Автореферат и диссертация по медицине (14.00.29) на тему:Характеристика ядрышкового антигена клеток человека, выявляемого новым моноклональным антителом

ДИССЕРТАЦИЯ
Характеристика ядрышкового антигена клеток человека, выявляемого новым моноклональным антителом - диссертация, тема по медицине
АВТОРЕФЕРАТ
Характеристика ядрышкового антигена клеток человека, выявляемого новым моноклональным антителом - тема автореферата по медицине
Григорьев, Андрей Александрович Москва 2008 г.
Ученая степень
кандидата биологических наук
ВАК РФ
14.00.29
 
 

Автореферат диссертации по медицине на тему Характеристика ядрышкового антигена клеток человека, выявляемого новым моноклональным антителом

На правах рукописи

ГРИГОРЬЕВ АНДРЕЙ АЛЕКСАНДРОВИЧ

ХАРАКТЕРИСТИКА ЯДРЫШКОВОГО АНТИГЕНА КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА, ВЫЯВЛЯЕМОГО НОВЫМ МОНОКЛОНАЛЬНЫМ АНТИТЕЛОМ.

14 00.29. - гематология и переливание крови 03.00 04. - биохимия

АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук

Москва 2008

003171131

Работа выполнена в Государственных некоммерческих учреждениях «Гематологический Научный Центр Российской Академии Медицинских Наук» и «Институт биоорганической химии им академиков М М Шемякина и Ю А Овчинникова Российской Академии Наук»

НАУЧНЫЕ РУКОВОДИТЕЛИ

Заслуженный деятель науки РФ, доктор медицинских наук, профессор Т И Булычева,

Доктор биологических наук, профессор О В Зацепина ОФИЦИАЛЬНЫЕ ОППОНЕНТЫ Доктор медицинских наук, профессор В М Погорелов Доктор биологических наук А В Филатов ВЕДУЩАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ

Российский онкологический научный центр имени Н Н Блохина РАМН, Москва

У CJ Í-

Защита диссертации состоится « л/f » 'UtVf-t9l- 2008 года в /7 часов на заседании диссертационного совета Д 001 042 02 при Государственном учреждении «Гематологический научный центр» Российской Академии Медицинских наук по адресу 125167, Москва, Новозыковский проезд, дом 4а

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке Государственного учреждения «Гематологический научный центр» Российской Академии Медицинских наук

Автореферат разослан «_» _ 2008 года

Ученый секретарь диссертационного совета, кандидат медицинских наук

Е Е Зыбунова

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ Актуальность проблемы

Ядрышко эукариотической клетки является динамической структурой, в которой происходят транскрипция рибосомных генов (рДНК), процессинг рРНК и сборка прерибосомных субъединиц Кроме того, эта органелла принимает участие в процессах пролиферации, клеточного старения и апоптоза Известно, что структурное состояние ядрышка зависит от уровня метаболизма и способности клеток к пролиферации Поэтому морфология ядрышек, а также его отдельных компонентов в митозе (ядрышковых организаторов) часто принимаются во внимание в медицинской практике для уточнения прогноза течения заболевания и выбора адекватного курса лечения Хорошо известно, что состояние ядрышка изменяется в ответ на стрессовые воздействия или после обработки токсическими веществами, подавляющими, например, синтез рРНК или влияющими на уровень фосфорилирования ключевых ядрышковых белков Однако в современной литературе содержатся лишь отдельные сведения о реакции ядрышка на действие ингибиторов белкового синтеза, включая те из них, которые вызывают гибель клеток путем апоптоза

Согласно последним данным масс-спектрометрического анализа, в составе ядрышка присутствует около 700 белков, которые в зависимости от аминокислотного состава или функциональной значимости могут быть объединены в несколько основных групп. Одна из таких групп включает белки, принимающие участие в регуляции транскрипции рибосомных генов (рДНК) и входящие в состав транскрипционного комплекса РНК полимеразы I Общим свойством белков этой группы является прочная связь с рДНК, которая сохраняется не только в активных ядрышках в интерфазе, но и во время митоза, когда транскрипция рДНК прекращается Известно, что некоторые из этих белков изменяют локализацию в ответ на действие химических агентов или физических факторов Определение реакции белков ядрышка к действию стрессовых агентов, таких, как ингибиторы транскрипции рибосомных генов и синтеза белка, лежит в основе изучения механизмов их действия на нормальные и опухолевые клетки человека.

Одним из подходов к изучению ядрышка является изучение его белков на иммуноцитохимическом уровне, в основе которого лежит использование специфических - поликлональных или

моноклональных антител. В лабораторных условиях моноклональные антитела (МКА) обычно получают путем иммунизации животных очищенными антигенами или клеточными структурами с дальнейшим применением методов гибридомной биотехнологии Этим путем были получены МКА к ядерным белкам В23/нуклеофозмину, Ki-67, PCNA (proliferating cell nuclear antigen) и др

Способность антител специфически узнавать антигены активно используется при изучении свойств и функций белков Однако панель антител к белкам ядрышка, обладающих высокой иммунореактивностью и видовой специфичностью, пригодных для проведения медико-биологических исследований, в настоящее время является достаточно ограниченной В связи с этим, целенаправленное получение новых МКА к ядрышковым антигенам клеток человека с целью их дальнейшей идентификации представляет несомненный как научный, так и практический интерес.

Целью работы явилась изучение иммуноцитохимических особенностей ядрышкового антигена, выявляемого новым моноклональным A3, в клетках человека с различным уровнем пролиферации, а также реакции A3 антигена на обработку клеток ингибиторами белкового синтеза

Задачи работы.

1 Отработать оптимальные условия иммуноцитохимического окрашивания ядрышкового антигена новым моноклональным антителом, названным «МКА A3».

2 Определить видовую и тканевую специфичность МКА A3, а также описать локализацию A3 антигена в разных типах клеток человека и на основных стадиях клеточного цикла

3 Изучить локализацию антигена A3 при активации лимфоцитов периферической крови здоровых доноров к пролиферации с помощью стимуляции фитогемагглютинином (ФГА).

4 Изучить влияние ингибиторов синтеза белка (анизомицина, пуромицина и циклогексимида) на локализацию A3 антигена

5. Исследовать колокализацию A3 антигена с известными белками ядрышка клеток человека до и после действия на клетки ингибиторов белкового синтеза.

6 Определить взаимосвязь между изменениями в локализации АЗ антигена и гибелью клеток, вызываемую подавлением синтеза белка

Научная новизна. С помощью нового моноклонального антитела, секретируемого мышиной гибридомой АЗ, выявлен антиген, располагающийся в ядрышках клеток человека, обладающий четкой видовой специфичностью, названный "АЗ антиген", и имеющий основные свойства, характерные для компонентов комплекса РНК полимеразы I Дана характеристика и выявлены особенности АЗ антигена Показано, что в пролиферирующих клетках человека в отличие от покоящихся АЗ антиген выявляется в виде многочисленных дискретных фокусов, расположенных исключительно в зоне ядрышка. Количество фокусов АЗ антигена уменьшается при ингибировании транскрипции рДНК Отличительной особенностью АЗ антигена является его высокая лабильность, которая проявляется в его миграции из ядрышка в нукпеоплазму под действием ингибиторов белкового синтеза Обнаружено, что изменения в локализации АЗ антигена предшествуют массовой гибели клеток путем апоптоза, что позволяет рассматривать этот феномен как маркер ранних стадий апоптотической гибели клеток человека в культуре

Обнаружено, что при длительном культивировании (в течение 4-6 месяцев) человеческих клеток НеЬа наблюдается спонтанная «миграция» АЗ антигена из ядрышка в нукпеоплазму, что сопровождается повышением чувствительности культуры к внешним воздействиям.

Теоретическое и практическое значение.

Выявлен ядрышковый антиген белковой природы, названный АЗ антиген, обладающий не только видовой специфичностью, но и способностью изменять локализацию под действием ингибиторов белкового синтеза, что дополняет фундаментальные представления о свойствах белков ядрышка.

Разработан метод объективной визуальной оценки общего состояния культур клеток человека , определяемого по локализации АЗ антигена Показано, что появление клеток с атипичной -внеядрышковой - локализацией АЗ антигена указывает на "старение" клеток и их повышенную чувствительность к внешним воздействиям.

Видовая специфичность МКА A3 может оказаться полезной для выявления возможной контаминации культур клеток человека клетками другой видовой принадлежности.

Высокая реактивность в иммуноцитохимических реакциях позволяет использовать МКА A3 в качестве положительного контроля в клинико-лабораторных исследованиях при тестировании различных антител

Изменения в локализации A3 антигена, наблюдаемые при ингибировании синтеза белка, позволяют использовать этот феномен при изучении механизмов действия новых антибиотиков и цитостатических препаратов, а также оценке их способности ингибировать синтез белка в опухолевых клетках человека in vitro. Положения, выносимые на защиту:

1 Антиген, выявляемый МКА A3, является ядрышковым белком, относящимся к комплексу РНК полимеразы I

2 Обработка клеток ингибиторами белкового синтеза (анизомицином, пуромицином или циклогексимидом) приводит к миграции A3 антигена из ядрышка в нуклеоплазму, где он локализуется в виде дискретных фокусов

3 Изменения в локализации A3 антигена относятся к ранним маркерам апоптотической гибели клеток человека в культуре

4 Длительное культивирование клеток HeLa приводит к спонтанной релокализации A3 антигена из ядрышка в нуклеоплазму Апробация работы.

Основные положения диссертации были представлены в виде постерных докладов на конференции Annual BIOCITY Symposium CELL STRESS, (Turcu, Финляндия) в августе 2006 , а также на VI съезде аллергологов и иммунологов СНГ (Москва) в сентябре 2006 г. Диссертационная работа апробирована 24 декабря 2007 на заседании проблемной комиссии «Гемопоэз, молекулярная биология, биотехнология, иммуногематология, гемобластозы и депрессии кроветворения» ГУ ГНЦ РАМН

Структура и объем работы.

Диссертация изложена на _ страницах машинописного

текста, состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, изложения собственных данных, заключения, выводов и библиографического указателя. Диссертация иллюстрирована 2 таблицами, 2 гистограммами и 21 фотографией

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

В работе использовали клетки человека как монослойных, так и суспензионных культур, включая клетки В-лимфобластоидной линии Ramos, первичные фибробласты человека, клетки карциномы шейки матки HeLa Клетки выращивали на покровных стеклах или в матрасах и использовали в экспоненциальной фазе роста

Использовали также лимфоциты здоровых людей в двух вариантах, неактивированные (интактные) и стимулированные фитогемагглютинином (ФГА) Для этого лимфоциты выделяли из венозной крови доноров с помощью градиентного центрифугирования на фиколле (d=l,077 г/смЗ, Pharmacia, Швеция), дважды промывали средой RPMI 1640 и помещали в среду RPMI 1640, содержащую 10% пуловой сыворотки человека AB (1Y) группы, 0 01 М буфера HEPES, глутамин и гентамицин Для стимуляции лимфоцитов добавляли 50 мкг/мл ФГА (Difco, США) Культивирование производили в пластиковых матрасах из расчета 1 млн лимфоцитов в 1 мл среды при 37° С в течение 16 ч, 45 ч и 72 часов В качестве контроля использовали лимфоциты, которые культивировали в тех же условиях без ФГА

После фиксации клеток препараты отмывали стандартным фосфатным буфером PBS, обрабатывали 0 5%-ным Тритоном Х-100 на PBS в течение 10 мин, отмывали в PBS 3 раза по 5 мин и инкубировали во влажной камере с МКА A3 в течение 1 ч при комнатной температуре После отмывки в трех сменах PBS по 10 мин клетки метили антителами к иммуноглобулинам мыши, конъюгированными с TRITC или FITC, при комнатной температуре в течение 40 мин

Препараты изучали с помощью эпифлуоресцентного микроскопа Axiovert 200 (Carl Zeiss, Германия), используя фазово-контрастный объектив ПланАпохромат ЮОх (числовая апертура 1 3) и соответствующий набор фильтров Некоторые препараты изучали под конфокальным лазерным сканирующим микроскопом LSM510 (Карл Цейсс, Германия), используя гелий-неоновый лазер (длина волны - 543 нм) и аргоновый лазер (длина волны 483 нм) для возбуждения флуоресценции в красной и зеленой областях спектра, соответственно

Инкубацию клеток с анизомицином (100 мкМ), пуромицином (100 мкг/мл), циклогексимидом (100 мкг/мл) или эметином (100мкг/мл) производили в течение 1-4 ч при 37° С до фиксации клеток

Для колокализации A3 антигена с другими белками ядра и ядрышка клетки HeLa метили МКА A3 и антителами к UBF (специфический ко-фактор РНК полимеразы I), NoppMO (неспецифический ко-фактор РНК полимеразы I), фибрилларину (фактор раннего процессинга пре-рРНК) или коилину (маркер телец Кахала) После отмывки в трех сменах PBS по 10 мин производили мечение вторичными антителами. Для выявления UBF и фибрилларина использовали антитела к иммуноглобулинам человека, конъюгированные с TRITC или FITC. Для выявления Noppl40 и коилина использовали антитела к иммуноглобулинам кролика, конъюгированные с TRITC или FITC Клетки отмывали от вторичных антител в трех сменах PBS по 10 мин и окрашивали 0 1 мкг/мл DAPI (4', 6-диамидино-2-фенилиндол) в течение 10 мин, отмывали в PBS и заключали в Мовиол

Фрагментацию ядерной ДНК выявляли с помощью метода TUNEL (Terminal deoxynucleotidyl transferase biotin-dUTP nick end labeling), используя набор реагентов «Túnel Apoptosis Detection Kit» (Upstate, США) и следуя рекомендациям производителя Клетки HeLa фиксировали 4%-ным параформальдегидом на PBS в течение 15 мин, отмывали PBS 3 раза по 10 мин и обрабатывали 0 5%-ным Тритоном Х-100 15 мин при комнатной температуре В качестве позитивного контроля использовали клетки, инкубированные 60 мин в PBS, содержащем 2-5 мкг/мл ДНКазы I, а затем - 15 мин в PBS без нуклеазы Клетки инкубировали с реакционной смесью, состоящей из биотинилированного dUTP (Bio-dUTP), TdT (terminal deoxynucleotidyl transferase) и TdT-буфера, 60 мин при 37° С После отмывки в PBS инкубировали с МКА A3 (45 мин), а затем - в смеси авидина, меченного FITC, и антител к IgG мыши, меченных Техасским красным Препараты заключали в Мовиол и изучали, как описано выше

Для проверки предположения, что изменения в локализации A3 антигена происходят предпочтительно на стадии репликации ДНК, исследовали клетки на разных стадиях клеточного цикла, для чего клетки HeLa инкубировали с анизомицином в течение 4 ч, а затем - с 10 мкМ BrdU 15 мин Клетки фиксировали 2%-ным параформальдегидом и метили МКА A3, как описано выше После дополнительной фиксации 2%-ным параформальдегидом 15 мин при комнатной температуре, препараты обрабатывали 4M НС1 в течение 30 мин Тщательно отмывали в PBS и инкубировали с антителами к BrdU, а затем - с антителами к IgG мыши, конъюгированными с FITC,

45 мин при 37° С Докрашивали 0 1 мкг/мл DAPI (10 мин), промывали дистиллированной водой и заключали в Мовиол

Выявление аргентофильных белков ядрышка производили по методике Кунафиной и др, (2005) Перед окрашиванием на аргентофильные белки проводили иммуноцитохимическое окрашивание в соответствии с протоколом, описанным выше Затем проводили дополнительную фиксацию смесью метанола и уксусной кислоты в соотношении 3.1 в течение 10 мин. Далее промывали 3 раза в бидистиллированной воде Потом наносили 5 мкл желатины (2 % желатины и 1 % муравьиной кислоты на бидистиллированной воде) на парафильм В ту же самую каплю добавляли 10 мкл AgN03 (50 % AgNC>3 на бидистиллированной воде) Затем на каплю помещали стекла клетками вниз и инкубировали в течение 15 мин в темноте После промывания бидистиллированной водой препараты заключали в Мовиол.

Для выявления микрофиламентов клетки культуры HeLa фиксировали 2%-ным раствором параформальдегида на PBS в течение 15 мин при комнатной температуре, затем пермеабилизовали 0 1%-ным Тритоном Х-100 на PBS в течение 3 мин и окрашивали МКА A3 по методике, описанной выше Для выявления микрофиламентов в раствор вторичных антител, конъюгированных с FITC, добавляли фаллоидин-родамин (Sigma, США) Затем клетки промывали в PBS 3 раза по 10 мин, окрашивали 0 1 мкг/мл DAPI в течение 10 мин при комнатной температуре и заключали в Мовиол.

Для определения природы A3 антигена клетки HeLa, зафиксированные абсолютным ацетоном (10 мин, 4° С), обрабатывали 1 мкм/мл РНКазы A (Sigma) на PBS в течение 30-60 мин при 37° С или 0 01 %-ньш пепсином (1-5 мин, Sigma), в соответствии с описанной методикой (Zatsepina et al, 1997, Гурченков и др, 2005). Клетки метили антителами и изучали под микроскопом

Для постановки иммуноблотов готовили суммарный и обогащенный фракцией ядер лизат клеток HeLa в экспоненциальной фазе роста Клетки лизировали в буфере, содержащем 10 мМ Tris-HCl, рН 6 8, 20% глицерина, 4% SDS, 200 мМ |3-меркаптоэтанола, 0 1% бромфенолового синего. Электрофорез проводили в 10%-ном полиакриламидном геле на установке фирмы Amersham Biosciences (США) по методу Лэммли (Laemmli, 1970) Перенос белков на нитроцеллюлозную мембрану (Millipore, Франция) с диаметром пор 0.22 мкм осуществляли в камере для влажного переноса (Amersham

Biosciences, США) при напряжении 70 В и силе тока 200 мА Перенос происходил в буфере, содержащем 50 мМ Tris-HCl, рН 7.6, 38 мМ глицина, 01% SDS, 20% метилового спирта в течение 2 ч. Нитроцеллюлозную мембрану инкубировали с МКА A3 в разведении 1- 3000 1 ч и отмывали в буфере TBST 5 раз по 5 мин Инкубировали с антителами к иммуноглобулинам мыши, конъюгированным с пероксидазой хрена, в течение 1 ч, в качестве субстрата использовали 3,3'-диаминобензидин (DAB). Отмывали в TBST 5 раз по 5 мин и высушивали на воздухе Для контроля мембраны окрашивали МКА ЗС9 к белку В23 по методике, описанной ранее (Dergunova et al., 2002).

РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ. Оптимизация условий выявления A3 антигена в разных типах клеток

Для оптимизации условий выявления A3 антигена клетки человека Ramos и HeLa фиксировали одним из следующих фиксаторов

2%-ный параформальдегид (20 мин), абсолютный ацетон (-20° С, 10 мин),

абсолютный метанол (-20° С, 10 мин), смесь метанола (3 части) и ледяной уксусной кислоты (1 часть) (-20° С, 10 мин). Полученные результаты показали, что МКА A3 проявляют иммунореактивность при всех тестированных способах фиксации, но наилучшую - при использовании 2% парафармальдегида. В этих условиях наблюдалось яркое окрашивание. Важно отметить, что антитела сохраняли способность окрашивать клетки даже после фиксации в смеси метанола и уксусной кислоты, те., когда большинство ядерных антигенов не узнаются специфическими антителами, что указывает на высокую иммунореактвность МКА A3 Определение видовой специфичности МКА A3

Из всех клеток, использованных в работе (клетки В-лимфобластоидной культуры Ramos, лимфоциты человека, первичные фибробласты человека, клетки карциномы шейки матки HeLa, фибробласты мыши L929 и NIH/3T3, клетки свиньи СПЭВ, крысы С6, китайского хомячка СНО, сирийского хомячка ВНК-21, кенгуровой крысы РТК1, быка МПТР, мартышки Vero), окрашивание наблюдалось только в клетках человека и мартышки. В клетках других видов реакции не наблюдалось, что свидетельствует о видовой, но не о тканевой специфичности полученных антител

Локализация АЗ-антигена в интерфазных и митотических клетках.

В ядрышках интерфазных клеток НеЬа МКА АЗ выявляло многочисленные гранулы, часто образующие розетко-подобные структуры или протяженные цепочки (рис.1).

а 6 i

». А* * « »с.

як

« »

>

Рис.1. Иммуномечение клеток культуры НеЬа МКА АЗ

а- окрашивание МКА АЗ, б- фазовый контраст, в- совмещение, масштабная

линия 2 мкм

Подобная локализация была характерна для других типов клеток -фибробластов кожи, клеток Ramos и ФГА-стимулированных лимфоцитов (рис.2).

а \ . i » \ \ : ( ) * i В 9

» • : •

Рис. 2. Иммуномечение различных культур клеток, фиксированных

парафармальдегидом, МКА АЗ .

а - фибробласты человека ; б - суспензионная культура Ramos; в - ФГА стимулированные лимфоциты человека. Пунктирная линия очерчивает ядро.

В митотических клетках МКА АЗ окрашивало одиночные гранулы, расположенные на некоторых хромосомах, что особенно хорошо видно при анализе клеток в метафазе митоза (рис. 3).

а" ♦ б • 41 г и д » •

¿Jm W б* • в* «ч

- •• б** 1Г КЗ

Рис. 3. Локализация A3 антигена в интерфазных и митотических клетках HeLa.

а-а*- интерфаза ; б-б* - профаза; в-в* - метафаза; г-г*- анафаза; д-д*- телофаза.

а-д - иммуномечене МКА A3; а*-д*- окрашивание DAPI, а**-д**-совмещение

Результаты определения электрофоретической подвижности A3 антигена на иммуноблотах.

Для выяснения массы антигена, выявляемого МКА A3, был применен метод иммуноблотов с использованием суммарных лизатов клеток HeLa и лизатов, полученных из обогащенной фракции ядер. В качестве контроля использовали МКА к белку В23/нуклеофозмину (МКА ЗС9). Однако в условиях, когда МКА ЗС9 отчетливо выявляло В23/нуклеофозмин, на мембранах, окрашенных МКА A3, реакции не наблюдалось. В связи с этим, для получения данных о природе A3 антигена была произведена его колокализация с хорошо изученными белками ядрышка.

Колокализация A3 антигена с известными белками ядрышка.

Сначала антиген A3 был колокализован с белком UBF, являющимся обязательным и специфическим компонентом комплекса РНК полимеразы I. Для анализа препаратов использовали метод конфокальной лазерной сканирующей микроскопии. Было замечено, что в интерфазных ядрышках места расположения антигена A3 полностью совпадают с участками, содержащими UBF (рис.4).

Рис. 4. Колокализация A3 антигена и UBF (конфокальная микроскопия).

а- локализация A3, б - локализация UBF, в - совмещение, масштабная линия 2 мкм

В то же время АЗ антиген не колокализовался с другими исследованными белками ядрышка такими, как фибрилларин (рис.5) и ИоррИО (рис.6).

а б в

1 *

Рис. 5 Колокализация АЗ антигена и фибрилларина в клетках НеЬа а - локализация АЗ антигена, б - локализация фибрилларина, в - совмещение,

а б в

ч • • ф Ф • - <£ С*'

Ниг *

——

Рис. 6 Колокализация АЗ антигена и №рр140 в клетках НеЬа а - локализация антигена АЗ, б - локализация Морр140, в - совмещение,

Колокализация АЗ антигена с аргентофильными белками ядрышка.

Окрашивание на аргентофильные белки является одним из наиболее распространенных видов окрашивания, которое позволяет оценить функциональное состояние ядрышка. При одновременном окрашивании на аргентофильные белки и иммуномечении МКА АЗ было обнаружено, что участки локализации АЗ антигена и участки локализации аргентофильных белков полностью совпадают. Локализация АЗ антигена после обработки клеток актиномицином Д.

Клетки НеЬа инкубировали с актиномицином Д в концентрации, избирательно ингибирующей транскрипцию рДНК (0.05 мкм/мл) в течение 4 часов, а затем окрашивали МКА АЗ и антителом к белку фибрилларину. Такое воздействие приводило к характерной сегрегации ядрышка, после чего становилось хорошо видно, что АЗ антиген и фибрилларин располагаются в разных компартментах сегрегированных ядрышек. Реакция АЗ антигена на действие ингибиторов синтеза белка.

Реакция клеток человека на ингибирование синтеза белка была сначала изучена на клетках НеЬа. Как показано на рис. 7, обработка клеток ингибитором белкового синтеза анизомицином приводила к миграции АЗ антигена из ядрышка в нуклеоплазму уже через 1 ч после начала воздействия.

Рис. 7. Изменение локализации АЗ антигена после обработки клеток НеЬа 100 мкМ анизомицина в течение разного времени.

а-в - иммуномечение МКА АЗ, а*-б* - фазовый контраст; б**- в** -

ОАР1.

а - локализация АЗ антигена в ядрышке и в нуклеоплазме через 1 ч инкубации с ингибитором, стрелка - фокус локализации АЗ в нуклеоплазме; б -преимущественная локализация АЗ антигена в нуклеоплазме через 2 ч инкубации с анизомицином; в - гетерогенность ответа клеток на ингибирование трансляции, наблюдаемая через 2 ч инкубации с анизомицином, стрелка - клетка с локализацией АЗ в ядрышках, две стрелки -клетка с нуклеоплазматической локализацией АЗ антигена, звездочка -апоптотическая клетка, як-ядрышко. Масштабная линия: 2 мкм.

Характерно, что обработка клеток анизомицином сопровождалась

появлением клеток, в которых вместо округлых ядер присутствовали фрагментированные ядра, что является одним из признаков гибели клеток НеЬа путем апоптоза (Плетюшкина и др., 2006) Число таких клеток прогрессивно увеличивалось по мере инкубации с ингибитором. Динамика изменений числа клеток с характерной локализацией антигена АЗ в ядрышках, аномальной локализацией антигена АЗ в нуклеоплазме и апоптотических клеток показана на гистограмме 1

Гистограмма 1. Реакция клеток НеЬа на действие 100 мкМ анизомицина

100

90-

^ 80-о""*

ш 70-

0 60 ® 50

1 40-

§ 30 4 20 10 ■ о

М

И

Нколичество клеток с ядрышковой локализацией АЗ

□ Количество клеток с релокализацией АЗ

□ количество апоптотических клеток

контроль 1 час 2 часа 3 часа 4 часа время обработки

Из гистограммы видно, что при увеличении времени инкубации с анизомицином увеличивалось количество клеток с релокализацией АЗ антигена, а также увеличивалось количество апоптотических клеток

Следует отметить, что на всех сроках инкубации с анизомицином на препаратах оставались клетки, в которых АЗ антиген располагался только в ядрышках

Аналогичная релокализация АЗ наблюдалась также в других культурах человека, что свидетельствует об универсальности ответа АЗ антигена на ингибирование синтеза белка

Определение стадии клеточного цикла, на которой происходит релокализация АЗ антигена после действия анизомицина

Было отмечено, что клетки, находящиеся в й0 периоде клеточного цикла, включая фибробласты, культивируемые в среде без ростовых факторов, и нестимулированные лимфоциты, не реагируют

на действие анизомицина. Это позволило высказать предположение, что АЗ антиген обладает повышенной «чувствительностью» к действию анизомицина только в пролиферирующих клетках. Для проверки данного предположения клетки HeLa обрабатывали 4 ч анизомицином, а затем инкубировали 30 мин с предшественником синтеза ДНК - BrdU и фиксировали 2% параформальдегидом, как описано выше. Результаты этих экспериментов показали, что практически во всех ядрах, включивших BrdU, АЗ антиген располагался не только в ядрышках, но и в нуклеоплазме. Это свидетельствует о том, что релокализация АЗ антигена из ядрышка в нуклеоплазму наблюдается, главным образом, на стадии репликации ДНК.

Выявление фрагментации хроматина методом Túnel и окраска на актин.

Для того, чтобы выяснить, связаны ли изменения в локализации АЗ антигена с фрагментацией ДНК, часто наблюдаемой при апоптотической гибели клеток, был применен метод Túnel. Наши наблюдения показали, что клетки с атипичным расположением АЗ антигена в нуклеоплазме не метятся в реакции Túnel, хотя метка отчетливо проявлялась в клетках, содержащих фрагментированные ядра. Это говорит о том, что изменения в расположении антигена не связаны с расщеплением ядерной ДНК.

Учитывая, что в клетках, вступающих в апоптоз, может наблюдаться реорганизация цитоскелета (Плетюшкина и др., 2006), клетки HeLa, обработанные анизомицином, окрашивали МКА АЗ и фаллоидином, меченным родамином (рис.8).

Рис. 8. Двойное окрашивание клеток НеЬа фаллоидином на актиновые филаменты (красный цвет) и антителами АЗ (зеленый цвет), а - распределение филаметов в клетке до обработки анизомицином, б - распределение филаметов после обработки анизомицином, в - апоптотическая клетка,

В результате обнаружено, что реорганизация актинового цитоскелета совпадала с релокализацией A3 антигена. Это указывало на то, что релокализация A3 антигена из ядрышка в нуклеоплазму соответствует ранним стадиям апоптоза

Реакция клеток HeLa на действие других ингибиторов белкового синтеза

При обработке клеток другими ингибиторами белкового синтеза - пуромицином (100 мкг/мл), циклогексимидом (100 мкг/мл) или эметином (100 мкг/мл) - наблюдалась сходная реакция Это указывает на то, что изменения в локализации A3 ангигена не вызываются особенностями действия конкретного ингибитора трансляции, а является универсальным ответом на ингибирование белкового синтеза

Колокализация A3 антигена с другими ядрьшковыми белками после инкубации клеток HeLa с анизомицином

Обработка клеток HeLa анизомицином приводила также к появлению в нуклеоплазме фибрилларина и UBF. Однако фокусы локализации фибрилларина не совпадали с фокусами локализации A3 антигена и уступали им по размерам. При исследовании колокализации A3 антигена с UBF, было выявлено, что во всех клетках, изученных методом конфокальной лазерной микроскопии, фокусы локализации A3 антигена полностью совпадали с фокусами локализации белка UBF. Эти наблюдения позволяют предположить, что A3 антиген может быть специфическим ко-фактором РНК полимеразы I - белком UBF

Изменение свойств культуры HeLa после длительного культивирования

Во время проведения данной работы было выявлено, что непрерывное культивирование клеток линии HeLa в течение 3-4 месяцев приводит к заметному изменению свойств клеток В «старой» культуре даже без обработки ингибиторами белкового синтеза могло присутствовать до 30% клеток, в которых A3 антиген располагался не только в ядрышках, но и в нуклеоплазме (гистограмма 2). При этом отмечено, что «старая» культура клеток HeLa проявляла повышенную чувствительность к действию анизомицина по сравнению с клетками краткосрочного культивирования (гистограмма 1). Так в «старой» культуре HeLa наблюдалась значительно более выраженная реакция на действие анизомицина, чем в «молодой» культуре HeLa, что видно при сравнении динамики ответа клеток на воздействие анизомицина, представленной на гистограммах 1 и 2. Более того, в «старой»

культуре было резко повышено количество апоптотических клеток после обработки анизомицином

Гистограмма 2. Реакция клеток IleLa длительного культивирования ("старая" культура HeLa) на действие 100 мкМ аннздмицина.

100

90

70

к 60

5 50

? 40

о

ч. 30

20

10

0

ta

ñ¡

М

контроль 1 час

2 часа

3 часа

Н количество клеток с ядрышковой локализацией АЗ

□ количество клеток с релокализацией АЗ

□ количество апоптотических клеток

4 часа время жкубации

Таким образом, с помощью нового МКА АЗ был выявлен ядрышковый белок, обладающий свойствами, характерными для компонентов транскрипционного аппарата РНК полимеразы I, особенностью которого является его миграция из ядрышка в нуклеоплазму под действием ингибиторов белкового синтеза ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ.

Полученные результаты показали, что МКА АЗ является видоспецифичным, поскольку выявляет антиген только в клетках культур человека и мартышки По-видимому, это связано с незначительными различиями между ядрышковыми белками, участвующими в регуляции транскрипции рДНК, у человека и других приматов Важно заметить, что после фиксации различными фиксаторами, в том числе после фиксации при жестких условиях - в смеси метанола и уксусной кислоты - наблюдалась характерная локализация АЗ антигена в ядрышке Это говорит о высокой иммунореактивности МКА АЗ на клеточном уровне Тот факт , что обработка пепсином, но не РНКазой А, блокировала иммуномечение ядрышек, указывает на белковую природу АЗ антигена

В клетках культур Vero, HeLa, фибробластов кожи и Ramos наблюдался одинаковый характер распределения антигена АЗ. В интерфазных клетках АЗ антиген выявлялся в виде ожерело-подобных

структур, располагающихся исключительно в области ядрышка, что напоминает распределение белков транскрипционного аппарата РНК полимеразы I (Zatsepina et al, 1993) В митотических клетках A3 антиген выявлялся в виде 7-8 ярких одиночных или парных точек, напоминающих ЯОР хромосом (Zatsepina et al, 1993, Roussel et al, 1996, Russell, Zomerdijk, 2005). A3 антиген также полностью колокализовался со специфическим ко-фактором РНК полимеразы I, белком UBF Места локализации A3 антигена не совпадали с другими белками ядрышка, включая фибрилларин, Noppl40 и коилин Перечисленные выше данные указывают на то, что A3 антиген является компонентом транскрипционного аппарата РНК полимеразы I и, возможно, соответствует UBF

В процессе выполнения работы было обнаружено, что A3 антиген обладает отличительной особенностью, которая проявлялась в его способности мигрировать в нуклеоплазму под действием ингибиторов белкового синтеза. Миграция ядрышковых белков при ингибировании белкового синтеза была описана при анализе транскрипционного фактора РНК полимеразы I TIF-IA Однако, при этом T1F-IA не располагался в дискретных фокусах, а диффузно распределялся по всей нуклеоплазме (Meyer et al, 2005) Важно отметить, что миграция МКА A3 из ядрышка в нуклеоплазму не может быть следствием ингибирования транскрипции рибосомных генов, поскольку обработка актиномицином Д не приводила к образованию фокусов A3 антигена в нуклеоплазме

Миграция A3 наблюдалась в клетках различной тканевой принадлежности Однако в каждой культуре наблюдалась определенная динамика протекания реакции на воздействие. Наиболее чувствительной оказалась культура клеток HeLa, фибробласты были менее чувствительны , а культура Ramos и неактивированные лимфоциты доноров были еще менее чувствительны к действию ингибиторов белкового синтеза Чувствительность оценивалась по количеству клеток в культуре с релокализацией A3 антигена Интересно, что при длительном - около 4 месяцев - непрерывном культивировании клеток линии HeLa в культуре появлялись клетки с нуклеоплазматической локализацией A3 антигена По общей морфологии внеядрышковые фокусы A3 антигена напоминали фокусы, индуцируемые ингибиторами белкового синтеза Характерно, что такая культура была более чувствительна к действию ингибиторов трансляции по сравнению с «молодой» культурой и менее жизнеспособна Эти наблюдения говорят о том, что по характеру

расположения АЗ антигена можно судить об общем состоянии культуры клеток HeLa.

Появление клеток с фокусами АЗ антигена в нуклеоплазме после инкубации с ингибиторами белкового синтеза предшествовало появлению апоптических клеток Однако при выявлении фрагментации ядерной ДНК, являющейся одним из признаков апоптоза, методом Túnel в клетках с релокализацией АЗ антигена фрагментации хроматина обнаружено не было Вероятно, это связано с тем, что при подавлении белкового синтеза фрагментация хроматина происходит на поздних стадиях апоптоза, в то время как изменения в локализации АЗ антигена, скорее всего, происходят в клетках, находящихся на ранних стадиях апоптоза В пользу этого вывода говорят также результаты одновременного окрашивания клеток HeLa, обработанных анизомицином, на актин. Известно, что ранним признаком апоптотической гибели клеток HeLa являются изменения в распределении актиновых микрофибрилл, проявляющиеся в укорочении пучков актина, но увеличении их количества (Домнина и др, 2002) Двойное окрашивание клеток меченным фаллоидином и МКА АЗ показало, что эти изменения характерны для клеток с атипичной локализацией АЗ антигена в нуклеоплазме Эти данные указывают на то, что клетки с внеядрышковым расположением АЗ антигена находятся на ранних стадиях апоптоза

Наблюдения о том, что места локализации АЗ антигена и специфического ко-фактора РНК полимеразы I белка UBF полностью совпадают, позволяют сделать два заключения Во-первых, АЗ антиген и UBF могут являться одним и тем же белком Во-вторых, АЗ антиген и UBF могут мигрировать в нуклеоплазму в составе общего комплекса Белки этого комплекса взаимодействуют друг с другом в ядрышке, и поэтому миграция одного компонента комплекса приводит к релокализации всего комплекса

Гетерогенность ответа клеточной популяции на подавление трансляции позволила предположить, что АЗ антиген более чувствителен к действию ингибиторов белкового синтеза на определенных стадиях клеточного цикла Ряд данных, полученных в настоящей работе, свидетельствует в пользу предполагаемой гипотезы Так, в фибробластах, которые находятся в состоянии контактного ингибирования, те в G0 периоде клеточного цикла, ингибиторы белкового синтеза не вызывали изменений в локализации АЗ антигена, в то время как в пролиферирующей культуре фибробластов наблюдалась выраженная реакция на воздействие

Неактивированные лимфоциты также не реагировали на действие анизомицина, но в ФГА стимулированных лимфоцитах наблюдалась релокализация A3 в нуклеоплазму

Таким образом, все культуры клеток, использованные в данной работе, которые содержали делящиеся клетки, реагировали на действие ингибиторов белкового синтеза Данное воздействие приводило к появлению клеток с нуклеоплазматическими фокусами локализации A3 и, в конечном счете, к массовой гибели клеток путем апоптоза Следует отметить, что выявленный феномен позволяет визуализовывать ранние стадии апоптоти ческой гибели клеток человека in vitro

Следует заметить, что в некоторых работах было показано, что клетки, находящиеся в S фазе, наиболее чувствительны к действию различных препаратов, используемых в терапии для индукции апоптоза раковых клеток В работе Griffiths et al (1987) животным инъецировали ингибиторы белкового синтеза рицин и арбирин. Полученные результаты показали, что это приводит к гибели клеток в тканях, которые содержали активно пролиферирующие клетки. Было выявлено, что морфология многих клеток в околоаортических лимфатических узлах и пейеровых бляшках соответствовала морфологии апоптотических клеток. Характерно, что нарушение регуляции белкового синтеза является основным фактором, способствующим развитию и последующему метастазированию рака. Это подтверждается тем, что гиперэкспрессия некоторых факторов инициации трансляции ведет к злокачественной трансформации и, наоборот, пониженная экспрессия ведет к подавлению развития злокачественных новообразований (Hershey, Miyamoto, 2000) Было показано, что компоненты трансляционного аппарата обычно содержат мутации и (или) гиперэкспрессируются в злокачественных образованиях (Anand et al, 2002, Draptchinskaia et al, 1999) Также было замечено, что многие ключевые компоненты антиапоптотических путей регулируются на уровне трансляции (Holcik et al, 2000), а раковый супрессор pRB непосредственно влияет на процесс трансляции путем изменения общего количества рибосом (Cavanaugh et al., 1995, Ruggero, Pandolfi, 2003)

Предположительно селективность действия ингибиторов белкового синтеза на клетки в S фазе может быть использована для индукции апоптоза в пролиферирующих злокачественных клетках in vivo И хотя на сегодняшний день анизомицин не используется в клинике для химиотерапии опухолей, но известны экспериментальные

работы, в которых показано, что анизомицин в комбинации с другими препаратами, применяемыми in vivo, вызывал массовую гибель опухолевых клеток (Ruller et al, 1999) Также имеется ряд работ, в которых были произведены успешные клинические испытания применения ингибиторов белкового синтеза в химиотерапии опухолей (Ottenheijm, van den Broek, 1988, Hafkemeyer-K et al, 1998, Rinehart, 2000, Kantarjian et al, 2001) Действительно, раковые клетки могут быть особенно чувствительны к ингибированию белкового синтеза, поскольку у них резко повышен общий уровень метаболизма Все эти данные указывают на то, что ингибирование белкового синтеза может явиться перспективным направлением в химиотерапии злокачественных новообразований

Следует отметить еще один важный феномен при увеличении времени культивирования клеток HeLa появляются клетки, для которых характерна спонтанная «миграция» АЗ антигена из ядрышка в нуклеоплазму При этом наблюдается повышение чувствительности культуры к действию анизомицина Это проявляется в том, что при обработке ингибиторами белкового синтеза «молодой» и «старой» культур при длительном культивировании количество апоптотических клеток значительно превышает количество апоптотических клеток в «молодой» культуре (гистограммы 1 и 2) Подобное явление не было описано в литературе и может учитываться при оценке реакции клеток на действие химиопрепаратов in vivo

В заключение следует отметить, что окончательно понять природу нуклеоплазматических фокусов локализации АЗ антигена позволит лишь определение его аминокислотной последовательности К сожалению, на настоящий момент не удалось произвести выявление АЗ антигена методом иммуноблотирования Однако, особенности АЗ антигена, описанные в настоящей работе, позволяют считать дальнейшие исследования по его идентификации перспективными с возможностью постановки иммунопреципитации

ВЫВОДЫ.

1 Антиген, выявляемый новым моноклональным антителом АЗ, и названный, соответственно, АЗ антиген, является видоспецифичным и локализуется в ядрышках клеток человека вне зависимости от их тканевого или линейного происхождения, АЗ антиген чувствителен к обработке пепсином и нечувствителен к обработке РНКазой А, что свидетельствует о его белковой природе

2. Использованный для определения природы A3 антигена метод колокализации с уже известными ядрышковыми белками позволяет высказать предположение о принадлежности A3 антигена к компонентам транскрипционного комплекса РНК полимеразы I и его соответствии специфическому ко-фактору -белку UBF

3 Особенностью A3 антигена является его миграция из ядрышка в нуклеоплазму в ответ на действие ингибиторов белкового синтеза, а также спонтанная релокализация в нуклеоплазму при длительном культивировании клеток HeLa, свидетельствующая о снижении их жизнестойкости и повышении чувствительности к внешним воздействиям

4 Изменения в локализации АЗ-антигена предшествуют гибели клеток путем апоптоза, что позволяет считать его ранним маркером апоптотической гибели клеток.

5 Изучение локализации A3 антигена с помощью иммуноцитохимических методов может использоваться для оценки состояния клеточных культур, изучения эффективности действия потенциальных ингибиторов белкового синтеза и при подборе химиотерапевтических препаратов in vitro

Список работ, опубликованных по теме диссертации.

1 Григорьев А А , Жарская О О , Булычева Т И , Зацепина О.В (2006) «Новые моноклональные антитела для выявления изменений ядерных антигенов под действием ингибиторов белкового синтеза в клетках человека» «Аллергология и иммунология», №3, стр. 260

2 Булычева Т.И, Калинина И.А, Григорьев А А, Зацепина О.В "Штамм культивируемых клеток мышиной гибридомы A3, используемый для получения моноклональных антител к антигену ядрышек клеток человека" ГНЦ РАМН, Патент на изобретение, №2005115525/13 от 27 03 2007, приоритет 23 05 05

3 Григорьев А А , Булычева Т И, Шеваль Е В, Калинин И А., Зацепина О В (2008) «Цитологические признаки подавления общего уровня синтеза белка, выявляемые с помощью нового моноклонального антитела » Цитология 50, 338-346

4 Григорьев А А, Жарская О О , Булычева Т И, Зацепина О.В (2007) "Изменения состояния ядрышка при длительном культивировании культуры клеток человека HeLa" Бюллетень экспериментальной биологии и медицины № 9, т. 144, стр 321-325

5 Grigoriev A A , Zharskaya O O , Bulycheva T I, Zatsepina O.V An early nucleolar response to inhibition of protein synthesis in human cultured cells. Abstracts for 16th Annual BIOCITY Symposium CELL STRESS, Turcu August 2006, p 22

 
 

Оглавление диссертации Григорьев, Андрей Александрович :: 2008 :: Москва

Список используемых сокращений:.

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Структура и функции ядрышка.

1.2. Реакции клетки и ядрышка на стрессовые воздействия.

ГЛАВА II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

2.1. Клетки.

2.2. Антитела.

2.3. Воздействие ингибиторов.

2.4. Методы исследования.

2.4.1. Реакция непрямой иммунофлуоресценции.

2.4.2. Выявление фрагментации ДНК методом TUNEL.

2.4.3. Мечение клеток BrdU.

2.4.4. Выявление аргентофильных белков.

2.4.5. Выявление микрофиламентов.

2.4.6. Обработка РНКазой А и пепсином.

2.4.7. Иммуноблотинг.

ГЛАВА III. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ.

3.1. Основная характеристика антигена, выявляемого новым моноклональным антителом A3.

3.1.1. Оптимизация условий выявления A3 антигена.

3.1.2. Определение видовой специфичности МКА A3.

3.1.3. Локализация антигена A3 в интерфазных и митотических клетках.

3.1.4. Особенности распределения антигена A3 в ядрышках клеток различных культур.

3.2. Реакция A3 антигена на действие ингибиторов белкового синтеза.

3.2.1. Влияние ингибитора белкового синтеза - анизомицина на локализацию A антигена в клетках различного тканевого происхождения.

3.2.2. Влияние различных ингибиторов белкового синтеза на локализацию A антигена в клетках HeLa.

3.2.3. Реакция клеток на ингибирование белкового синтеза в зависимости от стадии клеточного цикла.

3.2.4. Выявление Ag-белков после действия анизомицина.

3.2.5. Выявление фрагментации хроматина методом TUNEL.

3.2.6. Структура актинового цитоскелета в клетках HeLa, обработанных анизомицином.

3.2.7. Колокализация A3 с другими ядрышковыми белками после инкубации с анизомицином.

3.3. Выявление аномальной локализации A3 антигена при длительном культивировании клеток HeLa.

ГЛАВА IV. ОБСУЖДЕНИЕ ПОЛУЧЕННЫХ РЕЗУЛЬТАТОВ

ВЫВОДЫ:.

 
 

Введение диссертации по теме "Гематология и переливание крови", Григорьев, Андрей Александрович, автореферат

АКТУАЛЬНОСТЬ ТЕМЫ

Ядрышко эукариотической клетки является динамической структурой, в которой происходят транскрипция рибосомных генов (рДНК), процессинг рРНК и сборка прерибосомных субъединиц. Показано также, что эта органелла принимает участие как в процессах пролиферации, так и в процессах клеточного старения и апоптоза. Известно, что структурное состояние ядрышка зависит от уровня метаболизма и способности клеток к пролиферации. Поэтому морфология ядрышек, а также его отдельных компонентов в митозе (ядрышковых организаторов) часто принимаются во внимание в медицинской практике для уточнения прогноза течения заболевания и выбора адекватного курса лечения. Хорошо известно, что состояние ядрышка изменяется в ответ на стрессовые воздействия или после обработки токсическими веществами, подавляющими, например, синтез рРНК или влияющих на уровень фосфорилирования ключевых ядрышковых белков. Однако в современной литературе содержатся лишь отдельные сведения о реакции ядрышка на действие ингибиторов белкового синтеза, включая те из них, которые вызывают гибель клеток путем апоптоза.

Согласно последним данным масс-спектрометрического анализа ядрышка, в его составе присутствует около 700 белков, которые в зависимости от аминокислотного состава или функциональной значимости могут быть объединены в несколько основных групп. Одна из таких групп включает белки, которые принимают участие в регуляции транскрипции рибосомных генов и входят в состав комплекса транскрипционного аппарата РНК полимеразы I -комплекса, осуществляющего транскрипцию рДНК. Общим свойством белков этой группы является их прочная связь с рибосомными генами, которая сохраняется не только в активных ядрышках в интерфазе, но и во время митоза, когда транскрипция рДНК прекращается. Известно, что некоторые из этих белков изменяют локализацию в ответ на действие химических агентов или физических факторов. Определение чувствительности белков ядрышка к действию стрессовых агентов, таких как ингибиторы транскрипции рибосомных генов и синтеза белка, лежит в основе изучения механизмов их действия на нормальные и опухолевые клетки человека.

Одним из подходов к изучению ядрышка и его белковых компонентов является иммуноцитохимическое выявление белков ядрышка, в основе которого лежит использование моноклональных антител (МКА). В лабораторных условиях антитела обычно получают путем иммунизации животных антигенами разного происхождения или клеточными структурами с дальнейшим применением методов гибридомной биотехнологии. Этим путем были получены МКА к ядерным белкам В23/нуклеофозмину, Ki-67, PCNA (proliferating cell nuclear antigen) и др.

Способность антител специфически узнавать антигены применяется при изучении свойств и функций белков. Однако панель антител к ядрышковым белкам, обладающих высокой иммунореактивностью, видовой специфичностью и пригодных для проведения медико-биологических исследований, в настоящее время является достаточно ограниченной. В связи с этим, целенаправленное получение новых МКА к ядерным антигенам человека и их идентификация представляет несомненный как научный, так и практический интерес.

Целью работы явилось изучение иммуноцитохимических особенностей ядрышкового антигена, выявляемого новым моноклональным антителом A3, в клетках человека с различным уровнем пролиферации, а также реакции A3 антигена на обработку клеток ингибиторами белкового синтеза.

Для достижения поставленной цели было необходимо решить следующие задачи:

1.0тработать оптимальные условия иммуноцитохимического окрашивания ядрышкового антигена новым моноклональным антителом, названным «МКА A3».

2.0пределить видовую и тканевую специфичность МКА A3, а также описать локализацию A3 антигена в разных типах клеток человека и на основных стадиях клеточного цикла.

3.Изучить локализацию антигена A3 при активации лимфоцитов периферической крови здоровых доноров к пролиферации с помощью стимуляции фитогемагглютинином (ФГА).

4.Изучить влияние ингибиторов синтеза белка (анизомицина, пуромицина и циклогексимида) на локализацию A3 антигена.

5.Исследовать колокализацию A3 антигена с известными белками ядрышка клеток человека до и после действия на клетки ингибиторов белкового синтеза. б.Определить взаимосвязь между изменениями в локализации A3 антигена и гибелью клеток, вызываемую подавлением синтеза белка.

НОВИЗНА

С помощью нового моноклонального антитела, секретируемого мышиной гибридомой A3, выявлен антиген, располагающийся в ядрышках клеток человека, обладающий четкой видовой специфичностью, названный "A3 антиген", и имеющий основные свойства, характерные для компонентов комплекса РНК полимеразы I.

Дана характеристика и выявлены особенности A3 антигена. Показано, что в пролиферирующих клетках человека в отличие от покоящихся A3 антиген выявляется в виде многочисленных дискретных фокусов, расположенных исключительно в зоне ядрышка. Количество фокусов A3 антигена уменьшается при ингибировании транскрипции рДНК. Отличительной особенностью A3 антигена является его высокая лабильность, которая проявляется в его миграции из ядрышка в нуклеоплазму под действием ингибиторов белкового синтеза. Обнаружено, что изменения в локализации A3 антигена предшествуют массовой гибели клеток путем апоптоза, что позволяет рассматривать этот феномен-как-маркер-ранних-стадий-апоптотической-гибели-клетокчеловекав------культуре.

Обнаружено, что при длительном культивировании (в течение 4-6 месяцев) человеческих клеток HeLa наблюдается спонтанная «миграция» A3 антигена из ядрышка в нуклеоплазму, что сопровождается повышением чувствительности культуры к внешним воздействиям.

НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ

Выявлен ядрышковый антиген белковой природы, названный A3 антиген, обладающий не только видовой специфичностью, но и способностью изменять локализацию под действием ингибиторов белкового синтеза, что дополняет фундаментальные представления о свойствах белков ядрышка.

Разработан метод объективной визуальной оценки общего состояния культур клеток человека, определяемого по локализации A3 антигена. Показано, что появление клеток с атипичной - внеядрышковой - локализацией A3 антигена указывает на "старение" клеток и их повышенную чувствительность к внешним воздействиям.

Видовая специфичность МКА A3 может оказаться полезной для выявления возможной контаминации культур клеток человека клетками другой видовой принадлежности.

Высокая реактивность в иммуноцитохимических реакциях позволяет использовать МКА A3 в качестве положительного контроля в клинико-лабораторных исследованиях при тестировании различных антител.

Изменения в локализации A3 антигена, наблюдаемые при ингибировании синтеза белка, позволяют использовать этот феномен при изучении механизмов действия новых антибиотиков и цитостатических препаратов, а также оценке их способности ингибировать синтез белка в опухолевых клетках человека in vitro.

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ:

1. Антиген, выявляемый МКА A3, является ядрышковым белком, относящимся к комплексу РНК полимеразы I.

2. Обработка клеток ингибиторами белкового синтеза (анизомицином, пуромицином или циклогексимидом) приводит к миграции A3 антигена из ядрышка в нуклеоплазму, где он локализуется в виде дискретных фокусов.

3. Изменения в локализации A3 антигена относятся к ранним маркерам апоптотической гибели клеток человека в культуре.

4. Длительное культивирование клеток HeLa приводит к спонтанной релокализации A3 антигена из ядрышка в нуклеоплазму.

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ Основные положения диссертации были представлены в виде постерных докладов на конференции Annual BIOCITY Symposium CELL STRESS, (Turcu, Финляндия) в августе 2006 , а также на VI съезде аллергологов и иммунологов СНГ (Москва) в сентябре 2006 г. Диссертационная работа апробирована 24 декабря 2007 на заседании проблемной комиссии «Гемопоэз, молекулярная биология, биотехнология, иммуногематология; гемобластозы и депрессии кроветворения» ГУ ГНЦ РАМН.

Работа выполнена в лаборатории клинической иммунологии Гематологического научного центра РАМН (зав. лаб. - проф., д.м.н. Т.И. Булычева) и в лаборатории структурной биохимии Института биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН (зав.лаб.-проф., д.б.н. О.В.Зацепина)

 
 

Заключение диссертационного исследования на тему "Характеристика ядрышкового антигена клеток человека, выявляемого новым моноклональным антителом"

ВЫВОДЫ:

1. Антиген, выявляемый новым моноклональным антителом A3, и названный, соответственно, A3 антиген, является видоспецифичным и локализуется в ядрышках клеток человека вне зависимости от их тканевого или линейного происхождения; A3 антиген чувствителен к обработке пепсином и нечувствителен к обработке РНКазой А, что свидетельствует о его белковой природе.

2. Использованный для определения природы A3 антигена метод колокализации с уже известными ядрышковыми белками позволяет высказать предположение о принадлежности A3 антигена к компонентам транскрипционного комплекса РНК полимеразы I и его сходстве со специфическим кофактором — белком UBF.

3. Особенностью A3 антигена является его миграция из ядрышка в нуклеоплазму в ответ на действие ингибиторов белкового синтеза, а также спонтанная релокализация в нуклеоплазму при длительном культивировании клеток HeLa, свидетельствующая о снижении их жизнестойкости и повышении чувствительности к внешним воздействиям.

4. Изменения в локализации АЗ-антигена предшествуют гибели клеток путем апоптоза, что позволяет считать его ранним маркером апоптотической гибели клеток.

5. Изучение локализации A3 антигена с помощью иммуноцитохимических методов может использоваться для оценки состояния клеточных культур, изучения эффективности действия потенциальных ингибиторов белкового синтеза и при подборе химиотерапевтических препаратов in vitro.

 
 

Список использованной литературы по медицине, диссертация 2008 года, Григорьев, Андрей Александрович

1. Булычева Т.И., Дергунова Н.Н., Артеменко Е.Г. и др. Анализ пролиферативной активности клеток с помощью новых моноклональных антител к ядрышковому белку В23/нуклеофозмину. Цитология. 2000. 42 (10): 944-954.

2. Гурченков В.В., Ползиков М.А., Магоулас К. и др. Свойства и функции нового белка ядрышка Surf-б в клетках мыши ЗТЗ. Биоорганическая Химия. 2005; 31 (6) : 578-585.

3. Домнина JI.B., Иванова О.Ю., Черняк Б.В и др. Влияние ингибиторов цитоскелетных структур на развитие апоптоза, индуцированного фактором некроза опухолей. Биохимия, 2002; 67 (7): 890-900.

4. Жарская О.О., Зацепина О.В. Динамика и механизмы реорганизации ядрышка в митозе. Цитология. 2007; 49 (5) : 355-369.

5. Мухарьямова К.Ш., Дудник О.А., Сперанский А.И. и др. Сравнительная локализация основных белков ядрышка фибрилларина и В23 в делящихся клетках млекопитающих. Биологические Мембраны. 1998; 15 (6) : 657669.

6. Плетюшкина О.Ю., Фетисова. Е.К., Лямзаев.К.Г. и др. Пероксид водорода, образуемый внутри митохондрий, участвует в передаче апоптозного сигнала от клетки к клетке. Биохимия. 2006; 71 (1): 75-84.

7. Смирнова. О.Ю, Мишина.В.А, Зацепина. О.В Цитоплазматические эффекты воздействия ингибитора синтеза белка эметина на клетки и ядрышки культуры HeLa. Цитология. 2003 45(12): 1179-1187

8. Abayasiriwardana KS, Barbone D, Kim KU, et al. Malignant mesothelioma cells are rapidly sensitized to TRAIL-induced apoptosis by low-dose anisomycin viaBim. Mol Cancer Ther. 6(10):2766-2776.

9. Amamoto R.T., Nogi Y., Dodd J.A. et al. RRN3 gene of Saccharomyces cerevisiae encodes an essential RNA polymerase I transcription factor which interacts with the polymerase independently of DNA template. EMBO J. 1996; 15:3964-3973

10. Anand, N., Murthy, S., Amann, G., et al. Protein elongation factor EEF1A2 is a putative oncogene in ovarian cancer. Nat. Genet. 2002; 31: 301-305.

11. Andersen J.S., Lam Y.W., Leung A.K. et al. Nucleolar proteome dynamics. Nature. 2005; 433 (7021) : 77-83.

12. Andersen JS, Lyon CE, Fox AH et al. Directed proteomic analysis of the human nucleolus. Curr Biol. 2002 Jan 8; 12(1): 1-11.

13. Aprikian P., Moorefield В., and Reeder R.H. New model for the yeast RNA polymerase I transcription cycle. Mol. Cell. Biol. 2001; 21: 4847^1855.

14. Biggiogera M, Fakan S, Kaufmann SH et al. Simultaneous immunoelectron microscopic visualization of protein B23 and C23 distribution in the HeLa cell nucleolus. J Histochem Cytochem. 1989 , 37(9):1371-1374.

15. Bohmann K, Ferreira JA, Lamond Al. Mutational analysis of p80 coilin indicates a functional interaction between coiled bodies and the nucleolus. J Cell Biol. 1995 ;131(4):817-831.

16. Borer RA, Lehner CF, Eppenberger HM et al. Major nucleolar proteins shuttle between nucleus and cytoplasm. Cell. 1989, 56(3):379-390.

17. Budde A, Grummt I. p53 represses ribosomal gene transcription. Oncogene. 1999;18(4):1119-1124.

18. Caizergues-Ferrer M, Mariottini P, Curie С et al. Nucleolin from Xenopus laevis: cDNA cloning and expression during development. Genes Dev. 1989, 3(3):324-333.

19. Cavanaugh A.H., Hirschler-Laszkiewicz I., Hu Q. et al. Rrn3 phosphorylation is a regulatory checkpoint for ribosome biogenesis. J. Biol. Chem. 2002; 277: 27423-27432.

20. Cavanaugh AH, Hempel WM, Taylor LJ et al. Activity of RNA polymerase I transcription factor UBF blocked by Rb gene product. Nature. 1995;374(6518):177-180.

21. Chan PK, Aldrich M, Busch H. Alterations in immunolocalization of the phosphoprotein B23 in HeLa cells during serum starvation. Exp Cell Res. 1985 , 161(1):101-110.

22. Chen YR, Wang X, Templeton D et al. The role of c-Jun N-terminal kinase (JNK) in apoptosis induced by ultraviolet С and gamma radiation. Duration of JNK activation may determine cell death and proliferation. J Biol Chem. 1996 ;271(50):31929-31936.

23. Clos J, Normann A, Ohrlein A et al. The core promoter of mouse rDNA consists of two functionally distinct domains. Nucleic Acids Res. 1986, 14(19):7581-7595.

24. Colombo E, Marine JC, Danovi D et al. Nucleophosmin regulates the stability and transcriptional activity of p53. Nat Cell Biol. 2002; 4(7):529-533.

25. Comai L, Tanese N, Tjian R. The TATA-binding protein and associated factors are integral components of the RNA polymerase I transcription factor, SL1. Cell. 1992 ,68(5):965-976.

26. Conconi A, Widmer RM, Koller T et al. Two different chromatin structures coexist in ribosomal RNA genes throughout the cell cycle. Cell. 1989 ;57(5):753-761.

27. Coso OA, Chiariello M, Yu JC, Teramoto H et al. The small GTP-binding proteins Racl and Cdc42 regulate the activity of the JNK/SAPK signaling pathway. Cell. 1995; 81(7):1137 1146.

28. Cutler SR, Ehrhardt DW, Griffitts JS et al. Random GFP::cDNA fusions enable visualization of subcellular structures in cells of Arabidopsis at a high frequency. Proc Natl Acad Sci USA. 2000 , 97(7):3718-3723.

29. David-Pfeuty Т., Nouvian-Dooghe Y., Sirri V. et al. Common and reversible regulation of wild-type p53 function and of ribosomal biogenesis by protein kinases inhuman cells. Oncogene ;2001. 20 (42) : 5951-5963.

30. БёгуаМ В, Hibi M, Wu IH et al. JNK1: a protein kinase stimulated by UV light and Ha-Ras that binds and phosphorylates the c-Jun activation domain. Cell. 1994;76(6): 1025-1037.

31. Derijard B, Raingeaud J, Barrett T et al. Independent human MAP-kinase signal transduction pathways defined by MEK and MKK isoforms. Science. 1995;267(5198):682-685.

32. Devary Y, Gottlieb RA, Smeal T et al. The mammalian ultraviolet response is triggered by activation of Src tyrosine kinases. Cell. 1992;71(7):1081-1091.

33. Dousset T, Wang C, Verheggen C. et al. Initiation of nucleolar assembly is independent of RNA polymerase I transcription. Mol Biol Cell. 2000 Aug;l 1(8):2705-2717.

34. Dumbar TS, Gentry GA, Olson MO. Interaction of nucleolar phosphoprotein B23 with nucleic acids. Biochemistry. 1989 , 28(24):9495-9501.

35. Dundr M, Misteli Т. Functional architecture in the cell nucleus. Biochem J. 2001, 356(Pt 2):297-310.

36. Eberhard D, Tora L, Egly JM et al. A TBP-containing multiprotein complex (TIF-IB) mediates transcription specificity of murine RNA polymerase I. Nucleic Acids Res. 1993 , 21(18):4180-4186.

37. Erard MS, Belenguer P, Caizergues-Ferrer M et al A major nucleolar protein, nucleolin, induces chromatin decondensation by binding to histone HI. Eur J Biochem. 1988 , 175(3):525-530.

38. Escande-Geraud ML, Azum MC, Tichadou JL et al. Correlation between rDNA transcription and distribution of a 100 kD nucleolar protein in CHO cells. Exp Cell Res. 1985 ,161(2):353-363.

39. Fath S., Milkereit P., Peyroche G. et al. Differential roles of phosphorylation in the formation of transcriptional active RNA polymerase I. Proc. Natl. Acad. Sci. 2001; 98: 14334-14339.

40. Feuerstein N, Mond JJ, Kinchington PR et al. Evidence for DNA binding activity of numatrin (B23), a cell cycle-regulated nuclear matrix protein. Biochim Biophys Acta. 1990,1087 (2):127-136.

41. Ford E, Voit R, Liszt G et al. Mammalian Sir2 homolog SIRT7 is an activator of RNA polymerase I transcription. Genes Dev. 2006; 20(9):1075-1780.

42. French SL, Osheim YN, Cioci F et al. In exponentially growing Saccharomyces cerevisiae cells, rRNA synthesis is determined by the summed RNA polymerase I loading rate rather than by the number of active genes. Mol Cell Biol. 2003 ;23(5):1558-1568.

43. Gerbi SA. The evolution of eukaryotic ribosomal DNA. Biosystems. 1986;19(4):247-258.

44. Gerdes J., Schwab U., Lemke H. et al. Production of a mouse monoclonal antibody reactive with a human nuclear antigen associated with cell proliferation. Int. J. Cancer. 1983; 31 (1) : 13-20.

45. Goessens G. Nucleolar structure. Int Rev Cytol. 1984, 87:107-158.

46. Gokal PK, Cavanaugh AH, Thompson EA Jr. The effects of cycloheximide upon transcription of rRNA, 5 S RNA, and tRNA genes. J Biol Chem. 1986;261 (6):253 6-2541.

47. Goodpasture C, Bloom SE. Visualization of nucleolar organizer regions im mammalian chromosomes using silver staining. Chromosoma. 1975 ;53(1):37-50.

48. Griffiths, G.D., Leek, M.D. and Gee, D.J. The toxic plant proteins ricin and abrin induce apoptotic changes in mammalian lymphoid tissues and intestine. J. Pathol. 1987; 151:221-229.

49. Grummt I. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 1999;62:109-154. Regulation of mammalian ribosomal gene transcription by RNA polymerase I. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 1999;62:109-154.

50. Haas S, Kaina B. c-Fos is involved in the cellular defence against the genotoxic effect of UV radiation. Carcinogenesis. 1995;16(5):985-991.

51. Hanada K, Song CZ, Yamamoto К et al. RNA polymerase I associated factor 53 binds to the nucleolar transcription factor UBF and functions in specific rDNA transcription. EMBO J. 1996 ,15(9):2217-2226.

52. Heix J, Grummt I. Species specificity of transcription by RNA polymerase I. Curr Opin Genet Dev. 1995, 5(5):652-656

53. Heix J, Vente A, Voit R. et al. Mitotic silencing of human rRNA synthesis: inactivation of the promoter selectivity factor SL1 by cdc2/cyclin B-mediated phosphorylation. EMBO J. 1998 ,17(24):7373-7381.

54. Hernandez-Verdun D, Hubert J, Bourgeois CA et al. Ultrastructurallocalization of Ag-NOR stained proteins in the nucleolus during the cell cycleand in other nucleolar structures. Chromosoma. 1980;79(3):349-362.

55. Hernandez-Verdun D, Roussel P, Gebrane-Younes J. Emerging concepts of nucleolar assembly. J Cell Sci. 2002, 115 (Pt 11):2265-70.

56. Hernandez-Verdun D. Structural organization of the nucleolus in mammalian cells. Methods Achiev Exp Pathol. 1986;12:26-62.

57. Hernandez-Verdun D. The nucleolus: a model for the organization of nuclear functions. Histochem Cell Biol. 2006, 126(2): 135-148.

58. Herrera JE, Savkur R, Olson MO. The ribonuclease activity of nucleolar protein B23. :Nucleic Acids Res. 1995 ; 23(19):3974-3979.

59. Hershey, J.W.B. and Miyamoto S. Translational control of cancer. In Translational control of gene expression (eds. N. Sonenberg et al.), pp. 637654. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY. 2000

60. Hirschler-Laszkiewicz I., Cavanaugh A., Hu Q. et al,. The role of acetylation in rDNA transcription. Nucleic Acids Res. 2001; 29(20): 4114-4124.

61. Holcik, M.N., Sonenberg, N., and Korneluk, R.G. Internal ribosome initiation of translation and the control of cell death. Trends Genet 2000; 16: 469^73.

62. Horky M, Kotala V, Anton M et al. Nucleolus and apoptosis. Ann N Y Acad Sci. 2002;973:258-264.

63. Hubbell HR. Silver staining as an indicator of active ribosomal genes. Stain Technol. 1985 ;60(5):285-294.

64. Iborra FJ, Jackson DA, Cook PR. The case for nuclear translation. J Cell Sci. 2004 , 117(Pt 24) :5713-5720.

65. Isaac C, Yang Y, Meier UT. Noppl40 functions as a molecular link between the nucleolus and the coiled bodies. J Cell Biol. 1998 , 142(2):319-329

66. Jacob ST. Regulation of ribosomal gene transcription. Biochem J. 1995;306 ( Pt3):617-626.

67. Jantzen HM, Admon A, Bell SP et al. Nucleolar transcription factor hUBF contains a DNA-binding motif with homology to HMG proteins. Nature. 1990, 344 (6269):830-836.

68. Jimenez-Garcia LF, Segura-Valdez ML, Ochs RL et al. Nucleologenesis: U3 snRNA-containing prenucleolar bodies move to sites of active pre-rRNA transcription after mitosis. Mol Biol Cell. 1994 ;5(9):955-966.

69. Kageyama A, Kusano I, Tamura T et al. Comparison of the apoptosis-inducing abilities of various protein synthesis inhibitors in U937 cells. Biosci Biotechnol Biochem. 2002 ; 66(4):835-859.

70. Kantarjian HM, Talpaz M, Santini V et al. Homoharringtonine: history, current research, and future direction. Cancer. 2001 ; 92(6):1591-1605.

71. Keppler-Hafkemeyer A, Brinkmann U, Pastan I. Role of caspases in immunotoxin-induced apoptosis of cancer cells. Biochemistry. 1998 ;37(48): 16934-16942.

72. Kermekchiev M, Workman JL, Pikaard CS. Nucleosome binding by the polymerase I transactivator upstream binding factor displaces linker histone HI. Mol Cell Biol. 1997 , 17(10):5833-5842.

73. Klein J. and Grummt I. Cell cycle-dependent regulation of БУМА polymerase I transcription: The nucleolar transcription factor UBF is inactive in mitosis and early Gl. Proc. Natl. Acad. Sci. 1999, 96: 6095-6101.

74. Koberna K, MaHnsky J, Pliss A et al. Ribosomal genes in focus: new transcripts label the dense fibrillar components and form clusters indicative of "Christmas trees" in situ. J Cell Biol. 2002 ,157(5):743-748

75. Koroleva OA, Tomlinson ML, Leader D et al. High-throughput protein localization in Arabidopsis using Agrobacterium-mediated transient expression of GFP-ORF fusions. Plant J. 2005 , 41(1):162-174.

76. Kruhlak MJ, Lever MA, Fischle W. et al. Reduced mobility of the alternate splicing factor (ASF) through the nucleoplasm and steady state speckle compartments. J Cell Biol. 2000 ,150(1):41-51.

77. Laemmli UK. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature. 1970 ;227(5259):680-685.

78. Lafarga M, Berciano MT, Andres MA. Protein-synthesis inhibition induces perichromatin granule accumulation and intranuclear rodlet formation in osmotically stimulated supraoptic neurons. Anat Embryol (Berl). 1993 ;187(4):363-369.

79. Lamond Al, Earnshaw WC. Structure and function in the nucleus. Science. 1998, 280(5363): 547-553.

80. Lapeyre B, Mariottini P, Mathieu С et al. Molecular cloning of Xenopus fibrillarin, a conserved U3 small nuclear ribonucleoprotein recognized by antisera from humans with autoimmune disease. Mol Cell Biol. 1990; 10(l):430-434.

81. Learned RM, Cordes S, Tjian R. Purification and characterization of a transcription factor that confers promoter specificity to human RNA polymerase I. Mol Cell Biol. 1985, 5(6):1358-1369

82. Lee KH, Nishimura S, Matsunaga S et al. Inhibition of protein synthesis and activation of stress-activated protein kinases by onnamide A and theopederin B, antitumor marine natural products. Cancer Sci. 2005;96(6):357-364.

83. Leung AK, Gerlich D, Miller G et al. Quantitative kinetic analysis of nucleolar breakdown and reassembly during mitosis in live human cells. J Cell Biol. 2004, 166(6):787-800.

84. Lewis JD, Tollervey D. Like attracts like: getting RNA processing together in the nucleus. Science. 2000 , 288(5470):1385-1389

85. Lin A, Minden A, Martinetto H et al. Identification of a dual specificity kinase that activates the Jun kinases and p38-Mpk2. Science. 1995;268(5208):286-290.

86. Lischwe MA, Ochs RL, Reddy R et al. Purification and partial characterization of a nucleolar scleroderma antigen (Mr = 34,000; pi, 8.5) rich in NG,NG-dimethylarginine. J Biol Chem. 1985 ; 260(26):14304-14310.

87. Marilley M, Pasero P. Common DNA structural features exhibited by eukaryotic ribosomal gene promoters. Nucleic Acids Res. 1996, 24(12):2204-2211.

88. Marilley M, Radebaugh CA, Geiss GK et al. DNA structural variation affects complex formation and promoter melting in ribosomal RNA transcription. Mol Genet Genomics. 2002, 267(6):781-791.

89. Mayer C, Bierhoff H, Grummt I. et al. The nucleolus as a stress sensor: JNK2 inactivates the transcription factor TIF-IA and down-regulates rRNA synthesis. Genes Dev. 2005;19(8):933-941.

90. Mayer C, Zhao J, Yuan X et al. mTOR-dependent activation of the transcription factor TIF-IA links rRNA synthesis to nutrient availability. Genes Dev. 2004 ;18(4):423-434.

91. Mazzola JL, Sirover MA. Alteration of intracellular structure and function of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase: a common phenotype of neurodegenerative disorders? Neurotoxicology. 2002 , 23(4-5):603-609.

92. Meier UT, Blobel G. NAP57, a mammalian nucleolar protein with a putative homolog in yeast and bacteria. J Cell Biol. 1994; 127(6 Pt 1):1505- 1514.

93. Meier UT, Blobel G. Noppl40 shuttles on tracks between nucleolus and cytoplasm. Cell. 1992 ;70(1):127-138.

94. Milkereit P. and Tschochner H. A specialized form of RNA polymerase I, essential for initiation and growth-dependent regulation of rRNA synthesis, is disrupted during transcription. EMBO J. 1998; 17: 3692-3703.

95. Miller G., Panov K.I., Friedrich J.K. et al. hRRN3 is essential in the SL1-mediated recruitment of RNA polymerase I to RNA gene promoters. EMBO J. 2001; 20: 1373-1382.

96. Miller OJ, Miller DA, Dev VG et al. Expression of human and suppression of mouse nucleolus organizer activity in mouse-human somatic cell hybrids. Proc

97. Natl Acad Sci USA.1976 ;73(12):4531-4535.

98. Misteli T, Spector DL. The cellular organization of gene expression. Curr Opin Cell Biol. 1998, 10(3):323-331

99. Misteli Т. Protein dynamics: implications for nuclear architecture and gene expression. Science. 2001 ; 291(5505):843-847.

100. Morcillo G, De la Torre C, Gimenez-Martfn G. Nucleolar transcription during plant mitosis. In situ assay for RNA polymerase activity. Exp Cell Res. 1976 ;102(2):311-316.

101. Muth V., Nadaud S., Grummt I. et al. Acetylation of TAFI68, a subunit of TIF-IB/SL1, activates RNA polymerase I transcription. EMBO J. 2001 20: 1353-1362

102. Narayanan S, Surendranath K, Bora N, Surolia A, Karande AA Ribosome inactivating proteins and apoptosis. FEBS Lett. 2005;579(6): 1324-1331.

103. Noaillac-Depeyre J, Dupont MA, Tichadou JL et al. The effect of adenosine analogue (DRB) on a major nucleolar phosphoprotein nucleolin. Biol Cell. 1989; 67(l):27-35.

104. Ochs R.L., Lischwe M.A., Spohn W.H. et al. Fibrillarin: a new protein of the nucleolus identified by autoimmune sera. Biol Cell. 1985; 54 (2) : 123-133.

105. Olson MO. Sensing cellular stress: another new function for the nucleolus? Sci STKE. 2004;2004 (224): pelO.

106. O'Mahony DJ, Smith SD, Xie W et al. Analysis of the phosphorylation, DNA-binding and dimerization properties of the RNA polymerase I transcription factors UBF1 and UBF2. Nucleic Acids Res. 1992 ;20(6): 1301-1308.

107. Ottenheijm HC, van den Broek LA. The development of sparsomycin as an anti-tumour drug. Anticancer Drug Des. 1988 ; 2(4):333-337.

108. Pendle AF, Clark GP, Boon R. et al. Proteomic analysis of the Arabidopsis nucleolus suggests novel nucleolar functions. Mol Biol Cell. 2005,16(1): 260269

109. Pestov DG, Strezoska Z, Lau LF. Evidence of p53-dependent cross-talk between ribosome biogenesis and the cell cycle: effects of nucleolar protein Bopl on G(l)/S transition. Mol Cell Biol. 2001 ;21(13):4246-4255.

110. Peyroche G., Milkereit P., Bischler N. et al. The recruitment of RNA polymerase I on rDNA is mediated by the interaction of the A43 subunit with

111. Rrn3. EMBO J. 2000; 19: 573-5482.

112. Phair RD, Misteli T. High mobility of proteins in the mammalian cell nucleus.

113. Nature. 2000,404(6778):604-609

114. Platani M, Goldberg I, Swedlow JR et al. In vivo analysis of Cajal body movement, separation, and joining in live human cells. J Cell Biol. 2000 , 151(7):1561-74.

115. Raska I, Andrade LE, Ochs RL et al. Immunological and ultrastructural studies of the nuclear coiled body with autoimmune antibodies. Exp Cell Res. 1991 ;195(l):27-37.

116. Raska I. Oldies but goldies: searching for Christmas trees within the nucleolar architecture. Trends Cell Biol. 2003 , 13(10):517-525.

117. Reeder RH. Regulation of RNA polymerase I transcription in yeast and vertebrates. Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 1999;62:293-327.

118. Reichow SL, Hamma T, Ferre-D'Amare AR, Varani G. 2007. Nucleic Acids1. Res. 35(5):1452-1464.

119. Reimer G, Pollard KM, Penning CA et al. Monoclonal autoantibody from a (New Zealand black x New Zealand white) F1 mouse and some human scleroderma sera target an Mr 34,000 nucleolar protein of the U3 RNP particle.

120. Arthritis Rheum. 1987 ;30(7):793-800.

121. Rinehart KL. Antitumor compounds from tunicates. Med Res Rev. 200020(l):l-27.

122. Roussel P, A"Hre C, Comai L et al. The rDNA transcription machinery is assembled during mitosis in active NORs and absent in inactive NORs. J Cell Biol. 1996 ;133(2):235-246.

123. Roussel P, Hernandez-Verdun D. Identification of Ag-NOR proteins, markers of proliferation related to ribosomal gene activity. Exp Cell Res. 1994 ; 214(2):465-472.

124. Roussel P, Sirri V, Hernandez-Verdun D. Quantification of Ag-NOR proteins using Ag-NOR staining on western blots. J Histochem Cytochem. 1994;42(11):1513-1517.

125. Roussel P., Andre C., Masson C., Geraud G., Hernandez-Verdun D. Localization of the RNA polymerase I transcription factor hUBF during the cell cycle. J. Cell. Sci. 1993 104 (2) : 327-337.

126. Rubbi CP, Milner J. Disruption of the nucleolus mediates stabilization of p53 in response to DNA damage and other stresses. EMBO J. 2003; 22(22):6068-6077.

127. Rubbi CP, Milner J. p53~guardian of a genome's guardian? Cell Cycle. 2003; 2(1):20-21.

128. Ruggero, D. and Pandolfi, P.P. Does the ribosome translate cancer? Nat. Rev. 2003; 3: 179-192.

129. Riiller S, Stahl C, Kohler G et al. Sensitization of tumor cells to ribotoxic stress-induced apoptotic cell death: a new therapeutic strategy. Clin Cancer Res. 1999;5(10):2714-2725.

130. Russell J, Zomerdijk JC. RNA-polymerase-I-directed rDNA transcription, life and works. Trends Biochem Sci. 2005;30 (2):87-96.

131. Sanchez I, Hughes RT, Mayer В J et al. Role of SAPK/ERK kinase-1 in the stress-activated pathway regulating transcription factor c-Jun. Nature. 1994;372(6508):794-798.

132. Savino T.M., Bastos R., Jansen E. et al. The nucleolar antigen Nop52, the human homologue of the yeast ribosomal RNA processing RRP1, is recruited at late stages of nucleologenesis. J Cell Sci. 1999; 112 (12): 1889-1900.

133. Savkur RS, Olson MO. Preferential cleavage in pre-ribosomal RNA byprotein B23 endoribonuclease. Nucleic Acids Res. 1998; 26(19):4508-4515.

134. Schnapp A, Pfleiderer C, Rosenbauer H et al. A growth-dependent transcription initiation factor (TIF-IA) interacting with RNA polymerase I regulates mouse ribosomal RNA synthesis. EMBO J. 1990 ;9(9):2857- 2863.

135. Schreiber M, Baumann B, Cotten M et al. Fos is an essential component of the mammalian UV response. EMBO J. 1995;14(21):5338-5349.

136. Scott M., Boisvert F.M., Vieyra D. et al. UV induces nucleolar translocation of ING1 through two distinct nucleolar targeting sequences. Nucleic Acids Res. 2001; 29 (10) : 2052-2058.

137. Seither P, Zatsepina O, Hoffmann M et al. Constitutive and strong association of PAF53 with RNA polymerase I. Chromosoma. 1997 ,106(4):216-225.

138. Seither P., Iben S., Thiry M. et al. PAF67, a novel protein that is associated with the initiation-competent form of RNA polymerase I. Biol. Chem. 2001; 382: 1163- 1170.

139. Shav-Tal Y., Blechman J., Darzacq X. et al. Dynamic sorting of nuclear components into distinct nucleolar caps during transcriptional inhibition. Mol. Biol. Cell. 2005;16 (5) : 2395-2413.

140. Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A et al. Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing. EMBO Rep. 2000 ; l(3):287-292.

141. Sirri V., Roussel P., and Hernandez-Verdun, D. In vivo release of mitotic silencing of ribosomal gene transcription does not give rise to precursor ribosomal RNA processing. J. Cell Biol. 2000; 148: 259-270.

142. Srivastava M,'Fleming PJ, Pollard HB et al. Cloning and sequencing of the human nucleolin cDNA. FEBS Lett. 1989 , 250(1):99-105.

143. Stoykova AS, Dabeva MD, Dimova RN et al. Ribosome biogenesis and nucleolar ultrastructure in neuronal and oligodendroglial rat brain cells. J Neurochem. 1985 , 45(6): 1667-1676.

144. Tower J. and Sollner-Webb В. Transcription of mouse rDNA is regulated by an activated subform of RNA polymerase I. Cell 1987; 50: 873-883.

145. Туе K, Steitz JA. U3, U8 and U13 comprise a new class of mammalian snRNPs localized in the cell nucleolus. EMBO J. 1989 ;8(10):3113-3119.

146. Van Dam H, Wilhelm D, Herr I et al. ATF-2 is preferentially activated by stress-activated protein kinases to mediate c-jun induction in response to genotoxic agents. EMBO J. 1995; 14(8): 1798-1811.

147. Voit R, Schafer K, Grummt I. Mechanism of repression of RNA polymerase I transcription by the retinoblastoma protein. Mol Cell Biol. 1997;17(8):4230-4237.

148. Voit R, Schnapp A, Kuhn A et al. The nucleolar transcription factor mUBF is phosphorylated by casein kinase II in the C-terminal hyperacidic tail which is essential for transactivation. EMBO J. 1992 ;11(6):2211-2218.

149. Voit R., Hoffmann M., and Grummt I. Phosphorylation by Gl-specific cdk-cyclin complexes activates the nucleolar transcription factor UBF. EMBO J. 1999;18: 1891-1899.

150. Wang D, Baumann A, Szebeni A et al. The nucleic acid binding activity of nucleolar protein B23.1 resides in its carboxyl-terminal end. J Biol Chem. 1994 , 269(49):30994-30998.

151. Waskiewicz AJ, Cooper JA. Mitogen and stress response pathways: MAP kinase cascades and phosphatase regulation in mammals and yeast. Curr Opin Cell Biol. 1995;7(6):798-805.

152. Watkins, S.J. and Norbury, C.J. Translation initiation and its deregulation during tumorigenesis. Br. J. Cancer 2002; 86: 1023-1027.

153. Wojciechowski J., Horky M., Gueorguieva M., et al. Rapid onset of nucleolar disintegration preceding cell cycle arrest in roscovitine-induced apoptosis of human MCF-7 breast cancer cells. Int. J. Cancer. 2003; 106 (4) : 486-495.

154. Wu HL, Hsu CY, Liu WH, et al. Berberine-induced apoptosis of human leukemia HL-60 cells is associated with down-regulation of nucleophosmin/B23 and telomerase activity. Int J Cancer. 1999;81(6):923-929.

155. Yan M, Dai T, Deak JC, et al. Activation of stress-activated protein kinase by MEKK1 phosphorylation of its activator SEK1. Nature. 1994;372(6508):798-800.

156. Yang GH, Jarvis BB, Chung YJ et al. Apoptosis induction by the satratoxins and other trichothecene mycotoxins: relationship to ERK, p38 МАРК, and SAPK/JNK activation. Toxicol Appl Pharmacol. 2000;164(2):149-160.

157. Yuan X, Zhou Y, Casanova E et al. Genetic inactivation of the transcription factor TIF-IA leads to nucleolar disruption, cell cycle arrest, and p53-mediated apoptosis. Mol Cell. 2005 ;19(l):77-87.

158. Yuan X., Zhao J., Zentgraf H. et al. Multiple interactions between RNA polymerase I, TIF-IA and TAFI subunits regulate preinitiation complex assembly at the ribosomal gene promoter. EMBO Rep. 2002; 3: 1082-1087.

159. Yung BY, Busch H, Chan PK. Translocation of nucleolar phosphoprotein B23 (37 kDa/pI 5.1) induced by selective inhibitors of ribosome synthesis. Biochim Biophys Acta. 1985; 826(4): 167-173.

160. Zatsepina O.V., Todorov I.T., Philipova R.N. et al. Cell cycle-dependent translocations of a major nucleolar phosphoprotein, B23, and some characteristics of its variants. Eur. J. Cell Biol. 1997; 73 (1) : 58-70.168.169.170.171.172.

161. Zinck R, Cahill MA, Kracht M et al. Protein synthesis inhibitors reveal differential regulation of mitogen-activated protein kinase and stress-activated protein kinase pathways that converge on Elk-1. Mol Cell Biol. 1995; 15(9):4930-4938.