2010; Li X. et al, 2011). При стрессе ЭПР происходит активация трансмембранной киназы/эндорибонуклеазы IRE1, которая специфически распознает 5' и 3' сайты сплайсинга мРНК ХВР1 и вырезает 26-и нуклеотидный интрон. Это приводит к сдвигу рамки считывания и трансляции активного транскрипционного фактора (Yoshida et al, 2001; Lee К. et al, 2002). Поэтому мы использовали набор праймеров (Hirota M. et al, 2006) для определения относительного количества как общего пула мРНК ХВР1 (мРНК ХВР1(общ)), так и исключительно ее сплайсинговой формы (мРНК ХВР1(спл)). Образование и накопление сплайсинговой формы мРНК гена ХВР1 является характерным маркером активации сигнального пути IRE1-XBP1 системы UPR (Ron D. et al, 2007).

В нашей работе впервые показаны изменения экспрессии гена ХВР1 на уровне его мРНК - мРНК ХВР1(общ) и мРНК ХВР1(спл), в ответ на действие гомоцистеина на линии клеток Jurkat и EA.hy926 (Рис. 2). Согласно нашим данным, содержание мРНК ХВР1(спл) в клетках Jurkat росло пропорционально увеличению интенсивности стресс-индуцирующего воздействия (суммарного показателя - тип индуктора + время воздействия): при действии гомоцистеина уровень мРНК ХВР1(спл) в клетках Jurkat демонстрировал более ранний подъем (в 4,5 раза выше) и большую стабильность, чем в клетках EA.hy926. В последних уровень мРНК ХВР1(спл) менялся в большем диапазоне значений. Гомоцистеин вызывал значительный подъем только после 8 часов инкубации, тогда как действие ДТТ приводило к существенному росту уже после 4 часов (в 1,3 раза выше, чем в Jurkat) с последующим спадом в 3,3 раза после 8 часов инкубации. Необходимо отметить, что в клетках EA.hy926 количество мРНК ХВР1(спл) практически совпадало после 8 часов инкубации как с гомоцистеином, так и с ДТТ (5,31 и 5,90, соответственно).

Количество мРНК ХВР1(общ) отражает общий уровень транскрипции гена ХВР1. Полученные данные указывают на то, что действие гомоцистеина вызывает увеличение экспрессии мРНК гена ХВР1 и продукции его сплайсинговой формы в

il

обеих клеточных линиях. Однако динамический характер индукции этого гена и образования мРНК ХВР1(спл) различны для клеток EA.hy926 и Jurkat. Отличия становятся более значительными при действии положительного индуктора стресса ЭПР дитиотрейтола, который приводит к многократному усилению ответа и сокращению его во времени. В клетках эндотелиоцитарной линии EA.hy926 заметна следующая тенденция: чем сильнее индуктор, тем более ранней и интенсивной становится зависимая от активности IRE1 продукция мРНК ХВР1(спл). Клетки лимфоцитарной линии Jurkat демонстрировали более ранний подъем и более низкий уровень мРНК ХВР1(спл), постепенно повышающийся с увеличением времени инкубации, тогда как в клетках EA.hy926 происходило резкое падение мРНК ХВР1(спл) после 8 часов инкубации. Это обстоятельство указывает на снижение активности сигнального пути IRE1-XBP1 в клетках EA.hy926 после 8 часов инкубации.

Б

XBP1 (общ) (Jurkat)

XBP1 (спл) (Jurkat)

25,00 -|

Время, ч

Время, ч

XBP1 (общ) (EA,hy926)

ХВР1 (спл) (EA.hy926)

25,00 1

Время, ч

Время, ч

Рис. 2. Изменения уровней мРНК гена ХВР1 при действии Э,Ь-гомоцистеина (Гц) (2,5мМ) и дитиотрейтола (ДТТ) (2,5мМ) на клетки ,1игка1 и ЕА.Ьу926: А - общий пул мРНК ХВР1 в клетках .1игка1; Б - сплайсинговая форма мРНК ХВР1 в клетках Дигкаг; В - общий пул мРНК ХВР1 в клетках ЕА.Ьу926; Г - сплайсинговая форма мРНК ХВР1 в клетках ЕА.Ьу926.

2.2. Изменение уровня мРНК гена BiP в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием 0,Ь-гомоцистеина и дитиотрейтола. BiP (HSPA5, или GRP78), белок теплового шока и регулятор системы UPR, в норме связан с люменальными доменами ключевых сенсоров стресса ЭПР (PERK, ATF6 и IRE1) и способен к диссоциации при стрессе ЭПР в результате взаимодействия с белками, имеющими ненативные конформации. Это приводит к активации PERK, ATF6 и IRE1, и последующему запуску UPR (Wu J., Kaufman R.J. et al, 2006).

Результаты количественной оценки изменения содержания мРНК гена BiP в клетках EA.hy926 и Jurkat под действием гомоцистеина и ДТТ представлены на рисунке 3. Динамика изменений уровня мРНК гена BiP в обеих клеточных линиях имела общую, за некоторым исключением, тенденцию к повышению с увеличением времени инкубации и силы индуктора. Более ранний подъем и стабильный уровень мРНК BiP в ответ на действие гомоцистеина были характерны для клеток Jurkat, в отличие от клеток EA.hy926, демонстрировавших позднее, но сильное увеличение количества мРНК BiP (после 8 часов в 4,7 раза выше, чем в Jurkat). По сравнению с эффектом гомоцистеина, при действии ДТТ были обнаружены более высокие уровни мРНК BiP в обеих линиях клеток, но с некоторыми отличиями в динамике. Клетки Jurkat демонстрировали некоторое снижение уровня мРНК BiP после 8 часов инкубации с ДТТ, тогда как для клеток EA.hy926 был отмечен его постоянный рост.

Таким образом, под действием гомоцистеина происходит увеличение экспрессии мРНК гена BiP в обеих клеточных линиях, что указывает на развитие стресса ЭПР и активацию системы UPR (Takayanagi S. et al, 2012). В работе Outinen Р.А. et al (1998), выполненной на эндотелиальных клетках, было показано, что индукция мРНК BiP является характерной для действия гомоцистеина. Причем другие тиол-содержащие аминокислоты, тепловой шок или перекись водорода не приводили к значительному подъему уровня мРНК BiP. Также гомоцистеин не вызывает увеличения экспрессии шаперонов ядерно-цитоплазматической или митохондриальной локализации, что указывает на его специфичность в индукции стресса ЭПР (Kokame К. et al, 2000).

Полученные нами данные свидетельствуют об отличиях в динамике экспрессии мРНК гена BiP в клетках Jurkat и EA.hy926. Так, клетки Jurkat демонстрировали постепенно повышающийся, с увеличением временем инкубации, уровень мРНК гена BiP, тогда как в клетках EA.hy926 его подъем был более существенным, но только после 8 часов инкубации с гомоцистеином. Рост количества мРНК гена BiP в клетках EA.hy926, при увеличении времени инкубации с ДТТ, многократно превосходил таковой в клетках Jurkat. В последних, кроме того, отмечались тенденции к понижению после 8 часов инкубации с ДТТ. В исследованиях Kokame К. et al (1998) и Kokame К. et al (2000), при действии на эндотелиоциты более высоких концентраций гомоцистеина (ЮмМ), было продемонстрировано значительное увеличение количества мРНК гена BiP уже после 4 часов инкубации. Причем Kokame К. et al (2000) показали, что после достижения максимума на 4 часах, уровень мРНК BiP сохранялся и после 8 часов инкубации. Полученные нами данные по экспрессии мРНК BiP в клетках EA.hy926 согласуются с результатами Hossain G.S. et al (2003). Данные по изменению экспрессии мРНК гена BiP в Т-лимфоцитах под воздействием D,L-гомоцистеина и дитиотрейтола в литературе отсутствуют.

BIP (Jurkat)

BiP (EA.hy926)

7,00

£ 6,00 H

0

x 5,00 X

1 4,00 к

й 3,00

J 1,00 £

0,00 4 8

□ Гц 1,72 2,13

■ДТТ 4,19 3,73

Время, 4

Время, ч

Рис. 3. Изменения уровня мРНК гена BiP при действии D.L-гомоцистеина (Гц) (2,5мМ) и дитиотрейтола (ДТТ) (2,5мМ) на клетки Jurkat и EA.hy926: А - мРНК BiP в клетках Jurkat; Б - мРНК BiP в клетках EA.hy926.

2.3. Изменение уровня мРНК гена CHOP в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием 0,Ь-гомоцистеина и дитиотрейтола. CHOP (DDIT3, или GADD153) - ядерный транскрипционный фактор, являющийся ингибитором ряда других транскрипционных факторов. Он играет важную роль в регуляции программированной клеточной гибели (апоптоза) и регенерации (Ohoka N. et al, 2005; Ohoka N. et al, 2007). Результаты количественной оценки изменения содержания мРНК гена CHOP в клетках EA.hy926 и Jurkat под действием гомоцистеина и ДТТ представлены на Рисунке 4. Показано, что в клетках Jurkat под действием гомоцистеина рост уровня мРНК CHOP наблюдался уже после 4 часов инкубации, превышая таковой в клетках EA.hy926 в 4,0 раза. Эндотелиоциты демонстрировали увеличение количества мРНК CHOP только после 8 часов инкубации, которое превосходило в 1,2 раза количество в Jurkat. ДТТ, являясь более сильным индуктором стресса ЭПР, чем гомоцистеин, вызывал более значительное увеличение количества мРНК CHOP в клетках Jurkat (в среднем, в 7 раз), с сохранением прежней динамики. В клетках EA.hy926 при действии ДТТ было обнаружено существенное увеличение уровня мРНК CHOP уже после 4 часов инкубации (в 6,5 раза выше, чем в Jurkat, и в 136,9 раз выше по отношению к контролю) с последующим падением в 2,9 раза после 8 часов инкубации.

Таким образом, нами показано, что под действием гомоцистеина происходит увеличение уровня мРНК гена CHOP в клеточных линиях Jurkat и EA.hy926. Учитывая, что транскрипционный фактор CHOP является проапоптотическим (Szegezdi et al, 2006), а его экспрессия зависит от активации трех основных сигнальных путей системы UPR (PERK-, ATF6- и IRE 1-опосредованного) (Oyadomari S., Mori М., 2004), следовательно, гомоцистеин активирует систему UPR и вызывает проапоптотический ответ в клетках обеих линий. По сравнению с гомоцистеином, действие дитиотрейтола приводило к более значительному увеличению количества мРНК гена CHOP в клетках Jurkat и EA.hy926. Наивысший уровень был отмечен в эндотелиоцитах после 4 часов инкубации (в 136,9 раз выше, чем в контроле), а после 8

часов наблюдался резкий трехкратный спад. Клетки Jurkat характеризовались изначально более низким, но постепенно нарастающим уровнем мРНК гена CHOP. Полученные данные по экспрессии мРНК гена CHOP в эндотелиоцитах согласуются с Jia F. et al, (2011). Данные по изменению экспрессии мРНК гена CHOP в Т-лимфоцитах под воздействием Б,Ь-гомоцистеина и дитиотрейтола в литературе отсутствуют.

CHOP (Jukat)

180,00

? 160,00 х

0 140,00

1 120,00 а.

£ 100,00 к

« 80,00

0

& 60,00

| 40,00

1 20,00 | 0,00

□ Гц

1ДТТ

CHOP (EA.hy926)

0,83

4,16

Время, ч

Время, ч

Рис. 4. Изменение уровня мРНК гена CHOP при действии 0,Ь-гомоцистеина (Гц) (2,5мМ) и ДТТ (2,5мМ) на клетки Jurkat и EA.hy926: А - мРНК CHOP в клетках Jurkat; Б - мРНК CHOP в клетках EA.hy926.

Полученные данные по изменению экспрессии мРНК генов ХВР1, BiP и CHOP в клетках эндотелиоцитарной (EA.hy926) и лимфоцитарной (Jurkat) линий человека свидетельствуют об активации системы UPR в ответ на стресс-индуцирующее действие D.L-гомоцистеина и дитиотрейтола. Таким образом, гомоцистеин в концентрации 2,5мМ вызывает стресс эндоплазматического ретикулума в клетках EA.hy926 и Jurkat. Динамика и характер стрессового ответа в клетках данных линий различны. Так, в отличие от клеток Jurkat, клетки EA.hy926 демонстрировали более интенсивный ответ на действие гомоцистеина и дитиотрейтола в абсолютном значении, что указывает на большую реактивность клеток данной линии к стрессу ЭПР, но, вместе с тем, и большую инерционность. Падение экспрессии мРНК гена CHOP и образования сплайсинговой формы мРНК гена ХВР1 после 8 часов инкубации с дитиотрейтолом - положительным индуктором стресса, может свидетельствовать об активации компенсаторных механизмов и о возможном начале восстановительной фазы стресса.

3. Динамика внутриклеточной концентрации белковых продуктов генов стрессового ответа в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием D,L-r0M0iuiCTeiiiia и дитиотрейтола.

Важным показателем развития стресса ЭПР является изменение уровней белковых продуктов генов — участников стрессового ответа. Для некоторых эндотелиоцитарных клеточных линий уже продемонстрирован дозо- и времязависимый эффект гомоцистеина на примере изменения экспрессии белков BiP и

CHOP. Следует отметить, что с увеличением обоих этих параметров отмечалось повышение уровней белков ВІР и CHOP (Hossain G.S. et al, 2003; Kyriakakis E. et al, 2010). Сведения об экспрессии белков ВІР и CHOP в Т-лимфоцитатарных клеточных линиях в использованных в работе условиях индукции стресса в литературе отсутствуют.

Для сравнительного исследования динамики внутриклеточной концентрации белковых продуктов генов стрессового ответа, было проанализировано изменение уровня белка ВІР, шаперона ЭПР, а также белка CHOP, транскрипционного фактора, ассоциированного с апоптозом, в клетках эндотелиоцитарной (EA.hy926) и лимфоцитарной (Jurkat) линий человека, под воздействием Б,Ь-гомоцистеина и классического индуктора стресса ЭПР - дитиотрейтола (Outinen P.A. et al, 1999; Cusinato F. et al, 2006). Клетки EA.hy926 и Jurkat инкубировали в течение 6 и 18 часов с Б,Ь-гомоцистеином (Гц) и дитиотрейтолом (ДТТ), с различными концентрациями в ростовой среде (2,5 и 5,0мМ). Уровни белковых продукта целевых генов измеряли методом иммунофлуоресцентного анализа с использованием проточной цитофлуориметрии.

Как было показано (Jacobberger J.W., 2001), примененный метод количественной оценки содержания внутриклеточных белков дает результаты, хорошо согласующиеся с данными иммуноблоттинга для сравнительно широкого диапазона концентраций белков, однако, в области низких концентраций возможны нелинейные отклонения, что затрудняет прямую оценку уровня экспрессируемых белков. Метод проточной цитофлуориметрии, в отличие от иммуноблоттинга, позволяет оценивать экспрессию исследуемых белков в отдельных клетках и дает представление о распределении клеток по содержанию исследуемого белка.

3.1. Изменение внутриклеточного содержания белкового продукта гена ВІР в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием 0,Ь-гомоцистеина и дитиотрейтола. Результаты количественной оценки изменения содержания белка ВІР в клетках EA.hy926 и Jurkat под действием гомоцистеина и ДТТ представлены на Рисунке 5 (А и В). Было установлено, что гомоцистеин, в обеих линиях клеток, вызывает меньшие изменения уровня белка ВІР, по сравнению с ДТТ. При этом наибольшее увеличение уровня белка ВІР демонстрировали клетки EA.hy926 (средняя интенсивность флуоресценции клеток была больше в 1,8 раз) после 18 часов инкубации с гомоцистеином в концентрации 5,0мМ, тогда как в клетках Jurkat не было зарегистрировано статистически достоверных изменений уровня флуоресценции клеток. Более существенные изменения уровня флуоресценции клеток и, соответственно, уровня белка ВІР были обнаружены после воздействия ДТТ. В клетках Jurkat на протяжении всей временной шкалы наблюдалось некоторое понижение уровня белка ВІР при концентрации ДТТ 2,5мМ, тогда как при концентрации 5,0мМ происходило постепенное повышение средней интенсивности флуоресценции (до 1,5 раз, после 18 часов инкубации). Обратная картина наблюдалась в клетках EAhy926, где, при концентрации ДТТ 2,5мМ, со временем инкубации, происходило существенное увеличение уровня белка ВІР (интенсивность флуоресценции после 18 часов в 7,5 раз выше). Однако при увеличении концентрации ДТТ до 5,0мМ, после 6 часов инкубации отмечался более низкий уровень (до 2,4 раз), который незначительно понижался после 18 часов (до 2,3 раз).

16

Известно, что увеличение экспрессии белка BiP указывает на развитие стресса ЭПР и активацию системы UPR (Wu J., Kaufman R.J. et al, 2006; Takayanagi S. et al, 2012). В нашей работе показано, что с увеличением концентрации гомоцистеина и времени инкубации происходит увеличение внутриклеточного содержания белка BiP в клетках EA.hy926, что согласуется с результатами, полученными Hossain G.S. et al (2003), тогда как статистически достоверных изменений содержания этого белка в клетках линии Jurkat обнаружено не было. Действие дитиотрейтола, в среднем, приводило к большему увеличению количества белка BiP в клетках EA.hy926, чем в клетках Jurkat. Необходимо отметить, что для высокой концентрации ДТТ (5мМ) наблюдалось снижение уровня BiP при длительном воздействии. Это может быть связано с внутриклеточным перераспределением белка, обусловленным, вероятно, процессами протеасомной деградации и аутофагии, что было отмечено нами также с применением иммуноцитохимических исследований с использованием конфокальной лазерной сканирующей микроскопии (рис. 6, Г). Однако для интерпретации и подтверждения данного наблюдения требуется проведение дополнительных исследований.

3.2. Изменение внутриклеточного содержания белкового продукта гена CHOP в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием D,L-гомоцистеина и дитиотрейтола. Поскольку продолжительный или тяжелый стресс ЭПР может привести к запуску программированной гибели клетки - апоптозу (Szegezdi Е. et al, 2006), было исследовано изменение внутриклеточной концентрации проапоптотического транскрипционного фактора CHOP (Li J. et al, 2006; Oyadomari S. and Mori M., 2004) при действии гомоцистеина и дитиотрейтола на клетки EA.hy926 и Jurkat. Результаты количественной оценки изменения содержания белка CHOP в клетках EA.hy926 и Jurkat под действием гомоцистеина и ДТТ представлены на Рисунке 5 (Б и Г). Показано, что гомоцистеин, в обеих линиях клеток, вызывает меньшие изменения уровня белка CHOP, по сравнению с ДТТ. При этом наибольшее увеличение уровня белка CHOP демонстрировали клетки EA.hy926 (средняя интенсивность флуоресценции клеток была больше в 1,27 раз) после 18 часов инкубации с гомоцистеином в концентрации 5,0мМ. Изменения количества белка CHOP в клетках Jurkat при действии гомоцистеина были незначительны. С увеличением времени инкубации с ДТТ наблюдался рост уровня белка CHOP в клетках EA.hy926 и Jurkat. Наибольшее увеличение количества белка CHOP было обнаружено в клетках Jurkat при действии ДТТ в концентрации 5,0мМ (средняя интенсивность флуоресценции клеток больше в 1,92 раза).

Таким образом, с увеличением времени инкубации гомоцистеин приводил к росту уровня белка CHOP в клетках обеих линий. Действие ДТТ приводило к более значительному увеличению количества белка CHOP, однако, клетки EA.hy926 демонстрировали более высокий его уровень после 18 часов инкубации с гомоцистеином (2,5мМ), чем с ДТТ в той же концентрации. В целом, большее увеличение количества белка CHOP при действии гомоцистеина обнаружено в клетках EA.hy926.

BiP(Jurkat)

CHOP (Jurkat)

2,50

Время, ч/Концентрация, мМ

Время, ч/Концентрация, мМ

BiP (EA.hy926)

CHOP (EA.hy926)

Время, ч/Концентрация, мМ

Время, ч/Концентрация, мМ

Рис. 5. Изменение содержания белковых продуктов генов BiP и CHOP в клетках Jurkat и EA.hy926 после инкубации в течение 6 и 18 часов с D.L-гомоцистеином (Гц) и дитиотрейтолом (ДТТ) в разных концентрациях: А - изменение уровня белка BiP в клетках Jurkat; Б - изменение уровня белка CHOP в клетках Jurkat; В - изменение уровня белка BiP в клетках EA.hy926; Г - изменение уровня белка CHOP в клетках EA.hy926.

Опираясь на представленные в работе данные об изменении уровней белков CHOP и BiP в клетках линий EA.hy926 и Jurkat под действием гомоцистеина можно заключить, что гомоцистеин является слабым индуктором стресса ЭПР для клеток Jurkat. Клетки EA.hy926 более чувствительны к действию гомоцистеина. Стоит также отметить, что положительный индуктор стресса ЭПР — дитиотрейтол, вызывал большее увеличение уровня белка CHOP в клетках Jurkat, по сравнению с EA.hy926. Полученные нами данные согласуются с результатами Jia F. et al (2011), демонстрирующими время- и дозозависимый эффект гомоцистеина на эндотелиальных клетках. Jia F. et al (2011) показывают, что с увеличением этих двух параметров происходит увеличение экспрессии генов CHOP и BiP на уровне мРНК и белков. Данные аналогичных исследований, проведенных на клеточной линии Jurkat, в литературе отсутствуют.

4. Иммуноцитохимическое исследование экспрессии ЭПР-резидентных белков в клетках линий человека ЕА.Ьу926 и Лигка*:, под воздействием 0,Ь-гомоцистеина

и дитиотрейтола.

Для визуализации изменений в ЭПР нами было проведено иммуноцитохимическое исследование экспрессии ЭПР-резидентных белков в клетках ЕА.Ьу926 и 1игка1 с использованием моноклональных антител, специфичных к сигналу локализации в ЭПР - КОЕЬ (Ьуз-АБр-СЬ-Ьеи). Наиболее представленными белками ЭПР с такими сигналами являются шапероны В1Р, ОКР94 и белки семейства протеиндисульфоизомераз (Р01). Повышение экспрессии этих белков ассоциировано со стрессом ЭПР и индукцией адаптивного каскада - иРЯ. Проведенное нами исследование методом ЛКСМ с ЗБ-реконструкцией (Рис. 6) показало, что гомоцистеин и дитиотрейтол в концентрации 2,5мМ вызывают увеличение экспрессии шаперонов ЭПР в клетках двух линий, при концентрации 5мМ в клетках ЕА.Ьу926 наблюдались признаки перераспределения шаперонов в везикулы. А Б В

.'Л & '••і*..'- .У »

і у ш

/ /

Рис. 6. Экспрессия ЭПР-резидентных белков с сигналом локализации КХ)ЕЬ в клетках ЕА.Ьу926 и .Іигкаї, инкубированных с 0,Ь-гомоцистеином и дитиотрейтолом в течение 18 часов: А - контроль, клетки ЕА.Иу926, 18 часов без воздействия; Б - клетки ЕА.Ьу926, гомоцистеин, 2,5мМ; В - клетки ЕА.Ьу926, дитиотрейтол, 2,5мМ; Г - клетки ЕА.Ьу926, гомоцистеин, 5,0мМ; Д - контроль, клетки Іигкаї, 18 часов без воздействия; Е - клетки .Іигкаї:, дитиотрейтол, 2,5мМ.

Распределение шаперона ВІР в клетках ЕА.Ьу926 после 18 часов инкубации с гомоцистеином при концентрации 2,5мМ было равномерным, соответствующим локализации флуоресцентного зонда БЮСб при прижизненном мечении сети ЭПР

(Рис. 6, Б). Увеличение концентрации гомоцистеина до 5,0мМ, вызывало перераспределение белка, приводящее к образованию скоплений, заметных в цитоплазме клетки (Рис. 6, Г).

В работе Outinen P.A. et al (1999) было показано, что после 18-и часового воздействия гомоцистеина (5мМ) на эндетелиоциты, происходило перераспределение шаперона BiP из перинуклеарного пространства, по всей цитоплазме, а также изменение интенсивности иммуноцитохимического окрашивания, однако, наши данные, помимо этого, демонстрируют перераспределение шаперонов в везикулы.

6. Оценка клеточной гибели и распределения клеток по фазам клеточного цикла при действии индукторов стресса.

А Б

0,00 2,50 5,00

□ EAhy926_DTT 2,50 7,02 9,02

■ EAhy926 Hey 2,50 2,78 4,58

QJurkat_DTT 2,61 16,64 20,02

■ Jurkat_Hcy 2,50 3,79 7,39

Концентрация, мМ

Рис. 7. ДНК-цитометрический анализ гибели клеток ,1игка1 и ЕА.Ьу926 после 24 часов инкубации с 0,Ь-гомоцистеином и дитиотрейтолом. А, Б и В - однопараметрические гистограммы распределения клеток по фазам клеточного цикла, канал РЬ2-А: А - контроль, 24 часа без воздействия; Б - ДТТ, 2,5мМ; В - Э,Ь-гомоцистеин, 2,5мМ. Г - доля клеток в фазе цикла зиЬ-01.

Как видно из приведенных однопараметрических гистограмм (интервал 8иЬ-С1, Рис. 7, А - Г) и графика, отражающего долю апоптотических клеток (Рис. 7, Г), действие индуктора ДТТ приводит к росту апоптоза в обеих линиях клеток, процент клеток БиЬ-С! при действии ДТТ 2,5мМ в 2,37 раза выше у линии 1игка1. Гомоцистеин

оказывает заметно меньшее действие на клетки, процент апоптотических клеток незначительно превышает контроль.

70,00 60,00 50,00 40,00 30,00 20,00 10,00 0,00

0,00

3,00

1,00 2,00 Концентрация, мМ

-DTT_Jurkat_Gl —«H"DTT_Jurkat_G2 A DTT_Jurkat_S

-Hcy_Jurkat_Gl Ж HcyJurkat_G2 .......Hcy_Jurkat_S

0,00

3,00

1,00 2,00

Концентрация, мМ

-DTT_EAhy_Gl ~т— DTT_EAhy_G2 —*— DTT_Eahy_S -Hcy_Eahy_Gl Ж Hcy_EAhy_G2 Hcy_EAhy_S

Рис. 8. Распределения клеток Jurkat (А) и EA.hy926 (Б) по фазам клеточного цикла после 24 часов инкубации с О.Ь-гомоцистеином и дитиотрейтолом.

Таким образом, действие ДТТ в клетках Jurkat и EA.hy926 приводит к индукции стресса ЭПР и принятию решения об индукции апоптоза частью клеточной популяции. Клетки EA.hy926 имеют меньшую тенденцию к индукции апоптоза, что может свидетельствовать об их большей устойчивости к стрессу ЭПР.

Для распределения клеток по фазам цикла для двух клеточных линий свойственны разнонаправленные тенденции. Для концентрации 2,5мМ ДТТ и гомоцистеина характерно увеличение процента клеток в стадии Gl для всех линий, более выраженное у гомоцистеина. Действие и ДТТ, и гомоцистеина на два клеточных типа сопровождается снижением количества клеток в фазе S.

6. Изменения экспрессии белковых маркеров стресса ЭПР при действии избытка

гомоцистеина in vivo.

Одним из способов моделирования гипергомоцистеинемии у лабораторных животных являются диеты с пониженным содержанием фолиевой кислоты, витамина В12 и (или) избытком метионина (Кубатиев A.A. и др., 2006; Fukada S. et al., 2006; Blaise S.A. et al, 2007;). Данные модели представляют интерес в исследовании патогенеза гипергомоцистеинемии, однако, не лишены ряда недостатков. В частности, ряд авторов полагает, что наблюдаемые эффекты индуцируемой гипергомоцистеинемии имеют комплексный характер, обусловленный не только повышенным уровнем гомоцистеина, но и низким уровнем фолиевой кислоты или повышенным уровнем метионина (Perna A.F. et al, 1996; Hansrani М., Stansby G., 2008). Дефицит фолиевой кислоты и избыток метионина могут оказывать непосредственное неблагоприятное действие на функционирование сосудов независимо от повышенного уровня гомоцистеина (Doshi S.N. et al, 2002; Troen A.M. et al, 2003).

Для изучения токсического действия гомоцистеина нами была применена модифицированная модель химической индукции стресса гомоцистеином (БсИегег Е.В.Б. е1 а1, 2011). Гомоцистеин вводили животным подкожно и внутрибрюшинно, в дозе 0,6 мкмоль на 1 г. массы тела. Был проведен проточно-цитофлуориметрический анализ экспрессии маркеров стресса ЭПР в клетках печени крыс.

Результаты изменения концентрации гомоцистеина в крови у крыс представлены в Таблице 1.

Таблица 1. Средние значения концентрации гомоцистеина в плазме крови крыс в

экспериментальных группах

Группа Тип введения Концентрация Гомоцистеина, мкмоль/л

Интактные - 1,8±0,1

Физиологический раствор подкожный 2,6±0,3

внутрибрюшинный 2,4±0,2

0,Ь-Гомоцистеин подкожный 27,7±0,5

(доза 0,6 мкмоль/г массы тела) внутрибрюшинный 278,1±6,10

Результаты количественной оценки изменения содержания белков BiP и CHOP в клетках печени крысы при токсическом действии гомоцистеина представлены на рисунке 9. При подкожном введении гомоцистеина уровень экспрессии белка BiP в клетках печени был незначительно выше контрольного, тогда как при внутрибрюшинном введении экспрессия BiP увеличивалась более чем в четыре раза (средняя интенсивность флуоресценции клеток была в 4,62 раза выше). Так же было установлено, что внутрибрюшинное введение гомоцистеина приводило к заметному подъему уровня белка CHOP (средняя интенсивность флуоресценции клеток была в 2,87 раз выше), при подкожном введении статистически достоверных изменений уровня флуоресценции клеток, меченых антителами к CHOP, зарегистрировано не было.

Б

BiP

CHOP

5,00

s

I 4,50

J 01

& 3,50

I 3,00

t 2,50

0

S i 2,00

x —*

1 1,50

I 1,00 01

J 0,50

1 0,00

3,50

3,00

2,50

2,00

t; _

1,50

П/К В/Б

ОД-Гомоцистеин (0,6мкмоль/г)

П/К В/Б

DjL-Гомоцистеин (0,6мкмоль/г)

Рис. 9. Изменение содержания белков BiP и CHOP в клетках печени крыс: А - изменение экспрессии белка BiP; Б - изменение экспрессии белка CHOP. П/К - подкожное введение, В/Б -внутрибрюшинное введение.

Таким образом, внутрибрюшинное введение гомоцистеина (0,6 мкмоль/г массы ела животного) приводило к значительному увеличению экспрессии белков BiP и :НОР по сравнению с подкожным введением. Это свидетельствует о развитии стресса -)ПР в клетках печени крыс при действии высоких концентраций гомоцистеина .

В нашей работе проявлением токсического эффекта гомоцистеина in vivo вилась индукция стресса ЭПР в клетках печени крыс. Использованная нами модель ндуцируемого гомоцистеином стресса может быть применена для дальнейших сследований механизмов вызванной прямым действием гомоцистеина альтерации каней.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В работе охарактеризованы особенности экспрессии генов стрессового ответа ри действии повышенных концентраций гомоцистеина, характерных для тяжелых юрм гомоцистеинемии и гомоцистинурии.

Впервые показаны различия в функционировании системы сигнальных каскадов, ндуцируемых при стрессе эндоплазматического ретикулума (UPR, ответ на белки с енативными конформациями) в клетках эндотелиоцитарного и лимфоцитарного ипов. Эти отличия заключаются не только в уровнях индуцируемых мРНК при трессе ЭПР, что может быть обусловлено разным количеством молекул, ыполняюших функцию рецепции белков с дефектами конформаций в ЭПР, и, оответственно, разной концентрацией активирующих транскрипционных факторов. )бнаруженные изменения на уровне белковых продуктов свидетельствуют также о аличии дополнительных, клеточно-специфичных механизмов регуляции ЭПР-трессового ответа. В работе впервые показаны различия в эффективности адаптации стрессу ЭПР.

Новизна работы заключается в анализе не только величины, но и длительности игналов в регуляции стресса ЭПР. В частности, различная продолжительность ктивации IRE-1-опосредованного сигнального каскада и отличия временных рофилей экспрессии проапоптотического гена CHOP могут свидетельствовать о азной длительности «фазы принятия решения» об индукции апоптоза и буславливать различия в устойчивости клеток двух типов к ЭПР-стрессу. На основе роведенного анализа сформулировано предположение о времязависимой регуляции в истеме UPR. Для уточнения механизмов, лежащих в основе подобной ремязависимой регуляции, требуется проведение дополнительных исследований - в астности, анализ стабильности мРНК.

Исследования, проведенные на самцах крыс, показали, что внутрибрюшинное ведение гомоцистеина приводило к значительному увеличению экспрессии белков liP и CHOP по сравнению с подкожным введением. Это свидетельствует о развитии тресса ЭПР в клетках печени крыс при действии избытка гомоцистеина.

Полученные результаты уточняют картину молекулярных и субклеточных роцессов при стрессе ЭПР. Установленные особенности экспрессии стресс-еспонсивных генов, регуляции стресса ЭПР и апоптоза при действии избытка омоцистеина могут быть использованы для выработки подходов к лечению ипергомоцистеинемии.

выводы

1. Гомоцистеин в исследованном диапазоне концентраций приводит к развитию стресса ЭПР и активации системы сигнальных путей UPR в клетках EA.hy926 и Jurkat; гомоцистеин является более слабым индуктором стресса ЭПР по сравнению с дитиотрейтолом.

2. Продолжительность активации IRE 1-опосредованного сигнального пути различна в клетках двух типов. Снижение уровня мРНК сплайсинговой формы ХВР1 в клетках EA.hy926 является признаком более ранней аттенюации ЭПР-ядерного сигнала.

3. Различия в экспрессии гена BiP в клетках двух линий свидетельствуют о неодинаковой интенсивности и времени развития пикового стрессового ответа в клетках EA.hy926 и Jurkat.

4. Для клеток линии EA.hy926 характерно падение уровня мРНК проапоптотического гена CHOP после кратковременной фазы роста и более низкий процент клеточной гибели при исследованной продолжительности стресс-индуцирующего воздействия. В клетках Jurkat уровень мРНК гена CHOP имел более стабильный характер и поддерживался на сравнительно высоком уровне, рост концентрации белка CHOP в клетках Jurkat был более выражен.

5. Наблюдавшееся несоответствие между уровнями мРНК и концентрацией белковых продуктов ряда генов стрессового ответа (в частности, CHOP) свидетельствует о вовлечении дополнительных посттранскрипционных механизмов регуляции экспрессии генов системы UPR.

6. Высокие концентрации гомоцистеина способны индуцировать стресс ЭПР в клетках печени крыс.

СПИСОК РАБОТ, ОПУБЛИКОВАННЫХ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

1. М.В. Меситов, Т.Н. Игнашкова, М.Е. Мещерский, A.C. Акопов, A.A. Соколовская, A.A. Московцев, A.A. Кубатиев. Индукция стресса эндоплазматического ретикулума в условиях окислительно-восстановительного дисбаланса в клетках Т-лимфобластной лейкемии человека // Патологическая физиология и экспериментальная терапия. - 2012. - №3. - С. 88-94.

2. Т.Н. Игнашкова, М.В. Меситов, A.C. Рыбаков, A.A. Московцев, A.A. Соколовская, A.A. Кубатиев. Депонирование фактора Виллебранда в эндотелиальных клетках человека HUVEC в условиях стресса эндоплазматического ретикулума, индуцированного избытком гомоцистеина in vitro // Патологическая физиология и экспериментальная терапия. - 2012. - №3. -С. 82-87.

3. М.В. Меситов, М.Е. Мещерский, Т.Н. Игнашкова, A.A. Московцев, A.A. Соколовская, A.A. Кубатиев. Влияние гомоцистеина на фолдинг белков // Материалы VII съезда аллергологов и иммунологов СНГ. Санкт-Петербург, 25 -28 апреля 2009 // Аллергология и иммунология. - 2009. - Т. 10. - №2. - С. 180.

4. Alisa А. Sokolovskaya, Michael V. Mesitov, Tatiana I. Ignashkova, Michael E. Meshersky, Aleksey A. Moscovtsev, Asian A. Kubatiev. Homocysteine induced Unfolded Protein Response in human cell lines // Book of Abstracts The 4th International Congress on Stress Responses in Biology and Medicine, Sapporo, Japan, 6-9 October, 2009. - P-052.

Mesitov Mikhail Valentinovich

Tissue-specific expression patterns of genes associated with the homocysteine induced

endoplasmic reticulum stress

Hyperhomocysteinemia is a common pathological condition associated with cardiovascular, neurodegenerative diseases, insulin-dependent diabetes and a number o other disorders. One of the proposed mechanisms of homocysteine action is an endoplasmic reticulum stress, in response to which the cell activates system of the signaling pathways, commonly termed: the unfolded protein response, UPR. The aim of our work was to reveal the dynamics of gene expression response to endoplasmic reticulum stress in the different human cell lines.

We first who has shown the functional differences of UPR in endothelial cells and lymphocytes. These differences were in the mRNA levels induced by ER stress, as well as changes in the level of protein products, which suggest the presence of additional, cell-specific regulatory mechanisms of the ER-stress response. We have analyzed the expression of genes BiP, CHOP, and XBP1, involved in the the stress response in the Jurkat cells (human T-lymphoblastic leukemia). Higher amplitude and shorter duration in the change o CHOP mRNA levels , were in EA.hy926 cells compared to Jurkat cells. We hypnotized that it was associated with less cell death of EA.hy926. Thus, regulation of the stress response depends on both the amplitude and the duration of the mRNA expression impulses. We first who has shown the differences in adaptation and resistance to ER-stress between two cell types. Addition we demonstrated the lack of correlation between the CHOP mRNA level and its protein product. This fact may indicate the involvement posttranscriptional regulating mechanisms of this gene expression.

Taken together these results clarify the picture of the molecular and subcellula processes of ER-stress. Crucial features of stress responsive genes expression, as well as regulation of ER-stress and apoptosis by the action of an excess of homocysteine can be used to develop effective therapeutic approaches for the treatment of hyperhomocysteinemia.

Заказ № 16-А/09/2012 Подписано в печать 07.09.2012 Тираж 100 экз. Усл. п.л. 1,2

ООО "Цифровичок", тел. (495) 649-83-30 www.cfr.ru ; е-таіІ:гак@с/г. пі

 
 

Оглавление диссертации Меситов, Михаил Валентинович :: 2012 :: Москва

Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Функции и структурные компоненты эндоплазматического 15 ретикулума

1.2. Сигнальные пути системы UPR (Unfolded Protein Response) 27 эндоплазматического ретикулума

1.2.1. Сигнальный путь IRE 1 -ХВР

1.2.2. Сигнальный путь ATF

1.2.3. Сигнальный путь PERK-ATF

1.2.4. Механизмы апоптоза, индуцированного стрессом ЭПР

1.3. Гипергомоцистеинемия и клеточный стресс

1.3.1. Метаболизм гомоцистеина

1.3.2. Токсичность гомоцистеина

1.3.3. Гипергомоцистеинемия и сердечно-сосудистые 66 заболевания

Глава 2. Материалы, объекты и методы исследования

2.1. Материалы и объекты исследования

2.1.1. Реактивы

2.1.2. Клеточные линии человека

2.1.3. Животные

2.2. Методы исследования

2.2.1. Субкультивирование клеток Jurkat

2.2.2. Субкультивирование клеток EA.hy

2.2.3. Оценка жизнеспособности клеток методом исключения 75 красителя (трипановый синий)

2.2.4. Инкубация клеток с В,Ь-гомоцистеином и дитиотрейтолом

2.2.5. Моделирование токсического действия гомоцистеина in 75 vivo

2.2.6. Получение клеточной суспензии из ткани печени

2.2.7. Проточно-цитофлуориметрический анализ

2.2.8. Определение апоптотических клеток по окрашиванию 78 ДНК пропидий йодидом

2.2.9. Анализ клеточного цикла

2.2.10. Иммуноцитохимия

2.2.11. Выделение суммарной РНК из культивируемых клеток

2.2.12. Спектрофотометрическое определение содержания 83 суммарной РНК в образцах

2.2.13. Электрофорез РНК в агарозном геле

2.2.14. Приготовление образцов суммарной РНК, свободной от 85 ДНК

2.2.15. Флуориметрическое определение содержания суммарной 86 РНК в образцах

2.2.16. Синтез первой цепи комплементарной ДНК

2.2.17. Полимеразная цепная реакция «в реальном времени» 87 (ПЦР-РВ)

2.2.18. Анализ результатов ПЦР-РВ

2.2.19. Статистическая обработка данных

Глава 3. Результаты собственных исследований и их обсуждение

3.1. Морфофункциональные особенности эндоплазматического 91 ретикулума в клеточных линиях EA.hy926 и Jurkat

3.2. Изменения экспрессии генов системы UPR в клетках линий 93 человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием В,Ь-гомоцистеина и дитиотрейтола

3.2.1. Изменение уровня сплайсинговой формы гена ХВР

3.2.2. Изменение уровня мРНК гена BiP

3.2.3. Изменение уровня мРНК гена CHOP

3.2.4. Изменения уровней мРНК генов PDIA3, PERK и GADD

3.3. Динамика внутриклеточной концентрации белковых продуктов 104 генов стрессового ответа в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием 0,Ь-гомоцистеина и дитиотрейтола

3.3.1. Изменение внутриклеточного содержания белка BiP

3.3.2. Изменение внутриклеточного содержания белка CHOP

3.4. Иммуноцитохимическое исследование экспрессии ЭПР- 109 резидентных белков в клетках линий человека EA.hy926 и Jurkat, под воздействием 0,Ь-гомоцистеина и дитиотрейтола

3.5. Оценка клеточной гибели и распределения клеток по фазам 112 клеточного цикла при действии индукторов стресса

3.6. Изменения экспрессии белковых маркеров стресса ЭПР при 117 действии избытка гомоцистеина in vivo

 
 

Введение диссертации по теме "Патологическая физиология", Меситов, Михаил Валентинович, автореферат

Актуальность проблемы

Клеточный стрессовый ответ относится к числу механизмов, лежащих в основе патогенеза широкого спектра заболеваний. Изменения внутренней среды организма при патологических состояниях могут индуцировать стрессовые ответы определенных типов клеток в зависимости от их чувствительности к меняющимся факторам среды.

Клеточный стресс представляет собой универсальную неспецифическую форму системной реакции клетки на любую форму макромолекулярных повреждений, превышающих пороговую величину (Кубатиев A.A. и др., 2012; Kültz D., 2003). Стрессовая реакция необходима для временного увеличения толерантности к повреждениям макромолекул посредством использования филогенетически консервативных наборов генов и биохимических путей, которые опосредуют макромолекулярную стабилизацию и репарацию в клетке для обеспечения клеточной и организменной целостности в субоптимальных условиях (Kültz D, 2003). Структурированность эукариотической клетки, наличие отличающихся по составу внутренней среды компартментов с мембранами, выполняющими барьерные функции, и защитными системами, индуцируемыми независимо от цитоплазматических, обусловливают неодинаковую чувствительность к воздействиям и разную степень вовлеченности структурно-функциональных модулей клетки в стрессовый ответ. Факт наличия активных, стабилизирующих структуру и функцию биологического модуля, неспецифических «буферных» механизмов позволил масштабировать и использовать понятие «стресс» на субклеточном уровне, то есть рассматривать компартментализованный вариант клеточного стресса.

К числу компартментов эукариотической клетки, способных к инициации специальной формы стрессового ответа, относится эндоплазматический ретикулум (ЭПР) - многофункциональная органелла, одной из важнейших функций которой является конформационное созревание белков - в ЭПР осуществляется фолдинг около 30% белков эукариот (Hetz С., 2012). Нарушения процессов конформационного созревания белков могут стать причиной развития протеотоксического стресса, динамика которого определяется интенсивностью de novo синтеза и обновления клеточных и экстраклеточных белков. Продукты незаконченной трансляции, интермедиаты фолдинга с некорректной конформацией, а также субъединицы, не включенные в олигомерные белковые комплексы, могут экспонировать гидрофобные области (Hartl F.U., Hayer-Hartl М., 2009), которые становятся дополнительными, «незаконными» интерфейсами для межмолекулярного взаимодействия и могут приводить к агрегации белков, формированию токсичных и иммуногенных продуктов. Накопление конформационно-дефектных белков в люмене ЭПР в связи со множественностью функций и единым объемом этого компартмента может инициировать нарушения работы других систем ЭПР, и тем самым индуцировать состояние, характеризуемое как стресс эндоплазматического ретикулума (Ron D., Walter P., 2007).

Для защиты от протеотоксического стресса и ошибок работы системы конформационного созревания белков в ЭПР эукариот возникли следующие приспособления: 1) рецепция белков с ненативными конформациями в ЭПР; 2) обработка и передача информации в ядро о детектированных белках с дефектными или незрелыми конформациями; 3) адаптационные изменения ЭПР и ассоциированных структур, общим результатом действия которых должно стать снижение концентрации дефектных белков в люмене ЭПР.

Перечисленные функции реализуются посредством нескольких механизмов, действующих зачастую совместно: 1) система сигнальных каскадов ответа на белки с ненативными конформациями (Unfolded Protein Response, UPR); 2) контроль трансляции - аттенюация кеп-зависимой трансляции, опосредуемая киназой PERK; 3) активация транскрипционного фактора ATF6; 4) ответ на избыток белка в люмене ЭПР, или «перегрузку» ЭПР (endoplasmic reticulum overload response, EROR), опосредуемый активированным транскрипционным фактором NF-kappaB.

Таким образом, в компартменте ЭПР при различных нарушениях может иметь место локализованный протеотоксический стресс. При дефектах или функциональной недостаточности системы контроля качества стресс может быть «генерализован» во внутри- и внеклеточном пространстве. Невозможности компенсации стресса индуцирует программированную клеточную гибель (Szegezdi Е. et al, 2006).

Несмотря на значительный интерес исследователей, динамические аспекты регуляции стресса ЭПР в клетках человека различных типов изучены недостаточно. Способность клеток различных типов к эффективной реализации во времени адаптивной фазы стресса ЭПР определяет устойчивость клеток к стрессу и их дальнейшую выживаемость. В этой связи, анализ тканеспецифичных особенностей временных профилей экспрессии генов системы UPR, в частности, BiP, ХВР1, кинетики сплайсинга ХВР1 и соотнесение динамики этих процессов с индукцией проапоптотического гена CHOP, а также анализом клеточной гибели представляются актуальными задачами исследования.

При гипергомоцистеинемии - распространенном патологическом состоянии (Hashimoto Т. et al, 2007), ассоциированном с сердечно-сосудистыми, нейродегенеративными заболеваниями, инсулиннезависимым диабетом и рядом других патологий, возросший уровень аминокислоты гомоцистеина в плазме крови может оказывать стресс-индуцирующее действие на клетки. Предполагается, что гомоцистеин может активировать стрессовый ответ эндотелиоцитов и быть причиной развития эндотелиальной дисфункции, при этом формой стрессовой реакции может быть стресс ЭПР и IRE 1-зависимый апоптоз (Zhang С. et al, 2001).

ЭПР-стресс как результат нарушений конформационного созревания белков может играть ключевую роль в патогенезе ассоциированных с гипергомоцистеинемией заболеваний и способен рассматриваться как типовой молекулярно-патофизиологический процесс. В связи с этим, исследование ЭПР-стрессовых ответов клеток разных типов и различной тканевой принадлежности имеет важнейшее фундаментальное и прикладное значение для патофизиологии и биомедицинской науки в целом. С учетом вовлеченности сосудистой стенки в развитие патологического состояния гипергомоцистеинемии (Kubatiev A. et al, 2005), изучение стресса эндоплазматического ретикулума в эндотелиоцитах и взаимодействующих с ними клетках иммунной системы является актуальной задачей.

Цель исследования:

Целью настоящего исследования является сравнительный анализ экспрессионных профилей генов, вовлеченных в стресс эндоплазматического ретикулума, а также выявление неизвестных ранее тканеспецифических особенностей их регуляции под действием гомоцистеина in vitro и в условиях экспериментальной гипергомоцистеинемии in vivo.

Задачи исследования:

1. Провести исследование уровней мРНК генов ХВР1, BiP и CHOP, ассоциированных со стрессом ЭПР, в клетках Т-лимфоцитарной линии Jurkat и эндотелиоцитарной линии EA.hy926 под действием гомоцистеина in vitro.

2. Изучить динамику внутриклеточных концентраций белков стрессового ответа BiP и CHOP в клетках линий Jurkat и EA.hy926 под действием гомоцистеина.

3. Установить взаимосвязь временных профилей экспрессии генов стрессового ответа и концентраций их белковых продуктов с процессами клеточной гибели и распределением клеток по фазам клеточного цикла.

4. Выявить особенности экспрессии генов стрессового ответа на модели гипергомоцистеинемии in vivo.

Научная новизна исследования

Впервые проанализирована экспрессия генов BiP, CHOP и ХВР1, участвующих в формировании стрессового ответа, в клетках линии Т-лимфобластной лейкемии человека Jurkat. Получены временные профили экспрессии генов в линиях клеток Jurkat и EA.hy926, свидетельствующие о клеточно-специфичной динамике стрессового ответа, определяемой морфофункциональными особенностями эндоплазматического ретикулума этих клеток. Впервые показано отсутствие корреляции между изменением уровня мРНК гена CHOP и его белкового продукта в клетках Jurkat и EA.hy926, что может указывать на важность посттранскрипционных механизмов в регуляции экспрессии генов системы сигнальных каскадов UPR, участвующих в принятии решения клеткой о запуске про- или антиапоптотических механизмов.

Теоретическая и практическая значимость работы

Полученные в работе данные углубляют существующие представления о динамике развития стрессового ответа в линиях клеток, различающихся по морфофункциональным свойствам эндоплазматического ретикулума, но имеющих идентичную организацию системы сигнальных каскадов UPR. Обнаруженные в работе особенности экспрессии проапоптотического гена

CHOP могут указывать на существование нового регуляторного механизма при стрессе эндоплазматического ретикулума. Практическая значимость полученных данных состоит в возможности использования белков BiP и CHOP в качестве маркеров для диагностики стресса ЭПР in vivo.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Гомоцистеин способен вызывать стресс ЭПР в клетках различного тканевого происхождения (клетки Т-лимфоцитарной линии Jurkat и эндотелиоцитарной линии EA.hy926).

2. Степень чувствительности и устойчивости к стрессу ЭПР под действием гомоцистеина зависит от типа клеток и их тканевого происхождения.

3. Специфичность функционирования системы UPR в клетках Т-лимфоцитарной линии Jurkat и эндотелиоцитарной линии EA.hy926 выражается в различной динамике и уровнях экспрессии генов стрессового ответа.

4. Неполная корреляция между уровнями мРНК и концентрациями белковых продуктов генов стрессового ответа, прежде всего CHOP, указывает на возможность вовлечения дополнительных посттранскрипционных механизмов регуляции в систему сигнальных каскадов UPR.

5. Ключевую роль при стрессе ЭПР играет времязависимая регуляция системы UPR.

 
 

Заключение диссертационного исследования на тему "Тканеспецифичные особенности экспрессии генов, ассоциированных со стрессом эндоплазматического ретикулума под действием гомоцистеина"

ВЫВОДЫ

1. Гомоцистеин в исследованном диапазоне концентраций приводит к развитию стресса ЭПР и активации системы сигнальных путей UPR в клетках EA.hy926 и Jurkat; гомоцистеин является более слабым индуктором стресса ЭПР по сравнению с дитиотрейтолом.

2. Продолжительность активации IRE 1-опосредованного сигнального пути различна в клетках двух типов. Снижение уровня мРНК сплайсинговой формы ХВР1 в клетках EA.hy926 является признаком более ранней аттенюации ЭПР-ядерного сигнала.

3. Различия в экспрессии гена BiP в клетках двух линий свидетельствуют о неодинаковой интенсивности и времени развития пикового стрессового ответа в клетках EA.hy926 и Jurkat.

4. Для клеток линии EA.hy926 характерно падение уровня мРНК проапоптотического гена CHOP после кратковременной фазы роста и более низкий процент клеточной гибели при исследованной продолжительности стресс-индуцирующего воздействия. В клетках Jurkat уровень мРНК гена CHOP имел более стабильный характер и поддерживался на сравнительно высоком уровне, рост концентрации белка CHOP в клетках Jurkat был более выражен.

5. Наблюдавшееся несоответствие между уровнями мРНК и концентрацией белковых продуктов ряда генов стрессового ответа (в частности, CHOP) свидетельствует о вовлечении дополнительных посттранскрипционных механизмов регуляции экспрессии генов системы UPR.

6. Высокие концентрации гомоцистеина способны индуцировать стресс ЭПР в клетках печени крыс.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В работе охарактеризованы особенности экспрессии генов стрессового ответа при действии повышенных концентраций гомоцистеина, характерных для тяжелых форм гомоцистеинемии и гомоцистинурии.

Впервые показаны различия в функционировании системы сигнальных каскадов, индуцируемых при стрессе эндоплазматического ретикулума (UPR, ответ на белки с ненативными конформациями) в клетках эндотелиоцитарного и лимфоцитарного типов. Эти отличия заключаются не только в уровнях индуцируемых мРНК при стрессе ЭПР, что может быть обусловлено разным количеством молекул, выполняющих функцию рецепции белков с дефектами конформаций в ЭПР, и, соответственно, разной концентрацией активирующих транскрипционных факторов. Обнаруженные изменения на уровне белковых продуктов свидетельствуют также о наличии дополнительных, клеточно-специфичных механизмов регуляции ЭПР-стрессового ответа.

Новизна работы заключается в анализе не только величины, но и длительности сигналов в регуляции стресса ЭПР. В частности, различная продолжительность активации IRE-¡-опосредованного сигнального каскада и отличия временных профилей экспрессии проапоптотического гена CHOP могут свидетельствовать о разной длительности «фазы принятия решения» об индукции апоптоза и обуславливать различия в устойчивости клеток двух типов к ЭПР-стрессу. На основе проведенного анализа сформулировано предположение о времязависимой регуляции в системе UPR. Для уточнения механизмов, лежащих в основе подобной времязависимой регуляции, требуется проведение дополнительных исследований - в частности, анализ стабильности мРНК.

Исследования, проведенные на самцах крыс, показали, что внутрибрюшинное введение гомоцистеина приводило к значительному увеличению экспрессии белков BiP и CHOP по сравнению с подкожным введением. Это свидетельствует о развитии стресса ЭПР в клетках печени крыс при действии избытка гомоцистеина.

Полученные результаты уточняют картину молекулярных и субклеточных процессов при стрессе ЭПР. Установленные особенности экспрессии стресс-респонсивных генов, регуляции стресса ЭПР и апоптоза при действии избытка гомоцистеина могут быть использованы для выработки подходов к лечению гипергомоцистеинемии.

 
 

Список использованной литературы по медицине, диссертация 2012 года, Меситов, Михаил Валентинович

1. Иванов А.В., Лузянин Б.П., Московцев А.А., Роткина А.С., Кубатиев

2. А.А. Определение фракции восстановленного гомоцистеина в сыворотке крови методом ВЭЖХ-МС // Патол. физиол. и эксперим. тер. 2011. - № 2. - С. 55-60

3. Павлова Н.Н. Роль гомоцистеина в механизмах стресс-индуцированной дисфункции тромбоцитов и сосудистого эндотелия: Автореф. канд. мед. наук. М., 2006. - 21 с.

4. ПЦР "в реальном времени" / Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю. и др. Под ред. д.б.н. Ребрикова Д.В. М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2009.-215 с.

5. Austin R.C., Lentz S.R., Werstuck G.H. Role of hyperhomocysteinemia in endothelial dysfunction and atherothrombotic disease // Cell Death and Differentiation. 2004. - V. 11. - P.56-64

6. Bader M., Muse W., Ballou D.P., Gassner C., Bardwell J.C.A. Oxidative Protein Folding Is Driven by the Electron Transport System // Cell. 1999. -V. 98.-P. 217-227

7. Baker K.M., Chakravarthi S., Langton K.P., Sheppard A.M., Lu H.,Bulleid N.J. Low reduction potential of Erola regulatory disulphides ensures tight control of substrate oxidation // The EMBO Journal. 2008. - V. 27. - P. 2988-2997

8. Bergmann J.E., Fusco P.J. The G Protein of Vesicular Stomatitis Virus Has Free Access into And Egress from the Smooth Endoplasmic Reticulum of UT-1 Cells // The Journal of Cell Biology. 1990. - V. 110. - P. 625-635

9. Bertolotti A., Zhang Y., Hendershot L.M., Harding H.P., Ron D. Dynamic interaction of BiP and ER stress transducers in the unfolded-protein response // Nat Cell Biol. 2000. - V. 2. - № 6. - P. 326-332

10. Brewer J.W., Diehl J.A. PERK mediates cell-cycle exit during the mammalian unfolded protein response // PNAS. 2000. - V. 97. - № 23. - 12625-12630

11. Brosnan J.T., Brosnan M.E. The sulfur-containing amino acids: an overview // J Nutr. 2006. - V. 136. - № 6. - P. 1636S-1640S

12. Buchberger A., Bukau B., Sommer T. Protein Quality Control in the Cytosol and the Endoplasmic Reticulum: Brothers in Arms // Molecular Cell. 2010. -V. 40. - P. 238-252

13. Christis C., Lubsen N.H., Braakman I. Protein folding includes oligomerization examples from the endoplasmic reticulum and cytosol // FEBS Journal. - 2008. - V. 275. - P. 4700-4727

14. Chuikov S., Kurash J.K., Wilson J.R., Xiao B., Justin N., Ivanov G.S., McKinney K., Tempst P., Prives C., Gamblin S.J., Barlev N.A., Reinberg D. Regulation of p53 activity through lysine methylation // Nature. 2004. - V. 432.-№7015.-P. 353-360

15. Cochella L., Green R. Fidelity in protein synthesis // Current Biology. 2005.- V. 15. -№ 14. - P. 536-540

16. Cole N.B., Sciakyt N., Marotta A., Song J., Lippincott-Schwartz J. Golgi Dispersal during Microtubule Disruption: Regeneration of Golgi Stacks at Peripheral Endoplasmic Reticulum Exit Sites // Molecular Biology of the Cell.- 1996.-V. 7.-P. 631-650

17. Connor J.H., Weiser D.C., Li S., Hallenbeck J.M., and Shenolikar S. Growth Arrest and DNA Damage-Inducible Protein GADD34 Assembles a Novel Signaling Complex Containing Protein Phosphatase 1 and Inhibitor 1 //

18. Molicular and Cellular Biology. 2001. - V. 21. - № 20. - P. 6841-6850

19. Cuozzo J.W., Kaiser C.A. Competition between glutathione and protein thiols for disulphide-bond formation // Nature Cell Biology. 1999. - V. 1. - P. 130135

20. Cusinato F., Pighin I., Luciani S., Trevisi L. Synergism between staurosporine and drugs inducing endoplasmic reticulum stress // Biochemical pharmacology. 2006. - V. 71. - P. 1562-1569

21. Dai J., Wang X. Immunoregulatory effects of homocysteine on cardiovascular diseases // Acta Physiologica Sinica. 2007. - V. 59. - № 5. - P. 585-592

22. Davis R.J. Signal transduction by the JNK group of MAP kinases // Cell. -2000. V. 103. - № 2. - P. 239-252

23. Dayel M.J., Horn E.F.Y., Verkman A.S. Diffusion of Green Fluorescent Protein in the Aqueous-Phase Lumen of Endoplasmic Reticulum // Biophysical Journal. 1999. - V. 76. - P. 2843-2851

24. DeJong J.L., Morgenstern R., Jornvall H., DePierre J.W., Tu C.-P. D. Gene Expression of Rat and Human Microsomal Glutathione S-Transferases // The Journal Of Biological Chemistry. 1998. - V. 263. - № 17. - P. 8430-8436

25. Diamant S., Ben-Zvi A.P., Bukau B., Goloubinoff P. Size-dependent Disaggregation of Stable Protein Aggregates by the DnaK Chaperone Machinery // The Journal of Biological Chemistry. 2000. - V. 275. - № 28. -P. 21107-21113

26. Ellgaard L., Molinari M., Helenius A. Setting the Standards: Quality Control in the Secretory Pathway // Science. 1999. - V. 286. - P. 1882-1888

27. Ferri K.F., Kroemer G. Organelle-specific initiation of cell death pathways // Nature Cell Biology. 2001. - V. 3. - P. 225-263

28. Finkelstein J.D. Methionine metabolism in mammals // J. Nutr. Biochem. -1990. -V. 1. -№ 5. P. 228-237

29. Finkelstein J.D. The metabolism of homocysteine: pathways and regulation // Eur. J. Pediatr. 1998. - V. 157. - № 2. - P. S40-44

30. Frand A.R., Kaiser C.A. The EROl Gene of Yeast Is Required for Oxidation of Protein Dithiols in the Endoplasmic Reticulum // Molecular Cell. 1998. -V. 1. - P. 161-170

31. Freedman R.B. Protein Disulfide lsomerase: Multiple Roles in the Modification of Nascent Secretory Proteins // Cell. 1989. - V. 57. - P. 10691072

32. Fukada, S., Shimada, Y., Morita, T., Sugiyama, K. Suppression of methionineinduced hyperhomocysteinemia by glycine and serine in rats // Biosci. Biotechnol. Biochem. 2006. - V. 70. - P. 2403-2409

33. Galvin K.M., Shi Y. Multiple mechanisms of transcriptional repression by YY1 // Mol. Cell Biol. 1997. - V. 17. - № 7. - P. 3723-3732

34. Gess B., Hofbauer K.-H., Wenger R.H., Lohaus C., Meyer H.E.,Kurtz A. The cellular oxygen tension regulates expression of the endoplasmic oxidoreductase EROl-La // Eur. J. Biochem. 2003. - V. 270. - P. 2228-2235

35. Goldberg I J. Lipoprotein lipase and lipolysis: central roles in lipoprotein metabolism and atherogenesis // J. Lipid Res. 1996. - V. 37. - № 4. - P. 693707

36. Goldberger R.F., Epstein C.J. Characterization of the Active Product Obtained by Oxidation of Reduced Lysozyme // The Journal of Biologycal Chemistry. -1963. V. 238. - № 9. - P. 2988-2991

37. Goloubinoff P., De Los Rios P. The mechanism of Hsp70 chaperones: (entropic) pulling the models together // TRENDS in Biochemical Sciences. -2007. V. 32. - № 8. - P. 372-380

38. Gunn K.E., Gifford N.M., Mori K., Brewer J.W. A role for the unfolded protein response in optimizing antibody secretion // Mol. Immunol. 2004. -V. 41. -№9. - p. 919-927

39. Hansrani, M., Stansby, G., 2008. The use of an in vivo model to study the effects of hyperhomocysteinaemia on vascular function. J. Surg. Res. 145, 1318.

40. Harding H. P., Novoa I., Zhang Y., Zeng H., Wek R., Schapira M., Ron D. Regulated Translation Initiation Controls Stress-Induced Gene Expression in Mammalian Cells // Molecular Cell. 2000. - V. 6. - P. 1099-1108

41. Harding H.P., Zhang Y., Bertolotti A., Zeng H., Ron D. Perk Is Essential for Translational Regulation and Cell Survival during the Unfolded Protein Response // Molecular Cell. 2000. - V. 5. - P. 897-904

42. Harding H.P., Zhang Y., Ron D. Protein translation and folding are coupled by an endoplasmic-reticulumresident kinase // Nature. 1999. - V. 397. - P. 271-274

43. Hartl F.U., Hayer-Hartl M. Converging concepts of protein folding in vitro and in vivo // Nature Structural and Molecular Biology. 2009. - V. 16. - № 6.-P. 574-581

44. Hashimoto T., Shinohara Y., Hasegawa H. Homocysteine metabolism // The Pharmaceutical Society of Japan. 2007. - V. 127. - № 10. - P. 1579-1592

45. Hetz C. The unfolded protein response: controlling cell fate decisions under ER stress and beyond // Nature Reviews. 2012. - V. 3. - P. 89-102

46. Hirao A., Kong Y.Y., Matsuoka S., Wakeham A., Ruland J., Yoshida H., Liu D., Elledge S.J., Mak T.W. DNA damage-induced activation of p53 by the checkpoint kinase Chk2 // Science. 2000. - V. 287. - № 5459. - P. 1824-1827

47. Hirota M., Kitagaki M., Itagaki H. and Aiba S. Quantitative measurement of spliced XBP1 mRNA as an indicator of endoplasmic reticulum stress // The Journal of Toxicological Sciences. 2006. - V. 31. - № 2. - P. 149-156

48. Hitomi J., Katayama T., Taniguchi M., Honda A., Imaizumi K., Tohyama M. Apoptosis induced by endoplasmic reticulum stress depends on activation of caspase-3 via caspase-12 // Neuroscience Letters. 2003. - V. 357. - P. 127130

49. Hollien J., Lin J.H., Li H., Stevens N., Walter P., Weissman J.S. Regulated Ire 1-dependent decay of messenger RNAs in mammalian cells // J. Cell Biol.2009. V. 186. - № 3. - P. 323-331

50. Hollien J., Weissman J.S. Decay of Endoplasmic Reticulum-Localized mRNAs During the Unfolded Protein Response // Science. 2006. - V. 313.-P. 104-107

51. Hosokawa N., Wada I., Hasegawa K., Yorihuzi Т., Tremblay L.O., Herscovics A., Nagata K. A novel ER a-mannosidase-like protein accelerates ER-associated degradation // EMBO reports. 2001. - V. 21. - № 51. - P. 4215-4221

52. Hunt M.J., Tyagi S.C. Peroxisome proliferators compete and ameliorate Hcy-mediated endocardial endothelial cell activation // Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2002. - V. 283. - № 4. - P. 1073-1079

53. Ingram A.J., Krepinsky J.C., James L., Austin R.C., Tang D., Salapatek A.M., Thai K., Scholey J.W. Activation of mesangial cell МАРК in response to homocysteine // Kidney Int. 2004. - V. 66. - № 2. - P. 733-745

54. Jakubowski H. Pathophysiological consequences of homocysteine excess // J. Nutr. 2006. - V. 136. - № 6. - P. 1741S-1749S

55. Ji C., Kaplowitz N. Hyperhomocysteinemia, endoplasmic reticulum stress, and alcoholic liver injury // World J. Gastroenterol. 2004. - V. 10. - № 12. -P. 1699-1708

56. Jia F., Wu C., Chen Z., Lu G. Atorvastatin Inhibits Homocysteine-Induced Endoplasmic Reticulum Stress through Activation of AMP-Activated Protein Kinase // Cardiovascular Therapeutics. 2011. - P. 1-9

57. Juin P., Hueber A.O., Littlewood T., Evan G. c-Myc-induced sensitization to apoptosis is mediated through cytochrome c release // Genes Dev. 1999. - V. 13.-№ 11.-P. 1367-1381

58. Kawai T., Fan J., Mazan-Mamczarz K., Gorospe M. // Global mRNA stabilization preferentially linked to translational repression during the endoplasmic reticulum stress response // Mol. Cell Biol. 2004. - V. 24. - № 15.-P. 6773-6787

59. Klefstrom J., Verschuren E.W., Evan G. c-Myc augments the apoptotic activity of cytosolic death receptor signaling proteins by engaging the mitochondrial apoptotic pathway // J. Biol. Chem. 2002. - V. 277. - № 45. -P. 43224-43232

60. Kokame K., Agarwala K.L., Kato H., Miyata T. Herp, a New Ubiquitin-like Membrane Protein Induced by Endoplasmic Reticulum Stress // J. Biol. Chem. 2000. - V. 275. - № 42. - P. 32846-32853

61. Kokame K., Kato H., Miyata T. Homocysteine-respondent genes in vascular endothelial cells identified by differential display analysis. GRP78/BiP and novel genes // J. Biol. Chem. 1996. - V. 271. - № 47. - P. 29659-29665

62. Kokame K., Kato H., Miyata T. Nonradioactive Differential Display Cloning of Genes Induced by Homocysteine in Vascular Endothelial Cells // Methods.- 1998. V. 16. - № 4. - P. 434-443

63. Korennykh A.V., Korostelev A.A., Egea P.F., Finer-Moore J., Stroud R.M., Zhang C., Shokat K.M., Walter P. Structural and functional basis for RNA cleavage by Irel // BMC Biology. 2011. - V. 9. - P. 47

64. Kramer K., Harrington E.O., Lu Q., Bellas R., Newton J., Sheahan K.L., Rounds S. Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase activity modulates endothelial cell apoptosis // Mol. Biol. Cell. 2003. - V. 14. - № 3. - P. 848857

65. Kultz D. Evolution of the cellular stress proteome: from monophyletic origin to ubiquitous function // The Journal of Experimental Biology. 2003. - V. 206. - P. 3119-3124

66. Kyriakis J.M. Life-or-death decisions // Nature. 2001. - V. 414. - № 6861. -P. 265-266

67. Laboissiere M.C.A., Sturley S.L., Raines R.T. The Essential Function of Protein-disulfide Isomerase Is to Unscramble Non-native Disulfide Bonds // The Journal of Biologycal Chemistry. 1995. - V. 270. - № 47. - P. 2800628009

68. Lee A.-H., Iwakoshi N.N., Glimcher L.H. XBP-1 Regulates a Subset of Endoplasmic Reticulum Resident Chaperone Genes in the Unfolded Protein Response // Mol. Cell Biol. 2003. - V. 21. - P. 7448-7459

69. Lee S.J., Lee H.K. Sanguiin H-6 blocks endothelial cell growth through inhibition of VEGF binding to VEGF receptor // Arch. Pharm. Res. 2005. -V. 28. -№ 11. - P. 1270-1274

70. Lekstrom-Himes J., Xanthopoulos K.G. Biological Role of the CCAAT/Enhancer-binding Protein Family of Transcription Factors // The Journal of Biological Chimistry. 1998. - V. 273. - № 44. - P. 28545-28548

71. Li J., Lee B., Lee A.S. Endoplasmic Reticulum Stress-induced Apoptosis. Multiple pathways and activation of p53-up-regulated modulator of apoptosis (PUMA) and NOXA by p53 // The Journal Of Biological Chemistry. 2006. -V. 281. -№ 11. - P. 7260-7270

72. Li X., Zhang K., Li Z. Unfolded protein response in cancer: the Physician's perspective // Journal of Hematology and Oncology. 2011. - V. 4. - № 8. - P. 1-10

73. Livak K.J. and Schmittgen T.D. Analysis of Relative Gene Expression Data Using Real-Time Quantitative PCR and the 2"DDCt Method // Methods. 2001. . V. 4. p. 402-408

74. Matsumoto T., Claesson-Welsh L. VEGF receptor signal transduction // Sci STKE. 2001. - V. 2001. -№ 112.-P. 21.

75. McKeever M.P., Weir D.G., Molloy A., Scott J.M. Betaine-homocysteine methyltransferase: organ distribution in man, pig and rat and subcellular distribution in the rat // Clin. Sci. (Lond). 1991. - V. 81. - № 4. - P. 551-556.

76. Merksamer P.I. and Papa F.R. The UPR and cell fate at a glance // Journal of Cell Science. 2010. - V. 1. - P. 1003-1006

77. Mudd S.H., Poole J.R. Labile methyl balances for normal humans on various dietary regimens // Metabolism. 1975. - V. 24. - № 6. - P. 721-735

78. Nadanaka S., Okada T., Yoshida H., Mori K. Role of Disulfide Bridges

79. Formed in the Luminal Domain of ATF6 in Sensing Endoplasmic Reticulum

80. Stress // Mol. Cell Biol. 2007. - V. 27. - № 3. p. 1027-1043

81. Nishitoh H., Saitoh M., Mochida Y., Takeda K., Nakano H., Rothe M., Miyazono K., Ichijo H. ASK1 is essential for JNK/SAPK activation by TRAF2 // Mol Cell. 1998. - V. 2. - № 3. - P. 389-395

82. Novoa I., Zeng H., Harding H.P., Ron D. Feedback Inhibition of the Unfolded Protein Response by GADD34-mediated Dephosphorylation of eIF2a // The Journal of Cell Biology. -2001. V. 153. -№ 5. - P. 1011-1021

83. Ogle J.M., Ramakrishnan V. Structural insights into translational fidelity // Annu. Rev. Biochem. 2005. - V. 74. P. 129-177

84. Ohoka N., Hattori T., Kitagawa M., Onozaki K., and Hayashi H. Critical and Functional Regulation of CHOP (C/EBP Homologous Protein) through the N-terminal Portion // The Journal of Biological Chemystry. 2007. - V. - 282. -№ 49. - P. 35687-35694

85. Ohoka N., Yoshii S., Hattori T., Onozaki K. and Hayashi H. TRB3, a novel ER stress-inducible gene, is induced via ATF4-CHOP pathway and is involved in cell death // The EMBO Journal. 2005. - V. 24. - P. 1243-1255

86. Oikawa D., Kimata Y., Kohno K., Iwawaki T. Activation of mammalian

87. E 1 alpha upon ER stress depends on dissociation of BiP rather than on direct interaction with unfolded proteins // Exp. Cell Res. 2009. - V. 315. - № 15. -P. 2496-2504

88. Ord T., Ord D., Koivomagi M., Juhkam K., Ord T. Human TRB3 is upregulated in stressed cells by the induction of translationally efficient mRNA containing a truncated 5'-UTR // Gene. 2009. - V. 444. - № 1-2. - P. 24-32

89. Outinen P.A., Sood S.K., Liaw P.C.Y., Sarge K.D., Maeda N., Hirsh J., Ribau J., Podor T.J., Weitz J.I., Austin R.C. Characterization of the stress-inducing effects of homocysteine // Biochem. J. 1998. - V. 332. - P. 213-221

90. Oyadomari S., Mori M. Roles of CHOP/GADD153 in endoplasmic reticulum stress // Cell Death and Differentiation (2004) 11, 381-389

91. Park S.H., Blackstone C. Further assembly required: construction and dynamics of the endoplasmic reticulum network // EMBO reports. 2012. - V. 11. -№ 7. - P. 515-521

92. Pavlova N., Cherkasova K., Rudko I., Romanova E., Kubatiev A. Effects of Hyperhomocysteinemia on the Anticoagulant System and Platelet Function Under Stress // Journal of Thrombosis and Haemostasis. 2005. - V. 3. -Suppl. 1

93. Pavlova N., Cherkasova K., Rudko I., Romanova E., Kubatiev A. Stress-induced platelet activation in hyperhomocysteinemic rats // Journal of Thrombosis and Haemostasis. 2005. - V. 3. - Suppl. 1

94. Perna, A.F., Ingrosso, D., Galletti, P., Zappia, V., De Santo, N.G. Membraneprotein damage and methylation reactions in chronic renal failure // Kidney Int. 1996.-V. 50.-P. 358-366

95. Prinz W.A., Grzyb L., Veenhuis M., Kahana J.A., Silver P.A., Rapoport T.A. Mutants Affecting the Structure of the Cortical Endoplasmic Reticulum in Saccharomyces cerevisiae II The Journal of Cell Biology. 2000. - V. 150. -№3. - P. 461-474

96. Pollard M.G., Travers K.J., Weissman J.S. Erolp: A Novel and Ubiquitous Protein with an Essential Role in Oxidative Protein Folding in the Endoplasmic Reticulum // Molecular Cell. 1998. - V. 1. - P. 171-182

97. Reimold A.M., Iwakoshi N.N., Manis J., Vallabhajosyula P., Szomolanyi-Tsuda E., Gravallese E.M., Friend D., Grusby M.J., Alt F., Glimcher L.H. Plasma cell differentiation requires the transcription factor XBP-1 // Nature. 2001 Jul 19;412(6844):300-7.

98. Rodriguez F., Arsene-Ploetze F., Rist W., Rudiger S., Schneider-Mergener J., Mayer M.P., Bukau B. Molecular Basis for Regulation of the Heat Shock Transcription Factor a by the DnaK and DnaJ Chaperones // Molecular Cell. -2008. -V. 32. P. 347-358

99. Rolls M.M., Hall D.H., Victor M., Stelzer E.H.K., Rapoport T.A. Targeting of Rough Endoplasmic Reticulum Membrane Proteins and Ribosomes in Invertebrate Neurons // Molecular Biology of the Cell. 2002. - V. 13. - P. 1778-1791

100. Ron D., Habener J.F. CHOP, a novel developmentally regulated nuclear protein that aimerizes with transcription factors C/EBP and LAP and functions as a dominantnegative inhibitor of gene transcription // Genes Dev. 1992. -V. 6. - P. 439-453

101. Ron D., Walter P. Signal integration in the endoplasmic reticulum unfolded protein response // Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2007. - V. 5. -P. 1-11

102. Rosenberger F.R., Hilton J. The Frequency of Transcriptional and Translational Errors at Nonsense Codons in the lacZ Gene of Escherichia coli II Mol Gen Genet. 1983. - V. 191. - P. 207-212

103. Rutkowski D.T., Hegde R.S. Regulation of basal cellular physiology by the homeostatic unfolded protein response // J. Cell Biol. V. 189. - № 5. - P. 783-794

104. Shen J., Chen X., Hendershot L., Prywes R. ER Stress Regulation of ATF6 Localization by Dissociation of BiP/GRP78 Binding and Unmasking of Golgi Localization Signals // Developmental Cell. 2002. - V. 3. - № 1. - P. 99-111

105. Shen J., Snapp E.L., Lippincott-Schwartz J., Prywes R. Stable Binding of ATF6 to BiP in the Endoplasmic Reticulum Stress Response // Molecular and Cellular Biology. 2005. - V. - 25. - № 3. - P. 921-932

106. Sidrauski C., Walter P. The Transmembrane Kinase Irelp Is a Site-Specific Endonuclease That Initiates mRNA Splicing in the Unfolded Protein Response//Cell. 1997.-V. 90. - P. 1031-1039

107. Schindler A.J., Schekman R. In vitro reconstitution of ER-stress induced ATF6 transport in COPII vesicles // Proc. of the Nat. Acad, of Sei. of the USA. 2009. - V. 106. - № 42. - P. 17775-17780

108. Schroder M., Kaufman R.J. ER stress and the unfolded protein response // Mutation Research. 2005. - V. 569. -P. 29-63

109. Schroder M., Kaufman R.J. The mammalian unfolded protein response // Annu. Rev. Biochem. 2005. - V. 74. - P. 739-89

110. Snapp E. Design and Use of Fluorescent Fusion Proteins in Cell Biology // Curr Protoc Cell Biol. Author manuscript. 2010

111. Stevens F.J. and Argon Y. "Protein folding in the ER", seminars in CELL & DEVELOPMENTAL BIOLOGY, Vol 10, 1999: pp. 443-454

112. Subramanian K., Meyer T. Calcium-Induced Restructuring of Nuclear Envelope and Endoplasmic Reticulum Calcium Stores // Cell. 1997. - V. 89. -P. 963-971

113. Suzuki Y.J., Lorenzi M.V., Shi S.S., Day R.M., Blumberg J.B. Homocysteine exerts cell type-specific inhibition of AP-1 transcription factor // Free Radic. Biol. Med. 2000. - V. 28. - № 1. - P. 39-45

114. Svardal A., Refsum H., Ueland P.M. Determination of in vivo protein binding of homocysteine and its relation to free homocysteine in the liver and other tissues of the rat // J. Biol. Chem. 1986. - V. 261. - № 7. - P. 3156-3163

115. Szegezdi E., Logue S.E., Gorman A.M., Samali A. Mediators of endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis // EMBO reports. 2006. - V. 7. - P. 880885

116. Takayanagi S., Fukuda R., Takeuchi Y., Tsukada S., Yoshida K. Gene regulatory network of unfolded protein response genes in endoplasmic reticulum stress // Cell Stress and Chaperones, 2012

117. Tan H., Jiang X., Yang F., Li Z., Liao D., Trial J., Magera M.J., Durante W., Yang X., Wang H. Hyperhomocysteinemia inhibits post-injury reendothelialization in mice // Cardiovasc. Res. 2006. - V. 69. - № 1. - P. 253-262

118. Tate G., Kishimoto K., Hirayama Y., Suzuki T., Mitsuya T. A novel missense mutation of the XBP1 gene in diffuse large B-cell lymphoma // Cancer Genet Cytogenet. 2009. - V. 190. - № 2. - P. 131-133

119. Terasaki M. Dynamics of the Endoplasmic Reticulum and Golgi Apparatus during Early Sea Urchin Development // Molecular Biology of the Cell. -2000. -V. 11. P. 897-914

120. Terasaki M., Slater N.T., Fein A., Schmidek A., Reese T.S. Continuous network of endoplasmic reticulum in cerebellar Purkinje neurons // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994. - V. 91. - P. 7510-7514

121. Todd D.J., Lee A.-H., Glimcher L.H. The endoplasmic reticulum stress response in immunity and autoimmunity // Nat. Rev. Immunol. 2008. - V. 8.- № 9. P. 663-674

122. Travers K.J., Patil C.K., Wodicka L., Lockhart D.J., Weissman J.S., Walter P. Functional and Genomic Analyses Reveal an Essential Coordination between the Unfolded Protein Response and ER-Associated Degradation // Cell. -2000.-V. 101. P. 249-258

123. Troen, A.M., Lutgens, E., Smith, D.E., Rosenberg, I.H., Selhub, J. The atherogenic effect of excess methionine intake // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.- 2003. V. 100. - P. 15089-15094

124. Tu B.P., Weissman J.S. The FAD- and (VDependent Reaction Cycle of Erol-Mediated Oxidative Protein Folding in the Endoplasmic Reticulum // Molecular Cell. 2002. - V. 10. - P. 983-994

125. Undas A., Brozek J., Jankowski M., Siudak Z., Szczeklik A., Jakubowski H. Plasma homocysteine affects fibrin clot permeability and resistance to lysis inhuman subjects // Arterioscler. Thromb. Vase. Biol. 2006. - V. 26. - № 6. -P. 1397-1404

126. Vandesompele J., de Preter K., Pattyn F., Poppe B., van Roy N., de Paepe A., Speleman F. Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes // Genome Biol. -2002.-V. 3.-№7.

127. Vattem K.M., Wek R.C. Reinitiation involving upstream ORFs regulates ATF4 mRNA translation in mammalian cells // PNAS. 2004. - V. 101. - № 31. - P. 11269-11274

128. Verkhratsky A. The endoplasmic reticulum and neuronal calcium signalling // Cell Calcium. 2002. V. - 32. - № 5-6. - P. 393-404

129. Voeltz G.K., Rolls M.M., Rapoport T.A. Structural organization of the endoplasmic reticulum // EMBO reports. 2002. - V. 3. - № 10. - P. 944-950

130. Wek R.C., Jiang H.-Y., Anthony T.G. Coping with stress: eIF2 kinases and translational control // Biochem. Soc. Trans. 2006. - V. 34. - P. 7-11

131. Wiest D.L., Burkhardt J.K., Hester S., Hortsch M., Meyer D.I., Argon Y.

132. Membrane Biogenesis during B Cell Differentiation: Most Endoplasmic

133. Reticulum Proteins Are Expressed Coordinately // The Journal of Cell

134. Biology. 1990. - V. 110.-P. 1501-1511

135. Woehlbier U., Hetz C. Modulating stress responses by the UPRosome: amatter of life and death // Trends Biochem. Sei. 2011. - V. 36. - № 6. - P.329.337

136. Wong M.L., Medrano J.F. Real-time PCR for mRNA quantitation //

137. BioTechniques. 2005. - V. 39. - P. 75-85

138. Woo C.W., Siow Y.L., Pierce G.N., Choy P.C., Minuk G.Y., Mymin D., O K.

139. Hyperhomocysteinemia induces hepatic cholesterol biosynthesis and lipidaccumulation via activation of transcription factors // Am. J. Physiol.

140. Endocrinol. Metab. 2005. - V. 288. - № 5. - P. El002-1010

141. Wu J., Kaufman R.J. From acute ER stress to physiological roles of the

142. Unfolded Protein Response // Cell Death and Differentiation. 2006. - V. 13.1. P. 374-384

143. Ye J., Rawson R.B., Komuro R., Chen X., Dave' U.P., Prywes R., Brown

144. M.S., Goldstein J.L. ER stress induces cleavage of Membrane-Bound ATF6by the Same Proteases that Process SREBPs // Molecular Cell. 2000. - V. 6.-P. 1355-1364

145. Yoneda T., Imaizumi K., Oono K., Yui D., Gomi F., Katayama T., Tohyama

146. M. Activation of caspase-12, an endoplastic reticulum (ER) resident caspase,through tumor necrosis factor receptor-associated factor 2-dependentmechanism in response to the ER stress // J. Biol. Chem. 2001. - V. 276. - №17.-P. 13935-13940

147. Yoshida H., Matsui T., Yamamoto A., Okada T., Mori K. XBP1 mRNA Is Induced by ATF6 and Spliced by IRE1 in Response to ER Stress to Produce a Highly Active Transcription Factor // Cell. 2001. - V. 107. - P. 881-891

148. Yoshida H, Oku M., Suzuki M., Mori K. pXBP 1 (U) encoded in XBP1 pre-mRNA negatively regulates unfolded protein response activator pXBPl(S) in mammalian ER stress response // The Journal of Cell Biology. 2006. - V. 172.-№4.-P. 565-575

149. Zhang K., Wong H.N., Song B., Miller C.N., Scheuner D., Kaufman R.J. The unfolded protein response sensor IRE la is required at 2 distinct steps in B cell lymphopoiesis // J. Clin. Invest. 2005. - V. 115. - P. 268-281

150. Zinszner H., Kuroda M., Wang X., Batchvarova N., Lightfoot R.T., Remotti H., Stevens J.L., Ron D. CHOP is implicated in programmed cell death in response to impaired function of the endoplasmic reticulum // Genes Dev. -1998. V. 12. - № 7. - P. 982-995