Автореферат и диссертация по ветеринарии (16.00.03) на тему:Сравнительное изучение геномов микоплазм, инфицирующих крупный рогатый скот

АВТОРЕФЕРАТ
Сравнительное изучение геномов микоплазм, инфицирующих крупный рогатый скот - тема автореферата по ветеринарии
Маркина, Ольга Станиславовна Казань 1995 г.
Ученая степень
кандидата ветеринарных наук
ВАК РФ
16.00.03
 
 

Автореферат диссертации по ветеринарии на тему Сравнительное изучение геномов микоплазм, инфицирующих крупный рогатый скот

РГБ ОА

2 9 МАЙ В95

На правах рукописи

МАРКИНА Ольга Станиславовна

СРАВНИТЕЛЬНОЕ ИЗУЧЕНИЕ ГЕНОМОВ МИКОПЛАЗМ, ИНФИЦИРУЮЩИХ КРУПНЫЙ РОГАТЬИ СКОТ

16.00.03. - "Ветеринарная микробиология, вирусология, эпизоотология, микология и иммунология"

Автореферат

диссертации на соискание ученой степени . кандидата ветеринарных наук

Казань - 1395

Работа выполнена в лаборатории эпизоотологии Всероссийского научно-исследовательского ветеринарного инс.итута и в лаборатории молекулярной генетики Казанского института биологии КНЦ РАН.

Научные руководители - доктор ветеринарных наук, заслуженный деятель науки РТ, заведующий лабораторией эпизоотологии ВНИВИ Гаффаров Х.З.

- кандидат биологических наук, заведусадй лабораторией молекулярной генетики КИБ КНЦ РАН

Чернов В. М.

Официальные оппоненты - доктор ветеринарных наук, профессор,

заслуженный деятель науки РТ и РФ, Хазипов Н. 3.

- доктор ветеринарных наук, заведующий лабораторией биохимии ВНИВИ Алимов A.M.

Ведущее учреждение: Мордовский государственный университет им. Н.П.Огарева

Эавдта состоится ¿¿■¿-¿¿/-¿-В. 199S г. в час. на

заседании диссертационного совета Д-120.22.01 при Казанской государственной академии Ветеринарной медицины им. Н.Э.Баумана (420074, г.Казань, академия ветеринарной медицины).

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н.Э.Баумана.

Автореферат разослан

1995 г.

Ученый секретарь Диссертационного Совета, доцент

Чеботарев В.Е.

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность теин. Интерес к багологии микоплазн сегодня объясняется, с одной стороны, унукальностьг структурной организации этих микроорганиэчов, а с другой, - практической необходимостью так как микоплазмы имеет большое негативное значение для медицины, сельскохозяйственного производства и биотехнологии.

Болезни микоплазменной этиологии сельскохозяйственных животных широко распространены во всем мире и наносят значительный а ■■ териальный ущерб скотоводческим фермам и птицефабрикам. В 70-е rwv ды отечественные исследователи уделяли большое внимание изучен«? этиологической роли микоплазм при респираторных заболеваниях телят, маститах и других поражениях гешггальной снстс и крупного рогатого скота (Гаффаров Х.З., Митрофанов П. М., 1362, Коваленко Я. Г. и др., 1971; Курбанов И. А., 1972; Митрофанов П.М., 1977 и др.:. Оказалось, что возникновение микоплазмозов связано с нарушением природного равновесия во B3i тодействии симбиотической системы "микоплазма-организм хозяина" с факторам- окружающей среды, которое неизбежно происходит в процессе интенсификации животноводства.

Сложность и трудоемкость бактериологических исследований, отсутствие серологических методов диагностики микоплазмозов сельскохозяйственных животных, а также то обстоятельство, что в антигенная структуре, помимо компонентов, обладающих строгой специфичностью, содержатся и общие антигены, присущие другим видам лазм, ориентирует на поиск современных диагностических методов • надежных средств, обладают« высокой чувствительностью и специфичностью.

Достижения молекулярной биологии и генной инженерии! создали предпосылки для разработки новых биотехнологий, которые могут оып-успевно применимы для получения более эффективных яиагноствкуиоь.

8 этом плаке пенуноферментный анализ СИФА) првдставл.те? оооо;, уникальную комбинацию высокой чувствительности при индикации анти-геков и выявлении актатея. Популярности зте? м^тоя пользуете*. > при диагностике микоплазмозов животных и пгаа,. Яричеи, г»с чугствп-тельности и специфичности ИМ, как правило, превосходит такие серо -иикунологичеекгг вето»» как PCX, РИГА, РДП и В®Ф (LaEbert К. „

Cabasse E., 1987; Schaeren W., Nícolet J., 1983 и др.). Однако ИФА такке не гарантирует точного типирования различных видов, сероти-пов микоплазм, ахолеплаэм и уреоплазм, выделяемых от животных с различиьши формами клинического проявления заболевания.

Несовершенство диагностических методов затрудняет своевременное выявление микоплазменной инфекции, изучение механизмов взаимодействия микоплазм с клетками и организмом хозяина и разработку специфичных методов подавления инфекции.

В настоящее время решение проблемы диагностики микоплазменных инфекций связывают . применением метода ДНК-ДНК-гибридизации с использованием специфичных ДНК-зондов.

В изучении взаимодействия микоплазм с клетками и организмом хозяина сделаны лишь первые шаги, - показана роль микоплазм в возникновении того или иного заболевания и описаны симптомы болезни. Молекулярные механизмы взаимодействия микоплазм с клетками животных до сих пор не выяснены. Имеющиеся данные позволяют предположить возможность обмена между взаимодействующими организмами не только низкомолекулярными веществами, но и биополимерами, включая нуклеиновые кислоты.

Цель и задачи исследования. Целью настоящей работы является сравнительное изучение структурной организации геномов микоплазм, наиболее часто инфицирующих крупный рогатый скот и создание специфичных ДНК-эондов для обнаружения и идентификации этих микоплазм. В связи с поставленной цельс в задаче настоящего исследования входило:

1) определение степени гомологии разных видов микоплазм;

2) оп,еделение уровня гомологии между ДНК микоплазм и некоторых бактерий;

3) конструирование специфичных ДНК-зондов для обнаружения и идентификации микоплазм, наиболее часто инфицирующих крупный рогатый скот.

Научная новизна работы. Впе. зые установлено, что гомология между Mycoplasma bovis и большинства других микоплазм " ахолеплазм по ДНК касается отдельных фрагментов генома, соответствующих генам рРНК.

Впервые показано, что гомология межчу М. bovis и М. gallisepti-cum составляет более 50'/..

В геномах следующих п .р микоплазм: М. bovis и М. gallisepticum.

M. mycoides capri н M. fermentans, М. raycoides capri и H. fco-.:? ,inis обнаружены гомологичные повторявшиеся последовательности.

Сконструированы видоспецнфичные рекомбинантнне плазмиды рМЫ, pKbr9, pMmclS, содержание фрагменты геномов М bovis, М. bovirhinis, М. mycoides capri, которые позволяют обнаружить 1С?иикоплазменшя: частиц в любом биологическом материала и могут быть нспольэоезкн г качестве видоспецифичных ДНК-зоадов для обнаружения перочисяеинь.-' микоплаэм.

В геноке мнкоплазм обнаружены последовательности нуклеотидой, гомологичные сайтам посадки эукариотической топопзомерззн I,

Научно-практическая значимость работы. Отмечена знащ:те~,;г:? гомология между патогенными видами микоплаэм. Наличие гомологичны; повторявшихся нукяеотидных последовательностей в еномах миког.' лаэм, возможно свидетельствует о наличие каких-л::бо «^лков. или ферментов метаболизма, свойственных всем патогенкам кнхопяаэмш*, или ко эти участки ДНК связаны с генами обеспечиващюж метаболические потенции "минимальноЯ" '.летки.

Сконструированные рекомбинантные пл?змйды, содержание фрагменты геномов Н.bovis, М. bovirhinis н М. mycoides capri, явяявтся специфичными диагностическими зондами, которые могут бить использованы при диагнос.хке микоплазыента инфекций скота и идентификации этих видов микопяази.

До настоящего времени последовательности, гомологична™ сайтам узнавания топоизомераэы I, были идентифицированы только в геномах вирусов и эукариот. Наличие подобных участков в геноме ш;опяг?1 может быть аргументов за схогесть механизмов регуляции, »волпцкок-но сохранившихся от прокариотических к эукарпотеческии оргаднэка1.:.

Апробация работы. Основные положения работы доложены обсуждены на Международных конференциях ВсемирноЗ организации мйкоп-лазцологов (2-7 августа 1992г., Айкс, США; 18-27 нвля Í934r., Бордо, Франция), Яколе-сехйнаре по проблем. 5нстрой дкагксстаки ксплаэкепкых инфекция С?~14 августа 1S31 г., Иерусалим, йэраяль), Отчетной конференции Казанского научного центра Российской Ахзде-мии• Наук С22-29 января, 1333 г., Казань), заседания Ученого Совет-

вниви.

Публикации. По катерналак диссертация опубликовано в научных

работ.

Внедрение. Результаты работа оформлена в виде Еэтоаччесю»*

рекомендаций "Обнаружение и идентификация микоплазменных инфекций крупного рогатого скота методом ДНК-ДНК гибридизации" и используются для диагностики микоплазменных инфекций сельскохозяйственных животных.

На защиту выносятся следующие основные положения:

1. Гомология М. bovis и исследованных видов микоплаэы и ахолеп-лаэм по ДНК касается отдельных фрагментов генома, соответствующих генам рРНК.

2. Гомология между М. bovis и М. galiisepUcura по ДНК составляет более 50%.

3. В геномах не; торых исследованных микоплаэм обнаружены гомологичные повторяющиеся последовательности нуклеотйдов размером 7, 9, 10. S тыс. н.п., соответственно.

4. В геноме М. bovis обнаружены последовательности нуклеотйдов, гомологичные сайтам посадки эукариотической топоизомеразы I.

5. Сконструированные диагностические ДНК-зонды позволяет обнаружить микоплаэменнур инфекцис в любом биологическом материале, вызванную М.bovis, М. bovirhinis, М.mycoides capri.

Структура и объем диссертации. Работа изложена на 92 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, собственных исследований, включая методы и обсуждения результатов исследования, выводов и заключения, иллюстрирована 7 таблицами и 9 рисунками. Список использованной литературы включает 172 наименования, в том числе 152 иностранные работы.

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

1. Патериалы и методы исследований*

В работе использованы микоплаэмы; Mycoplasma arginini, М. bo-vigenitalirn, M.bovirhinis, M.bovis, H.mycoides capri, И.gallisep-ticum, M. f6imentans, Acholeplasma laidlawii PG8 и PG9, A.modicum, A. axanthum, а также штаммы HB101 DH5 Escherichia coli. Штаммы микоплаэм были получены из коллекции НШ эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи РАМН и музея лаборатории молекулягчой генетики Института биологии КНЦ РАН. Микоплаэмы выращивали на среде Эдварда, приготовленной в лаборатории питательных сред ВНИВИ. Культуры выращивали в течение 5-20 суток пр'- температуре 37°С.

Исследуемый биологический материал (кровь, молоко, носовая

слизь) получали от клинически больных животных. нодоз:лггс..*дшс к заболеванию и клинически здоровых, принадлежащих совхозу "Калининский" и откормсовхозу "Высокогорский" Высокогорского района республики Татарстан.,

Выделение ДНК. Клетки шисопяазы суспендировали з 5'; растЕо-ре ТХУ-ЭДТА-На, рН 8.0 и вскрывали 0.5« раствором БГЗ. ДНК »к«?-— гировали смесью фенол-хлороформ (1:1) и осаждали 2.5 ооьекаи» 9Гг этанола. Обрабатывали РНКазсй и протеиназоя К, Гидролиз ры, триктазами проводили по стандартные методикам (Наина "с 1. и ¡.\-198Л.

Злектройоретнческоэ разделение фрагяеятоа 7по?огп.т" г-

0.8% агарозных гелях в горизонтальных блоках. Для опо?,пг.л&ь";;я меров фрагментов ДНК строили калибровочные кривые, :.спояьэул ь кп-чэстве реперов ЕсойУ-фрагкекты Л2П! X яэ»вйтноа ллинн.

Взятие проб биологического ммериадо проредит?» « «иАи> дусмотренных правил в стерильные пробирки. Образцы центрифугировали.(18 тыс. об/мин, 10 шт.), из осадков -вкделялй ДШ1 согласи;: стандартной методики, добавляя лизоцим в :ониентрации 4 пгл'х.

Перенос фрагментов ДНК с агароэного геля на нитроцёллвлозккз фильтры осуществляли по методу Сауэерна без модификация. Для переноса высокомолекулярной ДНК - пробы, обработанные денатурирущим я нейтрализушим буферами наносили на фильтр » растворе 10-ти кратного ББС используя микроворонки "М1п1Го1сГ.

ведение радиоактивной метки в ДНК проводили методом ки> -трансляции по й. ¡?1дЫ с соавт. (1977). Удельная раг'оактиьност, меченной (а32Р)дНТФ составляла 108 имп/мин/мкг.

ДНК-ДНК гибридизацию с радиоактивными зондами проводили ПР1. температуре 42°С в растворе 35% формамида. После гибридизации фильтры отшвали при температуре 5ЕРс в растворе 2-х краткого йзг, (2 раза по 1 ч.), 2-х кратного £ЗС с 0. IX ЗОБ (2 раза по' 30 кик.) и 2-3 ч. в 3 мМ растворе триса, рД 9.0. Радиоавтографы полу.чалг при экспонировании фильтров с рентгеновской пленкой в течение 1-й уток при температуре - 20°С.

После гибридизации с ДНК-зондами меченныю; биоУТФ оильтры оо-рабатывали согласно прописи для работы с диагностическим комплотом "Мигитест" (Кардиоцентр РАМН, г.Москва),

Встраивание фрагиентов ДНЕ в плазмидный вектор рВК328, трансформации бактериальных штаммов рекомбинантными плазш-;дз;лт к сеяек-

цив и выделение пмзмид проводили по стандартным методикам (Маниа-тис Т. и др., 1984).

Определение нуклеотидной последовательности ДНК проводили по А.Максам и У.Гилберту С1986) твердофазным методом.

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЕ

Рестриктазные спектры микоплазм. Электрофоретические спектры рестриктазных фрагментов ДНК микоплазм, образующихся при обработке ДНК разными рестриктазами, оказывается дискретными, что зависит от частоты встречаемо :ги соответствующих сайтов рестрикции и малого размера генома микоплазм. При гидролизе ДНК рестриктазами образуется небольшое количество фрагментов С20-50), что дает возможность их четкого электрофоретического разделения в 0.8/4 агароэных гелях. Анализ злектрофоретиЧеских спектров рестриктазных фрагментов ДНК микоплазм может быть использован для идентификации видов и даже штаммов, а также эти спектры являются материальной основой гибри-

1 2 3 4 5 6

Рис. 1. Гомология участков геномов разных видов микоплазм

с ДНК Mycoplasma bovis. Радиоавтограф - результат блот-гибридизации меченной ^Р ДНК М. bovis с KcoRV-фрагментами ДНК: 1-М. bovirhinls; 2 - A. modicum; 3 - A. axanthum; 4 - A. laidlawi * PG8; 5 - A. iaidlawii PG9; 6 - М. bovis.

1изационного подхода при исследовании молекулярной организации ге-юма микоплэзм с помощью меченых зондов.

Гомология микоппазм по ДНК. Известно, что гомология между :редставителями класса микоплазм колеблется от 2 до 60/,. M. galli-septicum - наиболее тахителичная микоплазма, филогенетически отда-тенная от всех других представителей класса Moliicutes. Гены рРНК являются единственными гомологичными участками ДНК M. даHisepticum л большинства, микоплазм (Борхсениус С.H., Чернова O.A., Î989). Б экспериментах по ДНК-гибридизации нами установлен, что гомология '4. bovis и почти всех исследованных микоплазм по ДНК касается от-цельных участков генома, соответствующих генам рРНК С рис.1), в то ьремя как топология между другими видами микоплазм определяется не только рибосомными генами, но и по генам тРНК н другим учасгяаи геномов.

Гомология между M. gallisepticum и М. bovis составляет более 50'/.. Кроме того, в ходе работы нами было установлено, наличие общих, в том числе повторяющихся нуклеотидных последовательностей в геномах этих микоплазм.

При анализе данных С табл.1) по определению степени гомологии

Таблица 1.

Результаты перекрестной дот-гибридизации по определению степени гомологии микоплазм

ДНК зонды M. bovis M. bovi-' rinis M. mycoi -des capri A. laid-lawu A A. laid-lawii В M. fer- men- tans M. gal-lisep-ticuni

М. bovis + + +

M. bovir-turus + +

M. myco i-des capri + +

ALA + +

ALB + +

Примечание: знаком "«■" отмечены гзгксплаэж, при перекрестной

гибридизации которых степень гомологии прэзкшает 10%.

ДНК микоплазм, полученных в экспериментах по дот-гноридизгцкн обращает на себя внимание гомология между м. Гегтеп1апБ и другими идиоплазмами. Следует также отметить наличие обаих участков иежду патогенными видаки. Возможно, эти фрагменты ДНК связаны с кодированием ключевых белков, имеющих значение для патогенности микоплазм или генами, обеспечивающими метаболические потенции "минимальной" клетки.

Наличие гомологии между микоплаэмами и бактериями. Многие авторы рассматривали проблему гибридиэуемости ДНК микоплазм с ДНК других микроорганизмов. Так как существуют инфекционные заболевания, имеющие симптоматику, сходную с клиническим проявлением мико-плазмозов, нами при разработке диагностических ДНК-зондов на кико-плазкэнные инфекции крупного-рогатого скота проведено определение гомологии микоплазм и некоторых бактерий. Результаты перекрестной дот-гибридизации представлены ь таблице 2. ДНК-ДНК-гомология юшо-плаи с клетками БЬаШоссш; не превышает 5% и касается, по-видп-ыоыу, лишь отдельных непротяжэнных участков в их геномах.

Таблица 2.

Результаты перекрестной гибридизации микоплазм и бактерий

ДНК на фильтре

М.bovis! М.bövlrhinis

ДНК-зонды

, Mycobacterial ; avium

Brucella abortus

A. laldlawii A M. bovis M. bovirhinis

StwfllOCOCCUS

Bacillus subtills

Esherichia coll

Brucella abortus

Mycobacterium avium

+

+

+

+

+

4

- и -

Харктеристика сконструированных ДНК-зондов. Рекомбинантныв

1 лазмиды были получены и отобраны из туех серий клонотек, обозначенных Mb СМ. bovis), Mbr СМ. bovirhinis), Mac СМ. mycoides caprl), <аждая из которых состояла из десятков клонов, несущих случайные ïcoRV-фрагменты ДНК соответствующих микоплази), клонированных в векторе рВк323. Рекомбинантные плазмиды, содергащие вставки геномов м:коплазм первоначально выявлялись по злектрофоретической под-аиккости в агароэном геле, а затем по гибридизации с геномной ДНК гой гад микоплаэмы. В результате проведенных экспериментов были отобраны три рекомбинантние плазмиды, содержание вставки генома Ч. bovis: pMbl, рКЬЗ, рМЬ26, При определенна специфичности этих было выявлено, что плазмиды рМЬЗ и p№i2ô содержат участ-:гл, гомояогичйыа ДКХ M gai i isepticua, s то креыя как рМЫ имеет глотательную перекрестную реакции только с ДНК М. bovis. Далгз бн-(10 установлено, что плазыида рМЬ26, позволяющая обнаружить 3 иг ВДК М. bovis в исследуемых образцах, уступает по чувствительности ллазммдам рМЫ и рМЬЗ, выявляющих в тех же условиях 0.5 нг ДНК мн-коплазиы, что соответствует 104 инфекционных частиц С рис. 2). Как сказалось, этот эффект обьясняется тем, что в отличие от рМЬ26, плазмиды рМЫ и р№3 содержат фрагменты ДНК М. bovis, представленные в геноме ликсплазмы несколькими копиями.

Рис. 2. Оценка чувствительн<ста плазмид рМЬ28 Ca), рМЫ (б),

Р^З Сз).

Каждая из трек полос (а-э) содержит ДНК М. bovis в колпчестзахг 10 нг С1), 5 Hl С2), 0.5 яг СЗ) на точку.

- i2 -

Рекомбинантная плазмила pMbrQ, содержащая фрагмент генома H. boYlrhinis, является видоспецифичной для этой микоплазмы, но в отличие от плазкиды рМЫ, она гибридизуется только со своим фрагментом ДНК на фильтре, который соответствует по размеру фрагменту ыикоплазменной ДНК в плазмиде Сб. 7 тыс. н.п.). Это свидетельствует о том, что данный клонированный фрагмент генома; M. bovirhinis не только видоспецифичен, но и уникален. По чувствительности, плазми-да рМЬгЭ не уступает рМЫ.

При определении степени гомологии ДНК разных видов микоплаэм интересные результаты были получены в отношении M. mycoides capri. Эта микоплазма была взята в работу по создание диагностических зондов как возбудитель заболеваний мелкого рогатого скота для сраьненительного изучения. В качестве видоспецифичного ДНК-эонда нами была выбрана плазмида рМтс16, содержащая фрагмент генома M.mycoides capri, размером 1.3 тыс. н.п. Чувствительность полученного зонда также составляет 0.5 нг.

В сконструированной нами клолотеке Mme были также идентифицированы клоны, имеющие положительную перекрестную реакцию с гомологичными фрагментами в геномах M. bovirhinis (клон 12) и M. fermen-tans Склон 23). Кроме того, сказались, что клонированный EcoRV-фрагмент M. mycoides capri в геноме M. ferment-ans был представлен несколькими копиями. Эти данные согласуются с наличием высокой гомологии между видами M.fermentans и M.mycoides capri, выявленной в ваших экспериментах.

Как было отмечено выше, плаз милы рМЫ, рМЬгЭ. pMmcia были получены при клонировании случайных EcoRV-фрагментов ДНК кикоплазы в векторе pBR328. Таким образом, зонды представляют из себя реком-бинантные плазкиды, содержащие ДНК вектора размером 4.9 тыс. н.п. и ДНК фрагментов генома соответствующих микоплазм: М. bovis С1.7 тыс. н.п.), M.bovirhlnls Сб.7 тыс. н.п.) и M.mycoides capri С1.3 тыс. н.п.).

Обиорусаки© михоплаэиениых инфекций Н. bovis и M. bovirhinis в биологическом материала с поношш ДНК-зондоа. Сконструированные ДНК-зонды рКЬ1 и рМЬг9 были испытаны нами в лабораторко-производ-ственных условиях при исследовании биологических образцов с целью обнаружения и идентификации М. bovis и M. bovirhiris. В качестве проб были взяты: кояоко от коров с клиническим проявлением масти-

а, носовая слизь от телят 1-1.5 месячного возраста с признаками) оражекия органов дыхательной системы (бронхопневмония, ринит), а акже кровь от клинически здоровых бычков-откормочников.

В результате ДНК-ДНК гибридизации с диагностическими зондами МЫ и рНЬгЭ было обнаружено, что в 72*/. проб С18 из 25) присутству-т микоплазмы. Данные по обнаружение микоплазменных инфекций сье-ены в таблицу 3.

Таблица 3.

Обнаружение микоплазменных инфекций М bovis и М bovirhirus в биологическом материале

сйёйанная

Зиологический материал М. bovis М. bovirhinis микоплазменная

инфекция

кровь 50/. 70'/. 20%

носовая слизь 50% 75% 25%

молоко ' 54.5% 63.6% 30%

Наличие микоплазм в образцах, гзятых от клинически здоровых <вотнъгх, моано объяснить способностью микоплазм длительное время »холиться с макроорганизмом в симбиотических отношениях.

На основании лабораторно-производственных испытаний сконстру-эованных плзмидных зондов, нами разработаны методические рекомен-щии по обнаружению и идентификации микоплазменных инфекций круп-зго рогатого скота методом ДНК-ДНК-гибридизации.

В геноме И. boyis обнаружены последовательности нуклеогидов, экологичные сайтам посадки эухариотической топоизонеразы I. При

{бридиэации плазмиды рМЬЗ с EcoRV-фрагментами ДНК разных видов {коплаэм было обнаружено, что клонированный фрагмент М. bovis зоявляет слабую гомологию с оперонами рРНК. протестированных микста- ч. В ходе дальнейших экспериментов было установлено, что плаз-1да рИзЗ не содержит участки рРНК генов. Определение первичной ,'клеотидной последовательности показало, что клонированный фраг-. гнт содержит тетрадекамерный мотив ТСТТТдААААСТЬа. Анализ банка

данных нуклеотидных последовательностей, представленный в программе "DNASIS", показал, что обнаруженный нами тетрадекамерный мотив является сайтом посадки эукариотической топоизомераэы I. До сих пор последовательности, гомологичные сайтам узнавания топоизомераэы I, были идентифицированы только в геномах вирусов и эукариот. Наличие подобных структур в геноме микоплазм может быть аргументом за схожесть механизмов регуляции, эволвционно сохранившихся от прокариотических к эукариотнческим организмам.

вывода

1. Гомология Н. bovis и большинства других микоплазм и ахолеп-плазм по ДНК касается отдельных фрагментов генома, соответствуюиих генам рРНК.

2. Гомология между И. bovis и M. gallisepticum по ДНК составляет более 50%. .

3. В геномах следующих пар микоплазм: M.bo^is и М.gallisepticum, M. mycoides caprl и M. fer .Dent ans, M. mycoides caprl и M.bovir-hinis обнаружены гомологичные повторяющиеся последовательности размером 7, 9, 10. S тыс. н. п.

4. В геноме М. bovis обнаружены нуклеотидные последовательности, гомологичные сайтам узнавания эукариотической топоизомеразы I.

5. Схонструировглы видоспецифичные ДНК-зонды СрМЫ, рМЬгЭ, pMmclß) для обнаружения М.bovis, M. bovirhinis, M.mycoides capri, инфицирующих сельскохозяйственных животных.

Практические предложения.

1. Сконструированные плазмиди рМЫ С размером 6.6 тыс. н.п. ), рМЬгЭ (11.6 тыс. н.п.) и pWnclö (размером 6.2 тыс. н.п.) состоят кз плазкидного вектора pBR328 (размером 4.9 тыс. н.п. ) и специфичных фрагментов ДНК соответствующих микоплазм и позволяют обнаружить 0.5 иг юпсоплазкенной ДНК р любом биологическом материале. Пяазкидо рМЫ, рМЬгЭ, phtocie могут быть использованы в качестве специфичный ДНКгзондой для обнаружения микоплазменнцх инфекций сельскохозяйственных гавотных.

- 15 -

Список работ, опубликованных по материалам диссертации:

1. Чернов В.М. , Маркина 0.С., Гаффаров Х.Э.Чернова O.A. аецифичный ДНК-зонд для обнаружения инфекций Mycoplasma bovis // атериалы научной конференции ВНШВВиМ, октябрь 1992. г. Покров.

. 275.

2. Chernova O.A. , Markina O.S. , Chernov V.M. Repeated DMA equences shared by Mycoplasmas // IOM Letters, 1992. Vol. 2.

. 256.

3. Chernov V.M. , Chernova O.A.. GogoleY Y.V., Markina O.S. epeated tetradecamer nucleotide sequences as elementary struc-ures of genetic regulation in Mollicutes IOM Letters. 1994. ol. 3. P. 402.

4. Гаффаров X 3. , Маркина O.C., Чернов В. M. Диагностичес-ая эффективность твердофазного ИФА и ДНК-зонда при микоплазыен-ых инфекциях животных // Вопросы инфекционной патологии живот-ых. Межвузовский сборник научных трудов. Казань. 1994. С. 5-10.

5. Маркина 0. С. , Чернов В. М., Чернова 0. А., Гаффаров X. Э. бнаружение микоплазма бовис с помощью ДНК-зонда // Вопросы нфекционной патологии животных. Межвузовский сборник научных рудов. Казань. 1994. С. 11-13.

6. Чернов В. М., Гаффаров X. 3., Маркина 0. С., Чернова 0. А. оздание видоспецифичного ДНК-зонда для обнаружения и идентифи-ации Mycoplasma bovis у крупного рогатого скота // Сельскохо-яйственная биология. 1995. N 2. С. 47-52.

аказ te 99. Подписано в печать J7.05.95. «topuai 6Ü х 84^/16 у>зга ьисчан. Печать офсетная. 2'п.л. Тира» 100 экз. чьсток офсетьой печати КГАБМ. Казань-420074