Автореферат и диссертация по медицине (14.01.12) на тему:СКРИНИНГ "ПОВТОРЯЮЩИХСЯ" МУТАЦИЙ, АССОЦИИРОВАННЫХ С НАСЛЕДСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЕВЫМИ СИНДРОМАМИ И ДРУГИМИ МОНОГЕННЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ

ДИССЕРТАЦИЯ
СКРИНИНГ "ПОВТОРЯЮЩИХСЯ" МУТАЦИЙ, АССОЦИИРОВАННЫХ С НАСЛЕДСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЕВЫМИ СИНДРОМАМИ И ДРУГИМИ МОНОГЕННЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ - диссертация, тема по медицине
АВТОРЕФЕРАТ
СКРИНИНГ "ПОВТОРЯЮЩИХСЯ" МУТАЦИЙ, АССОЦИИРОВАННЫХ С НАСЛЕДСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЕВЫМИ СИНДРОМАМИ И ДРУГИМИ МОНОГЕННЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ - тема автореферата по медицине
Цыбакова, Наталья Юрьевна Санкт-Петербург 2012 г.
Ученая степень
кандидата медицинских наук
ВАК РФ
14.01.12
 
 

Автореферат диссертации по медицине на тему СКРИНИНГ "ПОВТОРЯЮЩИХСЯ" МУТАЦИЙ, АССОЦИИРОВАННЫХ С НАСЛЕДСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЕВЫМИ СИНДРОМАМИ И ДРУГИМИ МОНОГЕННЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ

#[вах рукописи

У

Цыбакова Наталья Юрьевна

СКРИНИНГ «ПОВТОРЯЮЩИХСЯ» МУТАЦИИ, АССОЦИИРОВАННЫХ С НАСЛЕДСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЕВЫМИ СИНДРОМАМИ И ДРУГИМИ МОНОГЕННЫМН ЗАБОЛЕВАНИЯМИ

Специальности: 14.01Л2 - онкология 03.02.07 - генетика

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук

2 2 НОЯ 2012

Санкт-Петербург 2012

005055318

Работа выполнена в ГБОУ ВПО «Санкт-Петербургская Государственная педиатрическая медицинская академия» Минздрава России

Научные руководители:

доктор медицинских наук, профессор доктор биологических наук, профессор Николаевна

Официальные оппомспты:

доктор медицинских наук, профессор Максимов Сергей Янович

ФГБУ «Научно-исследовательский институт онкологии имени H.H. Петрова» Минздрава России, руководитель отделения онкогинекологии

доктор биологических наук, профессор Комов Вадим Петрович

ГБОУ ВПО «Санкт-Петербургская Государственная химико-фармацевтическая академия» Минздрава России, заведующий кафедрой биохимии

Ведущая организация:

ГБОУ ВПО «Санкт-Петербургский государственный медицинский университет имени академика И.П. Павлова» Минздравсоцразвития России

Защита диссертации состоится "_"_2012 г. в_часов на заседании

диссертационного совета Д 208.052.01 при Федеральном государственном бюджетном учреждении «Научно-исследовательский институт онкологии имени H.H. Петрова» Министерства здравоохранения Российской Федерации (197758, Санкт-Петербург, Песочный-2, ул. Ленинградская, д. 68)

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке ФГБУ «НИИ онкологии им. H.H. Петрова» Минздрава России по адресу 197758, Санкт-Петербург, Песочный-2, ул. Ленинградская, д. 68.

Пмянитов Евгений Наумович Горбунова Виктория

Автореферат разослан «_»_2012 г.

Ученый секретарь диссертационного совета,

доктор медицинских наук Бахидзе Елена Вилльевна

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность проблемы

Профилактика наследственной патологии является актуальной проблемой и привлекает внимание многих специалистов. Принято выделять две группы превентивных мероприятий, а именно первичную профилактику, направленную на предотвращение рождения ребенка с наследственной патологией, а также вторичную профилактику, предусматривающую меры по минимизации клинических последствий патологических изменений генотипа. Основным методом вторичной профилактики является биохимический скрининг новорожденных. В России на протяжении 15 лет проводится неонатальный скрининг на фенилкетонурию и врожденный гипотиреоз, а с 2006 года в этот перечень включены адреногенитальный синдром, галактоземия и муковисцидоз. Основой первичной профилактики является медико-генетическое консультирование. Однако зачастую врачу приходится проводить ретроспективное консультирование в семье, уже имеющей больного ребенка. Безусловно, проспективное консультирование - наиболее эффективный метод профилактики, и молекулярно-генетический скрининг на носительство наследственных мутаций открывает такую возможность.

Для населения Российской Федерации характерна высокая частота повторяющихся (мажорных) мутаций, обусловленная так называемым «эффектом основателя». Например, единственная мутация в гене BRCA1 - 5382insC - составляет около 90% всех наследственных повреждений этого гена, приводящих к развитию рака молочной железы и яичников [Sokolenko et al., 2007; Grudinina et al., 2005; Suspitsin et al., 2009; Tereschenko et al., 2002]. У 90% пациентов с синдромом Неймегена выявлена делеция 5 пар оснований в экзоне 6 гена NBS1 [The International Nijmegen Breakage Syndrome Study Group, 2000]. Около 52% случаев врожденной и доречевой двусторонней тугоухости в России вызваны мутацией 35delG в гене GJB2, кодирующим коннексин 26 - Сх26 [Зинченко и др., 2007; Таварткиладзе и др., 2010; Журавский и др., 2004]. На сегодняшний день описано более 1700 мутаций в гене CFTR, приводящих к тяжелому наследственному заболеванию -муковисцидозу. Однако у пациентов Европейской части России относительная доля одной мутации - delF508 - составляет от 43% до 53%, а ее популяционная встречаемость находится в пределах от 0,5% до 0,8% [Потапова и др., 1994; Иващенко и др., 2002; Турина и др., 2006; Зинченко и др., 2007]. Частота мутации R408W, приводящей к фенилкетонурии, у российских больных приближается к 60% [Зинченко и др., 2007; Аничкина и др., 2003]. В связи с этим, представляется весьма целесообразным уточнение частоты гетерозиготного носнтельства наиболее значимых мажорных мутаций в популяции Северо-Западного региона России.

Цели п задачи исследования

Цель настоящей работы - оценить целесообразность скринингового обследования здорового населения Северо-Западного региона России на гетерозиготное носительство

повторяющихся мутаций, ассоциированных с наследственными раками и другими моногенными заболеваниями.

В связи с этим были поставлены следующие задачи:

1. Проанализировать встречаемость наследственных опухолевых синдромов и других частых моногенных заболеваний в европейской популяции Российской Федерации и выбрать гены-кандидаты для молекулярно-генетического скрининга.

2. Разработать скрининговые методы тестирования повторяющихся мутаций в генах, ассоциированных с наследственными опухолевыми синдромами и другими моногенными заболеваниями.

3.-Определить частоты гетерозиготного носительства мажорных мутаций в генах, ассоциированных с частыми наследственными заболеваниями, у здоровых жителей Санкт-Петербурга.

4. Проанализировать спектры и частоты мутаций, определяющих развитие основных наследственных заболеваний в Санкт-Петербурге.

Научная иовнзна полученных результатов.

В настоящей работе впервые проведен комплексный анализ встречаемости повторяющихся мутаций, ассоциированных с наследственными опухолевыми синдромами и другими частыми генетическими заболеваниями (мутация 5382тзС в гене В ПСА I, мутация 1100с1е1С в гене СНЕК2, мутация 657(1е15 в гене N881, мутация с!е1Р508 в гене €.¡■111, мутация 11408\У в гене РАН и мутация 35(1еЮ в гене 0./В2) у здоровых жителей Санкт-Петербурга.

Практическая значимость.

Результаты данной работы позволяют обозначить спектр молекулярно-генетических тестов для доклинической диагностики и своевременной профилактики злокачественных новообразований и частой наследственной патологии среди населения России.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Проведение скрининга на гетерозиготное носительство мутаций с1е1Р508 в гене С/-Т/?, мутации Я408\У в гене РАН и мутации 35с1еЮ в гене ОЗВ2 среди супружеских пар, планирующих иметь ребенка, с целью профилактики тяжелых наследственных заболеваний, таких как муковисцидоз, фенилкетонурия и доречевая тугоухость является оправданным.

2. Скрининг мутаций, ассоциированных с наследственным раком молочной железы, целесообразно ограничить группой риска.

3. Аллель-специфическая полимеразная цепная реакция в режиме реального времени является эффективным скрининговым методом для выявления мутаций: <1е1Р508 в гене С/'ТЯ, Ы408АУ в гене РАН, 5382тэС в гене ВКСА1 и 1100с1с!С в гене СНЕК2.

Апробация работы.

Результаты работы были представлены на научно-практических конференциях молодых ученых ГБОУ ВПО «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» «Актуальные вопросы клинической и экспериментальной медицины» (2010—2011 гг.), на заседаниях кафедры медицинской генетики ГБОУ ВПО «Санкт-Петербургская Государственная педиатрическая медицинская академия» Минздравсоцразвития России (2010 - 2012 гг.), а также использованы при разработке методических пособий для учебных курсов.

Публикации.

По материалам диссертации опубликовано 6 работ, из них 2 в журналах, рекомендованных ВАК РФ.

Внедрение в практику.

Результаты исследования внедрены в учебную работу кафедры медицинской генетики ГБОУ ВПО «Санкт-Петербургская Государственная педиатрическая медицинская академия» Минздравсоцразвития России, в практику научной и диагностической работы ФГБУ «НИИ онкологии им. H.H. Петрова» Минздравсоцразвития России.

Структура и объем диссертации

Основное содержание диссертации изложено на 108 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, главы материалов и методов, результатов и обсуждения полученных данных, выводов и списка использованной литературы. Работа иллюстрирована 6 рисунками и 10 таблицами. Библиографичекий указатель включает 186 источников, в том числе 54 отечественных и 132 зарубежных.

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

Материалы и методы

Популянионная выборка

Для настоящей работы материал собирался у 400 здоровых неродственных женщин, проживающих в Санкт-Петербурге. Средний возраст составлял 39 лет (возрастной интервал: 18-55 лет). Источником ДНК были лейкоциты периферической крови.

Выделение ДНК

Забор крови осуществлялся в пробирки, содержащие 0,5М раствор ЭДТА из расчета

5

30 мкл на 1 мл крови. Выделение ДНК из лейкоцитов периферической крови проводилось посредством модифицированного соль - хлороформного метода [Müllenbach et al., 1989]. Раствор ДНК хранился при температуре -20 °С.

Петекиия наследственных мутаций

В исследовании проводился анализ мутаций в генах CFTR, РАН, GJB2, BRCA1, СНЕК2, NBS1.

Детекция мутаций delF508 в гене CFTR, R408W в гене РАН, 5382insC в гене BRCAI, llOOdelC в гене СНЕК2 методом аллель-специфической полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (рис. 1)

Аллель-специфическая ПЦР в режиме реального времени проводилась на приборе "ÍQ5 ¡Cycler" (Bio-Rad Laboratories, USA) и состояла из 45 циклов (денатурация: 15 с при 95°С; отжиг: 30 с при 60°С; синтез: 30 с при 72°С). В состав ПЦР-смеси входили: 1 ед. "hot-start" Taq-полимеразы "Thermostar" («Синтол», Москва), однократный ПЦР буфер, 50 нг ДНК, 1,5 - 3,0 мМ MgCl2, по 200 мкМ каждого из дезоксинуклеотидтрифосфатов (дАТФ, дЦТФ, дГТФ, дТТФ), 100 нМ каждого олигонуклеотида и 20х раствор интеркалирующего красителя SYBR-Green I. Последовательности всех праймеров были подобраны самостоятельно с помощью Интернет-ресурса Gene Bank и программы Gene Runner (табл. 1). Концентрации MgCb и температура отжига праймеров определены эмпирически с целью увеличения специфичности и исключения ошибочных результатов. Специфичность контролировалась по известному нам значению температуры плавления амплифицированных фрагментов (рис. 2).

Рисунок 1. Пример детекции мутации ВКСА1 5382тзС. Красные кривые отражают амплификацию фрагмента с праймерами, специфичными к нормальной последовательности; фиолетовые - амплификацию фрагмента с праймерами, специфичными к мутантной последовательности. В случае гетерозиготы (А) амплификация фрагментов мутантного и нормального аллелей идет с равной эффективностью. В случае нормальной гомозиготы (Б) наблюдается четкое различие в кинетике амплификации между парами праймеров, специфичными к нормальной и мутантной последовательностям.

1\

м 11

\

!1 ;

■ 1 оо \

' ' ' ' 7 8

Рисунок 2. График кривой плавления амплифицированных фрагментов гена В1?СА1 гетерозиготной носительницы мутации ВЯСА1 5382тзС. Известно, что температура плавления специфического продукта 82.5 ± 0.3°С.

Таблица 1.

Последовательности олигонуклеотидов (праймеров), использованных в ПЦР.

Мутация IJpauMep Последовательность

CFTR delF508 common 5'-TTATGGGAGAACTGGAGCCT-3'

wt 5'-TCATCATAGGAAACACCAAAG-3'

mut 5'-TTCATCATAGGAAACACCGAT-3'

РАН R408W common 5'-CTCTAGGGAGGTGTCCGTGT-3'

wt 5'-TAGCGAACTGAGAAGGGCCG-3'

mut 5'-TAGCGAACTGAGAAGGGCCA-3'

GJB 36delG forward ACCGCCCAGAGTAGAAGATG

reverse TGAAGAGGACGGTGAGCCAG

NBS1 657del5 forward 5" -TGATCTGTCAGGACGGCAG-3'

reverse 5'-CATAATTACCTGTTTGGCATTC-3'

СНЕК 2 llOOdelC common 5'-CTGATCTAGCCTACGTGTCT-3'

wt 5'-TTGGAGTGCCCAAAATCAGT-3'

mut 5 '-CTTGGAGTGCCCAAAATC AT-3'

BRCA1 5382insC common 5 '-AGAACCTGTGTGAA AGTATCTAGCACTG-3'

wt 5 '-AAGCGAGCAAGAGAATTCCAG-3'

mut 5' -AGCG AGC A AG AG AATTCCC A-3'

Детекция мутации 657del5 в гене NBS1 методом полгшеразной цепной реакг/ии

Состав смеси для полимеразной цепной реакции был таким же, как описано выше, без добавления флуоресцентных красителей. Для детекции использовалась одна пара праймеров (табл. 1). Условия реакции соответствовали описанным выше. Визуализация амплифицированных фрагментов осуществлялась путем гель-электрофореза в 12% полиакриламидном геле - по разнице длин нормального и мутантного фрагментов (рис. 3).

12 3 4

-»-82 bp +•77 bp

Рисунок 3. Пример детекции мутации КВ81 657с1е15. Пробы 1,2,3 - нормальные гомозиготы, 4 — гетерозигота (мутантный аллель представлен фрагментом меньшей длины).

Детекция мутаций в гене GJB2 с использованием высокоточного анализа кинетики плавления ПЦР-продукта и секвенирования

Геномная ДНК, выделенная из лимфоцитов, была подвергнута амплификации с помощью пары праймеров, фланкирующих фрагмент с мутацией (табл. 1). Состав полимеразной цепной реакции соответствовал описанной выше, с использованием красителя LC Green в концентрации, рекомендованной производителем. Условия амплификации были стандартными, программа плавления заключалась в увеличении температуры на 0,1° с каждым циклом (продолжительностью 2 с) в интервале от 75 до 95°. Анализ плавления выполнялся на приборе CFX-96 «REAL TIME» (Bio-Rad США). Мутации обнаруживали путем выявления температурного сдвига кривой плавления и изменения её формы. Достоверность определения генотипов контрольных образцов была подтверждена секвеннрованием на приборе CEQ 8000 Genetic Analysis System (Beckman Coulter, USA) по протоколам производителя. При секвенировании были использованы те же последовательности праймеров, что и для высокоразрешающего плавления.

Статистическая обработка результатов

Частота идентифицированных мутаций в популяционной выборке рассчитывалась по формуле: р = n/N

где п - число хромосом с мутацией, N - общее число исследованных хромосом.

Частота гетерозиготного носительства мутаций рассчитывали по формуле: Р = гп/М

где ш - число индивидов с мутацией, М - общее число обследуемых

Статистическая обработка полученных данных производилась с использованием пакета программ «STATISTICA 5.0» (StatSoft), программного обеспечения MS Office Excel 2003 (Microsoft). При попарном сравнении частот аллелей в популяционной выборке использовался критерий Фишера. Различия считались статистически значимыми при значении р<0,05. Определение границ значения частоты мутаций (min-f-max) определялось точным методом Фишера.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Спектр повторяющихся наследственных мутаций у здоровых жительниц Санкт-Петербурга

На основании анализа литературы и компьютерных баз данных были определены наиболее частые мутации, приводящие к наследственным заболеваниям в СевероЗападном регионе Российской Федерации. К ним относятся 6 мутаций: delF508 в гене CFTR, R408W в гене РАН, 657del5 в гене NBS1, 35delG в гене GJB2, HOOdelC в гене СНЕК2, 5382insC в гене BRCA1 (табл. 2). Нами была разработана методика их регистрации с помощью ПЦР в режиме реального времени ("real-time PCR") и проведен скрининг среди 400 здоровых жительниц Санкт-Петербурга на носительство данных мутаций. Чаще других, у 9 из 400 женщин (2,25%), обнаруживалась мутация delF508 в гене CFTR. Встречаемость делеции 35delG в гене GJB2 составляла 1,5% (6 из 400 женщин), аллеля R408W в гене РАН- 0,75% (3 из 400), 657del5 в гене NBS1 - 0,5% (2 из 400), llOOdelC в гене СНЕК2 - 0,25% (1 из 400). Мутация 5382insC в гене BRCA1 не была выявлена ни в одном из проанализированных случаев. У 1 из 400 женщин было зарегистрировано одновременно две мутации - delF508 в гене CFTR и R408W в гене РАН. В целом анализируемые наследственные мутации определялись у 5% (20/400) здоровых жительниц Санкт-Петербурга.

При попарном сравнении частот мутаций deIF508, R408W 35delG и 657del5 в изучаемой выборке статистически значимые различия не выявлены. В то время как значение частоты мутаций, ассоциированных с наследственным раком молочной железы и яичников (HOOdelC в гене СНЕК2 и 5382insC в гене BRCA1), достоверно ниже, чем мутации delF508 в гене CFTR, приводящей к муковисцидозу. Также в популяции частота мутации 5382insC в гене BRCA1 достоверно ниже частоты мутации 35delG в GJB2.

Таблица 2

Встречаемость повторяющихся наследственных мутаций у здоровых жительниц Санкт-Петербурга

Заболевание Ген/ Мутация Частота гетерозиготных носительниц Частота мутации Границы значения частоты мутации (гшп-нпах) при 95%-ом доверительном интервале

Муковисцидоз СЕТИ/ аеШ508 1/44 0,011 0,0031-И),023 6

Фенил кетонурия ЯАН/ Я408\У 1/133 0,0037 0,0001+0,012

Нейросенсорная тугоухость 0.1В21 35с1еЮ 1/67 0,0075 0,0014^-0,0183

Синдром Неймеген; рак молочной железы А'£¿7/ 657(1е15 1/200 0,0025 0+0,0098

Рак молочной железы СНЕК2/ 1100с1е1С 1/400 0,001 0,0003+0,0065

Рак молочной железы, рак яичников ввели 5382шзС 0/400 0 0+0,0024

Оценка целесообразности проведения генетического тестирования па наличие мутации (1с1Г508 в гене CFГД среди жителей Санкт-Петербурга

Муковисцидоз — одно из самых частых аутосомно-рецессивных заболеваний среди представителей белой расы. Болезнь обусловлена мутациями в гене СЕТИ, кодирующим хлорный канал апикальных мембран эпителиальных клеток. Муковисцидоз характеризуется системным поражением экзокринных желез эпителия и сопровождается рекуррентными респираторными инфекциями, фиброзным перерастанием тканей поджелудочной железы, нарушением переваривания жира в кишечнике и отставанием в физическом развитии. Частота заболевания в России составляет в среднем 1:11000 [Петрова, 2009].

На международном уровне потенциал преконцепционного скринига для муковисцидоза широко изучен. Многочисленные исследования показали позитивное отношение к идее подобного тестирования со стороны широкой публики, медицинских работников, пациентов и их родственников. В США в марте 2001 года была рекомендована панель на 25 мутаций для скрининга на носительство мутаций в гене муковисцидоза |ХЗгос1у й а1., 2001]. Следует заметить, что данная панель содержала мутации с

относительной частотой 0,1% и более, встречающиеся среди белого населения США. Для скрининга других расовых групп, например афроамериканцев или выходцев из стран Азии, более актуален другой набор мутаций [КЬоигу й а1, 2003]. В выборке российских больных, согласно опубликованным данным, с частотой более 0,1% встречается 10 мажорных мутаций, а именно: (1е1Р508(50%), 394с1е1ТТ(2%), 0542Х(2%), 2143с1е1Т (4%), 2184тзА(3%), W1282X (2%), Ш303К(2%), 3737delA(4%), СГП1с1е121кЬ( 4%), 3849+ЮкЬ (2%). Минорные мутации (1366del5, Я553Х, 552цвА, 1677delTA) в совокупности составляют 4%, неизвестные - 21%. Таким образом, в настоящее время общая выявляемость мутаций в России достигает 79%: с1е!Р508 - 50%, другие мутации - 29% (рис. 4). Для Санкт-Петербурга общая выявляемость мутаций составляет 76%: ёе1Р508 -59%, другие мутации 17% [Иващенко и др., 2002].

РОССИЯ

САНКТ-ПЕТЕРБУРГ

нмгжмт.

МУТЛЦШГ.

яруги» мутации:

Рисунок 4. Распределение мутаций в гене СРТЯ у больных муковисцидозом в России и Санкт-Петербурге.

Нами в тестируемую панель была включена мутация с!е1Р508, поскольку она является основной в нашей популяции, коррелирует с тяжелым течением муковисцидоза и может быть выявлена с использованием простого и недорогого теста.

Мутация delF508 в гене СКШ преобладала в изучаемой выборке - данный генетический дефект был выявлен у 9 (2,25%) из 400 здоровых женщин, соответственно частота мутации составила 0,011 (0,0031-^0,0236 при 95%-ом доверительном интервале). При сравнении собственных и ранее опубликованных данных по Санкт-Петербургу [Потапова и др., 1994] и Москве [Петрова, 2009], а также выборке русских из Тверской, Ростовской и Кировской областей [Зинченко и др., 2007] статистически значимых различий не выявлено. Столь высокая популяционная частота мутации может является аргументом в пользу профилактического тестирования здоровых индивидуумов.

Оценка целесообразности проведения генетического тестирования на наличие мутации 1*408\У в гене РАН среди жителей Санкт-Петербурга

(1р№508: 50'о

ыутпшш; 11«о 1

другие мутации: :9*о

Мутации в гене фенилаланингидроксилазы (РАН) приводят к тяжелому аутосомно-

рецессивному заболеванию — фенилкетонурии (ФКУ), которое при отсутствии специфической диетотерапии проявляется нарушением психо-речевого и физического развития. По данным массового скрининга средняя частота ФКУ среди новорожденных в России составляет 1:8000 [Новиков, 2008].

К настоящему времени выявлено более 400 различных мутаций в гене РАН. На основании анализа данных о разнообразии и частоте мутаций, вызывающих ФКУ в 10 европейских популяциях, можио выделить повсеместное преобладание 5 следующих мутаций: к408\¥, 1*2610,1У810п1546, Я158С> и 1У812пН [ШяепяткЬ й а1.,1992]. Несмотря на существенные межпопуляционные различия в частоте мутаций в гене РАН, мажорной мутацией для жителей Европы является миссенс-мутация 12-го экзона гена РАН—К408\У, приводящая к замене аргинина на триптофан [01Ье11а е1 а1., 1986]. Мутация К408\\' вызывает тяжелую форму ФКУ и снижает активность фермента до 1—2,7%. так как замена аргинина-408 на более объемный триптофан изменяет водородосвязывающую сеть, удерживающую тетрамеризующий и каталитический домены вместе [ОП.еПа й а1., 1986].

Миссенс-мутация 11408\¥ является наиболее распространенной мутацией гена РАН в восточно-европейских популяциях (Польша, Россия, Чехия, Словакия, Венгрия, Болгария), а также в Греции, Ирландии, где она составляет более чем 50% всех мутантных аллелей.

Согласно литературным данным, частота мутации Я408Ш среди больных ФКУ из Санкт-Петербурга достигает 72,1% [Барановская и др., 1996], у пациентов из Москвы -56,4% [Чарикова и др., 1995]. Данная мутация широко распространена в Восточной Европе и странах Балтии, преобладая в Литве, Белоруссии (70%) [Твикегшап й а1., 1996] и Эстонии (84%) [ЦНеуаН й а1., 1995]. Уменьшение с запада на восток градиента частоты мутации 11408\У свидетельствует о ее славянском или балто-славянском происхождении [Скрябин и др., 1990]. Более низкая частота мутации Я408\У в популяциях, расположенных восточнее и юго-восточнее (Самара — 58%, Казань — 51%), указывает на то, что данная мутация была «введена» в азиатские популяции относительно недавней миграцией славян на восток [Барановская и др., 1996]. Частота других мутаций в популяции Восточной Европы является относительно невысокой.

В обследованной нами выборке мутация 1Ы08\\' была выявлена в гетерозиготном состоянии у 3 из 400 здоровых женщин, соответственно частота гетерозиготного носительства составила 1/133 человека, частота мутации 0,0037 (0,0001-^0,012 при 95%-ом доверительном интервале). При сравнении собственных результатов с данными, полученными Р.А. Зинченко в 2007 году на выборке русских из Тверской, Ростовской и Кировской областей, не установлено статистически значимых различий. Суммируя имеющиеся данные, можио сделать заключение о высокой частоте мутация Л408\У в популяции, что в совокупности с её клинической значимостью может быть аргументом в пользу включения данного генетического дефекта в скрининговый тест.

Оценка целесообразности проведения генетического тестирования на наличие мутации 35с1еЮ в гене йЛ}2 среди жителей Санкт-Петербурга

Распространенность врожденной глухоты составляет приблизительно 1 на 1000

новорожденных. Более 50% случаев заболевания в развитых странах обусловлены генетическими причинами, и их относительная пропорция увеличивается со временем [Petersen et al., 2006]. В России 52% заболеваемости врожденной и доречевой двусторонней тугоухостью обусловлены мутацией 35delG в гене GJB2. В большинстве случаев (до 90%) глухонемые дети происходят из семей со здоровыми родителями, причём в этих семьях не отмечается других родственников с нарушением слуха [Блюмина и др., 1981]. В работе НЛО. Некрасовой 2002 года показана преимущественная роль мутации 35delG в этих семьях.

В нашей работе мутация 35delG в гене GJB2 была выявлена у 6 (1,5%) из 400 обследованных женщин, соответственно частота мутации составила 0,0075 (0,0014+0,0183 при 95%-ом доверительном интервале). Полученные данные соответствуют средней частоте носительства делеции по России, которая составляет 1/46,2 [Anichkina et al., 2001], что согласуется с частотой мутации в выборке русских из Тверской, Ростовской и Кировской областей, которая составила 0,0164 [Зинченко и др., 2007]. Однако в работе Журавского С.Г. и соавт. были представлены более высокие показатели встречаемости данного генетического дефекта в группе здоровых жителей Северо-Западного региона России. Вопрос, в какой мере эти различия, которые оказались статистически значимы, связаны с особенностями выборки, а в какой - с особенностями методических подходов -требует дополнительного изучения.

Учитывая установленную популяционную частоту мутации, вероятность встречи носителей измененного гена и рождения у нормально слышащих родителей глухих детей, гомозиготных по данной делеции, в Санкт-Петербурге достаточно высока. Это обстоятельство определяет целесообразность скрингового выявления мутации 35delG в гене GJB2 для профилактики врожденной тугоухости. Ранняя диагностика данного генетического дефекта позволит в ряде случаев своевременно выполнить кохлеарную имплантацию, направленную на предотвращение дальнейших осложнений и обеспечение нормального развития ребенка. Как следует из приведенных данных, анализ всего лишь одной мутации в гене GJB2 при рождении позволяет решить ряд проблем - выявить детей с патологическим генотипом и обеспечить им соответствующую помощь, кроме того, провести консультацию членам семьи в отношении риска повторения заболевания.

Оценка целесообразности проведения генетического тестирования на наличие мутации 657del5 в гене NBS1 среди жителей Санкт-Петербурга

Наряду с ранее рассмотренными заболеваниями, мы включили в панель встречающийся у славян синдром Неймегена (синдром хромосомных поломок Неймеген, Nijmegen breakage syndrome, NBS). Это заболевание характеризуется микроцефалией, комбинированным первичным иммунодефицитом, повышенной чувствительностью к радиоактивному излучению и высокой предрасположенностью к лимфоидным опухолям.

У 90% больных с данным синдромом выявлена делеция 5 пар оснований в 6 экзоне гена NBSI. Частота мутации 657del5 в гене NBS1 среди новорожденных составила 1:154 в Чешской Республике, 1:182 в Украине (Львовская область), 1:190 в Польше, со средней распространенностью 1:177 в славянской популяции Центральной Европы [Varón et al.,

1999]. В ряде исследований были получены данные, свидетельствующие об ассоциации гетерозиготного носительства мутации 657del5 с увеличенным риском развития злокачественных новообразований (чаще рака молочной железы и лимфом) и повышенной чувствительностью к облучению [Hall et al., 1999; Masi et al., 2008; Resnick et al., 2003; Kostyuchenko et al., 2009; Cheung et al., 2006; Кременецкая и др., 2011]. Однако, как и в случае СНЕК2, гетерозиготные дефекты NBS1 характеризуются относительно низкой пенетрантностыо [Steffen et al., 2004; Buslov et al., 2005]. Как следует из приведенных данных, определение носительства мутации 657del5 позволит не только оценить риск болезни у потомства, но и обеспечить раииюю диагностику онкозаболеваний у обследуемого. К тому же, в случае онкологического заболевания носители мутации смогут избежать ионизирующего излучения и получать лечение по модифицированному протоколу.

В нашем исследовании у 2 (0,5%) из 400 женщин была обнаружена мутация 657del5 в гене A'B.S' 1, приводящая к синдрому Неймеген, что соответствует литературным данным по популяционной частоте делеции в Польше, Чехии и Украине. Однако достаточно низкая частота мутации 0,25% (0+0,98% при 95% доверительном интервале) определяет соответственно невысокий риск «гомозиготизации» этой патологии на популяционном уровне, особенно при отсутствии кровнородственных браков (при гетерозиготном носительстве 1/200 вероятность рождения больного ребенка 1/ 160000). Исходя из этого, мы рекомендуем определять данную мутацию только у лиц с онкологическим анамнезом.

Оценка целесообразности генетического тестирования на наличие мутаций 5382insC в гене BRCA1 il llOOdelC в гене СНЕК2 среди жителей Санкт-Петербурга

Наследственные мутации являются причиной 5-10% случаев рака молочной железы (РМЖ). В настоящее время к числу РМЖ-ассоциированных генов относят BRCA1, BRCA2, СНЕК2, NBS1, р53, PALB2 и ATM. При формировании диагностических панелей принимаются во внимание: частота мутации, её пенетрантность, уровень доказательств о причастности к формированию онкологического риска. Наиболее подробно изучена связь наследственных форм РМЖ с мутациями в генах BRCA1 и BRCA2. Дефекты генов BRCA характеризуются высокой пенетрантностыо (до 80%) и широкой географической распространенностью. Как в BRCA1, так и в BRCA2 обнаружено несколько сотен различных мутаций, затрагивающих различные участки этих генов. Во многих странах мира одной из наиболее частых среди больных РМЖ и раком яичника является мутация 5382insC в гене BRCA1. Помимо доказанной высокой пенетрантности [Antoniou et al., 2005], данная мутация характеризуется высокой встречаемостью как при наследственном раке (10%), так и в случайной выборке РМЖ (3.7%) [Sokolenko et al., 2006]. Инсерция одного нуклеотида приводит к сдвигу рамки считывания и преждевременному образованию стоп-кодона в позиции 1829, что повреждает структуру домена BRCT, делая белок более чувствительным к протеолитической деградации и нарушая его функцию как транскрипционного регулятора [Williams et al., 2003].

В отличие от BRCA1 и BRCA2, инактивация гена СНЕК2 увеличивает риск

возникновения РМЖ в несколько меньшей степени (кумулятивный риск возникновения опухоли к 70 годам варьирует от 26% до 57%). В этом гене описаны только наследственные мутации, ассоциированные с РМЖ. Аллель UOOdelC в гене СНЕК2 присутствует у 0,2-1,5% жителей Европы и Северной Америки. Мутация IVS2+1G>A в гене СНЕК2 обнаружена в Польше, Белоруссии, Германии и Северной Америке, в то время как для других стран значимость этого генетического варианта остается неизвестной [Dong et al., 2003; СНЕК2 Breast Cancer Case-Control Consortium, 2004; Bogdanova et al., 2005].

Значимость мутации UOOdelC в гене CHEK2 в российской популяции также велика -несмотря на менее выраженную по сравнению с BRCA1 пенетрантность данного аллеля, его высокая встречаемость позволяет сделать вывод о целесообразности включения в диагностическую панель [СНЕК2 Breast Cancer Case-Control Consortium, 2004; Chekmariova et al., 2006]. По некоторым данным, аллель UOOdelC в гене СНЕК2 может быть причастен к развитию рака в BRCA-негативных семьях с множественными случаями РМЖ, но не рака яичника [Oldenburg et al., 2003]. В крупномасштабных эпидемиологических исследованиях было показано 2,34-кратное увеличение риска развития монолатерального рака молочной железы и 6,43-кратное увеличение риска развития билатеральных карцином у носительниц данного аллеля по отношению к женщинам с нормальным генотипом СНЕК2. [Fletcher et al, 2009; СНЕК2 Breast Cancer Case-Control Consortium, 2004]. Другие мутации CHEK2, вероятно, не вносят существенного вклада в развитие рака молочной железы. [Соколенко и др., 2006; Szymanska-Pasternak et al., 2006].

Принимая во внимание очевидную роль данных мутаций в развитии наследственного рака молочной железы и яичников, нами были проведены исследования по оценке частоты данных мутаций в выборке здоровых женщин из Санкт-Петербурга.

Молекулярно-генетический анализ аллельного варианта 5382insC в гене BRCA1 в выборке здоровых женщин показал очень низкую популяционную частоту данного генетического дефекта. Мутация не была идентифицирована ни у одной из 400 женщин, частота мутации составила 0+0,0024 при 95%-ом доверительном интервале. Мутация UOOdelC в гене СНЕК2 была выявлена у 1 из 400 здоровых женщин в возрасте 40 лет. Соответственно, частота мутации в популяции составила 0,001 (0,0003+0,0065% при 95% доверительном интервале), частота гетерозиготного носительства 1/400. Тот факт, что среди здоровых женщин мутация UOOdelC в гене СНЕК2 встречается чаще, чем мутация 5382insC в гене BRCA1. В то время как в выборке больных РМЖ наблюдается обратное соотношение, по-видимому, объясняется менее выраженной пенетрантностью аллеля UOOdelC в гене СНЕК2 и у части носительниц мутации в гене СНЕК2 РМЖ не развивается. Мы считаем нецелесообразным включать эту мутацию в панель для профилактического тестирования здоровых женщин.

Таким образом, поиск мутаций в генах наследственного РМЖ следует ограничивать прежде всего пациентками с клиническими характеристиками генетической природы онкологического заболевания (ранний возраст на момент диагноза, первично-множественный характер опухолевого процесса, случаи онкологического заболевания в семье). Выявление мутаций в генах BRCA1, BRCA2 и СНЕК2 у самих больных и их

родственников позволяет сформировать группы высокого онкологического риска до появления клинических проявлении заболевания. Кроме того, значимость подобного молекулярного тестирования обусловлена необходимостью модификации лечебных мероприятий, как хирургических, так и терапевтических, для больных с наследственными формами РМЖ и яичников. К настоящему времени накоплено немало данных о том, что BRCAl-ассоциированные опухоли резистентны к таксанам, но в то же время более чувствительны к препаратам платины и PARP-ингибиторам [Byrski et al., 2009; 2008; Kennedy et al., 2004; Fong et al., 2009; Imyanitov et al., 2009]. В первом случае эффект основан на том, что для митотической гибели клеток, вызываемой стабилизаторами микротрубочек (таксаны), необходим нормально функционирующий белок BRCA1. Во втором, напротив, действие ДНК-повреждающих агентов (платина) будет эффективнее в клетках с дефектами ДНК-ренарации. Эти факты неоднократно подтверждены экспериментальными наблюдениями [Tasson et al., 2003; Lafarge et al., 2001; Fedier et al., 2003]. Установлено также, что риск ипси- и контралатеральных метахронных опухолей у носительниц мутаций в генах BRCA1/BRCA2 после органосохраняющих операций значительно выше, чем в случае спорадических опухолей, что необходимо учитывать при оперативном вмешательстве [Garcia-Etienne et al., 2009].

Таким образом, согласно результатам нашего исследования, каждая двадцатая женщина в Санкт-Петербурге является гетерозиготной носительницей мутаций в генах CFTR, РАН и GJB2, которые в гомозиготном состоянии могут стать причиной тяжелых наследственных заболеваний. Полученные данные служат основанием для проведения массового генетического скрининга среди здоровых лиц, вступающих в брак или планирующих беременность, с целью выявления перечисленных генетических дефектов и проведения соответствующих профилактических мероприятий. Напротив, анализ мутаций, ассоциированных с опухолями молочной железы и яичников, продемонстрировал их низкую популяционную частоту. Соответственно, профилактическое тестирование этих мутаций целесообразно ограничить группой онкологических больных и их родственников (рис. 5).

СЕЛЕКТИВНЫЙ СКРИНИНГ

5382!шС в гене ВИСА!

1100(1 е1С в

657(1е15 в гене Л/Ш

гене СНЕК2

МАССОВЫЙ СКРИНИНГ

<1е1Г508 в гене С ГТК

К408\У в гене РАН

35(1 е1С в гене СЗВ2

Рисунок 5. Рекомендуемый алгоритм скрининга «повторяющихся» мутаций.

ВЫВОДЫ

1. Генами-кандидатами для проведения молекулярно-генетического скрининга в европейской популяции Российской Федерации являются С^77?, СУВ2, РАН, ВЯСА1, СНЕК2 и N881.

2. Аллель-специфическая полимеразная цепная реакция представляется эффективным и доступным методом скрининга повторяющихся мутаций.

3. У здоровых жительниц Санкт-Петербурга частота гетерозиготного носительства мажорных мутаций, ассоциированных с наиболее частыми наследственными заболеваниями и онкологическими синдромами, составляет: ёе№508 в гене СРТЯ -2,25%, 35<1еЮ в гене вМ2 - 1,5%, Я408\У в гене РАН - 0,75%, 5382тэС в гене ВЯСА1 - 0%, 1100с1е1С в гене СНЕК2 - 0,25% и 657с1е15 в гене N881 - 0,5%. Эти показатели соответствуют средним данным по России.

4. В выборке здоровых женщин частота гетерозиготного носительства мутаций, ассоциированных с наследственным раком молочной железы и яичников, достоверно ниже, чем мутаций, приводящих к муковисцидозу и наследственной тугоухости (р < 0,05).

5. Тестирование мутаций, ассоциированных с наследственным раком молочной железы (5382твС в гене BRC.AU ПООёеЮ в гене СНЕК2 и 657с1е15 в гене /Ш7), целесообразно ограничить группами риска.

6. Анализ мутаций ёе1Р508 в гене СИТЯ, 35с1еЮ в гене GJB2, Я408\¥ в гене РАН целесообразно рекомендовать здоровым лицам, вступающим в брак или планирующим беременность, с целью профилактики наследственной патологии у потомства.

Симеон работ, опубликованных по теме диссертации

1. Цыбакова Н.Ю., Иевлева А.Г. Частота иосительства мутации NBS1 657del5 среди здоровых женщин в Санкт-Петербурге // «Актуальные вопросы клинической и экспериментальной медицины» Сборник тезисов юбилейной научно-практической конференции молодых ученых - СПб, 2010. - С. 103.

2. Цыбакова H. Ю. Разработка тест-системы для экспресс-диагностики мутаций в генах CFTR и РАН методом реал-тайм ПЦР // Материалы II научно-практической конференции «Новые генетические технологии в медицине», Москва, 2010. - С. 10.

3. Цыбакова Н. Ю., Иевлева А.Г., Соколенко А.П. Частота иосительства мутаций del508F в гене CFTR н R408VV в гене РАН среди здоровых женщин в Санкт-Петербурге // Мед. акад. журн. - 2010. - Т.10. №5. - С. 68.

4. В.Г. Вахарловский,Т.Е. Гембицкая, И.В. Двораковская, B.C. Круглова, НЛО. Цыбакова, А.Г. Черменский, E.H. Имянитов. Муковисцидоз: генетика, клиника, патогенез, диагностика, лечение, профилактика // Методическое пособие для студентов. Издание СПбГПМА, 2011. - 32 с.

5. Цыбакова НЛО., Шабанова Е.С., Ивлева А.Г. Частота иосительства мутации 35delG в гене GJB2 среди здоровых женщин в Санкт-Петербурге // Актуальные вопросы клинической и экспериментальной медицины. Сборник тезисов научно-практической конференции молодых ученых. - СПб, 2011. - С.56.

6. Цыбакова НЛО., Соколенко А.П., Иевлева А.Г., Суспнцын E.H., Пмппитов Е.П. Анализ встречаемости повторяющихся мутаций в генах BRCA1, СНЕК2, NBS1, CFTR, РАН и СХ26 у здоровых жительниц Санкт-Петербурга // MEDLINE.Ru.-2011.-Т. 12.-С. 1329-1341.

БЛАГОДАРНОСТИ

Выражаю огромную благодарность научным руководителям диссертационной работы проф. E.H. Имянитову и проф. В.Н. Горбуновой за постоянное внимание и ценные рекомендации.

Выражаю сердечную признательность сотрудникам кафедры медш/инской генетики ГБОУ ВПО «СПбГПМА» Минздрава России и коллективу лаборатории молекулярной онкологии ФГБУ «НИИ онкологии им. H.H. Петрова» Минздрава России за помощь при проведении исследований и плодотворные обсуждения.

Отдельно благодарю сотрудников лаборатории молекулярной генетики ФГБУ «РосНИИГТ» ФМБА России за постоянную поддержку и понимание.

Подписано в печать 29 октября 2012 г. Формат 60x84/16 Бумага офсетная. Печать офсетная. Уся. печ.л. 1,3. Тираж 100экз. Заказ№ 13/72

Типография «Восстания — 1» 191036, Санкт-Петербург Восстания, 1.

 
 

Оглавление диссертации Цыбакова, Наталья Юрьевна :: 2012 :: Санкт-Петербург

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Виды скрининга

1.2. Основные скринирующие программы для выявления наследственной патологии в России

1.3. Методы выявления носительства рецессивных мутаций, ассоциированных с наследственными заболеваниями

1.4. Мировой опыт молекулярно-генетического скрининга мутаций, ассоциированных с моногенными заболеваниями

1.5. Молекулярно-генетическая и эпидемиологическая характеристика частых наследственных заболеваний

1.5.1 Муковисцидоз

1.5.2 Фенилкетонурия

1.5.3 Нейросенсорная тугоухость— - - —

1.5.4 Проксимальная спинальная атрофия

1.5.5 Синдромы хромосомной нестабильности

1.5.6 Наследственные онкологические заболевания 1.6 Заключение

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Характеристика обследуемой популяционной группы

2.2. Выделение ДНК

2.3. Методы идентификации мутаций

2.3.1. Идентификация мутаций в генах CF77?, РАИ, ВЯСА, СИЕК2, методом аллель-специфической полимеразной цепной реакции в режиме реального времени

2.3.2. Идентификация мутации 657с1е15 в гене М357 методом полимеразной цепной реакции

2.3.3. Идентификация мутаций в гене с использованием высокоточного анализа кинетики плавления ПЦР-продукта и секвенирования

2.4. Статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Спектр мажорных мутаций в исследуемых генах у здоровых жительниц Санкт-Петербурга

3.2. Оценка целесообразности проведения в Санкт-Петербурге генетического скрининга на носительство мажорной мутации с!е1Р508 в гене муковисцидоза \CFTK)

3.3. Оценка целесообразности проведения в Санкт-Петербурге генетического скрининга на носительство мажорной мутации И.408\\^ в гене фенилкетонурии (РАИ)

3.4. Оценка целесообразности проведения в Санкт-Петербурге генетического скрининга на носительство мажорной мутации 657с1е15 в гене синдрома Неймеген

3.5. Оценка целесообразности проведения в Санкт-Петербурге генетического скрининга на носительство мажорной мутации 35с1еЮ в гене врожденной нейросенсорной тугоухости {СЗВ2)

3.6. Оценка целесообразности проведения в Санкт-Петербурге генетического скрининга на носительство мажорных мутаций 5382тзС и 1100с1е1С в генах наследственного рака молочной железы (ВКСА1 и СНЕК2 соответственно)

 
 

Введение диссертации по теме "Онкология", Цыбакова, Наталья Юрьевна, автореферат

Актуальность проблемы

В последние десятилетия профилактика наследственной патологии является проблемой, привлекающей внимание многих специалистов. Выделяют две группы профилактических мероприятий: первичная профилактика, направленная на предотвращение рождения ребенка с наследственной патологией и вторичная, направленная на предотвращение клинических проявлений у лиц с патологическими изменениями генотипа. Основным методом вторичной профилактики является биохимический скрининг новорожденных. В России на протяжении 15 лет проводится неонатальный скрининг на фенилкетонурию и врожденный гипотиреоз, а с 2006 года в программу включены адреногенитальный синдром, галактоземия и муковисцидоз. Основой первичной профилактики является медико-генетическое консультирование. Однако зачастую врачу приходится проводить ретроспективное консультирование в семье, уже имеющей больного ребенка. Безусловно, проспективное консультирование - наиболее эффективный метод профилактики, и молекулярно-генетический скрининг на носительство наследственных мутаций открывает такую возможность. Применение данного диагностического подхода может способствовать снижению количества наследственных заболеваний в России.

Для населения Российской Федерации характерна высокая частота повторяющихся мутаций, обусловленная, так называемым, «эффектом б основателя». Например, единственная мутация в гене BRCA1 - 5382insC -составляет около 90% всех наследственных повреждений этого гена [Sokolenko А.Р. et al., 2007; Grudinina N.A. et al., 2005; Suspitsin E.N. et al., 2009; Tereschenko I.V. et al., 2002]. У 90% пациентов с синдромом Неймегена выявлена делеция 5 пар оснований в экзоне 6 гена NBSI [The International Nijmegen Breakage Syndrome Study Group, 2000]. Около 52% случаев врожденной и доречевой двусторонней тугоухости в России вызваны мутацией 35delG в гене GJB2, кодирующем коннексин 26 - Сх26 [Зинченко P.A. и др., 2007; Таварткиладзе Г.А. и др., 2010; Журавский С.Г. и др., 2004]. На сегодняшний день описано более 1700 мутаций в гене CFTR, приводящих к тяжелому наследственному заболеванию - муковисцидозу. Однако у пациентов Европейской части России относительная доля одной мутации - delF508 составляет от 43% до 53%, а ее популяционная частота варьирует от 0,5% до 0,8% [Потапова О.Ю., 1994; Иващенко Т.Э. и др., 2002; Турина И.В. и др., 2006; Зинченко P.A. и др., 2007]. Частота мутации R408W, приводящей к фенилкетонурии, у российских больных составляет около 60% [Зинченко P.A. и др., 2007; Аничкина A.A. и др., 2003]. Однако, масштабных скрининговых исследований, позволяющих оценить популяционную частоту данных мутаций, в России не проводилось. В связи с этим, определение частоты гетерозиготного носительства наиболее значимых мажорных мутаций в популяции Северо-Западного региона России представляется весьма целесообразным.

Цели и задачи исследования

Цель настоящей работы - оценить целесообразность скринингового 7 обследования здорового населения Северо-Западного региона России на гетерозиготное носительство повторяющихся мутаций, ассоциированных с наследственными опухолевыми синдромами и другими моногенными заболеваниями.

В связи с этим были поставлены следующие задачи:

1. Проанализировать встречаемость наследственных опухолевых синдромов и других частых моногенных заболеваний в европейской популяции Российской Федерации и выбрать гены-кандидаты для молекулярно-генетического скрининга.

2. Разработать скрининговые методы тестирования повторяющихся мутаций в генах, ассоциированных с наследственными опухолевыми синдромами и другими моногенными заболеваниями.

3. Определить частоты гетерозиготного носительства мажорных мутаций в генах, ассоциированных с частыми наследственными заболеваниями, у здоровых жителей Санкт-Петербурга.

4. Проанализировать спектры и частоты мутаций, определяющих развитие основных наследственных заболеваний в Санкт-Петербурге.

Научная новизна полученных результатов.

В настоящей работе впервые проведен комплексный анализ встречаемости повторяющихся мутаций, ассоциированных с наследственными опухолевыми синдромами и другими частыми генетическими заболеваниями (мутация

5382шбС в гене ВЯСА1, мутация ПООёеЮ в гене СНЕК2, мутация 657ёе15 в гене N681, мутация с!е1Р508 в гене СБТЯ, мутация R408W в гене РАН и мутация 35ёеЮ в гене 0Ш2) у здоровых жителей Санкт-Петербурга.

Практическая значимость.

Результаты данной работы позволяют обозначить спектр молекулярно-генетических тестов для доклинической диагностики и своевременной профилактики злокачественных новообразований и частой наследственной патологии среди населения России.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Проведение скрининга на гетерозиготное носительство мутации ёе1Р508 в гене СБТЯ, мутации 11408\¥ в гене РАН и мутации 35с1еЮ в гене вШ2 среди супружеских пар, планирующих иметь ребенка, с целью профилактики тяжелых наследственных заболеваний, таких как муковисцидоз, фенилкетонурия и доречевая тугоухость является оправданным.

2. Скрининг мутаций, ассоциированных с наследственным раком молочной железы, целесообразно ограничить группой риска.

3. Аллель-специфическая полимеразная цепная реакция в режиме реального времени является эффективным скрининговым методом для выявления мутаций: с!е1Р508 в гене СПЯ, Л408\¥ в гене РАН, 5382шбС в гене ВЯСА1 и 1100с1е1С в гене СНЕК2.

Апробация работы.

Результаты работы были представлены на научно-практических конференциях молодых ученых ГБОУ ВПО «Северо-Западный государственный медицинский университет имени И.И. Мечникова» «Актуальные вопросы клинической и экспериментальной медицины» (20102011 гг.), на заседаниях кафедры медицинской генетики ГБОУ ВПО «Санкт-Петербургская Государственная педиатрическая медицинская академия» Минздрава России (2010 - 2012 гг.), а также использованы при разработке методических пособий для учебных курсов.

Публикации. По материалам диссертации опубликовано 6 работ, из них 2 в журналах, рекомендованных ВАК РФ.

Внедрение в практику.

Результаты исследования внедрены в учебную работу кафедры медицинской генетики ГБОУ ВПО СПбГПМА Минздрава России, в практику научной и диагностической работы ФГБУ «НИИ онкологии им. H.H. Петрова» Минздрава России.

Структура и объем диссертации

Диссертация изложена на 108 страницах и состоит из введения, глав материалов и методов, результатов и обсуждения полученных данных и выводов. Работа иллюстрирована 6 рисунками и 10 таблицами. Библиографичекий указатель включает 186 источников, в том числе 54 отечественных и 132 зарубежных.

 
 

Заключение диссертационного исследования на тему "СКРИНИНГ "ПОВТОРЯЮЩИХСЯ" МУТАЦИЙ, АССОЦИИРОВАННЫХ С НАСЛЕДСТВЕННЫМИ ОПУХОЛЕВЫМИ СИНДРОМАМИ И ДРУГИМИ МОНОГЕННЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ"

ВЫВОДЫ

1 Генами-кандидатами для проведения молекулярно-генетического скрининга в европейской популяции Российской Федерации являются СГТЯ, РАН, В11СА1,СНЕК2 иКВ81.

2 Аллель-специфическая полимеразная цепная реакция представляется эффективным и доступным методом скрининга повторяющихся мутаций.

3 У здоровых жительниц Санкт-Петербурга частота гетерозиготного носительства мажорных мутаций, ассоциированных с наиболее частыми наследственными заболеваниями и онкологическими синдромами, составляет: ёе1Р508 в гене СПЯ - 2,25%, 356еЮ в гене С1В2 - 1,5%, К408\¥

80 в гене РАН - 0,75%, 5382тБС в гене ВЯСА1 - 0%, 1100с1е1С в гене СНЕК2 -0,25% и 657ёе15 в гене ИВ81 - 0,5%. Эти показатели соответствуют средним данным по России.

4 В выборке здоровых женщин частота гетерозиготного носительства мутаций, ассоциированных с наследственным раком молочной железы и яичников, достоверно ниже, чем мутаций, приводящих к муковисцидозу и наследственной тугоухости (р < 0,05).

5 Тестирование мутаций, ассоциированных с наследственным раком молочной железы (5382тэС в гене ВЯСА1, 1100с1е1С в гене СНЕК2 и 657с1е15 в гене N681), целесообразно ограничить группами риска.

6 Анализ мутаций с1е1Р508 в гене СБТЯ, 35с1еЮ в гене С1В2, R408W в гене РАН целесообразно рекомендовать здоровым лицам, вступающим в брак или планирующим беременность, с целью профилактики наследственной патологии у потомства.

3.7. Заключение

Анализ распространенности патологических мутаций в популяции ориентирован прежде всего на развитие методов профилактики наследственной патологии. В нашем исследовании внимание было сфокусировано на оценке частоты гетерозиготного носительства 6 мажорных рецессивных патологических мутаций среди здоровых жительниц Санкт-Петербурга.

Согласно результатам нашего исследования, каждая 20 женщина в Санкт

Петербурге является гетерозиготной носительницей мутаций в генах CFTR,

РАН и GJB2, которые в гомозиготном состоянии могут стать причиной тяжелых наследственных заболеваний. Полученные данные служат основанием для проведения массового генетического скрининга среди здоровых лиц, вступающих в брак или планирующих беременность, с целью выявления перечисленных генетических дефектов и проведения соответствующих профилактических мероприятий. Напротив, анализ мутаций, ассоциированных

79 с РМЖ и яичников, в выборке здоровых женщин продемонстрировал их низкую популяционную частоту. Соответственно, профилактическое тестирование этих мутаций целесообразно ограничить группой больных РМЖ и их родственников (рис. 6).

Рисунок 6. Рекомендуемый алгоритм скрининга «повторяющихся» мутаций.

 
 

Список использованной литературы по медицине, диссертация 2012 года, Цыбакова, Наталья Юрьевна

1. Алексеенко С.Н., Самойлова Т.Н., Протопопова Н.В., и др. Неонатальный скрининг на фенилкетонурию в Иркутской области // Современные технологии в педиатрии и детской хирургии: Тез. III Всерос. конгр,- М., 2004,- С.85.

2. Аничкина A.A., Гаврилюк А.П., Тверская С.М., и др. Анализ наиболее часто встречающихся мутаций в гене фенилаланингидроксилазы у больных фенилкетонурией. // Медицинская генетика. 2003. - Т.2, №4. -С. 175- 181.

3. Аничкина A.A., Гаврилюк А.П., Тверская С.М., и др. Анализ наиболее часто встречающихся мутаций в гене фенилаланингидроксилазы у больных фенилкетонурией // Медицинская генетика. 2003. - Т.2, №4. -С.175 - 181.

4. Ахметова В.Л., Викторова Т.В., Мурзабаева С.Ш.и др. Анализ мутаций гена фенилаланингидроксилазы у больных фенилкетонурией из Башкортостана / // Медицинская генетика. 2003. - Том 2,N 4 . - С. 182187.

5. Баранов B.C., Кузнецова Т.В., Иващенко Т.Э. и др. Современные алгоритмы пренатальной диагностики наследственных заболеваний: методические рекомендации СПб.: Изд-во Н-Л, 2009. - 80 с.

6. Барановская С.С. Молекулярно-генетический анализ фенилкетонурии в Санкт-Петербурге: Автореф. дисс. на соискание уч. степени к.б.н. -Санкт-Петербург, 1996.

7. Барашков H.A., Тетюрин Ф.М., Сухомясова A.J1. Анализ распространенности мутации 35delG гена GJB2 у пациентов с нейросенсорной тугоухостью в Якутии // Наука и образование. 2006. -Т.42., №2. - С.129-133.

8. Блюмина М.Г., Московкина А.Г.Этиология нейросенсорной тугоухости у детей, имеющих родителей с нормальным слухом // Вестник оториноларингологии. 1981. - №3. - С.21-25.

9. Бочков Н.П. Клиническая генетика: Учебникю-З-е изд., испр. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2006. - 480 с.

10. Быкова A.B., Петрова Е.Г., Ястребцева E.H. Результаты ДНК-диагностики семей, имеющих больных с фенилкетонурией в Архангельской области // Современные технологии в педиатрии и детской хирургии: Тез. IV Всерос. конгр. М., 2005. - С.65-66.

11. П.Гембицкая Т.Е., Петрова М.А., Куприна Е.А., и др. Фенотипические и иммунологические особенности облигатных гетерозиготных носителей гена муковисцидоза // Пульмонология. 2001. - N 3. - С. 65-68.

12. Голубцов В.И., Рукавичкин Д.В., Морданов C.B., и др. Редкие мутации гена CFTR у больных муковисцидозом в Краснодарском крае // Медицинская генетика. 2007. - Том 6,N 9 . - С. 23-25.

13. Турина, И.В. Частота выявления мутации delF508 гена муковисцидоза в популяции города Новосибирска и ее связь с различными видами патологии // Бюллетень Сибирского отделения РАМН. 2006. -Вып.4(122). - С. 141-142.

14. Денисенкова Е.В., Бочков Н.П., Калиниченко Н.Ю., и др. Результаты скрининга новорожденных на наследственные болезни в г. Москве // Медицинская генетика. 2008. - Т.7, №6. - С.3-12.

15. Джемилева Л.У., Хуснутдинова Э.К., Хидиятова И.М. Наследственная нейросенсорная тугоухость/глухота // ДНК-диагностика и профилактика наследственной патологии в Республике Башкортостан / Под ред. проф.Э.К.Хуснутдиновой.-Уфа: Китап, 2005. 204с.

16. Журавский С.Г., Тараскина А.Е., Сетхияасиилиани Т.К. и др. Молекулярно-генетические аспекты прелингвальной сенсоневральной тугоухости // Рос. оторинолар. -2004. -Т.4, №11 С.42-44.

17. Захарова Е.Ю. Программы массового скрининга: технические, социальные и этические вопросы. Перевод // Медицинская генетика. -2006.-№3.-С.21-23

18. Зинченко P.A., Ельчинова Г.И., Галкина В.А. и др. Дифференциация этнических групп России по генам наследственных болезней // Медицинская генетика. 2007. - Т. 6, №2 (56). - С. 29-37.

19. Иващенко Т.Э. Муковисцидоз: молекулярно-генетический анализ гена, разработка новых подходов диагностики и терапии: Автореф. дис. докт. биол. наук. М., 2000. 46 с.

20. Иващенко Т.Э., Баранов B.C. Биохимические и молекулярно-генетические основы патогенеза муковисцидоза. СПб.: Интермедика, 2002 -256с.

21. Имянитов E.H. Скрининг для лиц с наследственной предрасположенностью к раку // Практическая онкология 2010. - Т. 11.-№2. -С. 102-109.

22. Имянитов E.H., Хансон К.П. Молекулярная онкология: клинические аспекты. С.Петербург: Печатный дом МАПО. 2007. - 210 с.

23. Капранов Н. И., Радионович А. М., Каширская Н. Ю. и др. Муковисцидоз: современные аспекты диагностики и лечения // Клиницист. 2006. - № 4. -С. 42-51.

24. Кобцева Н.М., Аксянова Х.Ф., Сотникова Е.А. Результаты неонатального скрининга на фенилкетонурию в Нижегородской области // Медицинская генетика. 2003. - Т. 2, № 10. - С. 421.

25. Козлова С.И., Демикова Н.С. Наследственные синдромы и медико-генетическое консультирование// атлас-справочник. 3-е изд., перераб. и дополн. М.:Т-во научных изданий КМК; авторская академия, 2007. -448 с.

26. Корытина Г. Ф., Викторова Т. В., Байкова Г. В., и др. Анализ спектра мутаций и полиморфных локусов гена трансмембранного регуляторногобелка муковисцидоза в Башкортостане // Генетика. 2002. - Том 38,N 9. -С. 1270-1275.

27. Кременецкая О.С., Асеева Е.А., Неверова A.J1., и др. Генетическая предрасположенность к лейкозам, возникающим после применения противоопухолевой терапии: анализ данных литературы. // Клиническая онкогематология. 2011. - №2. - С. 111-119.

28. Максимова С.П., Раннее выявление и лечение фенилкетонурии залог высокой психической и физической реабилитации // Медико-генетическое консультирование в профилактике наследственных болезней: Тез. докл. Рос. науч.-практ. конф. - М., 1997. - С. 165.

29. Маркова Т.Г. Клинико-генетический анализ врожденной и доречевой тугоухости: автореф. дисс. доктора медицинскихнаук: 14.00.04, 03.00.15 , 2008, 42 с.

30. Маркова Т.Г. Организация медико-генетического консультирования в отношении наследственных нарушений слуха // Вестник оториноларингологии. 2009. -№ 1. - С.34—36.

31. Маркова Т.Г., Некрасова Н.В., Шагина И.А., и др. Генетический скрининг среди детей с врожденной и ранней детской тугоухостью // Вестник оториноларингологии. 2006. - № 4. - С.9-14.

32. Некрасова Н.Ю., Шагина H.A., Поляков A.B. Молекулярно-генетическое обследование слабослышащих и глухих детей // Новости оторинолар. и логопатол. 2002. - №1 (29). - С.82- 83.

33. Николаева Е.Б., Филиппенко Г.И., Никитина Н.В. и др. Организация медико-генетической службы в Свердловской области // Медицинская генетика. 2005. - Т. 4. - № 5. - С. 239.

34. Новиков П.В. Наследственная патология в структуре болезней детского возраста и организация медико-генетической помощи детям в Российской Федерации // Медицинская генетика. 2008. - Т.7, № 12 (78). - С.З - 7.

35. Ондар Э.А., Сат А.О., Омзар О.С. и др. Анализ мутаций гена фенилаланингидроксилазы у больных фенилкетонурией из Республики Тыва // Медицинская генетика. 2005. - Т. 4. - № 5. - С. 243.

36. Осипова Е.В. Итоги обследования новорожденных на ФКУ в Удмуртской республике за 10 лет (1994-2003 гг.) // Медицинская генетика. 2005. - Т. 4, № 5.-С. 244.

37. Петрова Н.В. Изучение взаимосвязи СРТЯ-генотипа и фенотипа у российских больных муковисцидозом // Медицинская генетика. 2007. -Том 6, N 12 . - С. 22-29.

38. Петрова Н.В., Гинтер Е.К. Определение частоты мутации с!е1Р508 среди новорожденных города Москвы и оценка частоты муковисцидоза в Европейской части России // Генетика. 1997. - Т.ЗЗ, №9. - С. 1326 -1328.

39. Петрова Н.В., Гинтер Е.К., Капранов Н.И., и др. Доля некоторых мутаций гена муковисцидоза и неравновесие по сцеплению между локусами СРТЯ-гена и двумя ДНК-маркерными локусами в популяциях России / // Генетика. 1994. - Т.30,№ 7. - С. 974-977.87

40. Петрова Н.В., Тимковская Е.Е., Зинченко P.A., и др. Анализ частоты некоторых мутаций в гене CFTR в разных популяциях России // Медицинская генетика. 2006. - № 2. - С. 28-31.

41. Печенина Г.В., Середа O.A., Мурзабаева С.Ш. и др. Анализ неонатального скрининга на фенилкетонурию и врожденный гипотиреоз в Республике Башкортостан // Медицинская генетика. 2005. - Т. 4, №6. -С. 251.

42. Поляков A.B. Стратегия идентификации генетических локусов при гетерогенных менделирующих наследственных заболеваниях //Автореф. дисс. . докт. биол. наук: 03.00.26 молекулярная генетика.-Москва, 2002.-47с.

43. Потапова О.Ю. Молекулярно-генетический анализ кистозного фиброза в России: автореф. дисс. . канд. биол. наук. С.-Петербург: НИИЭМ РАМН. -1994.-21 с.

44. Скрябин Б.В., Хальчицкий С.Е., Кузьмин А.И., и др. Определение мутационных повреждений в гене ФАГ среди больных в Латвии. // 2 Всесоюз. съезд мед. ген.: Тез. докл. — Алма-Ата, 1990. - С. 401.

45. Степанова A.A. Исследование молекулярно-генетической природы фенилкетонурии в выборках российских больных: автореф. дисс. кандидата биологических наук: 03.00.15 , 2005, 136 с.

46. Степанова A.A., Тверская С.М., Поляков A.B., Различные типы ФКУ и методы их диагностики // Медицинская генетика. 2006. -Т. 5. Приложение 1. - С.25-29.

47. Строганова И.А., Мирошникова И.В. и др. Скринирующая программа в лечении больных фенилкетонурией в Ставропольском крае // Современные мед. технологии. Новосибирск, 1999. - С.337-339.

48. Таварткиладзе Г.А., Поляков A.B., Маркова Т.Г., и др. Генетический скрининг нарушений слуха у новорожденных, сочетанный с аудиологическим скринингом // Вестник оторинолар. 2010. - №.3. -С.15-18.

49. Таскина H.H., Цыпченко О.В., Никонов A.M. Неонатальный скрининг на наследственные болезни в Алтайском крае // Генетика человека и патология. Томск,- 2007. - С.303- 304.

50. Толстова В.Д., Каширская Н.Ю., Капранов Н.И. Массовый скрининг новорожденных на муковисцидоз в России // Фарматека. 2008. - №1. -С.1-5.

51. Чарикова Е.В. Изучение спектра точечных мутаций в гене ФАГ у больных фенилкетонурией в Москве и Московской области: Автореф. дисс. на соискание уч. степени к.б.н. — 1995. — Москва.

52. Шокарев P.A., Амелина С.С., Зинченко P.A., и др. Роль мутации 35delG в возникновении наследственных форм нейросенсорной глухоты в

53. Ростовской области //Медицинская генетика. 2006. - Т.5. Приложение 1. -С.38-43.

54. Abdel-Rahman W.M., Mecklin J.P., РекотдЫ P. The genetics of HNPCC: application to diagnosis and screening // Crit. Rev. Oncol. Hematol. 2006. -Vol.58.-P.208-220.

55. Abe S., Usami S., Shinkawa H.et al. Prevalent connexin 26 gene (GJB2) mutations in Japanese // J Med Genet. 2000. - Vol.37. - P.41-43.

56. Alessandra di Masi and Antonio Antoccia NBS1 Heterozygosity and Cancer Risk // Curr Genomics. 2008. - Vol. 9, №4. - P. 275-281.

57. Anderman A., Blancquaert 1. Genetic screening // Canadian Family Physician 2010,-Vol 56. -P.333 - 339.

58. Anhuf D., Eggermann Т., Rudnik-Schoneborn S., et al. Determination of SMN1 and SMN2 copy number using TaqMan technology. // Hum Mutat. -2003 Vol.22.-P. 74-78.

59. Anichkina A., Kulenich Т., Zinchenko S.et al. On the origin and frequency of the 35delG allele in GJB2-linked deafness in Europe // Eur. J. Hum. Genet. -2001.-Vol.9.-P. 151.

60. Antoniadi Т., Pampanos A., Petersen M.B. Prenatal diagnosis of prelingual deafness: carrier testing and prenatal diagnosis of the common GT02 35delG mutation //Prenat. Diagn. 2001.-Vol.21.-P. 10-13.

61. Antoniadi Т., Rabionet R., Kroupis C.et al. High prevalence in the Greek population of the 35delG mutation in the connexin 26 gene causing prelingual deafness // Clin. Genet. 1999. -Vol.55. - P.381 -382.

62. Arkblad E., Tul mius M., Kroksmark A.K., et al. A population-based study of genotypic and phenotypic variability in children with spinal muscular atrophy // Acta Paediatrica. 2009. - Vol.98. -P. 865-872

63. Arkblad E.L., Darin N., Berg K., et al. Multiplex ligation-dependent probe amplification improves diagnostics in spinal muscular atrophy. // Neuromuscul Disord. 2006. - Vol. 16. - P. 830-838.

64. Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology электронный ресурс. Доступ: http //atlasgeneticsoncology org//Kprones/FA10001 html

65. Balanovsky O., Rootsi S., Pshenichnov A., et al. Two sources of the Russian patrilineal heritage in their Eurasian context // Am. J. Hum. Genet. 2008. -Vol. 82. - P.236-50.

66. Baris H.N., Kedar I., Halpern G.J., et al. Prevalence of breast and colorectal cancer in Ashkenazi Jewish carriers of Fanconi anemia and Bloom syndrome // Isr Med Assoc J. 2007. - Vol. 9, №12 - P. 847-50.

67. Basel-Vanagaite L., Taub E., Drasinover V., et al. Genetic carrier screening for spinal muscular atrophy and spinal muscular atrophy with respiratory distress 1 in an isolated population in Israel // Genet. Test. 2008. - Vol.12. - P. 53-56.

68. Bicego M., Beltramello M., Melchionda S .et al. Pathogenetic role of the deafness-related M34T mutation of Cx26 // Hum.Mol.Genet. 2006. -Vol.15. -P. 2569 -2587.

69. Bickel H., Bachman C., Beckers R. Neonatal mass screening for metabolic disoders. // Eur. J. Pediatr. 1981. —Vol. 137.-P. 133-139.

70. Bitner-Glindzicz M. Hereditary deafness and phenotyping in humans // Br. Med. Bull. 2002. - Vol.63. - P.73-94.

71. Bolz H., Schade G., Ehmeretal S. Phenotypic variability of non-syndromic hearing loss in patients heterozygous for both c.35delG of GJB2 and the 342kb deletion involving GJB6 // Hear.Res. 2004. -Vol.188. - P.42-46.

72. Brook M. A. Clinicians View of Neuromuscular Diseases. Baltimore: Williams and Williams, 1986.

73. Burglen, L., Lefebvre, S., Clermont, O., et al. Structure and organization of the human survival motor neuron (SMN) gene // Genomics. -1996 -Vol.32 P. 479-482.

74. Buslov K.G., Iyevleva A.G., Chekmariova E.V., et al. NBS1 657del5 mutation may contribute only to a limited fraction of breast cancer cases in Russia // Int. J. Cancer. 2005. - Vol.114. - P.585 -589.

75. Carney J.P., Maser R.S., Olivares H. et al. // Rad 50 protein complex and Nijmegen breakage syndrome: linkage of double-strand break repair to the cellular DNA damage response // Cell. — 1998. — Vol. 93, № 3. — P. 477486.

76. Chekmariova E.V., Sokolenko A.P., Buslov K.G., et al. CHEK2 IlOOdelC mutation is frequent among Russian breast cancer patients // Breast. Cancer. Res. Treat. 2006. - Vol. 100. - P.99-102.

77. Cheung V.G., Ewens W.J. Heterozygous carriers of Nijmegen Breakage Syndrome have a distinct gene expression phenotype // Genome Research. -2006 Vol. 16, № 8, - P. 973-979.

78. Chillôn M., Casals T., Mercier B., et al. Mutations in the cystic fibrosis gene in patients with congenital absence of the vas deferens // N. Engl. J. Med. 1995. -V.332.-P. 1475-1480.

79. Chu C.S., Trapnell B.C., Curristin S., et al. Genetic basis of variable exon 9 skipping in cystic fibrosis transmembrane conductance regulator mRNA // Nat Genet. 1993.-V. 3. - P. 151-156.

80. Cleary S.P., Zhang W., Di Nicola N., et al. Heterozygosity for the M(Ash) mutation and cancer risk // Cancer Res. 2003 - Vol.63. - P. 1769-71.

81. Cryns K., Orzan E., Murgia A.et al. A genotype-phenotype correlation for GJB2 (connexin 26) deafness//J. Med. Genet. 2004. - Vol.41.-P. 147- 154.

82. Cusco I., Barcelo M.J., Baiget M., Implementation of SMA carrier testing in genetic laboratories: comparison of two methods for quantifying the SMN1 gene // Hum. Mutat. 2002. - Vol. 20. - P.452-459.

83. Denoyelle F., Weil D., Maw M.A.et al. Prelingual deafness: high prevalence of a 30delG mutation in thy connexin 26 gene // Hum. Mol. Genet. 1997. -Vol.6.-P.2173 - 2177.

84. Dent R., Warner E. Screening for hereditary breast cancer // Semin. Oncol. -2007.-Vol.34.-P.392-400.

85. DiLella A. G., Kwok S. C., Ledley F. D. et al. Molecular structure and polymorphic map of the human phenylalanine hydroxylase gene. // Biochemistry. 1986. - Vol. 25. - P. 743-749.

86. Dorfman R., Sandford A., Taylor C. et al. Complex two-gene modulation of lung disease severity in children with cystic fi'oiosis /7 J. Clin. Invest. -2008. -Vol. 118, №3,-P. 1040-1048.

87. Dork T., Wulbrand U., Richter T., et al. Cystic fibrosis with three mutations in the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator gene / // Hum. Genet. 1991.-Vol.87.-P.441-446.

88. Dork T., MaceK M. Jr., Mekus F. et al. Characterization of a novel 21-kb deletion, CFTRdele2,3(21 kb), in the CFTR gene: a cystic fibrosis mutation of Slavic origin common in Central and East Europe // Hum. Genet. 2000. -Vol. 106.-P. 259-268.

89. Drumm M.L., Konstan M.W., Schluchter M.D. et al. Genetic Modifiers of Lung Disease in Cystic Fibrosis. // N. Engl. J. Med. 2005. - Vol.6, №353 (14). P. 1443-1453.

90. Dubowitz, V. Muscle Disorders in Childhood. -Philadelphia: W.B. Saunders, 1978.

91. Eisensmith R.C., Okano Y., Dasovich M. et al. Multiple origins for phenylketonuria in Europe //Am. J. Hum. Genet, 1992. -Vol.51, №6. - P. 1355-1365.

92. Emery A. E.H. The nosology of spinal muscular atrophies. // J. Med. Genet. -1971.-Vol. 8. P.481-495.

93. Estivill X., Fortina P., Surrey S.et al. Connexin-26 mutations in sporadic and inherited sensorineural deafness // Lancet. 1998. - Vol.351. - P.394-398.

94. Fares F., Badarneh K., Abosaleh M., et al. Carrier frequency of autosomal-recessive disorders in the Ashkenazi Jewish population: should the rationale for mutation choice for screening be reevaluated? // Prenat Diagn. 2008 - Vol.28. - P.236-41.

95. Ferla R., Calo V., Cascio S., et al. Founder mutations in BRCA1 and BRCA2 genes // Ann. Oncol. -2007. Vol. 18. - P.93 - 98.

96. Gasparini P., Raboinet R., Barbujani G. et al. High carrier freguency of 35delG deafness mutation in European populations // Eur. J. of Hum. Genet -2000. -Vol.8.-P. 19-23.

97. German J. Bloom's syndrome// Dermatol. Clin. 1995 - Vol. 13. - P. 7-18.

98. German J., Sanz M.M., Ciocci S., et al. Syndrome-causing mutations of the BLM gene in persons in the Bloom's Syndrome Registry // Hum Mutat. 2007 -Vol.28-P. 743-53.

99. Godard B., Kate L., Evers-Kiebooms G., et al. Population genetic screening programmes: principles, techniques, practices, and policies // European Journal of Human Genetics. 2003. - Vol. 11, №2. - P.49-87.

100. Goss K.H., Risinger M.A., Kordich J.J., et al. Enhanced tumor formation in mice heterozygous for Blm mutation // Science. 2002. - Vol.297 - P.2051-3.

101. Grody W.W. Molecular Genetic Risk Screening // Annual Review of Medicine 2003 - Vol. 54. - P. 473-490.

102. Grody W.W., Cutting G.R., Klinger K.W., et al. Laboratory standards and guidelines for population based cystic fibrosis carrier screening // Genet Med. -2001.-Vol.3.-P. 149-1543.

103. Gruber S.B., Ellis N.A., Scott K.K., et al. BLM heterozygosity and the risk of colorectal cancer// Science. -2002. -Vol. 297. -P.2013.

104. Grudinina N.A., Golubkov V.l., Tikhomirova O.S., et al. Prevalence of widespread BRCA1 gene mutations in patients with familial breast cancer from St. Petersburg // Russ. J. Genet. 2005. - Vol.41. - P.318-322.

105. Hall J., Radiation A.S. DNA damage and cancer // Mol Med Today. 1999 -Vol.5, №4.-P. 157-64.

106. Hendrickson B.C., Donohoe C., Akmaev V.R., et al. Differences in SMN1 allele frequencies among ethnic groups within North America // J Med Genet. -2009-Vol.46.-P. 641-644.

107. Iyevleva A.G., Suspitsin E.N., Kroeze K., et al. Non-founder BRCA1 mutations in Russian breast cancer patients // Cancer Lett. 2010. - Vol.298. - P.258-63.

108. Jedrzejowska M., Borkowska J., Zimowski J., et al. Unaffected patients with a homozygous absence of the SMN1 gene // Eur J Hum Genet. 2008. Vol. 16. -P.930-934.

109. Kaback M.M. Population-based genetic screening for reproductive counseling: the Tay-Sachs disease model // Eur. J. Pediatr. 2000. - Vol.159, № 3 -P. 192-195.

110. Kehoe S.M., Kauff N.D. Screening and prevention of hereditary gynecologic cancers // Semin. Oncol. 2007. - Vol.34. - P.406-410.

111. Kelley P.M., Harris D.J., Comer B.C., et al. Novel mutations in the Connexin 26 gene (GJB2) that cause autosomal recessive (DFNB1) hearing loss // Am. J. Hum. Gent. 1998. -Vol.62. - P.792-799.97

112. Kelsell D.P., Dunlop J., Stevens H.P. et al. Connexin 26 mutations in hereditary non-syndromic sensorineural deafness // Nature. 1997. - Vol.387. -P. 80-83.

113. Khoury M.J, McCabe L.L., McCabe E.R.B. Population Screening in the Age of Genomic Medicine // N.Engl. J. Med. 2003. -Vol. 348, № 1. - P.50 - 58.

114. Knudson A.G. Cancer genetics // Amer. J. Med. Genet. 2002. - Vol.111. -P.96-102.

115. Kostyuchenko L., Makuch H., Kitsera N., et al. Nijmegen breakage syndrome in Ukraine: diagnostics and follow-up // Centr Eur J Immunol. 2009. -Vol.34, №1,-P. 46-52.

116. Kuhn E.M., Therman E. No increased chromosome breakage in three Bloom's syndrome heterozygotes // J Med Genet. 1979. - Vol. 16, №3. -P. 219-222.

117. Langerfelder-Schwind E., Kloza E., Sugerman E. et al. Cystic fibrosi prenatal screening in genetic counceling practice: Recommendations of the nationsl society of genetic councelors // J. Genet. Couns. 2005. -V. 14, № l.-P.l -15.

118. Lee T.M., Kim S.W., Lee K.S., Jin H.S., Koo S.K., et al. Quantitative analysis of SMN1 gene and estimation of SMN1 deletion carrier frequency in Korean population based on real-time PCR // J Korean Med Sei. 2004. -Vol.19. - P. 870-873.

119. Lefebvre S., Bürgten L., Reboullet S. et al. Identification and characterization of a spinal muscular atrophy-determining gene. // Cell. -1995. Vol.80. - P. 155-165.

120. Lench N., Houseman M., Newton V. et al. Connexin-26 mutations in sporadic non-syndromal sensorineural deafness // Lancet. -1998. Vol.351. -P.415.

121. Lindor N.M., Petersen G.M., Hadley D.W., et al. Recommendations for the care of individuals with an inherited predisposition to Lynch syndrome: a systematic review // JAMA. 2006. - Vol.296. - P. 1507-1517.

122. Loubieres Y., Grenet D., Simon-Bouy B.et al. Association between genetically determined pancreatic status and lung disease in adult cystic fibrosis patients / //CHEST.-2002.-Vol. 121, №1.-P. 73-80.

123. Lynch H.T., Silva E., Snyder C., et al. Hereditary breast cancer: part I. Diagnosing hereditary breast cancer syndromes // Breast. J. 2008. - Vol.14. -P.3-13.

124. Mailman M.D., Heinz J.W., Papp A.C., et al. Molecular analysis of spinal muscular atrophy and modification of the phenotype by SMN2 // Genet Med. -2002,- Vol.4. -P. 20-26.

125. Marlin S., Garabedian E.N., Roger Get al. Connexin 26 gene mutations in congenitally deaf children: pitfalls for genetic counseling //Arch.Otolaryngol.Head Neck Surg. 2001. - Vol. 127. - P.927-933.

126. Martin R.H., Rademaker A., German J. Chromosomal breakage in human spermatozoa, a heterozygous effect of the Bloom syndrome mutation // Am J Hum Genet 1994. - Vol. 55. - P. 1242-6.

127. Masi A., Antoccia A. NBS1 Heterozygosity and Cancer Risk // Curr Genomics. 2008 - Vol.9, №4 - P.275 - 81.

128. McAndrew P.E., Parsons D.W., Simard L.R., et al. Identification of proximal spinal muscular atrophy carriers and patients by analysis of SMNT and SMNC gene copy number //Am J Hum Genet. 1997 - Vol.60. - P. 1411-22.

129. Monani U.R., Lorson C.L., Parsons D.W., et al. A single nucleotide difference that alters splicing patterns distinguishes the SMA gene SMNl from the copy gene SMN2. // Hum.Mol.Genet. 1999 - Vol.8. - P. 1177 - 1183.

130. Morton C.C. Genetics, genomics and gene discovery in the auditory system // Hum. Mol.Genet. 2002. -Vol. 11, №.11. - P. 1229 - 1240.

131. Müllenbach R., Lagoda P.J., Welter C. An efficient salt-chloroform extraction of DNA from blood and tissues // Trends Genet. 1989. - Vol. 5. - P. 391.

132. Munsat T.L. Internation SMA collaboration workshop report. // Neuromuscular disorders. 1991. - Vol. 1. - P.81.

133. Norton M.E. Genetic screening and counseling // Curr. Opin. Obstet. Gynecol. 2008. -Vol. 20. P. 157-163.

134. Ogino S., Leonard D.G., Rennert H., et al. Genetic risk assessment in carrier testing for spinal muscular atrophy // Am J Med Genet. 2002 - Vol.110. -P.301-307.

135. Oguchi T., Ohtsuka A., Hashimoto S. et al. Clinical features of patients with GJB2 (connexin 26) mutations: severity of hearing loss is con-elated with genotypes and protein expression patterns // J. Hum. Genet. -2005. -Vol.50. -P.76-83.

136. Oprea G.E., Krober S., McWhorter M.L., et al. Plastin3 is a protective modifier of autosomal recessive spinal muscular atrophy // Science. 2008. -Vol.320.-P. 524-527.

137. Pearn J.H Classification of spinal muscular atrophies. // Lancet. 1980. -Vol.315.-P. 919-922.

138. Pearn J.K. Carter CO., Welson J. The genetic identity of acute infantile spinal muscular atrophy // Brain. 1973. Vol.96. - P.463-470.

139. Petersen M., Willems B.P. Non-syndromic, autosomal-recessive deafness // Clin. Genet. -2006. Vol.69. - P.371-392.

140. Posukh O., Pallares-Ruiz N., Tadinova V. et al. First molecular screening of deafness in the Altai Republic population // BMC.Med Genet. 2005. -Vol.6, №12. -P. 1-7.

141. Prior T.W. Carrier screening for spinal muscular atrophy. Genet Med. -2008. -Vol.10.-P.840-842.

142. Prior T.W. Spinal muscular atrophy: newborn and carrier screening // Obstet Gynecol Clin North Am. 2010. - Vol.37, №1- P.23-36.

143. Prior T.W., Swoboda K.J., Scott H.D., et al. Homozygous SMN1 deletions in unaffected family members and modification of the phenotype by SMN2 // Am J Med Genet. 2004. - Vol. 130. - P.307-310.

144. Robson M.E. Seizing the opportunity: recognition and management of hereditary cancer predisposition // Semin. Oncol. 2007. - Vol.34. - P.367-368.

145. Rodriques N.R., Owen N., Talbot K. et al. Deletion in the survival motor neuron gene on 5 q 13 in autosomal recessive spinal muscular atrophy // Hum. Mol. genet. -1995. -Vol.4. P.631-634.

146. Rodriquez E., Domchek S.M. The prevention of hereditary breast cancer // Semin. Oncol. 2007. - Vol.34. - P.401-405.

147. Salvatore F., Scudiero O., Castaldo G. Genotype-phenotype correlation in cystic fibrosis: The role of modifier genes / // Am. J. Med. Genet. 2002. - V. 111.-P. 88-95.

148. Sarin R. A decade of discovery of BRCA1 and BRCA2: are we turning the tide against hereditary breast cancers? //J. Cancer Res. Ther. 2006. - Vol.2. -P. 157-158.

149. Scriver C.R., Beaudet A.L., Sly W.S., et al. The Metabolic and Molecular Bases of Inherited Disease New York: McGraw- Hill, 2001. - P. 1667-724.

150. Simard L., Rochette C., Semionov A. et al. SMN t and NAIP mutations in

151. Canadian families with spinal muscular atrophy (SMA): genotype/ phenotype103correlations with disese severity. //Amer.J. med. Genet. -1997. Vol.72. —P.51-58.

152. Smith M., Calabro V., Chong B., et al. Population screening and cascade testing for carriers of SMA // Eur J Hum Genet. 2007 - Vol.15. - P759-766.

153. Smith M., Calabro V., Chong B., et al. Population screening and cascade testing for carriers of SMA // Eur J Hum Genet. 2007 - Vol. 15. - P.759-766.

154. Smith R.J. Mutation screening for deafness: more than simply another diagnostic test //Arch. Otolaryngol. Head Neck Surg. 2001. -Vol.127. -P.941-2.

155. Sokolenko A.P., Iyevleva A.G., Preobrazhenskaya E.V., et al. High prevalence and breast cancer predisposing role of the BLM c.l 642 C>T (Q548X) mutation in Russia // Int J Cancer. -2011. -Vol. 130, № 12. P. 2867-2873.

156. Sokolenko A.P., Mitiushkina N.V., Buslov K.G., et al. High frequency of BRCA1 5382insC mutation in Russian breast cancer patients // Eur. J. Cancer. -2006.-Vol.42.-P.1380 1384.

157. Sokolenko A.P., Rozanov M.E., Mitiushkina N.V. et al. Founder mutations in early-onset, familial and bilateral breast cancer patients from Russia. // Fam. Cancer. 2007. - Vol.6. - P.281-286.

158. Sokolenko A.P., Rozanov M.E., Mitiushkina N.V., et al. Founder mutations in earlyonset, familial and bilateral breast cancer patients from Russia // Fam. Cancer. 2007. - Vol.6. - P281-286.104

159. Su Y.N., Hung C.C., Lin S.Y., et al. Carrier Screening for Spinal Muscular Atrophy (SMA) in 107,611 Pregnant Women during the Period 2005-2009: A Prospective Population-Based Cohort Study // PLoS One. 2011 - Vol.6, № 2. -e. 17067.

160. Suspitsin E.N., Sherina N.Y., Ponomariova D.N., et al. High frequency of BRCA1, but not CHEK2 or NBS1 (NBN), founder mutations in Russian ovarian cancer patients // Hered. Cancer. Clin. Pract. 2009. - Vol.7. - P.5.

161. Tereschenko I.V., Basham V.M., Ponder B.A., et al. BRCA1 and BRCA2 mutations in Russian familial breast cancer // Hum. Mutat. 2002. - Vol.19. -P. 184.

162. The International Nijmegen Breakage Syndrome Study Group // Arch. Dis. Child. 2000. - Vol. 82. - P. 400-406.

163. Van Laer L., Cryns K., Smith RJ.et al. Nonsyndromic hearing loss // Ear Hear. 2003. - Vol.24. - P.275 - 288.

164. Varon R., Seemanova E., Chrzanowska K., et al. Clinical ascertainment of Nijmegen breakage syndrome (NBS) and prevalence of the major mutation, 657del5, in three Slav populations // Eur J Hum Genet. 2000 - Vol. 8, №11. -P.900-2.

165. Varon R., Seemanova E., Chrzanowska K., et al. Incidence of the major Nijmegen breakage syndrome (NBS) mutation 657del5 in Czech Republic, Poland and Ukraine//Am J Hum Genet 1999. Vol.65, abstr. #2821.

166. Varon R., Vissinga C., Platzer M. et al. Nibrin, a novel DNA double-strand break repair protein, is mutated in Nijmegen breakage syndrome. // Cell. -1998.-Vol. 93.-P. 467-476.

167. Vasen H.F., Muslein G., Alonso A., et al. Guidelines for the clinical management of Lynch syndrome (hereditary nonpolyposis cancer) // J. Med. Genet. 2007. - Vol.44. - P.353-362.

168. Vasen H.F., van der Meulende Jong A.E., de Vos Tot Nederveen Cappel W.H., et al. ESMO Guidelines Working Group. Familial colorectal cancer risk: ESMO clinical recommendations // Ann. Oncol. 2009. - Vol.20, №4. - P.51-53.

169. Verlingue C., Kapranov N.I., Mercier B. Cofnplete screening of mutations in the coding sequence of the CFTR gene in a sample of CF patients from Russia: Identification of three novel alleles // Human Mutation. 1995. -V. 5. - P. 205-209.

170. Watson M.S., Cutting G.R., Desnick R.J., et al. Cystic fibrosis population carrier screening: 2004 revision of the American College of Medical Genetics Mutation Panel // Genet Med. 2004. - Vol.6, №5 - P.387-391.

171. Williams, R., Mamotte, C., Burnett, J. Phenylketonuria: An Inborn Error of Phenylalanine Metabolism // Clin Biochem Rev 2008. - V. 29. - P. - 31-41.

172. Yan D., Park H.J., Ouyang X.M., et al. Evidence of a founder effect for the 235delC mutation of GJB2 (connexin 26) in east Asians // Hum Genet. 2003. -Vol.114. -P.44-50.

173. You Y.N., Lakhani V.T., Wells S.A. Jr. The role of prophylactic surgery in cancer prevention // World. J. Surg. 2007. - Vol.31. - P.450-464.

174. Zelante L., Gasparini P., Estivill X. et al. Connexin 26 mutations associated with the most common form of non-syndromic neurosensory autosomalrecessive deafness (DFNB1) in Mediterraneans // Hum. Mol. Genet. -1997. -Vol.9.-P. 1605-1609.

175. Zuckerman S., Lahad A., Shmueli A., et al. Carrier screening for Gaucher disease: lessons for low-penetrance, treatable diseases // JAMA. 2007. - Vol. 298. - P. 1281—1290.