Автореферат диссертации по медицине на тему Роль индигенной микрофлоры при воспалительных заболеваниях кишечника у детей
Г) С/
На правах рукописи
□034Э0 1 ИПАТОВА МАРИЯ ГЕОРГИЕВНА
РОЛЬ ИНДИГЕННОИ МИКРОФЛОРЫ ПРИ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЯХ КИШЕЧНИКА
УДЕТЕЙ
14.00.09 - Педиатрия
АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук
1 4ЯНВ
Москва, 2009
003490118
Работа выполнена в Федеральном государственном учреждении «Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии» Минздравсоразвития России и ГОУ ВПО РГМУ Росздрава
Научные руководители:
доктор медицинских наук, профессор Кафарская Людмила
Ивановна
кандидат медицинских наук Шумилов Петр
Валентинович
Официальные оппоненты:
доктор медицинских наук, профессор Горелов Александр
Васильевич
доктор медицинских наук, профессор Делягин Василий
Михайлович
Ведущая организация: Московский областной научно-исследовательский клинический институт им. М.Ф.Владимирского
Защита диссертации состоится «__»_ в_часов на заседании
диссертационного Совета Д.208.050.01 при ФГУ «Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии» Минздравсоразвития, по адресу: 117997, г. Москва, Ленинский проспект, д. 117, корпус 2.
С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке ФГУ ФНКЦ ДГОИ Минздравсоразвития и на сайте www.niidg.ru Автореферат разослан «_»_2009 г.
Ученый секретарь диссертационного совета,
доктор медицинских наук, профессор Чернов В.М.
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность проблемы
Воспалительные заболевания кишечника (ВЗК), к которым относятся неспецифический язвенный колит (НЯК) и болезнь Крона (БК), представляют собой хронически текущие, рецидивирующие воспалительные заболевания желудочно-кишечного тракта (ЖКТ), приводящие к необратимому нарушению его структуры и функции [Яблокова Е.А., 2006]. Рост заболеваемости у детей, поздняя диагностика, приводящая к различным осложнениям, и неблагоприятный прогноз обусловливают особую актуальность изучения данной проблемы.
Этиология ВЗК остается до конца неизвестной. Многие исследователи пришли к единому мнению, что в патогенезе воспалительных заболеваний кишечника лежит взаимодействие генетической предрасположенности, факторов внешней среды, иммунорегуляторных механизмов и кишечной микрофлоры 1?. БсаМайял й а1., 2005].
Результаты современных отечественных и зарубежных исследований указывают на значительную роль индигенной микрофлоры в патогенезе воспалительных заболеваний кишечника, в особенности его дистальных отделов. Но имеющийся объем информации об особенностях кишечной микрофлоры у пациентов с ВЗК недостаточен для глубокого понимания конкретной роли различных видов бактерий в развитии данной патологии. Это связано, в первую очередь, с несовершенством рутинных бактериологических методов исследования микрофлоры, а также недостаточным вниманием к изучению качественного и количественного состава пристеночной микрофлоры толстой кишки у пациентов с БК и НЯК. В большинстве исследований изучалась преимущественно фекальная микрофлора, которая по составу существенно отличается от микрофлоры слизистой оболочки ЖКТ [Р.В. ЕскЬи^ й а1., 2005].
В последние годы развитие молекулярной систематики бактерий и методов детекции нуклеиновых кислот, таких как полимеразная цепная реакция (ПЦР) в режиме реального времени сделали возможным выявление в исследуемом материале тех групп бактерий, учет которых был крайне затруднен из-за сложности или невозможности их культивирования методами классической бактериологии. Полученные данные кардинально изменили представление о составе пристеночной микрофлоры кишечника [Matsuki Т. et al., 2002, Miyamoto Y. et al., 2002, Matsuki, T. et al., 2004].
На сегодняшний день нет единого консенсуса относительно роли микробного компонента в развитии ВЗК, состава кишечной микрофлоры у пациентов с БК и НЯК в зависимости от активности и распространенности заболевания. Все известные исследования проводились только у взрослых пациентов [Swidsinski A. et al. 2002; Eckburg Р.В. et al., 2005, Takaishi H. et al, 2008].
Изучение особенностей состава индигенной пристеночной микрофлоры и иммунологической реактивности к ней у пациентов с НЯК и БК важно не только для понимания патогенеза ВЗК, но и необходимо для разработки новых диагностических и терапевтических подходов, оценки эффективности и безопасности новых методов лечения, что делает нашу работу крайне актуальной.
Цель исследования
Установить особенности состава пристеночной микрофлоры кишечника и адаптивного иммунитета у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом для оптимизации лечебно-диагностических и профилактических мероприятий.
Задачи исследования:
1. Выявить особенности анамнестических, клинических и лабораторно-инструментальных данных у детей с различными вариантами течения болезни Крона и неспецифического язвенного колита.
2. Изучить количественный и качественный состав основных представителей пристеночной микрофлоры в биоптате слизистой оболочки кишечника у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом методом количественного ПЦР в режиме реального времени с группоспецифическими праймерами.
3. Выявить корреляционные связи между количественным содержанием различных представителей индигенной микрофлоры (группа В. fragilis, группа С. leptum, группа C.coccoides, род Bifidobacterium, род Lactobacillus, род Prevotella и кластер Atopobium) при различных течениях воспалительных заболеваний кишечника у детей с клиническими и лабораторно-инструментальными данными.
4. Исследовать титр антител класса IgG к основным представителям индигенной микрофлоры в сыворотке крови с помощью иммуноферментного анализа у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом и оценить его диагностическую и прогностическую роль.
5. Оптимизировать лечебно-диагностические и профилактические мероприятия на основании установленных особенностей состава пристеночной микрофлоры у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом.
Научная новизна.
Впервые была проведена комплексная оценка пристеночной микрофлоры толстой кишки у детей с БК и НЯК методом количественного ПЦР в режиме реального времени с группоспецифическими праймерами. Выявлены особенности количественного и качественного состава пристеночной микрофлоры (группа В. fragilis, группа С. leptum, группа C.coccoides, род Bifidobacterium, род Lactobacillus, род Prevotella и кластер
АЮроЫит) в зависимости от нозологической формы, особенностей клинического течения, распространенности патологического процесса и проводимой терапии.
Впервые оценена иммуногенная роль индигенной флоры (на примере бифидобактерий и лактобацилд) в патогенезе воспалительных заболеваний кишечника по данным иммуноферментного анализа. Показано, что повышение уровня 1§С-антител к лактобациллам и бифидобактериям коррелируют с распространенностью и активностью патологического процесса при НЯК и может быть использовано в качестве диагностического и прогностического критерия у детей с ВЗК.
Полученные результаты данного исследования могут послужить основой для дальнейшей качественной и количественной идентификации основных представителей пристеночной микрофлоры кишечника, для разработки новых диагностических критериев болезни Крона и неспецифического язвенного колита, для оптимизации методов медикаментозной терапии у детей и мониторинга их эффективности.
Практическая значимость.
Изучен состав пристеночной микрофлоры толстой кишки у детей с БК и НЯК методом количественного ПЦР в режиме реального времени с группоспецифическими праймерами в зависимости от нозологической формы, особенностей клинического течения и распространенности патологического процесса. Предложены новые дополнительные диагностические критерии у детей с БК и НЯК. Показано влияние проводимой терапии на состав пристеночной микрофлоры и роль ее изменения на течение ВЗК у детей.
Показана высокая диагностическая ценность определения титра антител класса ^О к лактобациллам и бифидобактериям в сыворотке крови у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом посредством иммуноферментного анализа и его прогностическая роль для определения активности течения неспецифического язвенного колита у детей.
Предложены дополнительные диагностические критерии БК и НЖ у детей в зависимости от состава пристеночной микрофлоры кишечника и уровня ^О-антител к лактобациллам и бифидобактериям.
Апробация работы
Основные положения диссертации доложены и обсуждены на XIV Российской Гастроэнтерологической неделе (Москва 6-8 октября 2008г), VII Российском конгрессе «Современные технологии в педиатрии и детской хирургии», Москва 21-23 октября 2008 г., 11-ом Международном Славянобалтийском научном форуме «Санкт-Петербург - Гастро-2009», Санкт-Петербург 20-22 мая 2009 г., 2-ом международном конгрессе по пробиотикам «Санкт-Петербург - Пробиотики-2009», Санкт-Петербург 28-30 октября 2009 г.
Внедрение в практику
Разработанные дополнительные микробиологические диагностические критерии БК и НЯК у детей внедрены в практику и используются в педиатрическом отделении городской детской клинической больницы № 13 имени Н.Ф. Филатова г. Москвы. Основные научные положения и выводы внедрены в педагогический процесс курса гастроэнтерологии и диетологии ФУВ кафедры детских болезней № 2 ГОУ ВПО Российский государственный медицинский университет им. Н.И. Пирогова Росздрава.
Публикации: По теме диссертации имеется 6 публикаций, в том числе 2 статьи в журналах, рекомендуемых ВАК РФ.
Объем и структура диссертации
Диссертация изложена на _ страницах машинописного текста и
состоит из введения, обзора литературы, описания объема и методов исследования, трех глав собственных исследований, обсуждения, выводов и
практических рекомендаций. Работа проиллюстрирована __таблицами и
_рисунками. Библиография содержит_литературных источников:_
отечественных и_иностранных.
СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ
Объем и методы исследования
Работа выполнялась на базе отделения гастроэнтерологии с гепатологической группой (зав. отд. - д.м.н., проф. А.С.Потапов) НИИ Педиатрии ГУ НЦЗД РАМН (директор - академик РАМН, д.м.н., проф. A.A. Баранов), кафедры микробиологии и вирусологии ГОУ ВПО Российского государственного медицинского университета им. Н.И.Пирогова Росздрава (зав. кафедрой - д.м.н., проф. Кафарская Л.И.) и лаборатории иммунохимической диагностики ФГУ НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова РАМН (зав. лабораторией - д.м.н. Ястребова Н.Е.).
Таблица 1.
Объем проведенных исследований _
Наименование исследования Количество исследований
Клиническое обследование, сбор анамнеза, осмотр 51
Клинический анализ крови 51
Общий анализ мочи 51
Копрограмма 51
Коагулограмма 38
Биохимический анализ крови 51
Иммунологические исследования крови 51
Ультразвуковое исследование органов брюшной полости 51
Колоноскопия 51
Гистологическое исследование биоптатов тонкой и толстой кишки 51
Оценка активности по индексу ЛасИтНеш^ (клинический, эндоскопический) 26
Оценка активности по педиатрическому индексу болезни Крона (РСБА!) 17
Оценка простого эндоскопического индекса активности при болезни Крона (SES-CD) 17
Уровень igG антител к антигенам лактобацилл и би ф идобактериям 50
ПЦР в режиме реального времени бактерий: Clostridium coccoides, Clostridium leptum, Bacteroides fragilis, Bifidobacterium, Lactobacillus, Prevotella, Atopobium 32
Было обследовано 43 ребенка с воспалительными заболеваниями кишечника в возрасте от 1,5 лет до 17 лет 10 мес. (26 мальчиков и 17 девочек). Из них у 26 детей был диагностирован НЯК, у 17 - БК. Средний возраст обследованных детей с ВЗК составлял 12,2±3,97 лет. Длительность ВЗК у наблюдаемых детей в среднем составила 3,6±3,4 лет. Референтная группа включала 24 ребенка (у 8 детей исследовались биоптаты слизистой оболочки толстой кишки, у 16 - сыворотка крови), не имевших воспалительных заболеваний кишечника и других воспалительных заболеваний на момент забора материала. Группа сравнения была сопоставима с исследуемой группой по возрасту и половому составу.
Таблица 2.
Распределение детей с ВЗК (п=43) по полу и возрасту.
до 3-х лет 4 года -12 лет 13 лет-17 лет
БК (%) м 1(5%) 6(35%) 4(24%)
д 0 4 (24%) 2 (12%)
НЯК (%) м 1 (4%) 4(15%) 10(39%)
Д 1 (4%) 5(19%) 5(19%)
Всего (%) 3(7%) 19 (44%) 21 (49%)
Диагнозы НЯК . и БК устанавливались на основании жалоб, данных анамнеза и результатов клинико-лабораторных, эндоскопических и морфологических методов исследования.
Клинический осмотр проводился с применением общепринятых методов пальпации, перкуссии и аускультации. При осмотре обращали
9
внимание на общее состояние ребенка, телосложение и состояние питания, цвет, температуру и наличие изменений кожных покровов, форму и размер живота. Физическое развитие детей оценивали по стандартным центильным таблицам (А.В. Мазурин, И.М. Воронцов, 2001).
Для определения клинической активности НЯК у детей использовали балльную шкалу Rachmilewitz (D.Rachmilewitz, 1989), БК - с помощью педиатрического индекса активности болезни Крона (PCDAI) (H.J. Loonen, А.М. Griffiths et al., 2003).
Эндоскопическую активность НЯК определяли с использованием эндоскопического индекса Rachmilewitz. Оценка эндоскопической активности БК проводилась при помощи простого эндоскопического индекса активности болезни Крона (SES-CD). Гистологические исследования биоптатов слизистой оболочки кишечника выполнялись в патоморфологической лаборатории ГНЦК МЗ РФ (зав.- д.м.н., проф. Капуллер Л.Л.).
Изучение особенностей состава индигенной пристеночной микрофлоры (группа Clostridium coccoides, группа Clostridium leptum, группа Bacteroides fragilis, род Bifidobacterium, род Lactobacillus, род Prevotella, и кластер Atopobium) проводилось методом ПЦР в режиме реального времени с помощью группоспецифических праймеров на кафедре микробиологии Российского государственного медицинского университета им. Н.И.Пирогова Росздрава (зав. кафедрой - д.м.н., проф. Кафарская Л.И.). Забор материала для исследования проводился во время плановой диагностической фиброколоноскопии с лестничной биопсией (назначена лечащим врачом согласно индивидуального плана обследования). Для исследования брался один дополнительный биоптат слизистой оболочки прямой кишки, который хранился в сухой пластиковой микропробирке при температуре -80°С до проведения исследования. Выделение ДНК из образцов проводилось по методу Boom с использованием набора ZR Genomic DNA Tissue MiniPrep (ZYMO RESEARCH) в соответствии с рекомендациями
изготовителя. Постановку реакции ПЦР в режиме реального времени осуществляли с использование готовых 2,5Х ПЦР-смесей («Синтол») в приборе АНК-32 («Синтол»). Флуоресценция в пробирках детектировалась в режиме реального времени на канале FAM (возбуждение 492 нм, эммиссия 520 нм). Значения пороговых циклов определялись автоматически прибором. Построение калибровочных кривых и расчет значений концентрации бактериального геномного ДНК в исследуемых образцах проводили с использованием программы Microsoft Excel.
Для изучения иммунологической реактивности к индигенной микрофлоре кишечника проводилось определение антител класса IgG к лактобациллам и бифидобактериям на базе лаборатории иммунохимической диагностики ФГУ НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова РАМН (зав. лабораторией - д.м.н. Ястребова Н.Е.). Для приготовления диагностических систем для ИФА использовались пробиотические штаммы Bifidobacterium bifidum 791 и Lactobacillus rhamnosus 1, которые культивировались в питательной среде MRS (Himedia Labs, Индия) в анаэробных условиях при 37°С. Препараты клеточных стенок были получены методом дезинтеграции и центрифугирования (Ястребова Н.Е. и др.. 1999). Антитела класса IgG к бифидобактериям и лактобациллам определяли с помощью иммуноферментного анализа. Учет результатов на спектрофотометре при длине волны 492нм. Оптическую плотность растворов в каждой ячейке измеряли с помощью многоканального автоматического горизонтального фотометра "Titertech Multiscan®MC" фирмы "Flow Laboratories" (Англия).
Статистическая обработка полученных данных проводилась с использованием пакета программ BIOSTAT и STATISTICA 6.0. В обработку результатов входил анализ распределения признаков и их числовые характеристики. В случае, если выборка подчинялась закону нормального распределения, для анализа использовались критерии параметрической статистики с вычислением средней и стандартного отклонения, при сравнении признаков применялся Т-тест. В случаях
ненормального распределения, в анализе полученных результатов использовались критерии непараметрической статистики с вычислением медианы и 25%-ой и 75%-ой перцентилей. При сравнении двух независимых признаков использовался критерий Манна-Уитни, а при сравнении зависимых признаков - парный критерий Уилкоксона. Для сравнения долей использовался критерий углового преобразования Фишера. При сравнении однородных величин различия считались достоверными при р<0,05. В целях выявления характера взаимодействия между показателями, характеризующими изменение в организме ребёнка, анализировалась линейная корреляция Пирсона (г) или ранговая корреляция Спирмена (г5). Корреляционная связь при коэффициенте корреляции до 0,5 расценивалась как низкая, 0,5-0,7- умеренная, 0,7-0,9-сильная.
Результаты исследования
При поступлении в клинику у большинства детей (62%) наблюдалось обострение заболевания. Самыми частыми клиническими проявлениями у детей, страдающих НЯК, были частый разжиженный стул до 4 - 6 раз в сутки (69%), кровь в стуле (50%) и болевой синдром (54%), локализующийся по ходу толстой кишки и имеющий связь с актом дефекации. У 69% детей с НЯК отмечались внекишечные проявления. У детей с БК самыми частыми клиническими проявлениями были кашицеобразный стул 1 - 3 раз в сутки (47%), болевой синдром (24%) и кровь в стуле (12%). Внекишечные проявления у детей, страдающих БК, отмечались чаще (82%). Наибольшая часть детей с НЯК (35%) имели умеренную клиническую активность, высокая активность и низкая активность составили по 23%, соответственно. 19% детей находились в состоянии ремиссии. Наибольшая часть детей с БК (47%) имели умеренную клиническую активность, высокая активность отмечалась у 29%, а низкая -у 18% детей. 6% детей находились в состоянии ремиссии.
При эндоскопическом обследовании у детей с НЯК преобладали распространенные формы поражения толстой кишки (панколит) - 65% и низкая степень активности (35%), в то время как умеренная активность отмечена у 31% детей, а высокая в 23% случаев. У 12% детей эндоскопическая картина соответствовала стадии ремиссии. Среди детей с БК преобладало сочетанное поражение толстой и подвздошной кишки (илеоколит) - 82% и умеренная степень активности (47%), в то время как высокая активность отмечена у 12% детей, и низкая в 23% случаев. У 18% детей эндоскопическая картина соответствовала стадии ремиссии.
Результаты лабораторных исследований у детей с ВЗК указывали на наличие анемии (14,7%) и латентного дефицита железа (38,2%). Среди неспецифических изменений крови, свойственных хроническому воспалению, у больных с НЯК и БК наиболее часто встречались лейкоцитоз, моноцитоз, тромбоцитоз, ускорение СОЭ, диспротеинемия, гипергаммаглобулинемия, увеличение уровней иммуноглобулинов класса А, в и М, циркулирующих иммунных комплексов (ЦИК). Причем для больных с НЯК был характерен более высокий уровень 1§М, 1§0 и ЦИК.
Все дети с ВЗК получали базисную терапию препаратами 5-аминосалициловой кислоты. Системные глюкокортикостероиды (преднизолон, метилпреднизолон) получали 13 детей (7 детей с НЯК и 6 детей с БК), цитостатическую терапию (азатиоприн или циклоспорин) получали 14 детей (по 7 детей в каждой группе), 2 детей с НЯК и 4 ребенка с БК получали антицитокиновую терапию (инфликсимаб). Антибактериальную терапию (метронидазол) получали 11 пациентов с ВЗК (3 детей с БК и 8 детей с НЯК).
Анализируя количественный состав пристеночной микрофлоры, было выявлено, что суммарная бактериальная плотность (количество бактерий, которые были идентифицированы методом ПЦР в каждом исследуемом биоптате) у детей с НЯК, БК и группе сравнения не имеет статистически
значимых отличий. У детей с ВЗК была выявлена более низкая бактериальная плотность В. fragilis и Prevotella и повышенное количество Lactobacillus по сравнению с группой сравнения. При оценке бактериальной обсемененности пристеночной микрофлоры у детей исследуемых групп было выявлено, что для детей с НЯК характерны более высокие значения С. coccoides. Полученные отличия не были статистически значимыми, за исключением В. fragilis, которые были статистически ниже у пациентов с БК по сравнению с группой сравнения (р<0,05), что возможно связано с особенностями данной нозологии. Полученные результаты представлены в табл. 3.
Таблица 3.
Результаты ПЦР состава пристеночной микрофлоры ректосигмоидного _отдела кишечника у детей, исследуемых групп, (М±а)_
Бактериальная группа Праймер Больные НЯК (n=16) Больные БК (n=8) Группа сравнения (n=8)
loglO, клеток/г
Bacteroides . fragilis (группа) g-Bfra-F g-Bfra-R 6,45±0,72 6,16±0,25* 6,89±0,89
Prevotella (род) g-Prevo-F g-Prevo-R 6,31±0,82 6,1±1,16 6,53±0,75
Clostridium coccoides (группа) g-Ccoc-F g-Ccoc-R 8,1511,05 7,72+1,37 7,83+1,07
Clostridium leptum (группа) sg-Clept-F sg-Clept-R3 7,51+0,41 7,3±0,49 7,4210,43
Atopobium (кластер) c-Atopo-F c-Atopo-R 8,39±0,32 8,48+0,44 8,3210,21
Lactobacillus (РОД) g-Lacto-F g-Lacto-R 2,59+0,63 2,56±0,34 2,2910,58
Bifidobacterium (род) g-Bifi-F g-Bifi-R 7,39±0,15 7,37+0,26 7,6310,58
*- р < 0,05 по сравнению с группой сравнения
В связи с тем, что на количественный состав микрофлоры влияет прием антибактериальных препаратов, а дети (42%), страдающие ВЗК, часто получают
антибактериальную терапию (метронидазол), мы оценили количественный состав пристеночной микрофлоры в зависимости от приема антибактериального препарата. При оценке суммарной бактериальной плотности пристеночной микрофлоры у детей исследуемых групп было выявлено, что для детей с ВЗК, не принимавших антибактериальные препараты, характерны более высокие значения, особенно С. coccoides (табл. 4). У детей, получавших антибиотики, было снижено количество большинства исследуемых бактериальных групп, за исключением Atopobium, уровень которых оставался неизменным, и Lactobacillus, для которых была характерна тенденция к нарастанию. Наиболее выраженное снижение бактериальной плотности было отмечено со стороны представителей рода Prevotella (р<0,01) и rpynns В. fragilis (р<0,05).
Таблица 4.
Результаты ПЦР состава пристеночной микрофлоры ректосигмоидного
отдела кишечника у детей, исследуемых групп в зависимости от _ проводимой терапии, (М±о)__
Бактериальная группа Прамеры Больные ВЗК, принимавшие АБ (n=10) Больные ВЗК, не принимавшие АБ (п=14) Группа сравнения (п=8)
loglO, клеток/г
Bacteroides fragilis (группа) g-Bfra-F g-Bfra-R 6,14±0,25* 6,51±0,75 6,89+0,89
Prevotella (род) g-Prevo-F g-Prevo-R 5,64+0,89** 6,67+0,71 6,53±0,75
Clostridium coccoides (группа) g-Ccoc-F g-Ccoc-R 7,47+1,45 8,27±0,93 7,83±1,07
Clostridium leptum (ipynna) sg-Clept-F sg-Clept-R3 7,31±0,39 7,4910,46 7,42±0,43
Atopobium (кластер) c-Atopo-F c-Atopo-R 8,39±0,34 8,44±0,38 8,32±0,21
Lactobacillus (род) g-Lacto-F g-Lacto-R 2,67±0,72 2,42±0,35 2,29+0,58
Bifidobacterium (РОД) g-Bifi-F g-Bifi-R 7,39±0,21 7,44±0,29 7,63±0,58
Суммарная бактериальная плотность. 8,61±0,41 8,78±0,5 8,65+0,4
*-р< 0,05 по сравнению с группой сравнения **- р < 0,01 по сравнению с группой сравнения и р < 0,05 по сравнению с детьми, не получавшими антибактериальную терапию
При оценке состава пристеночной микрофлоры было выявлено, что для детей с ВЗК характерно снижение доли представителей филогенетического отдела Bacteroidetes (В. fragilis и Prevotella), особенно у детей с БК, у которых снижение содержания В. fragilis было статистически значимым (р<0,05), и рост представителей филогенетического отдела Firmicutes {Lactobacillus, С. leptum, C.coccoides), особенно у детей с НЯК, у которых повышение C.coccoides и Lactobacillus было более существенным, хотя и статистически не значимым. Доля представителей филогенетического отдела Actinobacteria была примерно одинаковой во всех исследуемых группах (рис. 1).
100% 90% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0%
•ч ' ' ' у 1
34.0% - 33,7 % "Т. ■ ' 34,7%
37,4% 39,0% 38,5%
IfBlii UJf'/.
шшшш.
ЩШШЙЙ Viii';-:': _ ■
□ Actinobacteria
□ Firmicutes
В Bacteroidetes
Группа сравнения
НЯК
БК
Рисунок 1. Доли отдельных филогенетических отделов бактерий в составе пристеночной микрофлоры у детей, исследуемых групп
С целью изучения особенностей состава пристеночной микрофлоры кишечника у детей с разными нозологическими формами ВЗК, его влияния на клиническую и эндоскопическую картину, и оценки индигенной флоры при различной площади поражения и применяемой терапии были отдельно проанализированы дети с НЯК и БК.
Для детей с НЯК характерно относительно повышенная бактериальная плотность C.coccoides и Lactobacillus, при некотором снижении Bifidobacterium, В. fragilis и Prevotella. В период обострения у детей с НЯК отмечается тенденция к повышению бактериальной плотности до loglO 8,95±0,38, в то время как в период ремиссии она составляет loglO 8,65+0,28.
Максимальная бактериальная плотность отмечается у детей с низкой клинической активностью (loglO 8,65±0,28). По мере повышения клинической активности отмечалась тенденция к снижению показателей бактериальной плотности (log 10 8,46±0,63), что связано с усилением агрессивности проводимой терапии, в том числе антибактериальной. При высокой клинической активности было снижено содержание представителей всех исследуемых групп, за исключением Lactobacillus, уровень которого был максимальным у детей с высокой активностью НЯК, a Bifidobacterium у этих детей практически отсутствовали (табл. 5). Максимальные значения Bifidobacterium были отмечены у детей с низкой активностью заболевания. Данные закономерности изменений уровня Lactobacillus и Bifidobacterium подтверждаются выявленными прямыми сильными корреляционными связями Lactobacillus с высокой клинической активностью НЯК (rs=0,86, /КО,01), a Bifidobacterium с низкой клинической активностью заболевания (г8=0,79,р<0,05).
При анализе лабораторных показателей с исследуемыми бактериальными группами было выявлено, что для Bifidobacterium характерна прямая сильная корреляционная связь (rs=0,78, р<0,05) с уровнем IgM в сыворотке крови. Для Lactobacillus была выявлена прямая сильная корреляционная связь с повышением СРВ (rs=0,83,^<0,001).
Средние значения представителей индигенной микрофлоры в зависимости от клинической активности у детей с НЯК
Больные с высокой степенью активности (п=4) Больные с умеренной степенью активности (п=5) Больные с низкой степенью активности (п=4) Больные в периоде ремиссии (п=3)
Bacteroides fragilis (группа) 6,0510,09 6,54±0,77 6,97+1,06 6,16±0,03
Prevotella (род) 5,69±1,18 6,49±0,58 6,66±0,55 6,36±0,90
Clostridium coccoides (группа) 7,50±2,11 8,40±0,70 8,66±0,77 7,64±1,21
Clostridium leptum (группа) 7,55 7,50+0,18 7,80±0,39 7,1910,69
Atopobium (кластер) 8,23+0,48 8,39+0,30 8,60+0,13 8,3010,20
Lactobacillus (род) 3,36±0,35 1,92±0,41 2,41±0,22 2,8010,22
Bifidobacterium (род) н/о 7,08±0,38 7,72±0,24 7,3310,08
Суммарная бактериальная плотность 8,46+0,63 8,81±0,38 8,95±0,46 8,65+0,27
н/о - не обнаружено
При индивидуальном анализе бактериальных групп в зависимости от эндоскопического индекса активности по Rachmilewitz нами было отмечено, что для детей с высокой эндоскопической активностью характерно снижение бактериальной плотности Prevotella, по сравнению с детьми, у которых эндоскопическая картина соответствовала умеренной и низкой активности. Однако это количество было схоже с количеством копий нуклеотидных последовательности Prevotella у детей, находящихся в эндоскопической ремиссии. У детей с умеренной эндоскопической активностью не было выявлено статистически значимых отличий бактериальной плотности исследуемых бактерий по сравнению с эндоскопической картиной у других детей. При низкой клинической активности были выявлены самые высокие значения копий нуклеотидных последовательностей Prevotella по сравнению
с другими группами эндоскопической активности и эти отличия были статистически значимы (р<0,05). Эндоскопическая ремиссия у детей с НЯК характеризовалась самой низкой бактериальной плотностью Clostridium leptum и Clostridium coccoides (табл. 6).
Таблица 6.
Средние значения представителей индигенной микрофлоры в зависимости от эндоскопической активности у детей с НЯК
Больные с высокой степенью активности (п=5) Больные с умеренной степенью активности (п=3) Больные с низкой степенью активности (п=6) Больные в периоде ремиссии (п=2)
Bacteroides fragilis (группа) 6,36±0,78 6,28±0,48 6,70±0,92 6,2210,07
Prevotella (род) 5,96±0,99 6,19±1,03 6,90±0,26* 5,5910,38
Clostridium coccoides (группа) 8,04±1,37 8,77 8,45+0,82 7,1211,11
Clostridium leptum (группа) 7,51±0,09 7,50±0,18 7,6410,45 6,64
Atopobium (кластер) 8,25±0,41 8,42+0,18 8,4310,36 8,5610,09
Lactobacillus (род) 2,8±0,77 2,37+0,91 2,33+0,48 2,7210,20
Bifidobacterium (род) 7,32 7,48+0,69 7,3910,57 7,25
Суммарная бактериальная плотность 8,60±0,59 8,6910,20 8,8710,52 8,6310,04
*- р < 0,05 по сравнению с бактериальной плотностью у детей с
высокой, умеренной эндоскопической активностью и в периоде ремиссии.
Анализируя связь бактериальной плотности с распространенностью патологического процесса при НЯК, было выявлено, что при проктосигмоидитах повышена бактериальная плотность Bacteroides fragilis, Clostridium coccoides по сравнению с проктитами и панколитами. А у детей с проктитами количество копий нуклеотидных последовательностей Bifidobacterium было ниже порогового уровня чувствительности.
При анализе зависимости состава индигенной пристеночной микрофлоры от проводимой терапии была выявлена обратная сильная корреляционная связь Bifidobacterium с применением антибактериальной терапии (rs=-0,79, /к0,05) и прямая корреляционная связь умеренной силы приема цитостатической терапии (азатиоприн) и уровнем Lactobacillus (rs=0,67„p<0,05)
Для детей с БК характерно более низкое значение B.fragilis (р<0,05), С. leptum, C.coccoides и Prevotella при некотором нарастании бактериальной плотности Lactobacillus. Уровень Bifidobacterium и Atopobium не отличались от группы сравнения.
При оценке зависимости состава пристеночной микрофлоры от клинической активности у детей с БК было выявлено, что максимальная бактериальная плотность отмечалась у детей с умеренной клинической активностью БК (loglO 9,02±0,36), по мере нарастания активности бактериальная плотность падает до loglO 8,37±0,59, что связано с применением антибактериальной терапии. Детей с низкой клинической активностью в исследовании не было. В стадии ремиссии находился один ребенок, и суммарная бактериальная плотность у него составила loglO 8,79.
Высокая клиническая активность у детей с БК характеризовалась снижением бактериальной плотности C.coccoides и Prevotella по сравнению с бактериальной плотностью у детей с умеренной клинической активностью и ремиссией. При умеренной клинической активности значения бактериальной плотности были схожи с результатами количественного ПЦР исследуемых бактерий у ребенка, находившегося в ремиссии (табл. 7).
Средние значения представителей индигенной микрофлоры у детей с различной клинической активности БК
Больные с высокой степенью активности (п=4) Больные с умеренной степенью активности (п=3) Больные в периоде ремиссии (п=1)
Bacteroides fragilis (группа) 6,23±0,37 6,0910,04 6,1
Prevotella (род) 5,57±0,97 6,6911,46 6,47
Clostridium coccoides (группа) 6,74+1,27 8,9110,45 8,28
Clostridium leptum (группа) 7,02±0,48 7,70+0,45 7,36
Atopobium (кластер) 8,29±0,55 8,7110,23 8,56
Lactobacillus (род) 2,43+0,35 2,7510,42 2,68
Bifidobacterium (род) 7,4810,25 7,16+0,29 7,42
Суммарная бактериальная плотность 8,37+0,59 9,0210,36 8,79
Для детей с БК с целью оценки клинического значения состава пристеночной микрофлоры мы проанализировали особенности клинической активности и выявили прямую сильную корреляционную связь С. leptum и С. coccoides с умеренной клинической активностью (rs=0,83, р<0.05) и обратную зависимость этих представителей индигенной микрофлоры с высокой активностью заболевания (rs=-0,88,/><0,05).
При оценке клинических симптомов БК у детей с представителями индигенной микрофлоры была выявлена прямая сильная корреляционная связь между наличием Atopobium и повышением температуры тела (rs=0,88, р<0,01), С. leptum и учащением стула до 3 раз в сутки (rs=0,84, р<0,05), Lactobacillus и примесью крови в стуле (rs=0,86, р<0,05), в то время как
уровень Bifidobacterium имеет обратную сильную корреляционную связь с примесью крови в стуле (rs=-0,88,/K0,05).
При анализе лабораторных показателей с исследуемыми бактериальными группами было выявлено, что для С. coccoides характерна прямая сильная корреляционная связь (rs=0,83, р<0,05) с анемией и нейтрофилезом. Для С. leptum также была выявлена прямая сильная корреляционная связь (rs=0,90, р<0,05) с повышением уровня нейтрофилов в периферической крови у детей с БК. Для Lactobacillus была выявлена прямая сильная корреляционная связь (rs=0,81,p<0,05) с повышением СОЭ, а также повышением уровня IgG в сыворотке крови (rs=0,82,p<0,05).
Таблица 8.
Средние значения представителей индигенной микрофлоры у детей с различной эндоскопической активностью БК__
Больные с высокой степенью активности fn=2) Больные с умеренной степенью активности (п=3) Больные с низкой степенью активности (п=2) Больные в периоде ремиссии (п=1)
Bacteroides fragilis (группа) 6,05±0,09 6,30±0,41 6,08±0,04 6,11
Prevotella (род) 5,08±0,01 6,41±1,10 6,45±2,03 6,47
Clostridium coccoides (группа) н/о 7,58+1,44 7,65+2,21 8,28
Clostridium leptum (группа) н/о 7,04±0,50 7,68+0,48 7,36
Atopobium (кластер) 8,54±0,64 8,22±0,65 8,76±0,23 8,56
Lactobacillus (род) 2,87±0,25 2,54±0,23 2,2±0,35 2,68
Bifidobacterium (род) 7,33+0,05 7,12+0,33 7,76 7,42
Суммарная бактериальная плотность 8,57±0,2 8,43+0,76 9,06±0,52 8,79
н/о - не обнаружено
При оценке особенностей эндоскопической картины у детей с БК в зависимости от характера бактериального пейзажа пристеночной микрофлоры было выявлено, что для детей с высокой эндоскопической активностью по SES-CD характерно снижение бактериальной плотности Prevotella, по сравнению с детьми, у которых эндоскопическая картина соответствовала умеренной, низкой активности и эндоскопической ремиссии. Clostridium leptum и Clostridium coccoides были ниже порогового уровня чувствительности (табл. 8).
При оценке состава пристеночной микрофлоры в зависимости от распространенности патологического процесса при болезни Крона было выявлено, что при панколитах бактериальная плотность Prevotella, С. leptum и С. coccoides были выше, чем при илеоколитах. У детей с БК была выявлена прямая сильная корреляционная связь С. leptum и C.coccoides (rs=0,82, /КО,05 и rs=0,82, р<0,05, соответственно) с изолированным поражением толстой кишки, и обратная сильная корреляционная связь с вовлечением в патологический процесс подвздошной кишки (rs=-0,83, ¿><0,05 и rs=-0,83, /><0,05, соответственно).
Индивидуальный анализ каждой бактериальной группы с эндоскопической картиной выявил прямую сильную корреляционную связь Atopobium (rs=0,73, р<0,05) с наличием язв в слизистой оболочке толстой кишки и прямую сильную корреляционную связь Atopobium (rs=0,75,/?<0,05) с воспалительными полипами в толстой кишке.
При анализе проводимой терапии у детей с БК была выявлена обратная сильная корреляционную связь Prevotella с антибактериальной терапией (rs=0,85, /к0,01) и между уровнем Bifidobacterium и проводимой цитостатической терапией (rs=0,83,/><0.05).
Исследование IgG-антител к лактобациллам и бифидобактериям показало, что повышение уровня антител к бактериальным антигенам лактобацилл и бифидобактерий более характерно для больных с НЯК по
сравнению с БК и группой сравнения. Повышение уровня 1§0-антител было выявлено у 55% детей с НЯК и только у одного ребенка с БК.
Повышенный уровень ^С-антител к лакто- и бифидобактериям значимо чаще встречается в активный период заболевания (/К0,05). В период обострения уровень ^О-антител был повышен у 71 % детей с НЯК, в то время как в период ремиссии этот показатель был повышен только в 17% случаев (р<0,05). Повышенный уровень этих показателей чаше встречается у детей с НЯК при высокой клинической активности (36%), в то время как максимальная доля детей с нормальным уровнем ^в-антител приходится на клиническую ремиссию НЯК (рис.2).
□ дети с НЯК без повышения уровня 1д С-антител Ш дети с НЯК с повышенным уровнем!д й-антител
Рисунок 2. Клиническая активность по индексу ЛасЬтПелукг у детей с НЯК с различным уровнем ^О- антител к лактобациллам и бифидобактериям
Для детей с повышенным уровнем ^-антител к лактобациллам и бифидобактериям характерна большая распространенность и активность патологических эндоскопических изменений. У 73% детей повышенный уровень ^О-антител к лактобациллам и бифидобактериям сочетался с панколитом, и лишь в 27% случаев повышение уровня ^О- антител отмечалось при локализованных формах (рис.3).
простит и панколит
проктосигмоидит
□ дети с НЯК без повышения уровня 1д в-антител И дети с НЯК с повышенным уровнем 1д О-антител
Рисунок 3. Распространенность поражения ЖКТ у детей с НЯК с различным уровнем 1§С- антител к лактобациллам и бифидобактериям.
При анализе корреляционной зависимости показателей иммунограммы с уровнем 1§0-антител к бифидобактериям и лактобациллам (табл. 9) была выявлена статистически значимая (/><0,05) сильная (г=0,71) прямая линейная корреляционная связь между уровнем иммуноглобулинов класса М и уровнем ^й-антител к бифидобактериям, и показателями 1§М и уровнем ¡¿О-антителами к лактобациллам. Статистически значимых корреляционных связей уровня ^в-антител к лактобациллам и бифидобактериям с другими показателями иммунограммы выявлено не было.
Корреляционная связь показателей гуморального иммунитета и ^С-антитител к лакто- и бифидобактериям у детей с НЯК (п=20)
Показатели ^в-антитела к бифидобактериям 1§0-антитела клактобациллам 1ЕМ ДО 1еА ЦИК
^О-антител а к бифидобактериям 0,96* 0,71* 0,34 -0,08 0,10
^б-антитела к лактобациллам 0,96* 0,71* 0,35 -0,05 0,05
0,71* 0,71* 0,19 0,18 -0,16
I & 0,34 0,35 0,19 -0,16 0,57*
1ёА -0,08 -0,05 0,18 -0,16 -0,09
ЦИК 0,10 0,05 -0,16 0,57* -0,09
*-р< 0,05
Группа детей с НЯК с повышенным уровнем ^С-антител к индигенной микрофлоре кишечника характеризуется более старшим возрастом (14,5±2,5 лет), поздней манифестацией (в 11,3±3,3 лет) и меньшей длительностью заболевания (3,1±0,2 лет), что отличает их от детей с нормальным уровнем антител (11,6±2,9 лет, 6,4±3,8 лет и 5,0±2,5 лет соответственно), но данные различия статистически не значимы.
У детей с повышенным уровнем ^в-антител к лакто- и бифидобактериям чаще отмечались анемия (45,5%) и дефицит массы тела (45,0%), то в группе с нормальным уровнем ^й-антител эти клинические симптомы не были выявлены ни у одного пациента. Была выявлена статистически значимая (р<0,05) прямая корреляционная связь средней силы (г5>0,5) между уровнем ^й-антител к бифидобактериям и частотой анемии у детей с НЯК, между уровнем 1§0-антител к бифидобактериям и частотой дефицита массы тела у детей с НЯК и между уровнем 1§С-антитсл к лактобациллам и частотой дефицита массы тела у детей с НЯК.
Таким образом, в нашем исследовании у детей с ВЗК отмечается повышение уровня антител к лакто- и бифидобактериям. Повышение уровня
26
^С-антител к лактобациллам и бифидобактериям коррелируют с распространенностью и активностью патологического процесса при НЯК. Однако, ИФА - является непрямым методом микробиологической диагностики и направлен на определение наличия и концентрации специфических антител в организме больного. Следовательно, несмотря на его надежность, доступность и относительную простоту в техническом выполнении необходимо учитывать возможность перекрестных иммунологических реакций с другими представителями индигенной микрофлоры.
В результате наших исследований выявлены различия в составе пристеночной микрофлоры при различных формах течения ВЗК у детей. По всей видимости, эти изменения в составе индигенной микрофлоры могут оказывать непосредственное влияние на характер течения, распространенность патологического процесса и риск развития осложнений, влияя через механизмы иммунной системы на активацию гуморального звена иммунитета, что негативно сказывается на течении ВЗК у детей и на эффективности проводимой терапии. Дети с разными вариантами течения ВЗК имеют различный состав пристеночной микрофлоры и уровень 1£0-антител к бифидобактериям и лактобациллам, что может быть использовано в качестве дополнительных диагностических критериев (табл. 10).
Дополнительные диагностические критерии при ВЗК у детей.
НЯК БК
Клиническая активность Высокая Т Lactobacillus | Bifidobacterium 1Prevotella f уровня IgG-антител к бифидобактериям и лактобациллам J, Prevotella | C.coccoides | C. leptum
Умеренная 4 Lactobacillus t C.coccoides t C. leptum
Низкая Т B.fragilis t Bifidobacterium t C.coccoides -
Ремиссия J. C. leptum -
Эндоскопическая активность Высокая J. Prevotella t уровня IgG-антител к бифидобактериям и лактобациллам | C.coccoides 1 C. leptum J, Prevotella
Умеренная t C.coccoides -
Низкая I B.fragilis t Prevotella -
Ремиссия | Prevotella J. С. leptum J. C.coccoides
Площадь поражения Илеоколит - -
Панколит Пристеночная микрофлора - без особенностей; t уровня IgG-антител к бифидобактериям и лактобациллам f Prevotella t C.coccoides I C. leptum
Проктосигмоидит | С. leptum f C.coccoides t B.fragilis -
Проктит 1 С. leptum | C.coccoides | Bifidobacterium -
выводы
1. Популяционные уровни отдельных представителей пристеночной микрофлоры (Bacteroides fragilis, Lactobacillus, Clostridium leptum, Clostridium coccoides, Prevotella, Bifidobacterium) отличаются при различных формах воспалительных заболеваниях кишечника у детей различного возраста и влияют на характер, остроту, распространенность патологического процесса при болезни Крона и неспецифическом язвенном колите.
2. При воспалительных заболеваниях кишечника у детей в составе пристеночной микрофлоры отмечается нарастание доли представителей отдела Firmicutes, при одновременном снижении доли представителей филогенетического отдела Bacteroidetes. У детей с болезнью Крона выявлено снижение количества Bacteroides fragilis по сравнению с детьми в группе сравнения (loglO 6,16+0,25 vs. loglO 6,89±0,89;р<0,05).
3. Выявлены сильные корреляционные связи Atopobium с развитием эрозивно-язвенных изменений (rs=0,73, р<0,05) и формированием воспалительных полипов (rs=0,75, р<0,05) в толстой кишке у детей, страдающих болезнью Крона, что, возможно, является факторами прогрессирования патологического процесса.
4. Маркером развития изолированного поражения толстой кишки при болезни Крона у детей является значительное повышение уровня представителей групп Clostridium coccoides (rs=0,82, р<0,05) и Clostridium leptum (rs=0,82, p<0,05). Клинически это проявляется умеренной активностью (rs=0,83, р<0,05) с определенным симптомокомплексом в виде учащенного стула (rs=0,84, р<0,05), воспалительными изменениями периферической крови и анемией (rs=0,90, р<0,05).
5. У детей, страдающих НЯК и болезнью Крона, определены более высокие популяционные уровни представителей рода Lactobacillus, что сопровождалось более высокой клинической активностью НЯК (rs=0,86, /><0,01) и повышением острофазовых белков (rs=0,83, /КО,001); для болезни Крона - наличием примеси крови в стуле (rs=0,86, р<0,05), ускорением СОЭ 0¥=0,81, р<0,05) и повышением сывороточного уровня IgG (rs=0,82,/T<0,05).
6. У 55% детей с неспецифическим язвенным колитом установлено повышение уровня IgG-антител к лактобациллам и бифидобактериям, что может служить дополнительным показателем высокой клинической и эндоскопической активности и распространенности патологического процесса.
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
1. Морфологическое исследование биоптатов слизистой оболочки толстой кишки у детей с воспалительными заболеваниями кишечника должно сопровождаться изучением качественного и количественного состава пристеночной микрофлоры методом ПЦР в режиме реального времени, что важно для диагностики, подбора терапии и построения прогноза.
2. Целесообразно в качестве критерия активности и распространенности патологического процесса исследовать титр IgG-антител к лактобациллам и бифидобактериям у детей с неспецифическим язвенным колитом.
3. Диагностическими критериями воспалительных заболеваний кишечника у детей служат нарастание доли представителей отдела Firmicutes, при одновременном снижении доли представителей филогенетического отдела Bacteroidetes в составе пристеночной микрофлоры кишечника.
4. Для оценки активности и определения прогноза течения болезни Крона и неспецифического язвенного колита у детей целесообразно
использовать разработанные нами дополнительные диагностические критерии.
Список работ, опубликованных по теме диссертации:
1. Ипатова М.Г., Осипов Г.А., Хромова С.С. //Значение микробного фактора в развитии воспалительных заболеваниях кишечника у детей// Сборник материалов Четырнадцатой Российской Гастроэнтерологической недели « Российский журнал Гастроэнтерологии, Гепатологии, Колопроктологии», Москва, 2008г. Т.18 -№5-С.84.
2. Хандамирова О .О., Шумилов П.В., Ипатова М.Г., Цимбалова Е.Г., Цветков П. М., Осипова Е.Ю., Карпина JI.M. // Индукция цитокинов под влиянием белков бактериальных оболочек у детей с воспалительными заболеваниями кишечника // Сборник материалов Четырнадцатой Российской Гастроэнтерологической недели «Российский журнал Гастроэнтерологии, Гепатологии, Колопроктологии», Москва, 2008г. Т. 18 - №5 - С.64.
3. Хандамирова О.О., Шумилов П.В., Ипатова М.Г., Цимбалова Е.Г., Цветков П. М., Румянцев С.А., Мухина Ю.Г. // Особенности экспрессии цитокинового профиля при воспалительных заболеваниях кишечника у детей // Сборник материалов Седьмого Российского конгресса «Современные технологии в педиатрии и детской хирургии», Москва, 2008 г.-С. 65.
4. М.Г. Ипатова, П.В. Шумилов, Н.Е. Ястребова, A.C. Потапов //Нарушение иммунного ответа к индигенной микрофлоре при воспалительных заболеваниях кишечника у детей // журнал «Педиатрия» им. Г. Н. Сперанского, 2009г. - 88 (6) - С.55-59
5. П.В. Шумилов, О.О. Хандамирова, H.A. Малахинова, М.Г. Ипатова, С.А. Румянцев, A.C. ПотаповУ/ Роль иммунных нарушений и микробного фактора в развитии воспалительных заболеваний кишечника у детей // Вопросы детской диетологии.// 2009г. Т.7 - №4. С. 20-24.
6. Ипатова МГ., Шумилов П.В., Осипов Г.А., Ястребова Н.Е., Цимбалова Е.Г.//Особенности пристеночной микробиоты при воспалительных заболеваниях кишечника у детей// Сборник материалов 2-ого международного конгресса по пробиотикам «Санкт-Петербург -Пробиотики-2009», Санкт-Петербург 28-30 октября 2009 г., С. 16
Список сокращений
АБ - антибиотики БК - болезнь Крона
ВЗК - воспалительные заболевания кишечника
ИФА - иммуноферментный анализ
НЯК - неспецифический язвенный колит
ПЦР - полимеразная цепная реакция
рРНК - рибосомная рибонуклеиновая кислота
СРВ - С-реактивный белок
СОЭ - скорость оседания эритроцитов
ЦИК - циркулирующие иммунные комплексы
Ig - иммуноглобулин
Подписано в печать:
18.12.2009
Заказ № 3231 Тираж -100 экз. Печать трафареггная. Типография «11-й ФОРМАТ» ИНН 7726330900 115230, Москва, Варшавское ш., 36 (499) 788-78-56 www.autoreferat.ru
Оглавление диссертации Ипатова, Мария Георгиевна :: 2010 :: Москва
Список сокращений
Введение
Глава 1. Обзор литературы. Современные представления о роли 12 индигенной микрофлоры кишечника в патогенезе и клиническом течении ВЗК у детей и подростков.
1.1. Современное понятие о воспалительных заболеваниях 12 кишечника у детей и подростков
1.2. Факторы развития воспалительных заболеваний кишечника
1.3. Иммунные аспекты развития ВЗК
1.4. Микробный фактор при ВЗК
Глава 2. Материалы и методы исследования
2.1. Общая характеристика обследуемых больных
2.2. Методы исследования
Глава 3. Результаты собственных наблюдений
3.1. Клинико-лабораторные и эндоскопические проявления 57 воспалительных заболеваний кишечника у детей
3.2. Особенности состава пристеночной микрофлоры у детей с 78 ВЗК и ее клиническое значение
3.3. Значение антител к индигенной микрофлоре кишечника у 101 детей с ВЗК
Глава 4. Обсуждение. Роль индигенной микрофлоры в развитии и прогрессировании ВЗК у детей.
Выводы
Введение диссертации по теме "Педиатрия", Ипатова, Мария Георгиевна, автореферат
Болезнь Крона (БК) и неспецифический язвенный колит (НЯК), которые объединены термином «воспалительные заболевания кишечника» (ВЗК), представляют собой одну из наиболее серьезных и нерешенных проблем в современной гастроэнтерологии и колопроктологии. По уровню заболеваемости ВЗК уступают другим гастроэнтерологическим заболеваниям, но по тяжести течения, частоте осложнений и летальности они занимают одно из ведущих мест в структуре болезней желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) [10].
Современные эпидемиологические исследования свидетельствуют о значительной распространенности заболеваемости ВЗК с тенденцией к увеличению частоты начала заболевания в детском возрасте. Распространенность ВЗК у детей в мире в настоящее время составляет 2,2 — 6,8 на 100 ООО детей [43, 91, 92, 121, 174, 179]. По данным Е. Lanfholz et al. в Дании почти у 40% больных первая манифестация заболевания наблюдалась до достижения ими 10-летнего возраста, a R. Behrens с соавторами указывают, что примерно у 1/3 пациентов манифестация ВЗК происходит до достижения ими 18 лет [32, 51, 97]. Отдельные российские данные о распространенности ВЗК у детей подтверждают общую мировую тенденцию к росту ВЗК. Но большинство российских исследований носит ретроспективный характер.
ВЗК у детей и взрослых пациентов схожи в своей клинической манифестации и имеют одинаковый базисный терапевтический алгоритм, но дети, страдающие НЯК и БК, имеют ряд важных особенностей [12, 13]. Преобладание распространенных форм и тотальных колитов наблюдаются у 60-80% детей и лишь у 20-30% взрослых. Ранняя инвалидизация, поздняя диагностика, приводящая к различным осложнениям, включая летальный исход, отсутствие четких диагностических критериев - обусловливают особую актуальность изучения данной проблемы в детском возрасте.
НЯК и БК до сих пор остаются неизлечимыми заболеваниями и часто требуют обширной терапии с применением различных групп лекарственных препаратов, а при их неэффективности даже хирургического вмешательства. Лечение ВЗК противовоспалительными, антибактериальными препаратами, кортикостероидами и/или иммуносупрессивными препаратами, как правило, эффективно, но не способствует полному излечению [135,136]. Безусловно, необходимы новые подходы в лечении этих заболеваний, что, в свою очередь, требует более полного понимания факторов, приводящих к развитию ВЗК.
До сих пор этиология ВЗК остается до конца неизвестной. Многие исследователи пришли к единому мнению, что взаимодействие генетической предрасположенности, факторов внешней среды, иммунорегуляторных механизмов и кишечная микрофлора функционально интегрированы в патогенезе ВЗК [64]. Совокупность этих факторов приводит к нарушению эпителиального барьера в кишечнике с формированием и поддержанием хронического воспаления в пищеварительном тракте.
Нормальная микрофлора играет важную роль для жизнедеятельности растущего детского организма [70]. Доказано ее благотворное воздействие на физиологию кишечника и организм в целом, что обусловлено защитными, структурными и метаболическими эффектами. Огромное значение нормальная микрофлора играет в колонизационной резистентности, а также в созревании и нормальном функционировании иммунитета [60].
Результаты современных отечественных и зарубежных исследований указывают на значительную роль индигенной микрофлоры в патогенезе воспалительных заболеваний кишечника. Микрофлора ЖКТ состоит более чем из 1014 бактериальных клеток, что примерно в 10 раз больше количества соматических и гаметных клеток в теле человека [28]. Можно предположить, что такая высокая концентрация микрофлоры в просвете кишечника может служить причиной того, что многие микробные патогены могут быть потенциальным этиологическим фактором ВЗК. Подобное предположение остается дискутабельным и требует дальнейшего изучения в детской гастроэнтерологии.
В качестве инфекционного агента изучались многие микроорганизмы [26, 42, 48, 61, 63, 66, 102, 130, 135, 136, 153, 165, 168], но результате дальнейших исследований не было получено убедительных данных, подтверждающих эти предположения. Кроме того, концепция об инфекционной этиологии не согласуется с благоприятным действием иммуносупрессивной терапии.
Хотя конкретная инфекционная причина ВЗК не установлена, современные клинические и экспериментальные исследования свидетельствуют об утрате иммунологической толерантности к нормальной микрофлоре при развитии хронического воспаления в кишечнике при ВЗК [36, 134, 142, 143, 152, 158, 160].
Однако в клинических исследованиях у больных с ВЗК было выявлено, что интестинальная микрофлора претерпевает большие изменения. Они включают в себя высокую сосредоточенность бактерий в мукозном слое, как в воспаленных, так и невоспаленных участках кишки [166].
На сегодняшний день данные о кишечной микрофлоре у пациентов ВЗК неоднозначны. Это обусловлено тем, что традиционные методы выделения микроорганизмов в культуре дают неполную картину состава микрофлоры кишечника вследствие того, что одни виды бактерий, обитающих в ЖКТ, лучше поддаются культивированию, чем другие. В результате искажается состав кишечной микрофлоры, что приводит к недооценке роли отдельных микроорганизмов и целых бактериальных групп у здоровых детей и при патологических процессах. Также в большинстве исследований изучалась преимущественно фекальная микрофлора, которая по составу существенно отличается от микрофлоры слизистой оболочки ЖКТ [55]. Доминирующая часть пристеночной микрофлоры, в которой в значительной степени преобладают некультивируемые анаэробы, остается мало изученной.
В настоящее время для изучения микрофлоры в качестве. наиболее чувствительного и быстрого метода широко применяется метод ПЦР с использованием специфических праймеров, которые позволяют определить род и вид представителей микробиоценоза. Уже разработаны специфические праймеры для многих известных видов бактерий, которые присутствуют в пищеварительном тракте [113, 114, 119]. ПЦР в режиме реального времени с видоспецифичными праймерами может предоставить точные количественные данные о пристеночной микрофлоре.
На сегодняшний день нет единого консенсуса относительно роли микробного компонента в развитии ВЗК, состава интестинальной микрофлоры у пациентов с БК и НЯК в зависимости от активности и распространенности заболевания. Изучение особенностей , состава t ♦ j t 1 индигенной пристеночной микрофлоры и иммунологической реактивности у v пациентов с ВЗК важно не только для понимания патогенеза ВЗК, но и необходимо для разработки новых диагностических и терапевтических подходов, оценки эффективности и безопасности новых методов лечения.
Цель исследования :
Установить особенности состава пристеночной микрофлоры кишечника и адаптивного иммунитета у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом для оптимизации лечебно-диагностических и профилактических мероприятий.
Задачи исследования: 5 i
1. Выявить особенности анамнестических клинических и лабораторно-инструментальных данных у детей с различными вариантами течения болезни Крона и неспецифического язвенного колита.
2. Изучить количественный и качественный состав .основных представителей пристеночной микрофлоры в биоптате слизистой оболочки кишечника у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом методом количественного ПЦР в режиме реального времени с группоспецифическими праймерами.
3. Выявить корреляционные связи между количественным содержанием различных представителей индигенной микрофлоры (группа В. fragilis, группа С. leptum, группа C.coccoides, род Bifidobacterium, род Lactobacillus, род Prevotella и кластер Atopobium) при различных вариантах течения воспалительных заболеваний кишечника у детей с клиническими и лабораторно-инструментальными данными.
4. Исследовать титр антител класса IgG к основным представителям индигенной микрофлоры в сыворотке крови с помощью иммуноферментного анализа у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом и оценить его диагностическую и прогностическую роль.
5. Оптимизировать лечебно-диагностические и профилактические мероприятия на основании установленных особенностей состава пристеночной микрофлоры у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом.
Научная новизна.
Впервые была проведена комплексная оценка пристеночной микрофлоры толстой кишки у детей с БК и НЯК методом количественного ПЦР в режиме реального времени с группоспецифическими праймерами. Выявлены особенности количественного и качественного состава пристеночной микрофлоры (группа В. fragilis, группа С. leptum, группа C.coccoides, род Bifidobacterium, род Lactobacillus, род Prevotella и кластер Atopobium) в зависимости от нозологической формы, особенностей клинического течения, распространенности патологического процесса и проводимой терапии.
Впервые оценена иммуногенная роль индигенной флоры (на примере бифидобактерий и лактобацилл) в патогенезе воспалительных заболеваний кишечника по данным иммуноферментного анализа. Показано, что повышение уровня IgG-антител к лактобациллам и бифидобактериям коррелируют с распространенностью и активностью патологического процесса при НЯК, и может быть использовано в качестве диагностического и прогностического критерия у детей с ВЗК.
Полученные результаты данного исследования могут послужить основой для дальнейшей качественной и количественной идентификации основных представителей пристеночной микрофлоры кишечника, для разработки новых диагностических критериев болезни Крона и неспецифического язвенного колита, для оптимизации методов медикаментозной терапии у детей и мониторинга их эффективности.
Практическая значимость.
Изучен состав пристеночной микрофлоры толстой кишки у детей с БК и НЯК методом количественного ПНР в режиме реального времени с группоспецифическими праймерами в зависимости от нозологической формы, особенностей клинического течения и распространенности патологического процесса. Предложены новые диагностические критерии активности у детей с БК и НЯК. Показано влияние проводимой терапии на состав пристеночной микрофлоры и роль ее изменения на течение ВЗК у детей.
Показана высокая диагностическая ценность определения титра антител класса IgG к лакто- и бифидобактериям в сыворотке крови у детей с болезнью Крона и неспецифическим язвенным колитом посредством иммуноферментного анализа и его прогностическая роль для определения активности течения неспецифического язвенного колита у детей.
Предложены диагностические алгоритмы БК и НЯК у детей в зависимости от состава пристеночной микрофлоры кишечника и уровня IgG-антител к лактобациллам и бифидобактериям.
Апробация работы
Основные положения диссертации доложены и обсуждены на XIV Российской Гастроэнтерологической неделе (Москва 6-8 октября 2008г), VII Российском конгрессе «Современные технологии в педиатрии и детской хирургии», Москва 21-23 октября 2008 г., 11-ом Международном Славянобалтийском научном форуме «Санкт-Петербург — Гастро-2009», Санкт-Петербург 20-22 мая 2009 г., 2-ом международном конгрессе по пробиотикам «Санкт-Петербург - Пробиотики-2009», Санкт-Петербург 28-30 октября 2009 г.
Внедрение в практику
Разработанные дополнительные микробиологические диагностические критерии БК и НЯК у детей внедрены в практику и используются в педиатрическом отделении городской детской клинической больницы № 13 имени Н.Ф. Филатова г. Москвы. Основные научные положения и выводы внедрены в педагогический процесс курса гастроэнтерологии и диетологии ФУВ кафедры детских болезней № 2 ГОУ ВПО Российский государственный медицинский университет им. Н.И. Пирогова Росздрава.
По материалам диссертации опубликовано 6 научных работ, в том числе 2 статьи в журналах, рецензируемых ВАК РФ.
Объем и структура диссертации
Диссертация изложена на 163 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, описания объема и методов исследования, трех глав собственных исследований, обсуждения, выводов, и практических рекомендаций. Работа иллюстрирована 30 таблицами, 23 рисунками. Библиография содержит 189 литературных источников: 20 отечественных и 169 иностранных.
Заключение диссертационного исследования на тему "Роль индигенной микрофлоры при воспалительных заболеваниях кишечника у детей"
выводы
1. Популляционные уровни отдельных представителей пристеночной микрофлоры (Bacteroides fragilis, Lactobacillus, Clostridium leptum, Clostridium coccoides, Atopobium, Bifidobacterium) отличаются при различных формах воспалительных заболеваниях кишечника у детей различного возраста и влияют на характер, остроту, распространенность патологического процесса при болезни Крона и неспецифическом язвенном колите.
2. При воспалительных заболеваниях кишечника у детей в составе пристеночной микрофлоры отмечается нарастание доли представителей отдела Firmicutes, при одновременном снижении доли представителей филогенетического отдела Bacteroidetes. У детей с болезнью Крона выявлено снижение количества Bacteroides fragilis по равнению с детьми контрольной группой (loglO 6,16±0,25 vs. loglO 6,89±0,89; /?<0,05).
3. Выявлены сильные корреляционные связи Atopobium с развитием эрозивно-язвенных изменений (rs=0,73, р<0,05) и формированием воспалительных полипов (rs=0,75, jc<0,05) в толстой кишке у детей, страдающих болезнью Крона, что, возможно, является факторами прогрессирования патологического процесса.
4. Маркером развития изолированного поражения толстой кишки при болезни Крона у детей является значительное повышение уровня представителей групп Clostridium coccoides (rs=0,82, р<0,05) и Clostridium leptum (rs=0,82, p<0,05). Клинически это проявляется умеренной активностью (rs=0,83, /?<0,05) с определенным симптомокомплексом в виде учащенного стула (rs=0,84, jc<0,05), воспалительными изменениями периферической крови и анемией (rs=0,90,p<0,05).
5. У детей, страдающих НЯК и болезнью Крона, определены более высокие популяционные уровни представителей рода Lactobacillus, что сопровождается высокой клинической активностью (rs=0,86, /КО,01) и повышением острофазовых белков (rs=0,83, /КО,001) у детей с НЯК, а при болезни Крона наличием примеси крови в стуле (rs=0,86, /КО,05), ускорением СОЭ (rs=0,81, /КО,05) и повышением сывороточного уровня IgG (rs=0,82,/K0,05).
6. У 55% детей с неспецифическим язвенным колитом установлено повышение уровня IgG-антител к лактобациллам и бифидобактериям, что может служить показателем высокой клинической и эндоскопической активности и распространенности патологического процесса.
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
1. Морфологическое исследование биоптатов слизистой оболочки толстой кишки у детей с воспалительными заболеваниями кишечника должно сопровождаться изучением качественного и количественного состава пристеночной микрофлоры методом ПЦР в режиме реального времени, что важно для диагностики, подбора терапии и построения прогноза.
2. Целесообразно в качестве критерия активности и распространенности патологического процесса у детей исследовать титр IgG-антител к лактобациллам и бифидобактериям у детей с неспецифическим язвенным колитом.
3. Диагностическими критериями воспалительных заболеваний кишечника у детей служат нарастание доли представителей отдела Firmicutes, при одновременном снижении доли представителей филогенетического отдела Bacteroidetes в составе пристеночной микрофлоры кишечника.
4. Для оценки активности и определения прогноза течения болезни Крона и неспецифического язвенного колита у детей целесообразно использовать дополнительные диагностические критерии.
Список использованной литературы по медицине, диссертация 2010 года, Ипатова, Мария Георгиевна
1. Белоусова Е.А. Эпидемиология воспалительных заболеваний кишечника в России. // Межд. Симпозиум «Основные принципы лечения воспалительных заболеваний кишечника»: Тез. Докл. — СПб. — 1996.-C.il
2. Ефимов Б.А. Микроэкология кишечника человека, коррекция микрофлоры при дисбиотических состояниях. // Автореф. дисс. . докт. мед. наук. Москва, 2004.
3. Кетлинский С.А. Симбирцев А.С. Воробьев А.А. Эндогенные иммуномодуляторы. СПб.: Гиппократ, 1992. 255 с.
4. Козлов В.А. Некоторые аспекты проблемы цитокинов. // Цитокины и воспаление. 2002. №1. - С. 3-8.
5. Коршунов В. М., Смеянов В. В., Ефимов Б. А. Рациональные подходы к проблеме коррекции микрофлоры кишечника. // Вестник Российской академии медицинских наук. 1996. № 2, с. 60-64.
6. Мазурин А.В., Воронцов И.М. Пропедевтика детских болезней. — СПб: ООО «Издательство Фолиант», 2001.- 928с.
7. Никулина И.В. Клинико-эпидемиологическая характеристика воспалительных заболеваний кишечника в Московской области. // Дисс. канд.мед.наук., Москва. 1997. 24с.
8. Пинегин Б.В., Мальцев В.Н., Коршунов В.М. Дисбактериозы кишечника. // М.: Медицина, 1984.-143 с.
9. Е.А.Постникова, А.П.Пикина, Л.И. Кафарская, Ефимов Б.А. Изучение качественного и количественного состава микрофлоры кишечника у клинически здоровых детей в раннем возрасте. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии, 2004, № 1, с.62-67.
10. Ю.Рачкова Н.С., Хавкин А.И. Воспалительные заболевания кишечника. Проблемы дифференциальной диагностики и лечения // Детская гастроэнтерология и нутрициология, 2006, том 14, № 3: 154-159.
11. М. Рот, В. Бернхардт. Воспалительные заболевания кишечника. // Др. Фальк Фарма Гмбх. — 2004. Практическое руководство. С. 3.
12. Румянцев В.Г., Щиголева Н.Е. Болезнь Крона в детском возрасте. // Прил. к журналу "Consilium Medicum". 2002; 4 (6): 17-20.
13. Румянцев В.Г., Щиголева Н.Е. Неспецифический язвенный колит у детей. // Прил. к журналу "Consilium Medicum". 2002; 4 (6): 16-9.
14. Смеянов В.В. Новые подходы к разработке препаратов на основе лактобактерий для лечения дисбактериозов кишечника. // Автореф. дис. . канд.мед.наук. М., 1993.
15. Хавкин А.И. «Микробиоценоз кишечника и иммунитет». // Русский медицинский журнал 11(3): 122-125, 2003.
16. Хаитов P.M., «Физиология иммунной системы», 2001 М.: ВИНИТИ РАН.
17. Хаитов P.M., Пинегин Б.В., «Иммунная система ЖКТ: особенности строения и функционирования в норме и патологии». // Иммунология. 5:4-7, 1997
18. Щербаков П.Л. Воспалительные заболевания кишечника у детей: болезнь Крона и неспецифический язвенный колит. // Детский доктор. 2000.- №4 - С. 22-26.
19. Яблокова Е.А., Горелов А.В., Ратникова М.А., Сичинава И.В. и др. Воспалительные заболевания кишечника у детей // Педиатрия. 2006.-№5.- С.99-102.
20. Ястребова Н.Е., Ванеева Н.П., Цветкова Н.В. Характеристика скринингового иммуноферментного теста для определения антител к условно-патогенным бактериям // Аллергия, астма и клинич. иммунол. 1999, №9, С. 148-151.
21. Abreu MT, Fukata M, Arditi M. TLR signaling in the gut in health and disease. IIJ Immunol 2005; 174: 4453-60.
22. Ahmad T, Armuzzi A, Bunce M, Mulcahy-Hawes K, Marshall SE, Orchard TR, et al. The molecular classification of the clinical manifestations of Crohn's disease. // Gastroenterology. 2002;122:854-66.
23. Ahmad T, Tamboli CP, Jewell D, et al. Clinical relevance of advances in genetics and pharmacogenetics oflBD. // Gastroenterology 2004;126:1533— 49.
24. Amre DK, Lambrette P, Law L et al. Investigating the hygiene hypothesis as a risk factor in pediatric onset Crohn's disease: a case-control study. // Am J Gastroenterol 2006; 101: 1005-11.
25. Aranda R, Sydora ВС, McAllister PL, et al. Analysis of intestinal lymphocytes in mouse colitis mediated by transfer of CD4+, CD45RBhigh T cells to SCID recipients. // J Immunol 1997;158:3464-73.
26. Arnott ID, Landers CJ, Nimmo EJ et al. // Sero-reactivity to microbial components in Crohn's disease is associated with disease severity and progression, but not NOD2 / CARD 15 genotype. Am J Gastroenterology 2004; 99: 2376-84
27. Ayabe T, Satchell DP, Wilson CL, Parks WC, Selsted ME, Ouellette AJ. Secretion of microbicidal alpha-defensins by intestinal Paneth cells in response to bacteria. // Nat Immunol. 2000; 1:113-8.
28. Backhed F, Ley RE, Sonnenburg JL, Peterson DA, Gordon JI (2005) Host-bacterial mutualism in the human intestine. // Science 307:1915—1920
29. Bairead E, Harmon DL, Curtis AM, et al. Association of NOD2 with Crohn's disease in a homogenous Irish population. // Eur J Hum Genet 2003;11:237-244.
30. Balish E, Warner T. Enterococcus faecalis induces inflammatory bowel disease in interleukin-10 knockout mice. // Am J Pathol 2002; 160: 2253-7.
31. Bamba T, Matsuda H, Endo M, Fujiyama Y. The pathogenic role of Bacteroides vulgatus in patients with ulcerative colitis. // J Gastroenterol 1995;30:45-7.
32. Behrens R, Ruder H. Chronic inflammatory intestinal disease and nephritis. Klin. Padiatr. 204: 61-64 (1992). Behrens R. // Practice Manual. — Dr.Falk pharma GmbH, 2003.
33. Beltinger J, McKaig ВС, Makh S et al. Human colonic subepithelial myofibroblasts modulate transepithelial resistance and secretory response. // Am J Physiol 1999; 277(2 Pt 1 ):C271-C279.
34. Beytout J., Gourdon F., Laurichesse H. Infections extra-digestives a Bacterodes fragilis. // Med Mai Infect. 1996, 26, 230-238.
35. Bjarnason I, MacPherson A, Hollander D. Intestinal permeability: an overview. // Gastroenterology1995; 108:1566-1581.
36. Blumberg RS, Saubermann LJ, Strober W. Animal Models of Mucosal Inflammation and Their Relation to Human Inflammatory Bowel Disease. // Current Opinions in Immunology 1999; 11: 648-656
37. Boirivant M, Pica R, DeMaria R, et al. Stimulated human lamina propria T cells manifest enhanced Fas-mediated apoptosis. // J Clin Invest 1996;98:2616-22.
38. Brant SR, Picco MF, Achkar JP, Bayless TM, Kane SV, Brzezinski A, et al. Defining complex contributions of NOD2/CARD15 gene mutations, age at onset, and tobacco use on Crohn's disease phenotypes. // Inflamm Bowel Dis. 2003; 9:281-9.
39. C. D. Packey & R. B. Sartor, Interplay of commensal and pathogenic bacteria, genetic mutations, and immunoregulatory defects in the pathogenesis of inflammatory bowel diseases. // Journal of Internal Medicine. 2008 - Vol. 263. - P. 597-606.
40. С.J. Landers, O. Cohavy, R.Misra, H. Yang, Y.C. Lin, J. Braun, S.R. Targan, Selected loss of tolerance evidenced by Crohn's diseaseassociatedimmune responses to auto- and microbial antigens. // Gastroenterology 123 (2002) 689-699.;
41. Cario E. Bacterial interactions with cells of the intestinal mucosa: Toll-like receptors andNOD2. // Gut 2005;54:1182-93.
42. Casellas F, Borruel N, Papo M, et al. Anti-inflammatory effects of enterically coated amoxicilin-clavulanic acid in ulcerative colitis. // Inflamm Bowel Dis 1998;4:1-5.
43. Cezard JP, Touati G, Alberti C, et al. Growth in paediatric Crohn's disease. //Horm Res 2002; 58: 11-5.
44. Chiffrin E. J., Rochat F., Link-amster H., Aeschlimann J.M., Donnet-Hughes A. Immuno-modulation of human blood cells following the ingestion of lactic acid bacteria. // J. Dairy Sci. 1995.-78, P.491-497.
45. Cobrin GM, Abreu MT. Defects in mucosal immunity leading to Crohn's disease. // Immunol Rev 2005;206:277-295.
46. Conway P. L., Gorbach S. L., Goldin B. R. Survival of lactic acid bacteria in the human stomach and adhesion to intestinal cells. // J. Dairy Sci. 1987.-70, P. 1-12.
47. Daniel K. Podolsky, M.D. INFLAMMATORY BOWEL DISEASE // N Engl J Med, 2002, Vol. 347, No. 6, P. 417-429.
48. Darfeuille-Michaud A, Boudeau J, Bulois P et al. High prevalence of adherent-invasive Escherichia coli associated with ileal mucosa in Crohn's disease. // Gastroenterology 2004; 127: 412-21.
49. De Maria R, Boirivant M, Cifone MG, et al. Functional expression of Fas and Fas ligand on human gut lamina propria T lymphocytes. A potential role for the acidic sphingomyelinase pathway in normal immunoregulation. // J Clin Invest 1996;97:316-22.
50. De Simone C., Ciardi A., Grassi A., Lambert Gardini S., et al. Effect of Bifidobacterium bifidum and Lactobacillus acidophilus on gut mucosa and peripheral blood lymphocytes. // Immunopharmacol. Immunotoxicol. 1992.14, P. 331-340.
51. Dr. Johanna С. Escher, Jan A. J. M. Taminiau, et al. Grand Treatment of inflammatory bowel disease in childhood: Best available evidence // Inflammatory Bowel Diseases Volume 9 Issue 1, Pages 34 — 58
52. Dublanchet A., Breuil J. Bacteroides fragilis enterotoxinogene (BffiT). // Med Mai Infect. 1996, 26, 192-195.
53. Duchmann R., Kaiser I., Hermann E., et al. Tolerance exists towards resident intestinal flora but is broken in active inflammatory bowel disease (IBD) // Clin Exp Immunol 1995; 102: 448-455.
54. Ecbom A., Helmick C., Zack M. et al. The epidemiology of inflammatory bowel disease: a large, population based study in Sweden // Gastroenterology. 1991. - Vol. 100. - P. 350-358.
55. Eckburg PB, Bik EM, Bernstein CN, Purdom E, Dethlefsen L, et al. Diversity of the human intestinal microbiol flora // Science (2005) 308:1635-1638.
56. Edlund C, Nord С. E. A model of bacterial antimicrobial interactions: the case of oropharyngeal and gastrointestinal microflora. // J. Chemother. 1991.- 3 (Suppl 1), P. 196-200.
57. Elmer G.W., Mc Farland L.W.,Surawicz C.M. Biotherapeutic Agents and Infection Diseases.// Human Press. 1999.-316 P.
58. Elphick DA, Mahida YR. Paneth cells: their role in innate immunity and inflammatory disease. // Gut. 2005;54:1802-9.
59. F. Pallone, G. Monteleone, I. Monteleone, L. Biancone. The immune system in inflammatory bowel disease. // In: Inflammatory bowel diseases, by J Satsangi & L R Sutherland (Ed.). Elsevier: Churchill Livingstone, Philadelphia, 2003, P. 85-93.
60. Falk PG, Hooper LV, Midtvedt T, et al. Creating and maintaining the gastrointestinal ecosystem: what we know and need to know from gnotobiology. // Microbiol Mol Biol Rev 1998;62:1157-1170.
61. Farrell RJ, La Mont JT. Microbial factors in inflammatory bowel disease. // Gastroenterol Clin North Am 2002;31(1): 41-62.
62. Finegold S.M., Sutter V.L., Sugihara P.T., Elder H.A., Lehmann S.M., Phillips R.L. Fecal microbial flora in Seventh Day Adventist populations and control subjects. // Am. J. Clin. Nutr. 1977. -30. P. 1781-1792.
63. Fox JG, Gorelick PL, Kullberg MC et al. A novel urease-negative Helicobacter species associated with colitis and typhlitis in IL-10-deficient mice. // Infect Immun 1999;64:1757-1762.
64. Franco SCALDAFERRI & Claudio FIOCCHI, Inflammatory bowel disease: Progress and current concepts of etiopathogenesis // Journal of Digestive Diseases 2007; 8 ; 171-178.
65. Frank DN, St. Amand AL, Feldman RA, Boedeker EC, Harpaz N, Pace NR. Molecular-phylogenetic characterization of microbial community imbalances in human inflammatory bowel diseases. // Proc Natl Acad Sci U S A 2007; 104: 13780-5.
66. Franklin CL, Riley LK, Livingston RS et al. Enteric lesions in SCID mice infected with 'Helicobacter typhlonicus,' a novel urease-negative Helicobacter species. // Lab Anim Scincel999;49:496-505.
67. Fremaux C., Ahn C., Klaenhammer T.R. Molecular analysis of the Lactacin F operon. Applied Environ. // Microbiol., 1993, vol. 59, p. 3906-3915.
68. Garside P, Mcl Mowat A, Khoruts A. Oral tolerance in disease. // Gut 1999;44:137-42.
69. Giaffer M H, Holdsworth С D, Duerden В I. The assessment of faecal flora in patients with inflammatory bowel disease by a simplified bacteriological technique. // J Med Microbiol 1991; 35: 238-243.
70. Gianfrilli P.M. Normal intestinal flora in children and their changes in pathological conditions // Ann. 1st Super Sanita. 1986; 22: 3: 783-789.
71. Gill H.S., Rutherfurd J., Prasad J., Gopal P.K. Enhancement of natural and acquired immunity by Lactobacillus rhamnosus (HN001), Lactobacillus acidophilus (HN017) and Bifidobacterium lactis (HN019). // Br J Nutr 2000, 83:2, 167-76.
72. Goldin B.R., Gorbach S. L., Saxelin M., Barakat S., Gualtieri L., Salminen S. Survival of Lactobacillus species ( strain GG ) in human gastrointestinal tract //Dig. Dis. Sci. 1992.-37, P. 121-128.
73. Gophna, U., Sommerfeld, K., Gophna, S., Doolittle, W. F., Veldhuyzen van Zanten, S. J. O. (2006). Differences between Tissue-Associated Intestinal Microfloras of Patients with Crohn's Disease and Ulcerative Colitis. // J. Clin. Microbiol 44: 4136-4141
74. Griffiths AM. Crohn's disease in adolescents. // Baillieres Clin Gastroenterol 1998; 12: 115-32.
75. Harper PH, Lee EC, Kettlewell MG, Bennett MK, Jewell DP. Role of the faecal stream in the maintenance of Crohn's colitis // Gut (1985) 26:279284.
76. Harper PH, Truelove SC, Lee EC et al. Split ileostomy and ileocolostomy for Crohn's disease of t he colon and ulcerative colitis: a 20 year survey. // Gut 1983;24:106-113.
77. Hart AL, Stagg AJ, Frame M, et al. Review article: the role of the gut flora in health and disease, and its modification as therapy. // Aliment Pharmacol Ther 2002;16:1383-93.
78. Hermiston ML, Gordon JI. Inflammatory bowel disease and adenomas in mice expressing a dominat negative N-cadherin. // Science 1995/ 270(5239): 1203-1207.
79. Hiromasa Takaishi, Takahiro Matsuki, Atsushi Nakazawa et al., 2008. Imbalance in intestinal microflora constitution could be involved in the pathogenesis of inflammatory bowel disease //1 J of Medical Microbiol. 298, 463-472
80. Hisamatsu T, Suzuki M, Reinecker HC, et al. CARD15/NOD2 functions as an antibacterial factor in human intestinal epithelial cells. // Gastroenterology 2003; 124:993-1000.
81. Hollander D. Intestinal permeability in patients with Crohn's disease and their relatives. // Dig Liver Dis 2001;33:649-651.
82. Hugot JP, Chamaillard M, Zouali H, Lesage S, Cezard JP, Belaiche J, et al. Association of NOD2 leucine-rich repeat variants with susceptibility to Crohn's disease. // Nature. 2001;411:599-603.
83. I L Huibregtse, A U van Lent, S J H van Deventer. Immunopathogenesis of IBD: insufficient suppressor function in the gut? // Gut 2007;56:584-592.
84. Inohara N, Chamaillard M, et al. NOD-LRR proteins: role in host-microbial interactions and inflammatory disease. // Annu Rev Biochem 2005;74:355-383.
85. Inohara N, Nunez G. Nods: intracellular proteins involved in inflammation and apoptosis. // Nature Rev 2003; 3: 371-82.
86. Kaila M., Isolauri E., Soppi E., Virtanen E., Laine S., Arvilommi H. Enhancement of the circulating antibody secreting cell response in human diarrhea by a human Lactobacillus strain. // Pediatr. Res. 1992.-32. P. 141144.
87. Kirschner BS. Permanent growth failure in pediatric inflammatory bowel disease. // J Pediatr Gastroenterol Nutr 1993; 16: 368.
88. Klaenhammer T.R. Bacteriocins of lactic acid bacteria. // Biochimie, 1988, vol. 70, p. 337-349.
89. Kleesen B, Bezirtzoglou E, Matto J. Cultured-based knowledge on biodiversity, development and stability of human gastrointestinal microbiota. // Microb Ecol Health Dis 2000;2(suppl):53-63.
90. Krook A, Lindstrom B, Kjellander J, Jarnerot G, Bodin L. Relation between concentrations of metronidazole and Bacteroides spp in faeces of patients with Crohn's disease and healthy individuals. IIJ Clin Pathol 1981; 34:645650.
91. L Dianda, AM Hanby, NA Wright, A Sebesteny, AC Hayday, and MJ Owen. T cell receptor-alpha beta-deficient mice fail to develop colitis in the absence of a microbial environment // Am J Pathol 1997 150: 91-97.
92. Langholz E, Munkholm P, Krasilnikoff PA, et al. Inflammatory bowel diseases with onset in childhood. Clinical features, morbidity, and mortality in a regional cohort. // Scand J Gastroenterol 1997, Vol. 32, No. 2, Pages 139-147
93. Lesage S, Zouali H, Cezard JP, Colombel JF, Belaiche J, Aimer S, et al. CARD15/NOD2 mutational analysis and genotype-phenotype correlation in 612 patients with inflammatory bowel disease. // Am J Hum Genet. 2002; 70:845-57.
94. Li J, Moran T, Swanson E, et al. Regulation ofIL-8 andlL-lbeta expression in Crohn's disease associated NOD2/CARD15 mutations. // Hum Mol Genet 2004;13:1715-1725.
95. Lievin-Le Moal V, Servin AL. The front line of enteric host defense against unwelcome intrusion of harmful microorganisms: mucins, antimicrobial peptides, and microbiota. // Clin Microbiol Rev. 2006; 19:31537.
96. Liu Y Van Kruiningen HJ, West AB et al. Immunocytochemical evidence of Listeria,Escherichia coli, and Streptococcus antigens in Crohn's disease. // Gastroenterology 1995;108:1396-1404.
97. Loonen H.J., Griffiths A.M., Mercus M.P., et al. A critical assessment of items on the Pediatric Crohn's Disease Activity Index // Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 2003. - Vol. 36. - №1. - P.90-95.
98. M.C. Dubinsky, Y.C. Lin, D. Dutridge, et al. Serum immune responses predict rapid disease progression among children with Crohn's disease: immune responses predict disease progression, // Am. J. Gastroenterol. 101 (2006) 360-367.
99. MacDonald TT Carter PB. Requirement for a bacterial flora before mice generate cells capable of mediating the delayed hypersensitivity reaction to sheep red blood cells. // J Immunol 1979;122:2624-2629.
100. Macdonald TT, Monteleone G. Immunity, inflammation, and allergy in the gut. // Science 2005;307:1920-1925.
101. Mackie RI, Sghir A, Gaskins HR. Developmental microbial ecology of neonatal gastrointestinal tract. // Am J Clin Nutr 1999;69 (suppl): 1035-45.
102. Mahida YR. Mechanisms of host protection and inflammation in the gastrointestinal Tract. IIJ R Coll Physicians Lond 1997; 31 (5):493-497
103. Maltseva N.N., Bossart W., Schkarupeta M.M., Ginodman G.A., Korschunov V.M. The study of immunomodulation effect of human microflora species in experiment and clinics. Abstracts, 4th Felasa Symposium, Lyon, France, 1990, p. 93.
104. Mangin I, Bonnet R, Seksik P, et al. Molecular inventory of faecal microflora in patients with Crohn's disease // FEMS Micro Ecol 2004; 50:25-36.
105. Manichanh, С, Rigottier-Gois, L, Bonnaud, E, et al.,. Reduced diversity of faecal microbiota in Crohn's disease revealed by a metagenomic approach. // Gut (2006) 55:205-211
106. Matsuki, Т., Watanabe, K., Fujimoto, J., Takada, Т., Tanaka, R., 2004. Use of 16S rRNA gene-targeted group-specific primers for real-time PCR analysis of predominant bacteria in human feces. // Appl. Environ. Microbiol. 70, 7220-7228.
107. Matsumoto, S, Okabe, Y, Setoyama, H, Takayama K, et al., Inflammatory bowel disease-like enteritis and caecitis in a senescence accelerated mouse Pl/Yit strain. // Gut 43 (1998): 71-78
108. Meddings JB. Intestinal permeability in Crohn's disease. // Aliment Pharmacol Ther 1997;Suppl I 1:47-53.
109. Merwe JP, Schroder AM, Wensick F, Hazenberg MP // Scand J Gastroenterol. 1988; 23:1125-1131.
110. Miettinen M., Lehtonen A., Julkunen L., Matikainen S. Lactobacilli and treptococci activate NF-kB and STAT signaling pathways in human macrophages // J.Imminol.-vol.64:p.3733-3740.-2000
111. Miyamoto, Y., Watanabe, K., Tanaka, R., Itoh, K., 2002. Distribution analysis of six predominant Bacteroides species in normal human fecesusing 16S rDNA-targeted species-specific primers. // Microb. Ecol. Health Dis. 14, 133-136.
112. Moore W.E.C., Cato E.P., Holdeman L.V. Some current concepts in intestinal bacteriology. Am. J. Clin. Nutr. 1978. -31. P. 33-42.
113. Murch SH, Baldassano R, Buller H, Chin S, et al.; Inflammatory bowel disease: Working Group report of the second World Congress of Pediatric Gastroenterology, Hepatology, and Nutrition. // J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2004 Jun;39 Suppl 2:S647-54.
114. Netea MG, Kullberg В J, de Jong DJ, etal. NOD2 mediates antiinflammatory signals induced by TLR2 ligands: implications for Crohn's disease. // Eur J Immunol 2004;34:2052-2059.
115. Neutra M.R., Kraehenbuhl J-P. «Regional Immune Response to microbial pathogens». In: Edds. S.H.E. Kaufmann, A. Sher, R. Ahmed. «Immunology of Infectious Disease». ASM Press USA Washimgton. P.495, 2002.
116. Nicholas D.B., Otley A., Smith C. Challenges and strategies of children and adolescents with inflammatory bowel disease: a qualitative examination // Health Qual Outcomes. 2007. - Vol.25. - №5. - P.28
117. O. Cohavy, D. Bruckner, L.K. Gordon, R. Misra, B. Wei, M.E. Eggena, S.R. Targan, J. Braun, Colonic bacteria express an ulcerative colitis pANCA-related protein epitope, // Infect. Immun. 68 (2000) 1542-1548.
118. Oberhelman HA, Jr, Kohatsu S, Taylor KB, Kivel RM. Diverting ileostomy in the surgical management of Crohn's disease of the colon. // Am J Surg. 1968 Feb; 115(2):231-240.
119. Ogura Y, Bonen DK, Inohara N, et al. A frameshift mutation in NOD2 associated with susceptibility to Crohn's disease. // Nature 2001;411:603-606.
120. Onderdonk AB, Franklin ML, Cisneros RL. Production of experimental ulcerative colitis in gnotobiotic guinea pigs with simplified microflora. // Infect Immun 1981;32:225-231.
121. Orholm M, Binder V, Sorensen TI, Rasmussen LP, Kyvik КО. Concordance of inflammatory bowel disease among Danish twins: results of a nationwide study. // Scand J Gastroenterol 2000; 35: 1075-81.
122. Parent K, Mitchel P. Cell wall defective variants of Pseudomonos-like (group Va) bacteria in Crohn's disease. // Gastroenterology 1978;75:368-372.
123. Pasare C, Medzhitov R. Toll pathway-dependent blockade of CD4+CD25+ T cell-mediated suppression by dendritic cells. // Science 2003;299:1033-1036.
124. Paster, B. J., F. E. Dewhirst, I. Olsen, and G. J. Fraser. 1994. Phylogeny of Bacteroides, Prevotella, and Porphyromonas spp. and related bacteria. // J. Bacteriol. 176:725-732.
125. Peppelenbosch MP, van Deventer SJ. T cell apoptosis and inflammatory bowel disease. // Gut 2004;53:1556-8.
126. Pizarro TT, Arseneau КО, Cominelli F. Lessons From Genetically
127. Engineered Animal Models XI. Novel mouse models to study pathogenicmechanisms of Crohn's disease (2000) II Am J Physiol 278:G665-G669.
128. Prantera C, Berto E, Scribano ML, Falasco G. Use of antibiotics in the treatment of active Crohn's disease: experience with metronidazole and ciprofloxacin. II Ital J Gastroenterol Hepatol 1998; 30: 602-6.
129. Prantera C, Kohn A. Proposed measures of disease activity: how useful are they? // In: Prantera, C, Korelitz, BI, eds. Crohn's Disease. New York, NY: Marcel Dekker Inc, 1996: 187-97.
130. Prindiville TP, Sheikh RA, Cohen SH, Tang YJ, Cantrell MC, Silva J Bacteroides fragilis enterotoxin gene sequences in patients with inflammatory bowel disease. // Emerg Infect Dis 2000; 6: 171-4.
131. Prindiville, Т., Cantrell, M. & Wilson, К. H. Ribosomal DNA sequence analysis of mucosa-associated bacteria in Crohn's disease. // Inflamm Bowel Dis 10 (2004)., 824-833.
132. Rachmilewitz D., Coated mesalazine versus sulfasalazine in the treatment of active ulcerative colitis: a randomized trial // B.M.J. -1989. Vol.82. -P.82.
133. Rakoff-Nahoum S, Paglino J, Eslami-Varzaneh F, et al. Recognition of commensal microflora by toll-like receptors is required for intestinal homeostasis. // Cell 2004;118:229-241.
134. Rasic JL, Kurman JA. Bifidobacteria and Their Role: microbiological, nutritional, physyological, medical and technological aspects and bibliography. // Basel: Birkbauser Verlag. Switzerland. 1982, P. 166
135. Rath H C, Herfarth H H, Ikeda J S, et al. Normal luminal bacteria, especially Bacteroides species, mediate chronic colitis, gastritis, and arthritis in HLA-B27/human beta2 microglobulin transgenic rats. // J Clin Investig. 1996;98:945-953
136. Rennick, D. M., Fort, M. M. (2000). Lessons From Genetically Engineered Animal Models: XII. IL-10-deficient (IL-10-/-) mice and intestinal inflammation. // Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. 278: G829-G833.
137. Roediger WE, Duncan A, Kapaniris O, Millard S. Reducing sulfur compounds of the colon impair colonocyte nutrition: implications for ulcerative colitis. // Gastroenterology 1993; 104: 802-9
138. Rook GAW, Brunet LR. Microbes, immunoregulation, and the gut. // Gut 2005; 54: 317-20.
139. Rubin D, Weiner HL, Fields BN, Greene MI. Immunologic tolerance after oral administration of reovirus: requirement for two viral gene products for tolerance induction.//J Immunol 1981; 127: 1697-1701.
140. Rutgeerts P, Hiele M, Geboes K, et al. Controlled trial of metronidazole treatment for prevention of Crohn's recurrence after ileal resection. Gastroenterology 1995; 108:1617-1621
141. Rutgeerts, P., K. Goboes, M. Peeters, M. Hiele, F. Penninckx, R. Aerts, R. Kerremans, and G. Vantrappen. Effect of faecal stream diversion onrecurrence of Crohn's disease in the neoterminal ileum. // Lancet 1991; 338:771-774.
142. Sallusto F, Lanzavecchia A, Mackay CR. «Chemokines and chemokine receptors in T-cell priming and Thl/Th2 mediated responses». // Immunol. Today. 19(12):568-574, 1998.
143. Salminen S, Bouley C, Boutron-Ruault MC, et al. Functional food science and gastrointestinal physiology and fuction. // Br J Nutr 1998;80(suppl): 147-71
144. Sartor RB. Intestinal microflora in human and experimental inflammatory bowel disease. // Curr Opin Gastroenterol 2001; 17:324-330.
145. Sartor RB. Mechanisms of disease: pathogenesis of Crohn's disease and ulcerative colitis. // Nat Clin Pract Gastroenterol Hepatol. 2006;3:390-407.
146. Sartor RB. Microbial influences in inflammatory bowel diseases. // Gastroenterology 2008; 134: 577-94.
147. Scanlan PD, Shanahan F, O'Mahony C, Marchesi JR. Cultureindependent analyses of temporal variation of the dominant fecal microbiota and targeted bacterial subgroups in Crohn's disease. // J Clin Microbiol 2006; 44: 39808.
148. Sebald M. Facteurs de virilunce des anaerobies. // Med Mai Infect. 1990, 20, 15-18.
149. Seksik P, Rigottier-Gois L, Gramet G, Sutren M, Pochart P, Marteau P, Jian R, Dore J. Alterations of the dominant faecal bacterial groups in patients with Crohn"s disease of the colon. // Gut (2003) 52:237-242.
150. Selby W, Pavli P, Crotty В et al. Two year combination antibiotic therapy with clarithromycin, rifabutin, and clofazimine for Crohn's disease. // Gastroenterology 2007; 132: 2313-9.
151. Sellon, R. K., Tonkonogy, S., Schultz, M., Dieleman, et al. Resident enteric bacteria are necessary for development of spontaneous colitis and immune system activation in interleukin-10- deficient mice. // Infect. Immun., 66: 5224-5231, 1998
152. Shanahan F, O'Mahony J. The mycobacteria story in Crohn's disease. // Am J Gastroenterol 2005;100:1537-1538.
153. Shanahan F. Probiotics in inflammatory bowel disease: therapeutic rationale and role. // Adv Drug Deliv Rev 2004;56:809-818.
154. Shiba T, Aiba Y, Ashikawa H, et al. The suppressive effect of Bifidobacteria on Bacteroides vulgatus, a putative pathiogenic microbe in inflammatory bowel disease. // Microbiol Immunol 2003;47:371-8,
155. Smeyanov V.V., V.M. Korshunov, W. Bossart, B.V. Pinegin, E.A. Zueva. Experimental and clinical immunomodulating activity of inactivated Lactobacillus acidophilus "Solco" preparations. J. Chemotherapy. 1993. 5(Sl):250-252.
156. Spiekermann GM, Walker WA. Oral tolerance and its role in clinical disease. // J Pediatr Gastroenterol Nutr 2001; 32:237-55.
157. Stephen A., Cummings G. The microbial contribution to human fecal mass. //J. Med. Microbiol. 1980.-13. P. 45-51.
158. Sutton CL, Kim J, Yamane A et al. Identification of a novel bacterial sequence associated with Crohn's disease. // Gastroenterology 2000; I 19:233 I.
159. Swidsinski A, Ladhoff A, Pernthaler A, et al. Mucosal flora in inflammatory bowel disease. // Gastroenterology 2002; 122:44-54.
160. Swidsinski A, Weber J, Loening-Baucke V, Hale LP, Lochs H. Spatial organization and composition of the mucosal flora in patients with inflammatory bowel disease. // J Clin Microbiol 2005; 7: 3380-9.
161. Tabaqchali S, O'Donoghue DP, Bettelheim KA. Escherichia coli antibodies in patients with inflammatory bowel disease. // Gut 1978; 19:10813.
162. Tanaka Н., Hashiba Н., Кок J., Mierau I. Bile salt hydrolase of Bifidobacterium longum-biochemical and genetic characterization. // Appl Environ Microbiol. 2000, 66:6, 2502-12.
163. Targan SR, Karp LC. Defects in mucosal immunity leading to ulcerative colitis. // Immunol Rev 2005;206:296-305.
164. Taurog J D, Maika S D, Simmons W A, Breban M, Hammer R E. Susceptibility to inflammatory disease in HLA-B27 transgenic rat lines correlates with the level of B27 expression. // J Immunol. 1993;150:4168-4178.
165. Taurog J D, Richardson J A, Croft J T, Simmons W A, Zhou M, Fernandez-Sueiro J L, Balish E, Hammer R E. The germfree state prevents development of gut and joint inflammatory disease in HLA-B27 transgenic rats. //J Exp Med. 1994;180:2359-2364
166. Teitelbaum JE, Walker WA. Nutritional impact of pre- and probiotics as protective gastrointestinal organisms. // Annu Rev Nutr 2002;22:107-38.
167. Tysk C, Lindberg E, Jarnerot G, Floderus-Myrhed B. Ulcerative colitis and Crohn's disease in an unselected population of monozygotic and dizygotic twins. A study of heritability and the influence of smoking. // Gut 1988; 29: 990-96.
168. Vainer B, Nielsen OH, Hendel J, et al. Colonic expression and synthesis of interleukin 13 and interleukin 15 in inflammatory bowel disease. // Cytokine 2000;12:1531-6.
169. Van der Waaij D. Colonization pattern of the digestive tract by potentially pathogenic microorganisms: Colonization controlling mechanisms and consequences for antibiotic treatment. // Infection. 1983.- 11. P. 90-92.
170. Veltkamp C, Tonkonogy SL, De Jong YP, et al. Continuous stimulation by normal luminal bacteria is essential for the development and perpetuation of colitis in Tg (epsilon26) mice. // Gastroenterology 2001;120:900-13.)
171. Vind I, Riis L, Jess T, Rnudsen E, et al. Increasing incidences of inflammatory bowel disease and decreasing surgery rates in Copenhagen
172. City and County, 2003-2005: a population-based study from the Danish Crohn colitis database. // Am J Gastroenterol. 2006 Jun;101(6):1274-82.
173. Vogel R.F., Pohle B.S., Tichaczek P.S., Hammes W.P. The competitive advandage of Lactobacillus curvatus LTH 1174 in sausage fermentation is caused by formation of Curvacin A. System. // Appl. Microbiol., 1993, vol. 16, p. 457-462.
174. Wakefield AJ, Pittilo RM, Sim R et al. Evidence of persistent measles virus infection in Crohn's disease. // J Med Virol 1993;39:345-353.
175. Watanabe T, Kitani A, Murray PJ, etal. NOD2 is a negative regulator of Toll-like receptor 2-mediated T helper type 1 responses. // Nat Immunol 2004;5:800-808.
176. Winslet MC, Allan A, Poxon V, Youngs D, Keighley MR. Faecal diversion for Crohn's colitis: a model to study the role of the faecal stream in the inflammatory process. // Gut 1994;35:236-42.
177. Woolverton C.J., Holt L.C., Mitshell D., Sartor R.B. Identification and characterization of rat intestinal lamina propria cells: consequences of microbial colonization. // Veterinary Immunology and Immunopathology 1992, vol. 34, p. 127-138.
178. Xavier RJ, Podolsky DK. Unraveling the pathogenesis of inflammatory bowel disease. // Nature 2007; 448: 427-34.
179. Yoshida M, 5hirai Y, Watanabe T et al. Differential localization of colitogenic Th 1 and Th2 cells monospecific to a microflora-associated antigen in mice. // Gastroenterology 2002; 123: 1949-1961.
180. Yoshida M, Watanabe T Usui T et al. CD4 T cells monospecific to ovalbumin produced by E. coli can induce colitis upon transfer to BALB/c and SCID mice. Int Immunol 2001; 13: 1561-1570.
181. West B, Lendrum R, Hill MJ, Walker G. Effects of sulphasalazine (Salazopyrin) on faecal flora in patients with inflammatory bowel disease. // Gut 1974; 15: 960-965.